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【中文期刊】 刘本国 刘江伟 等 《高等学校化学学报》 2017年38卷1期 41-46页
【摘要】 采用基于R基团搜索技术的Topomer CoMFA建立了30个类黄酮类P糖蛋白抑制剂的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型,并用包括9个样本的测试集验证模型的外部预测能力.所得模型的拟合、交互验证以及外部验证的复相关系数分别为r2=0.9...
- 概要:
- 方法:
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【中文期刊】 冯惠 冯长君 等 《南京理工大学学报(自然科学版)》 2017年41卷3期 393-398页
【摘要】 为了探讨氟喹诺酮均三唑稠杂环类衍生物(FQTHs)体外抗肿瘤作用的微观机理,建立其对中国仓鼠卵巢细胞(CHO)、鼠白血病细胞(L1210)和人白血病细胞(HL60)等的体外抗肿瘤活性(Aj:AC、AL、AH)与量化参数Qt的定量结构-活性相...
【关键词】 氟喹诺酮均三唑稠杂环类衍生物;中国仓鼠卵巢细胞;鼠白血病细胞;
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- 结论:
【中文期刊】 袁钰涵 范旖旎 等 《化学研究与应用》 2017年29卷12期 1833-1839页
【摘要】 采用量子化学中的密度泛函理论(DFT)方法,在B3LYP/6-31++G(d,p)基组水平上系统计算了TβR-I抑制剂吡唑类衍生物(AHSPs)的量子化学结构参数.用逐步线性回归方法(SR)对该类AHSPs化合物进行了定量构效关系研究,筛选...
【关键词】 转化生长因子-β受体激酶TβR-Ⅰ;定量构效关系(QSAR);量子化学计算;
- 概要:
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【中文期刊】 李美萍 张生万 《原子与分子物理学报》 2017年34卷6期 997-1002页
【摘要】 本文利用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对均三氮苯类衍生物分子结构进行表征,并利用逐步回归结合多元线性回归建立均三氮苯类衍生物除草活性的定量构效关系模型,同时采用内外部双重验证的方法检验模型的稳定性.所建模型相关统计量如下:建模...
【关键词】 三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF);均三氮苯类衍生物;多元线性回归;
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- 结论:
【中文期刊】 杨军锋 赵智东 等 《计算机与应用化学》 2016年33卷1期 75-79页
【摘要】 采用分子全息定量构效关系(HQSAR)方法,研究了21个HIV-1逆转录酶抑制剂苯基氨基吡啶派生物(Phenylaminopyridine,PAP)类化合物的构效关系;探讨了碎片区分参数、分子碎片大小和分子全息长度对模型质量的影响;建立了一...
【关键词】 苯基氨基吡啶派生物;HIV-1逆转录酶抑制剂;分子全息定量构效关系;
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【中文期刊】 孙运佳 吉海东 等 《化学研究与应用》 2015年27卷4期 483-488页
【摘要】 基于拓扑方法计算了16种嘧啶吗啉苯甲酰胺衍生物的电性距离矢量(M1).通过最佳变量子集回归建立其对Hedgehog信号通路抑制活性(IC50)与Mt的最佳三元数学模型(QSAR),其判定系数(R2)及逐一剔除法的交叉验证相关系数(Rer2)...
【关键词】 嘧啶吗啉苯甲酰胺衍生物;Hedgehog信号通路;抑制活性;
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 张艳萍 成忠 等 《浙江科技学院学报》 2015年3期 174-182页
【摘要】 以自组建的食源性血管紧张素转化酶(angiotensin I‐converting enzyme ,ACE)抑制二肽为研究样本,采用氨基酸描述子VHSE(principal component score vector of hydroph...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 刘海春 卢帅 等 《物理化学学报》 2015年31卷11期 2191-2206页
【摘要】 B-Raf激酶在促分裂素原活化蛋白激酶(MAPK)信号转导通路中起着重要作用,已被确定为癌症治疗非常有吸引力的靶标.新型高效B-Raf抑制剂的开发成为癌症治疗的一个热门研究领域.本文以结构多样的B-RafⅡ 型抑制剂为研究对象,联合应用分子...
【关键词】 B-Raf Ⅱ型抑制剂;分子对接;打分评价函数;
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【中文期刊】 卢永忠 康道乐 《食品科学》 2015年36卷15期 299-304页
【摘要】 抗菌肽在医药、食品、农业及水产等领域具有潜在的应用价值,定量构效关系(quantitative structureactivity relationships,QSAR)研究对于指导抗菌肽的优化设计具有重要意义.本文介绍抗菌肽在分子表征及建...
- 概要:
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【中文期刊】 牟佳佳 徐文方 等 《计算机与应用化学》 2015年32卷10期 1215-1218页
【摘要】 氨肽酶N(aminopeptidaseN,APN)在肿瘤细胞的生长、侵袭、转移和新血管生成等过程中发挥着关键作用,是抗肿瘤药物的重要靶点.本文应用比较分子力场分析法(CoMFA)对52个L-精氨酸类APN抑制剂进行了三维定量构效关系分析,得...
