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【中文期刊】 唐鹤云 杨啸林 等 《中国生物医学工程学报》 2011年5期 685-689页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 研究氨基酸结构对蛋白质结构预测具有重要意义.目前主要采用二面角来描述氨基酸的几何结构,但是角度的方法比较抽象,并且难量化地评估结构差异的程度.提出一种描述氨基酸结构差异的新方法——C'散点图.这种方法用散点图的形式在三维坐标图上显示羧基碳原...
【中文期刊】 陆伟刚 张翠仙 等 《天然产物研究与开发》 2006年18卷6期 893-895页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本文对Δ5-3β,7β-二羟基甾醇(1～3)和Δ5-3β,7α-二羟基甾醇(4～6)的一些核磁共振波谱特征进行了比较.活性测试表明化合物1～6对乙酰胆碱酯酶(AChE)无明显的抑制活性,对丁酰胆碱酯酶(BuChE)则有较强的抑制活性,其中2...
【关键词】 Δ5-3β,7β-二羟基甾醇； Δ5-3β,7α-二羟基甾醇； 胆碱酯酶；
【中文期刊】 梁力丹 李俊杰 《甘肃水利水电技术》 2013年9期 31-34页
【摘要】 文章以安县芭蕉坪滑坡为研究对象，首先采用赤平投影法分析确定边坡岩体中结构面的不利空间组合，再利用三维离散元软件3DEC模拟岩质边坡在不同结构面组合情况下的位移变形特征，以此分析该岩质边坡不同结构面组合之间的二面角效应，发现当岩层层面产状与坡...
【中文期刊】 张红亮 李立 《中国生物化学与分子生物学报》 2009年25卷8期 770-775页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 提出一种在给定构象下计算蛋白质多肽链中所有二面角的新方法.通过总体最小二乘法将每个肽单位中的6个原子拟合为1个肽平面,将连续平面之间包含的角定义为二面角,并以数值实验证明了该方法的有效性.精确的二面角值对很多蛋白质分析方法意义重大,特别是将...
【中文期刊】 郝瑞林 单树花 等 《山西农业科学》 2023年51卷9期 1050-1059页
【摘要】 利用制备型高效液相色谱仪从桦褐孔菌中分离并鉴定出12种酚类化合物,通过钼酸铵显色法分析酚类化合物对过氧化氢酶的影响.结果表明,原儿茶醛、Phelligridin E 和Phelligridin I显示出增强过氧化氢酶活性的能力,特别是Phe...
【中文期刊】 李亭 刘俊 等 《小型微型计算机系统》 2022年43卷1期 203-209页
【摘要】 预测蛋白质三维结构对了解其生物功能、疾病发病机理研究、药物研发等具有重大意义.为了提高蛋白质结构预测的精度,提出了一种基于距离约束和二面角优化的蛋白质结构预测方法(Distance Constraint and Dihedral Angle...
【中文期刊】 相艳 朱爽 等 《辽宁化工》 2022年51卷10期 1362-1364页
【摘要】 采用多组分反应方法,以对氯苯甲醛、丙二腈和取代3-氰乙酰基吲哚三组分为原料,在微波条件下简便快速合成2-氨基-3,5-二氰基-4-(对氯苯基)-6-(取代吲哚基)吡喃化合物.产物结构通过熔点、红外、核磁共振谱和高分辨质谱等方法进行了表征,并...
【中文期刊】 蔡棣 田浤 等 《中国药科大学学报》 2017年48卷2期 227-232页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 建立含有L-对硝基苯丙氨酸(p-nitro-L-phenylalanine,pNO2Phe)蛋白的分子动力学模拟方法,分析了含有pNO2Phe的蛋白具有免疫原性的构效关系,为其他含有非天然氨基酸蛋白的动力学模拟研究提供参考.使用CGenFF...
【关键词】 纳米分子动力学(NAMD)； 可视化分子动力学(VMD)； 分子动力学模似；
【中文期刊】 徐为人 刘成卜 等 《中草药》 2004年35卷4期 375-378页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的水飞蓟宾RRRR对映体分子中存在多个可变的二面角,可以产生许多立体构象,旨在从理论上寻找其合理构象.方法采用二面角系统搜索后,结合AM1方法确定主要构象,以B3LYP/6-31G*方法优化构型后,在B3LYP/3-21G水平计算了振动频...
【中文期刊】 李章维 肖璐倩 等 《计算机科学》 2020年47卷7期 161-165页
【摘要】 蛋白质能量模型的不精确性导致数学上的最优解并不一定对应其稳定的天然态结构,同时其巨大的构象空间使得现有方法也极易收敛到局部最优解.针对蛋白质结构能量模型不精确和高维构象空间采样可靠性低的问题,在进化算法的基础上,提出了一种基于二面角相似度的...
