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【中文期刊】 苏辉 戴宜武 等 《中华神经外科疾病研究杂志》 2016年15卷2期 144-147页ISTICCA
【摘要】 目的：研究表明人类表皮生长因子受体2（ HER2）基因的异常表达与乳腺癌，胃癌等多种恶性肿瘤的进展相关，然而其与胶质母细胞瘤（ GBM）的关系目前尚不清楚。方法利用肿瘤与癌症基因图谱计划（TCGA），脑肿瘤分子数据库（REMBRANT）和基...
【关键词】 人类表皮生长因子受体2；基因芯片；胶质母细胞瘤；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘梦园 吴瑛 等 《临床军医杂志》 2016年44卷8期 862-865页ISTICCA
【摘要】 目的 利用在线表达谱芯片数据,探讨转化生长因子-β1诱导转录蛋白1(TGFB1I1)在胃癌中的表达情况与临床病理学参数的关系,评价TGFB 1I1对胃癌的预后价值.方法 利用GEO数据库的胃癌数据集GSE62254和K-M plotter数...
【关键词】 胃癌；转化生长因子-β1诱导转录蛋白1；预后；
- 概要：
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【中文期刊】 李奉喜 吴向华 等 《广东医学》 2016年37卷14期 2084-2087页ISTICCA
【摘要】 目的：应用基因芯片技术探讨Nrf2与乳腺癌化疗耐药可能相关的下游通路。方法选择人乳腺癌多柔比星耐药细胞株 MCF－7／ADM作为研究对象，经NFE2L2－RNAi成功转染，敲除NFE2L2目的基因，应用RT－PCR方法检测目的基因的表达情况...
- 概要：
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【中文期刊】 崔洪亮 张阳德 等 《中国现代医学杂志》 2014年24卷3期 77-79页ISTICCA
【摘要】 目的 筛选人类与癌症发病相关的miRNA基因,对已发表的数据库dbDEMC进行更新.方法 收集公开发表的75套微阵列数据,共涵盖21种人类癌症的miRNA表达谱.利用芯片显著性分析(significance analysis of micr...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 粟艳林 谌思 等 《湖南师范大学学报（医学版）》 2014年11卷2期 5-8页ISTIC
【摘要】 目的:前期的研究发现Stab1为GBM的一个特异性差异表达基因,本文通过对其他GBM表达公共数据库的进一步挖掘结合实验验证从而推测STAB1的表达与GBM生存之间的关系.方法:对TCGA数据库中的GBM基因表达谱芯片数据进行Cox回归分析和...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 张千 邓存良 等 《西部医学》 2013年25卷8期 1143-1145页ISTIC
【摘要】 目的 利用生物信息学技术探索大鼠肝纤维化肝窦内皮细胞的关键差异基因及相关信号通路.方法 在公共数据库GEO中找到大鼠肝纤维化相关基因芯片数据,利用String、FLink在线工具筛选差异表达基因,对差异表达基因进行相关信号通路分析.结果 在...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 曹伟军 吴海露 等 《临床肿瘤学杂志》 2013年18卷10期 882-886页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨长链非编码RNA (lncRNA)在结肠癌中的表达情况.方法 从公共数据平台Gene ExpressionOmnibus (GEO)下载结肠癌外显子芯片数据集GSE31737,包含40对结肠癌及癌旁组织.对外显子芯片探针进行重排,...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 陈睦虎 胡迎春 等 《西部医学》 2013年25卷6期 821-823页ISTIC
【摘要】 目的 利用生物信息学找到大鼠颅脑损伤后的差异表达基因信息,为后期研究提供线索.方法 在公共基因芯片数据库GEO中找到大鼠颅脑损伤基因芯片数据,并利用其筛选工具找到差异表达基因,随后对其进行生物学分析.结果 在大鼠损伤脑组织中共找到190条表...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 谢龙祥 闫中义 等 《河南大学学报（医学版）》 2018年37卷3期 223-228页CA
【摘要】 由美国政府发起的癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)计划是一个公共资助的项目,其采用高通量基因组测序、基因芯片技术,运用多维数据整合分析方法,将人类几乎所有癌症(包括亚型在内的50多种肿瘤)的基因组变异...