- 概要:
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【中文期刊】 刘婧盈 沈飞 等 《世界科技研究与发展》 2014年5期 498-504页
【摘要】 对18个取代联苯类化合物的单一毒性进行了定量结构活性相关(QSAR)分析,建立了最优模型及正辛醇/水分配系数(lgKow )模型。分析表明,量子化学参数模型能很好地预测取代联苯的单一毒性,-lgEC50=0.575 lgKow-40.827...
- 概要:
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【中文期刊】 廖圣良 宋杰 等 《计算机与应用化学》 2014年31卷5期 595-600页
【摘要】 利用量子化学方法对酰胺类驱避化合物与嗅觉引诱物L-乳酸之间的缔合作用进行了定量计算,再利用定量构效关系手段研究了该作用对驱避活性的影响.应用GAUSSIAN软件,计算了酰胺类驱避化合物与L-乳酸之间的缔合能量和几何参数;借助AMPAC和CO...
- 概要:
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【中文期刊】 黄文文 毕毅 等 《烟台大学学报(自然科学与工程版)》 2014年27卷2期 117-121页
【摘要】 应用Surflex-dock对21个水杨酸类酪氨酸蛋白磷酸酯酶1B抑制剂进行分子对接分析,结果显示水杨酸结构的头部深入活性口袋内部,其氢键决定其与酶结合的稳定性,尾部结构及氢键决定其抑制活性.据此,利用Topomer CoMFA建模时将头尾...
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【中文期刊】 吴启勋 李志强 等 《武汉工程大学学报》 2013年35卷6期 35-39页
【摘要】 为了更好地揭示炔烃的各种物理化学性质与结构的关系,根据炔烃分子隐氢结构图的距离矩阵和邻接矩阵,构建了各炔烃的顶点度矩阵和距离加和矩阵,同时基于各炔烃的碳原子数目(N),提出一种新的拓扑指数Tx用于炔烃的热力学性质的研究.拓扑指数Tx具有良好...
- 概要:
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【中文期刊】 朱利兰 《食品科学》 2013年34卷19期 138-141页
【摘要】 基于分子拓扑理论,计算黄酒中13种风味物质分子的电性距离矢量(Mk~d).运用最佳变量子集回归方法,建立上述物质的香味强度与Mk~d的定量构效关系(QSAR)模型.该三元(M2~9、M1~2、M9~9)模型的判定系数(R2)为0.957,估...
- 概要:
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【中文期刊】 易忠胜 叶廷文 等 《桂林理工大学学报》 2013年33卷1期 99-106页
【摘要】 在B3LYP/6-31G*水平上采用高斯09全优化计算了50个P450 1A2抑制剂的量子化学参数,应用基于预测的模型变量选择方法(VSMP)选择描述子最佳子集,建立了最高轨道占有能(EHOMO)和分子体积(k)与萘、内酯衍生物及其他化合物...
【关键词】 细胞色素P450 1A2;抑制剂;定量结构-活性相关;
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【中文期刊】 梁经纬 李佐静 等 《计算机与应用化学》 2013年7期 781-784页
【摘要】 组蛋白去乙酰化酶是分子靶向抗肿瘤药物的一个重要靶点,目前大多数组蛋白去乙酰化酶抑制剂都属于羟肟酸类化合物。本实验利用Tripo公司的Sybyl-X软件包,采用Topomer CoMFA方法对2-哌嗪基噻唑类羟肟酸类化合物进行了三维定量构效关...
- 概要:
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【中文期刊】 冯子雅 冯惠 等 《广州化工》 2013年24期 17-19页
【摘要】 基于拓扑方法计算了13种3-取代硫基-5-(2-羟基苯基)-4H-1,2,4-三唑类杀菌剂的电性距离矢量( MK )。通过最佳变量子集回归建立其对金黄色葡萄球菌(Sa)的抑菌活性(Sm)与Mk的最佳二元数学模型(QSAR),其判定系数(R2...
- 概要:
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【中文期刊】 曾威 黄国栋 等 《原子与分子物理学报》 2013年30卷3期 463-470页
【摘要】 固定酪氨酸为端基对ACE三肽抑制剂进行构效关系研究,采用多元线性回归方法,基于不同描述符建立模型,比较模型的可靠性和准确性.结果表明Z描述子建立的模型最好.定量构效关系研究表明ACE抑制三肽第二位氨基酸的电性参数是抑制活性的最大影响因素.
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【中文期刊】 张倩 张英 等 《广西工学院学报》 2012年23卷3期 95-98页
【摘要】 采用二维拓扑结构描述子—分子电性距离矢量(MEDV),对TIBO类衍生物、非核苷类逆转录酶抑制剂和环脲类化合物等三类抗HIV病毒的药物定量结构活性关系进行了研究.用MEDV描述子对三类药物分子进行结构表征,以VSMP法对所得的91个分子结构...
