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【中文期刊】 罗春清 杨焕明 《遗传》 2002年24卷3期 310-314页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 全基因组测序主要有二种策略,一种是分级鸟枪法测序,另一种是全基因组鸟枪法测序.微生物是一种十分重要的遗传资源,运用全基因组鸟枪法可以方便、快捷地完成其基因组的测序任务.本文对微生物全基因组鸟枪法测序中文库构建、插入片段的长短比例、反应投入量...
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【学位论文】 作者：蔡涛 导师：魏丽萍 北京大学 生物学 生物信息学（博士） 2007年
【摘要】 随着测序技术的进步和成本的降低，我们一方面希望对更多的物种进行测序从中了解生命的本质，另一方面，我们希望能从海量基因组序列数据中快速有效地挖掘真正有用的信息。本论文针对这些问题，对基因组测序，基因组功能注释和比较进行研究。 目前，...
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【学位论文】 作者：邹寰 导师：孙明 华中农业大学 生物学 生物化学及分子生物学（硕士） 2007年
【摘要】 本研究分为两部分，第一部分是用WGS法进行Bt YBT1520的全基因组测序工作。具体流程是包括：第一，构建好的文库进行末端测序，用phred程序将色谱图文件转变为phd格式的数值信号文件，phd2fasta将phd文件转变为fasta文件...
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【学位论文】 作者：张悦庆 导师：瞿涤 复旦大学 生物学 病原生物学（硕士） 2002年
【摘要】 自从1995年美国的TIGR（The Institute of genomic research ）中心采用全基因组“鸟枪法”（Shotgun）测序策略成功地测定了世界上首个细菌（流感嗜血杆菌）的完整基因组序列后,这种测序方法已被广泛接受,...
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【中文期刊】 唐其 马小军 等 《广西植物》 2015年6期 786-791页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 罗汉果是广西特有药用及甜料植物，其主要成分之一甜苷 V 作为天然、非糖甜味剂，具有广阔的开发前景，但罗汉果目前完全来自于栽培，适生区狭窄，连作障碍严重，加之含量低导致甜苷 V 生产成本居高不下，严重限制了其应用。为了减少盲目性，在大规模全基...
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【中文期刊】 肖安 张雨田 等 《遗传》 2013年35卷4期 547-548页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 <篇首> 斑马鱼(Danio rerio)是目前遗传发育研究领域最为活跃的模式脊椎动物之一, 有多个大型研究计划正在进行中.本文选择其中的一部分进行简要介绍.1 斑马鱼基因组测序计划斑马鱼基因组测序计划始于2001 年, 最初由英国Sanger...
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【中文期刊】 李明 申晓冬 等 《第三军医大学学报》 2006年28卷6期 539-542页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的采用大片段克隆策略对难测序铜绿假单胞菌噬菌体PaP1基因组进行克隆及测序.方法用限制性内切酶AatⅡ将噬菌体PaP1基因组DNA切成几个大片段,分别进行末端修饰后与线性化的大片段克隆载体pYLTAC7连接,将连接产物电转化感受态细胞,筛...
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【中文期刊】 张晓梅 单祥年 等 《遗传》 2004年26卷6期 849-853页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 通过建立麂属动物小麂线粒体DNA文库、鸟枪法测序,获得了小麂线粒体基因组全序列并对其基因组成、蛋白质的编码序列、tRNA基因等结构作了详细分析,这也是国内有关哺乳动物线粒体基因组全序列的首次报道.与其他哺乳动物线粒体基因组全序列的比较研究发...
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【中文期刊】 黄建军 胡晓梅 等 《微生物学杂志》 2004年24卷5期 53-53页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 <篇首> 在噬菌体全基因组测序工作中,基因组结构性质和末端鉴定是一个重要内容,只有在明确了末端的性质与结构之后,对一个生物体的测序工作才告结束.噬菌体PaP2是我室新近分离的1株溶原性铜绿假单胞菌噬菌体,以噬菌体PaP2基因组为模板,经过鸟枪法...
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【中文期刊】 邬亭亭 魏强 等 《西部医学》 2018年30卷12期 1728-1733,1737页ISTIC
【摘要】 目的 研究分枝杆菌噬菌体33D的基因组特性并探索其抗结核治疗的潜力.方法 通过鸟枪法完成33D全基因组测序;使用DNAStar、TRF、Promoter predictions、tRNAscan-SE、Glimmer、BLAST软件分别对3...
【关键词】 分枝杆菌噬菌体33D；基因组；结核分枝杆菌；
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【中文期刊】 朱大强 李存 等 《生物信息学》 2011年09卷2期 106-112页ISTIC
【摘要】 新一代测序平台的诞生推动了对全基因组鸟枪法测序数据的拼接算法和软件的研究,自2005年以来多种用于高通量测序的序列拼接软件已经被开发出来,并且在不断地进行改进以提高拼接效果.本文利用目前广泛使用的高通量测序拼接软件Velvet、AbySS、...
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【中文期刊】 杨璐 熊向华 等 《生物技术通讯》 2010年21卷6期 775-778页ISTICCA
【摘要】 目的:建立甲基营养菌MP681基因组文库,用于鸟枪法测序.方法:提取MP681基因组DNA,经超声随机片段化及T4 DNA聚合酶末端修平处理后,与经SmaⅠ酶切、小牛肠碱性磷酸酶(CIP)去磷酸化处理的pUC19载体连接,电击转化大肠杆菌D...
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【中文期刊】 刘先凯 王恒樑 等 《生物技术通讯》 2004年15卷5期 481-485页ISTICCA
【摘要】 本文综述了微生物全基因组测序的基本方法,数据收集和组装,序列缺口的填充、全基因组序列注释.同时对微生物基因组的研究现状和重大意义也作了简单概述.
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【中文期刊】 孙全 何晓红 等 《四川大学学报（自然科学版）》 2014年51卷6期 1330-1334页
【摘要】 本研究基于下一代测序技术,对黄连基因组进行了勘测,构建了两个插入片段大小分别为200bp和500bp的文库,进行了深度约30X的测序.通过测序获得了54Gb的原始数据,过滤后得到44.8G数据.通过SOAP de nove软件组装后初步获得...
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【中文期刊】 申欣 田美 等 《海洋学报（中文版）》 2012年34卷2期 136-142页
【摘要】 线粒体基因组的获得传统上通常是采取长PCR结合鸟枪法或步移法测序.近年来新一代测序技术蓬勃发展,以454,Solexa和SOLiD测序平台为代表.应用新一代高通量测序技术(Solexa)并结合巢式PCR扩增,完成了大室别藻苔虫(Membra...
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【中文期刊】 张晓梅 张海军 等 《南京师大学报（自然科学版）》 2003年26卷1期 74-77页
【摘要】 通过建立麂属动物小麂线粒体DNA文库、鸟枪法测序,我们获得了小麂线粒体基因组全序列的初步信息,这也是国内有关哺乳动物线粒体基因组全序列的首次报道.与其他哺乳动物线粒体基因组全序列的比较研究发现:全长为16354bp的小麂线粒体基因组同样编码...
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【中文期刊】 谭银玲 李明 等 《中华烧伤杂志》 2006年22卷2期 96-100页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的对分离的铜绿假单胞菌噬菌体PaP1进行全基因组测序,并进行初步的生物信息学分析,为噬菌体的改造及其治疗奠定基础.方法采用鸟枪法随机测序和重叠群组装的策略对PaP1进行基因组测序,并通过EditSeq、开放读码框架(ORF)finder、...
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