【中文期刊】 朱晓彤 张荣丽 等 《徐州医学院学报》 2013年33卷3期 151-154页 ISTICCA
【摘要】 目的 研究1,4-二苯基-6-苯基氨基-1,3,5-三嗪-2(1H)-硫酮(分子式C21H16N4S,相对分子质量356.44)的合成方法和其单晶结构.方法 先将一定量的苄脒、氢氧化钠和N,N-二甲基甲酰胺(DMF)混合放入10 ml反应器...
【关键词】 1,3,5-三嗪衍生物； 合成； 微波辐射；
【中文期刊】 赵宏涛 黎云燕 等 《天津医科大学学报》 2012年18卷3期 320-323页 ISTIC
【摘要】 目的:研究人细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)与抑制剂roscovitine相互作用的机制.方法:利用分子动力学模拟的方法研究roscovitine与CDK2之间的相互作用.结果:和空载CDK2相比,roscovitine的存在会使RMS...
【关键词】 细胞周期蛋白依赖性激酶2； Roscovitine； 分子模拟；
【中文期刊】 梁静 刘梦源 等 《天津医科大学学报》 2011年17卷4期 437-439页 ISTIC
【摘要】 目的:研究激动剂能够使过氧化物酶体增殖物激活受体-γ (PPAR-γ)的α螺旋结构更稳定的原因以及PPAR-γ可能的活化机制.方法:利用分子动力学模拟的方法研究激动剂对PPAR-γ的α螺旋的诱导契合效应.结果:激动剂的存在能够增加PPAR-...
【关键词】 过氧化物酶体增殖物激活受体-γ； 激动剂； 分子动力学模拟；
【中文期刊】 郭城 杨洪乾 等 《药学进展》 2010年34卷4期 159-163页 ISTICCA
【摘要】 蛋白质侧链构象的准确预测很大程度上决定了建模的质量以及利用计算机手段进行未知蛋白质准确预测的可行性.综述蛋白质侧链构象预测的研究进展,介绍蛋白质侧链构象的基本概念、侧链预测的基本过程、旋转异构体库的发展以及侧链预测软件的应用.
【中文期刊】 赵丹 宫利东 等 《北华大学学报(自然科学版)》 2008年9卷3期 213-216页 ISTICCA
【摘要】 对尿素与二肽的相互作用的研究可为探讨尿素致蛋白质变性的机理提供基础.应用ABEEM/MM方法,对尿素和缬氨酸二肽间的相互作用进行了理论研究.结果 表明,尿素对缬氨酸二肽的几何结构影响很大,使其骨架二面角发生了明显的扭转.此外,用该方法计算的...
【关键词】 ABEEM/MM浮动电荷分子力场； 尿素； 缬氨酸二肽；
【中文期刊】 王素娟 裴月湖 等 《中国药物化学杂志》 2003年13卷2期 80-82页 ISTICCA
【摘要】 目的阐述某些环状二苯基庚烷类化合物在1H-NMR谱中异常位移的原因.方法利用分子力场MM2法计算环状二苯基庚烷类化合物的空间优势构象,分析MM2法与X-射线单晶衍射法的异同,根据分析结果寻找某些环状二苯基庚烷类化合物在1H-NMR谱中异常位...
【中文期刊】 刘述斌 荣春英 等 《物理化学学报》 2015年31卷11期 2057-2063页
【摘要】 根据密度泛函理论,分子的电子密度确定了该体系基态下的所有性质,其中包括结构和反应活性.如何运用电子密度泛函有效地预测分子反应活性仍然是一个有待解决的难题.密度泛函活性理论(DFRT)倾力打造这样一个理论和概念架构,使得运用电子密度以及相关变...
【关键词】 Rényi熵； Tsallis熵； Onicescu信息能；
【中文期刊】 陈优生 《广州化学》 2015年40卷4期 55-58页
【摘要】 以2-甲基-3-硝基苯甲醛为原料,通过还原、氯代和氰代单元反应合成出2-甲基-3-硝基苯乙腈,经过制备单晶并用X-射线衍射表征其为2-甲基-3-硝基苯乙腈晶体结构,化合物属单斜晶系,空间群为P21/C,分子式CgH8O2N2,Mr=176....
【关键词】 2-甲基-3-硝基苯乙腈； X-射线衍射； 晶体结构；
【中文期刊】 邓理丹 苏宇 等 《河南科学》 2014年32卷3期 343-346页
【摘要】 采用密度泛函理论,在B3LYP/6-31G (d)水平下,对苯并[1,2-b:4,5-b']二噻吩(BDT)-thieno[3,4-b]thiadiazole (TD)的低聚物和聚合物进行了理论计算.其中,BDT为电子供体,TD为电子受体,...