【关键词】 定量结构-活性相关(QSAR);TIBO类衍生物;环脲类衍生物;
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【中文期刊】 赫敏 张晶 等 《广州化学》 2012年37卷3期 60-66页
【摘要】 定量构效关系研究是目前国际上一个比较活跃的领域。定量结构-活性相关性(QSAR)在新药研制中的研究方法包括取代基多参数法(Hansch法)、比较分子力场分析法(CoMFA)等。QSAR在癌症、AIDS等药物研制方面取得良好的成果,为药物研究...
【关键词】 定量结构-活性相关性;药物设计;方法;
- 概要:
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【中文期刊】 程飞雄 沈杰 等 《农药学学报》 2010年12卷4期 477-488页
【摘要】 采用子结构模式识别结合5种机器学习方法(包括支持向量机、C4.5决策树、k-最近邻法、随机森林法、和朴素贝叶斯法),分别构建了有机化合物对水生和陆地环境毒性评价的两个重要生物靶标--呆鲦鱼(Fathead minnow)和蜜蜂毒性的定性分类...
【关键词】 呆鲦鱼毒性;蜜蜂毒性;定量结构-活性相关性(QSAR);
- 概要:
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【中文期刊】 《亚太热带医药杂志(英文版)》 2009年3期 15-22页
【摘要】 Objective:Inhibition of HIV-1 integrase is an important strategy for the treatment of HIV and AIDS.There-fore,HIV-1 inte...
- 概要:
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【中文期刊】 廖思燕 苗体方 等 《化学物理学报》 2009年22卷5期 473-480页
【摘要】 对一系列具有抗人乳腺癌细胞系MCF-7生物活性的微管蛋白抑制剂-芳基硫代吲哚衍生物(arylthioindole),进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)和对接(docking)研究.在训练集中,建立了具有良好统计质量和预报能力的比较分子...
- 概要:
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【中文期刊】 《重庆大学学报(英文版)》 2007年6卷2期 79-87页
【摘要】 A set of novel structural descriptors (molecular hybridization electronegativity-distance vector, VMEDh) was put forward...
【关键词】 molecular hybridization electronegativity-distance vector;quantitative structure-activity relationship (QSAR);17α-Acetoxyprogesterones;
- 概要:
- 方法:
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【中文期刊】 栾锋 姚小军 等 《兰州大学学报(自然科学版)》 2006年42卷4期 71-78页
【摘要】 用比较分子力场(CoMFA)和比较分子相似性指数分析方法(CoMSIA)对一系列与DNA结合的氮蒽类化合物的潜在抗癌活性进行了3D定量构效关系的研究,对模型中的一些参数进行了优化以期得到最好的三维定量构效关系模型,优化结果显示用CoMSIA...
【关键词】 比较分子力场;比较分子相似性指数分析方法;三维定量构效关系;
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- 结论:
【中文期刊】 李欢 刘志永 等 《环境与健康杂志》 2024年41卷1期 89-92页ISTICCA
【摘要】 定量构效关系(QSAR)是目前应用非常普遍的理论预测物质行为的一种研究方法,并且逐渐广泛应用于环境中物质毒性预测的研究中,有利于节省前期实验时间,节约成本.本文回顾了经典QSAR研究历程以及建模方法,对QSAR模型进行了基于维度的分类,探讨...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 杨紫媛 李晨红 等 《上海中医药大学学报》 2024年38卷2期 71-82页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的:运用定量结构-活性关系(QSAR)机器学习模型和分子对接技术预测丹参治疗慢性疼痛相关的活性成分,并结合"久病致瘀"理论以及网络药理学探讨丹参治疗慢性疼痛的分子机制.方法:首先通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和人类基因组...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 梁琦 何俊 等 《华西药学杂志》 2023年38卷4期 359-365页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 筛选核糖原合成酶激酶3β(GSK3β)/程序性死亡配体1(PD-L1)双靶点抑制剂,并预测其活性.方法 采用药效团模型和分子对接方法筛选ChemDiv数据库,得到排序靠前的化合物,并通过定量构效关系(QSAR)模型预测其活性.结果 得...
【关键词】 程序性死亡配体1;核糖原合成酶激酶3β;药效团模型;
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 李双星 李一昊 等 《药物评价研究》 2023年46卷9期 2030-2036页ISTICPKUCA
【摘要】 人工智能(AI)和机器学习不仅使药物发现和开发实现了质的飞跃,而且帮助药物开发进程进入现代化.机器学习和深度学习算法已应用于药物发现各个阶段,如先导化合物的筛选、多肽合成及小分子药物的发现、最佳给药剂量的确定、类药化合物的设计和药物不良反应...
- 概要:
- 方法:
- 结论: