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                【学位论文】 作者:李玥芃 导师:陈自力   南昌大学   数学 数学硕士 2024年

                【摘要】 Cucker?Smale模型是研究生物群体集体行为的经典模型.在许多现实的场景中,生物体会受到各种作用力的影响.本文主要研究具有幂律势的Cucker?Smale模型及动理学Cucker?Smale模型,定量的建立解的大时间行为.具体安排如下...

                【关键词】 Cucker-Smale模型幂律势

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                【学位论文】 作者:张帅 导师:施绍群   南昌大学   数学 数学硕士 2024年

                【摘要】 测序技术的飞速发展产生了大量可用的基因表达数据,为人类探索癌症与基因间关系提供了机会。癌症预测和基因选择不仅极大程度上节约了医疗成本,还为癌症靶向治疗提供帮助。正则化技术在提高癌症预测准确性和识别相关生物标志物方面已经表现出重要价值。然而传...

                【关键词】 癌症预测基因选择

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                【学位论文】 作者:余紫媛 导师:施绍萍   南昌大学   数学 数学硕士 2024年

                【摘要】 蛋白质磷酸化修饰在理解和揭示各类生物学现象中有着不可或缺的作用,而磷酸化异常也是许多疾病发生的关键因素,因此研究蛋白质磷酸化修饰具有重要现实意义。研究的关键在于准确识别蛋白质上的磷酸化位点。高通量筛选等传统生物实验方法虽然准确率很高,但耗时...

                【关键词】 蛋白质磷酸化修饰位点预测

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                【学位论文】 作者:邹金坪 导师:施绍萍   南昌大学   数学 应用数学硕士 2023年

                【摘要】 在人类与疾病的长期斗争中,特别是近年来新型冠状病毒感染在全球范围内大流行,药物发挥着越来越重要的作用。新药物的研发存在投入成本高,耗费时间长的问题。传统药物发现过程的主要挑战是化学分子的搜索空间巨大且离散,高通量筛选以及虚拟筛选的方法需要耗...

                【关键词】 药物分子生成深度学习

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                【学位论文】 作者:李强 导师:尹洪位   南昌大学   数学 应用数学硕士 2023年

                【摘要】 成形素是一类在胚胎发育过程中具有重要作用的信号分子,它控制着细胞的分化方向和组织增长。成形素分子首先在胚胎局部区域形成,然后通过传播机制(如自然扩散,转胞吞,超扩散等)扩散到胚胎其他区域,从而形成成形素分子浓度梯度。成形素下游信号通路传递该...

                【关键词】 胚胎发育成形素梯度

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                【学位论文】 作者:何欢 导师:施绍萍   南昌大学   数学 应用数学硕士 2022年

                【摘要】 基因表达是基因型产生表型的最基本的层次,对于生物体的发育至关重要。人类基因组计划的成功完成,基因表达数据激增,这类数据的分析和处理成为探索其应用的主要瓶颈。精准医疗中,恶性肿瘤的药物靶点和生物标志物的精准预测识别,对患者临床治疗和癌症治愈具...

                【关键词】 癌症分类基因选择

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                【学位论文】 作者:郭昕昀 导师:施绍萍   南昌大学   数学 应用数学硕士 2022年

                【摘要】 磷酸化作为最重要的蛋白质翻译后修饰(PTM)之一几乎参与生物生命活动的全程,蛋白激酶之间的磷酸化级联则是细胞内信号整合和传播的核心机制,由于实验方法无法直接鉴定激酶信息,使用计算方法预测磷酸化位点的特异激酶逐渐成为研究热点。本文针对数据库中...

                【关键词】 蛋白质翻译后修饰磷酸化位点

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                【学位论文】 作者:林丹 导师:施绍萍   南昌大学   数学 应用数学硕士 2021年

                【摘要】 近年来,多肽作为新的诊断药物在治疗人类疾病方面显示出巨大的潜力,其中抗炎肽(AIPs)为自身免疫性疾病和炎症性疾病提供了新的治疗方法。相比于小分子非特异性抗炎药物,抗炎肽具有副作用小和更有效等特点。随着多肽数据的大量涌现,如何准确地识别抗炎...

                【关键词】 抗炎肽特征编码

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                【学位论文】 作者:张菊 导师:施绍萍   南昌大学   数学 应用数学硕士 2021年

                【摘要】 蛋白质是基因表达的产物,是生命中的基本元素,具有维持生物体生命活动的重要作用,这使得蛋白质组学成为后基因组时代生命科学中重要的研究领域。准确预测蛋白质,对蛋白质进行精准分类,对研究其结构及功能具有重要的意义。随着后基因组时代的发展,蛋白质数...