【关键词】 癌症基因组图谱(TCGA)；癌症基因组学；测序；
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【中文期刊】 曹创裕 周永健 等 《广州医药》 2018年49卷6期 24-29页
【摘要】 目的 通过生物信息分析途径,从分子水平揭示非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的发病发展机制,为NAFLD研究提供新的思路.方法 从公共数据库GEO中下载NAFLD相关的基因芯片数据GSE48452,利用Tran-scriptome Analy...
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【中文期刊】 范振海 邢时云 等 《现代养生（下半月版）》 2018年9期 66-68页
【摘要】 目的:采用生物信息学方法筛选出肝癌的关键差异表达基因.方法:对GEO公共数据库中获取的四组肝癌和癌旁组织基因表达芯片数据进行生物信息学分析,首先用R数据包中的limma程序分别对各数据集的差异表达基因进行初筛,再进一步应用Robust ra...
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【中文期刊】 蒋峥 卜友泉 等 《医学分子生物学杂志》 2011年08卷3期 220-224,252页ISTICCA
【摘要】 目的 对公共数据库上下载得到的乳腺癌基因芯片试验结果进行数据分析,找出在正常组织与癌组织中呈现差异表达的基因,并寻找差异表达基因的相关基因.方法 综合运用显著性分析(SAM)、顶级评分基因对(TSP)、关联规则挖掘等方法,对数据进行处理.结...
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【中文期刊】 曾娟 刘青兰 等 《口腔医学》 2010年30卷8期 455-459页ISTICCA
【摘要】 目的 应用基因芯片技术及最新公共数据库,观察玉屏风口服液作用后口腔扁平苔藓(oral lichen planus,OLP)组织中基因表达谱改变. 方法 分离纯化正常口腔黏膜组织、口腔扁平苔藓病变组织和服用玉屏风口服液后扁平苔藓病变组织mRN...
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【中文期刊】 仲燕 袁栎 等 《世界华人消化杂志》 2004年12卷8期 1988-1990页ISTICCA
【摘要】 目的:探讨大鼠胚胎胰腺发育外分泌功能基因表达调控.方法:采用高密度寡核苷酸芯片(Affemetrix芯片)对E15.5和E18.5胚胎胰腺进行基因转录水平分析,基于获得的基因表达信息对UCSC,TRANSFAC,NCBI等公共数据库进行检索...
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【中文期刊】 卢娟 郑剑锋 《实验与检验医学》 2015年6期 711-713,744页CA
【摘要】 目的：利用公共数据库挖掘肝癌发生过程的关键基因，为后续的功能验证奠定基础。方法以肝癌表达谱芯片数据GSE33006为例，采用免费开源的R/BioConductor分析工具，介绍基本分析步骤，对肝癌表达谱数据进行分析。结果芯片数据GSE330...
【关键词】 肿瘤数据库；基因表达；R/BioConductor；
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【中文期刊】 李长征 周淑清 等 《医学信息（下旬刊）》 2013年26卷8期 1-2页
【摘要】 目的 用生物信息学方法探讨TNF-α抑制剂治疗类风湿关节炎的相关基因,为探讨TNF-α抑制剂治疗类风湿关节炎的机制提供新思路.方法 从基因芯片公共数据库Gene Expression Omnibus (GEO)中下载TNF-α抑制剂治疗类风...
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【中文期刊】 胡迎春 张千 等 《泸州医学院学报》 2013年36卷1期 80-82页
【摘要】 目的:利用生物信息学找到大鼠脓毒血症的差异基因表达信息,为后期研究提供线索.方法:在公共基因芯片数据库GEO中找到大鼠脓毒血症基因芯片数据,并利用其筛选工具找到相关表达基因,随后对其进行生物学分析.结果:在大鼠脓毒血症组织中共找到275条表...
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【中文期刊】 陈可和 冯国生 等 《内科》 2006年01卷1期 12-15,封3页
【摘要】 目的 探讨寡核苷酸芯片技术在我国肝细胞癌p53基因点突变发生频率及形式,并以DNA测序法进行验证.方法 参照国际p53突变公共数据库资料,以发生频率最高的7个点突变序列设计探针,制备p53基因点突变专用寡核苷酸芯片,应用该技术检测我国肝细胞...
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【中文期刊】 黄宏斌 梁芳 等 《生物化学与生物物理进展》 2012年39卷1期 35-44页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 传统的技术路线研发新药,不仅周期很长而且耗资巨大,开发已获批准药物新的治疗用途,又称为药物重定位,比传统的新药研发具有明显的优势.基于芯片的基因表达谱分析,已常规地广泛用于各种人类疾病的临床研究,提供了在全基因组水平描述疾病状态的特征信号....
