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【中文期刊】 郭倩 宋延平 等 《中国药业》 2022年31卷9期 39-43页ISTICCA
【摘要】 目的 基于分子对接技术探讨安宫牛黄丸中的有效化学成分与血管紧张素转换酶2(ACE2)结合的亲和力,以及其治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制.方法 采用计算机检索TCMSP数据库中安宫牛黄丸中药材化学成分,从PDB数据库中下载...
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【中文期刊】 姜媛 肖冰茹 等 《化学研究与应用》 2022年34卷4期 722-729页
【摘要】 G蛋白偶联受体34(GPR34)在肥大细胞、肿瘤组织和人体免疫器官中高度选择性表达,但因属于膜蛋白,其三维结构难以测定,不能从分子水平上分析其与药物作用情况.本文选用PDB数据库中与GPR34一级序列同源性最高的4NTJ为模版蛋白进行同源建...
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【中文期刊】 邵百卉 姜东君 等 《中国畜牧兽医》 2022年49卷9期 3581-3588页
【摘要】 [目的]采用分子对接以及体外试验确定青蒿素对牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)复制的抑制作用,为抗病毒药物和制剂开发提供新思路.[方法]以BVDV-NS5B蛋白为作用靶点,通过PDB数据库检...
【关键词】 青蒿素；牛病毒性腹泻病毒(BVDV)；抗病毒活性；
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【中文期刊】 杨保军 梁琪 等 《中国食品学报》 2022年22卷5期 8-17页
【摘要】 用生物信息学方法计算并分析牦牛乳硬质干酪中鉴定出的3种苦味肽RK7、VN10和SN12的理化特性,对肽结构做能量最小化处理,从PDB数据库获取血管紧张素转化酶(ACE)蛋白晶体的X射线衍射三维结构,通过分子对接和数据库比对评估和表征苦味肽的...
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【中文期刊】 庞湃 王斌 《实用中医内科杂志》 2022年36卷7期 8-11,后插4-后插5页
【摘要】 目的 基于网络药理学探讨黄连-佩兰药对改善胰岛素抵抗的作用机制.方法 利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选黄连-佩兰药对有效活性成分及其相关靶点.通过OMMI、GeneCards、TTD和DisGeNET数据库获取胰岛素抵抗相关靶点...
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【中文期刊】 翟莉 李冰清 等 《中国病原生物学杂志》 2025年20卷3期 271-276页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 通过蛋白表达纯化、晶体X射线衍射技术解析鼠伤寒沙门菌YbiB蛋白的结构,为进一步探索YbiB蛋白参与的生物学过程及功能研究提供结构基础.方法 分子克隆ybiB基因,插入pGL01表达载体,构建ybiB-pGL01重组质粒.诱导并纯化目...
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【学位论文】 作者：饶翔 导师：沈世镒 南开大学 数学 概率论与数理统计（硕士） 2005年
【摘要】 自然界中所有的蛋白质都是由一系列氨基酸按一定生物规则排列成。而最常见的氨基酸种类有20种，除甘氨酸(GLY)外，每—种氨基酸都至少有一个不对称的碳原子，即在羧基和氨基之间的那个碳原子，所以每—种氨基酸都可以以两种旋光异构体存在。一般来说，我...
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【中文期刊】 李伟 刘志强 等 《信息安全与技术》 2015年6卷9期 93-96页
【摘要】 充分发挥Oracle12c数据库CDB-PDB集中式管理多个数据库的新特性,通过将字符集一致的多个医院辅助信息系统低版本Oracle数据库实例进行升级整合,实现了实例与数据库一对多管理,达到了多个独立业务应用服务器不同版本Oracle数据库...
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【中文期刊】 马路 周果宏 《情报杂志》 2002年21卷3期 65-66页
【摘要】 介绍用Delphi5.0开发的蛋白质大分子三维结构信息系统。该系统提供蛋白质大分子信息及二维、三维图像的检索、测览、保存及通过局域网发送的功能。蛋白质大分子三堆结构数据来源为美国布鲁克海文(Brookhaven)蛋白质数据库(pdb)，该系...
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【中文期刊】 苏智楷 周映霖 等 《现代药物与临床》 2024年39卷6期 1417-1424页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学结合网络药理学及分子对接系统性探索芹菜素抗前列腺癌的分子机制.方法 通过ETCM、HERB、HIT 2.0 及SwissTargetPrediction数据库预测芹菜素靶点.计算TCGA和GEO数据集差异基因作为前列腺癌...
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【中文期刊】 吴梅君 叶晓莉 等 《中药材》 2023年46卷6期 1513-1518页MEDLINEISTICPKUCA
【摘要】 目的:探讨鸢尾苷元对β淀粉样蛋白(Aβ)1-42诱导SH-SY5Y细胞损伤的保护作用及其潜在机制.方法:以Aβ1-42诱导人神经母细胞瘤细胞系SH-SY5Y建立阿尔茨海默症(AD)神经元损伤模型,MTT检测细胞活力;流式细胞术检测细胞凋亡;...
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【中文期刊】 汤家明 董丽娜 等 《时珍国医国药》 2023年34卷1期 220-222页PKUCSCDCA
【摘要】 目的 运用分子对接技术筛选天麻对GABAARS激活性成分,为孤独症谱系障碍中医治疗研究提供思路.方法 在TCMSP数据库获取天麻化合物,RCSB PDB数据库选择合适的GABAARs蛋白,采用AutoDock软件、Pymol软件等进行对接....
【关键词】 分子对接；孤独症谱系障碍；A型γ-氨基丁酸受体；
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【中文期刊】 刘明皓 Faez Iqbal Khan 等 《生物医学工程学杂志》 2022年39卷5期 1005-1014页MEDLINEISTICPKUCA
【摘要】 本研究旨在从国家卫生健康委员会发布的《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第九版)》重型和危重型药方中筛选可能对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)有治疗作用的活性成分,并通过其与严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)蛋白的相互作用...
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【中文期刊】 钱刚 王海燕 等 《生物化学与生物物理进展》 2012年39卷5期 472-482页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 β转角作为一种蛋白质二级结构类型在蛋白质折叠、蛋白质稳定性、分子识别等方面具有重要作用.现有的β转角预测方法,没有将PDB等结构数据库中先前存在的同源序列的结构信息映射到待预测的蛋白质序列上.PDB存储的结构已超过70000,因此对一条新确...
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