【关键词】 密度泛函理论； 苯并[1,2-b； 4,5-b']二噻吩；
【中文期刊】 周长会 吴启勋 等 《陕西理工学院学报（自然科学版）》 2013年6期 55-58页
【摘要】 采用密度泛函理论在B3LYP/6-31G（ d）水平上对苯基亚磷酸甲酯分子的几何结构进行优化，计算了该分子的分子轨道能、键长、键角、二面角、慕利肯电荷分布及轨道电子激发态，这些分子量化计算结果可为研究苯基亚磷酸甲酯分子性质提供理论基础。
【关键词】 密度泛函理论( DFT)； 苯基亚磷酸甲酯； 慕利肯电荷；
【中文期刊】 刘鸿雁 李岩 《吉林化工学院学报》 2013年30卷11期 10-12,21页
【摘要】 采用DFT//B3 LYP方法,在6-31G*基组下,对8-羟基喹啉锂(LiQ)及其衍生物基态结构进行优化.在基态几何优化基础上,用含时密度泛函理论(TD-DFT)计算吸收光谱.用CIS/6-31G*方法优化8-羟基喹啉锂单体的S1激发态结...
【中文期刊】 杨丽君 刘茜 等 《计算机与应用化学》 2012年29卷4期 461-464页
【摘要】 采用Gaussian03程序用MP2/6-311g (2d,p)方法计算了三组(9个)五元杂芳环与苯环处于4种构型时相互作用能随二聚体各参数变化的情况,在此基础上用正交实验设计方法探索4种构型下环间相互作用能的主要影响因素及二聚体各参数的...
【中文期刊】 蒋启华 张海东 等 《原子与分子物理学报》 2012年29卷4期 603-607页
【摘要】 采用DFT及TD-DFT方法在B3LYP/6-311++G**水平对S-酮洛芬电子结构及手性光学性质进行了理论研究.研究发现,羰基与两个苯环发生共轭；由于C(20)与C(11)上H原子之间存在空间位阻,羰基与环A及环B之间均存在一定的二面角...
【中文期刊】 江峰 凌云 等 《化学研究与应用》 2011年23卷9期 1235-1239页
【摘要】 采用Sonagashira偶联反应和N-烷基化反应合成了含有咔唑和偶氮苯的乙炔衍生物:3-乙炔基-9-(4-[4-(硝基)苯基偶氮苯]氧)亚丁基咔唑3.其结构通过IR,1H NMR,13C NMR,元素分析和X-射线单晶衍射法测定.标题化合...
【中文期刊】 李志锋 李会学 等 《原子与分子物理学报》 2010年27卷2期 226-232页
【摘要】 采用密度泛函B3LYP/6-31+G·方法对多巴胺DA的构象异构及其稳定性进行了研究. 结果表明,势能面上存在6种稳定构象和8种构象转换过渡态, 构象之间主要通过C1-O7 [二面角T1: H15O7C1C6], C2-O8 [二面角T2:...
【中文期刊】 兰子平 覃松 等 《内江师范学院学报》 2010年25卷10期 42-45页
【摘要】 采用密度泛函理论在B3LYP/6-311+G*水平上对该化合物可能的两种异构体进行分子几何结构优化和频率计算.结果 表明,最稳定异构体分子的酰胺基团与噻唑环共平面,苯环与噻二唑环共平面,分子由两个共轭平面组成,其二面角为30°左右.并对其进...
【关键词】 N-(1,3-噻唑-2-基)-1,2,3-苯并噻二唑-7-甲酰胺； 光谱； 热力学性质；
【中文期刊】 黄银生 杨京霞 等 《阜阳师范学院学报（自然科学版）》 2010年27卷1期 27-30页
【摘要】 应用密度泛函理论为基础的量子化学计算方法研究了周边氢键和Mg2+的轴向配位体对叶绿素分子结构的影响.结果表明:Mg2+的配位体(水和甲硫氨酸)使叶绿素a(Chla)分子的结构发生了很大的变化;由于水分子中的氧原子对Mg2+的吸引致使叶绿素a...
【中文期刊】 韩莹 屠树滋 等 《计算机与应用化学》 2004年21卷5期 786-788页
【摘要】 目的:研究新型香豆素磺酰脲化合物降血糖作用与化学结构之间的关系,为进一步设计合成该类化合物提供理论依据.方法:选择10个降血糖活性较强的化合物,利用MM2分子力学和CNDO/2量子化学方法计算有关结构参数并进行定量构效关系研究.结果:香豆素...
【中文期刊】 林鸿 冯云龙 《应用基础与工程科学学报》 2003年11卷3期 236-240页
【摘要】 合成了2-环己酮-1,3-二肟,并测定了该分子的晶体结构.晶体属单斜晶系,空间群为P 21/c,晶胞参数:a=1.0255(2),b=0.5687(1),c=1.2953(3)nm,β=107.01(3)°,V=0.7223(2)nm3,Z...
【关键词】 2-环己酮-1,3-二肟； 合成； 晶体结构；
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