- 概要：
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【中文期刊】 廖宝 周凤坤 等 《中华医学杂志》 2019年99卷7期 525-531页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用生物信息学分析颅内动脉瘤(LA)的公共数据库中的表达谱芯片数据,为疾病机制研究提供重要信息.方法 基于数据集(GSE75436)进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)构建其基因共表达网络,并识别枢纽基因;同时,使用在线工具DAV...
【关键词】 颅内动脉瘤；加权基因共表达网络分析；基因；
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【中文期刊】 缪冉 董星琲 等 《中华医学杂志》 2018年98卷18期 1397-1402页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探索与慢性血栓栓塞性肺动脉高压(CTEPH)显著相关的微RNA (miR).方法 通过整合Affymetrix miR芯片数据以及从高通量基因表达数据库(GEO)公共数据库上下载的GSE56914数据.两套芯片数据均来自于CTEPH患...
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【中文期刊】 孙娜 刘启玲 等 《中华疾病控制杂志》 2018年22卷7期 677-681页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 采用生物信息学研究方法分析大气污染物对成人和儿童外周血基因表达谱的影响,为后期开展有针对性的预防、诊断及治疗提供理论依据.方法 从基因芯片公共数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载一组来自不同大气污染暴...
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【中文期刊】 王苗 高巍 等 《中华病理学杂志》 2017年46卷7期 485-490页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过生物信息学分析及实验验证,揭示长链非编码RNA PVT1在肿瘤中的表达及作用机制,为肿瘤的发病机制研究提供新的思路.方法 从starBase v2.0 公共数据库分析PVT1在14种常见肿瘤中的表达,利用PVT1 RNA原位杂交实...
- 概要：
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【中文期刊】 刘珂 侯毅 等 《中华骨科杂志》 2017年37卷11期 691-697页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨膝关节滑膜成纤维细胞在类风湿关节炎发生、发展过程中的作用及在发病过程中起重要作用的通路.方法 在公共数据库NCBI GEO和EBI ArrayExpress中,通过查找关键字进行数据检索,筛选出符合要求的全基因组表达谱芯片数据.对...
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【中文期刊】 李长征 王慧 等 《中华神经医学杂志》 2012年11卷8期 767-769页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过生物信息学方法探讨阿尔茨海默病的发病相关基因,为阿尔茨海默病的基础研究和临床治疗提供新思路. 方法 从基因芯片公共数据库GEO中下载阿尔茨海默病相关基因芯片数据,利用String、KEGG、Panther等在线分析软件对差异表...
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【中文期刊】 刘芳 陈树宝 等 《上海第二医科大学学报》 2005年25卷5期 478-482页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的检测剔除心脏神经嵴心脏组织与正常心脏组织之间表达差异基因,筛选心脏圆锥动脉干发育相关基因.方法用电刺激方法建立鸡胚实验模型;用抑制消减杂交法筛选出实验组和对照组心脏组织之间存在的差异表达基因;构建减数杂交文库,用cDNA基因芯片技术验证...
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【中文期刊】 王静 李伟 《武汉大学学报（医学版）》 2019年40卷6期 917-921页ISTICCABP
【摘要】 目的:探讨KCNN4基因在胰腺癌(PC)患者组织中的表达与临床特征及预后的相关性.方法:NCBI的GEO数据库下载相关芯片数据(GSE15471),包含39例PC组织及39例正常胰腺组织的基因表达谱数据,检测KCNN4的表达情况;TCGA公...
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【中文期刊】 王琪 冯辉 等 《肿瘤学杂志》 2018年24卷7期 666-671页ISTICCA
【摘要】 [目的]本研究通过基因表达汇编(gene expression omnibus,GEO)数据库探索核糖核苷酸还原酶M2(ribonucleotide reductase regulatory subunit M2,RRM2)在肺癌中的表达情...
【关键词】 肺癌；核糖核苷酸还原酶M2；预后；
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【中文期刊】 张维莉 吴玉梅 等 《中华医学遗传学杂志》 2005年22卷6期 705-708页MEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 目的应用基因芯片技术及最新公共数据库,筛选常染色体显性多囊肾组织中差异表达的基因,对其进行功能分类,并对其中1条基因利用原位杂交技术进行验证.方法将代表8398条人类基因的PCR产物制成基因芯片.将等量的多囊肾组织和正常肾组织mRNA分别用...
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