                【关键词】 蛋白质预测深度学习

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                【学位论文】 作者:杨淑芬 导师:尹洪位   南昌大学   数学 应用数学硕士 2020年

                【摘要】 细胞生命活动是一个十分复杂的过程,受蛋白质和基因表达相互作用等生化反应的调控,其生化反应表现出明显的随机性。而对生化反应系统进行建模和仿真的一个重要途径是研究系统生物学,这一过程中,离散性和随机性起着很重要的作用。
                  本文中我们主要...

                【关键词】 随机过程随机模拟算法

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                【学位论文】 作者:余佳麟 导师:施绍萍   南昌大学   数学 应用数学硕士 2020年

                【摘要】 在后基因组时代,蛋白质组学是一个非常重要的研究内容。蛋白质作为一种基础物质是直接参与了人类的生命活动,通常需要通过进行翻译后修饰(Post-translational modifications,PTMs)才能转化为具备功能的成熟蛋白,然而...

                【关键词】 赖氨酸翻译后修饰

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                【学位论文】 作者:曹曼 导师:施绍萍   南昌大学   数学 计算数学硕士 2019年

                【摘要】 蛋白质翻译后修饰,也称为共价修饰,是调控蛋白质功能的重要机制,在信号通路和生物学过程中发挥着不可替代的作用,并可逆地决定了细胞的动力学和可塑性。然而,随着蛋白质翻译后修饰数据的高通量发展,传统的实验方法往往是费力、费时和昂贵的,快捷便利的计...

                【关键词】 机器学习蛋白质

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                【学位论文】 作者:陈国东 导师:施绍萍   南昌大学   数学 应用数学硕士 2019年

                【摘要】 赖氨酸乙酰化修饰是一种被广泛研究且可逆的蛋白质翻译后修饰,对细胞的转录调控、中心代谢、蛋白质的合成、细胞周期、细胞形态、信号传导等诸多生理过程具有重要的意义。乙酰化修饰位点的识别是了解乙酰化蛋白分子机制的基础。虽然已经有越来越多的研究者发展...

                【关键词】 原核生物赖氨酸

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                【学位论文】 作者:范彩凤 导师:熊佐亮   南昌大学   数学 应用数学硕士 2015年

                【摘要】 生态数学模型的研究是近些年来在生物数学研究领域中最主要的研究内容。可以看到,随着自然界环境愈发的被人类探索、开发、改造以及人为或自然发生的环境灾害也都日益频繁。因此,在生态模型的研究中加入环境的干扰进一步提高了用数学生态系统模拟生态的精准性...

                【关键词】 随机捕食被捕食系统

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                【学位论文】 作者:孙冲冲 导师:汪祥   南昌大学   数学 计算数学硕士 2014年

                【摘要】 矩阵计算是科学和工程计算的基础,很多科学和工程计算的问题往往最终都是转化为矩阵计算问题来获得所要求的数值结果。在分子生物学中,研究基因表达时发现,在一个基因列表内的成千上万的基因中,发挥作用的只有少数的基因,并且这少数基因发挥作用的大小也不...

                【关键词】 基因排序数值求解算法

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                【学位论文】 作者:韦秋妤 导师:熊佐亮   南昌大学   数学 应用数学硕士 2014年

                【摘要】 在自然界中各种环境干扰无处不在,在确定性模型中加入环境噪声的影响,可以更好的揭示生态系统和传染病系统的发展变化规律,也更符合实际.本文主要研究种群生态模型和传染病模型受到随机白噪声干扰时系统的渐近行为,内容安排如下:
                  第1章介绍了...

                【关键词】 随机食物链系统状态转换

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                【学位论文】 作者:汪芳 导师:熊佐亮   南昌大学   数学 应用数学硕士 2014年

                【摘要】 本文主要研究三类种群生态模型:具有Beddington-DeAngelis功能函数的随机食饵-捕食系统、具有脉冲效应的随机生态模型和具有时滞的随机生态模型.
                  第1章给出了本文的研究背景及主要工作.
                  第2章研究了一类具有B...

                【关键词】 捕食-被捕食系统脉冲效应

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                【学位论文】 作者:王伟华 导师:熊佐亮   南昌大学   数学 应用数学硕士 2013年

                【摘要】 本文主要考虑了种群生态系统,我们在传统的微分方程模型基础上,引入了脉冲和时滞,并讨论了环境噪声包括白噪声和有色噪声对传统生态系统的影响,建立了脉冲和随机生态模型。本文的主要章节安排如下:
                   第1章介绍了种群动力系统的研究背景、发...

                【关键词】 状态转换分布时滞

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                【学位论文】 作者:梁珊 导师:王胜华   南昌大学   数学 应用数学硕士 2013年

                【摘要】 本文研究了种群细胞中一类具Rotenberg模型的迁移方程,讨论了该Rotenberg模型相应的迁移算子的谱分析、生成C0半群的性质及该迁移方程解关于时间的渐近稳定性等。主要结果有:
                   1、讨论了种群细胞中一类具积分边界条件的R...

                【关键词】 种群细胞Rotenberg模型

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