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【中文期刊】 傅东升 艾克热木江·木合热木 《中国组织工程研究》 2025年29卷20期 4379-4388页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:多指畸形患者中参与Heghog信号通路的一些转录因子发生异常表达,这些转录因子调控大量靶基因的表达,从而影响细胞的功能.目的:通过单细胞转录组分析多指畸形患者的转录组特征.方法:从GEO公共数据库中下载4例多指畸形患者细胞间质和上皮细...
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【中文期刊】 杨品 任振华 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷7期 1196-1213页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 多模态组学数据的联合运用在揭示细胞异质性和解析细胞命运调控机制方面具有重要意义,目前已有多种方法被开发,用于处理不同组学模态数据的整合.本研究通过对应用于不同整合任务的多种数据整合方法进行性能评测,为相关领域的研究提供有益参考.使用6个联合...
- 概要：
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【中文期刊】 徐琪 禹雷 等 《海南医学》 2024年35卷11期 1533-1544页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨结直肠癌恶性转变过程中的分子特征及其调控网络扰动,深入剖析结直肠癌恶性转变的微环境异质性并识别潜在治疗靶点.方法 首先从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中收集单细胞转录组测序数据,从欧洲分子生物学实验...
- 概要：
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【中文期刊】 蔡浩洋 《四川师范大学学报（自然科学版）》 2022年45卷4期 452-461页
【摘要】 随着测序技术的发展,目前单细胞测序已经成为生命科学各研究方向的前沿技术.单细胞测序技术是指在单个细胞的水平上对其携带的遗传信息进行高通量测序分析的技术.在2011年和2013年,单细胞测序技术分别被《Nature Methods》和《Sci...
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【学位论文】 作者：杨秀辉导师：吴昊 丁俊 山东大学 计算机科学与技术 人工智能（硕士） 2024年
【摘要】 单细胞多组学技术阐明了复杂的细胞状态，为细胞动力学和疾病提供了变革性的见解。然而，尽管该技术已取得了长足的发展，但其多多种组学数据的分析与集成方面仍面临着一定的挑战。相对于scRNA-seq数据保有量高、稳健性好等，scATAC-seq等数...
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【学位论文】 作者：王金章导师：张岩 哈尔滨工业大学 生物医学工程 生物医学工程（硕士） 2024年
【摘要】 单细胞转录组学对研究复杂生物系统产生深远影响，通过常规测量数千个细胞的基因表达，现已能够构建全生物体细胞图谱。然而，转录组仅仅是定义细胞类型和状态以及确定其功能的众多参数中的一种。随着单细胞测序技术的发展，可以对同一个细胞同时检测转录组和染...
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【学位论文】 作者：许震导师：孙磊 高海东 扬州大学 其他 通信工程（含宽带网络，移动通信等）（硕士） 2024年
【摘要】 相对于传统的批量测序技术，单细胞组学技术具有单细胞分辨率的优点，已成为研究细胞异质性、发育过程、细胞间通信和疾病机制等问题的重要手段。特别是单细胞多组学技术能够获取同一细胞的不同组学层面信息。其中，配对的单细胞转录组测序（scRNA-seq...
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【学位论文】 作者：陈丹阳导师：唐洲平 华中科技大学 临床医学 神经病学（硕士） 2023年
【摘要】
目的：胶质母细胞瘤（Glioblastoma，GBM）预后较差，目前的治疗不够个性化和精准化。本研究旨在基于多组学数据构建GBM分子分型并开发一种稳健的预后预测模型，探索具有亚类特异性的靶向药物，改善GBM临床疗效。
方法：本研究...
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【学位论文】 作者：王筱颖导师：刘丙强 马勤 山东大学 数学 运筹学与控制论（博士） 2023年
【摘要】 中心法则是生物体进行各项生命活动的所遵循的基本原则。随着测序技术的发展，基因组，转录组和蛋白质组的多种组学数据海量涌现，为深入研究生物体各项活动的内在机理提供了重大机遇。基于转录在中心法则中的轴承地位，利用转录组学数据研究生物体生命活动过程...
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【学位论文】 作者：阙千荟导师：陈佳奇 哈尔滨工业大学 统计学 应用统计（硕士） 2023年
【摘要】 单细胞多组学指的是在同一细胞中联合检测两个或更多组学数据的方法。从不同组学数据中整合信息通常可以达到更高的分析精度，并更有利于探索和识别细胞特征，以及研究个体细胞的异质性。然而，不同组学数据的异质性对数据分析带来了巨大的挑战。如何有效地对不...
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【学位论文】 作者：马科馨导师：蒋庆华 哈尔滨工业大学 生物医学工程 生物医学工程（硕士） 2022年
【摘要】 单细胞多组学技术是指在同一个细胞中同时测量多个不同组学数据的前沿测序技术。这种技术避免了传统测序中一些难以消除的误差，如不同批次、不同试剂处理等；减少了在数据处理过程中复杂的数学计算；实现了单细胞层次上同步解析多维度特征，从而在潜在遗传问题...
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【学位论文】 作者：陈嘉鋆导师：杜红丽 华南理工大学 生物学 生物学（硕士） 2021年
【摘要】 乳腺癌具有高度的瘤间和瘤内异质性，对临床诊断分型和治疗效果评估提出巨大挑战。单细胞转录组测序技术的应用，为研究乳腺癌的肿瘤异质性，耐药发生机制，免疫微环境可塑性以及提出新的临床治疗方案提供了可能。然而目前应用单细胞转录组技术对乳腺癌相关的研...
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【中文期刊】 刘博 孙超 等 《吉林大学学报（医学版）》 2025年51卷2期 437-446页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:采用生物信息学方法筛选多原发肺癌(MPLCs)的差异表达基因(DEGs),分析其生物学功能以及对肺腺癌预后的影响.方法:在高通量基因表达综合数据库(GEO)下载GSE200972单细胞转录组测序数据.采用R软件进行数据初步处理后,采用...
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【中文期刊】 廖恒渐 莫显伟 《贵州科学》 2025年43卷2期 18-24页
【摘要】 目的:本研究通过分析单细胞数据集和bulk数据集,确认结直肠癌中的主要免疫细胞群及其功能特性.方法:将来自GEO数据库的数据集GSE87211、GSE29638、GSE143985 和GSE110224 分别按照已知免疫元基因分为两个免疫浸...
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【中文期刊】 严涛 房林 《包头医学院学报》 2024年40卷7期 15-22页CA
【摘要】 目的:建立基于乳腺癌脂肪酸代谢(fatty acid metabolism,FAM)相关基因的预后模型,并对乳腺癌的FAM 模型进行评估预后.方法:整理乳腺癌单细胞 RNA 测序(single-cell RNA sequencing,scR...
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【中文期刊】 刘瓅莹 吴巧凤 《世界科学技术-中医药现代化》 2023年25卷11期 3515-3522页ISTICPKUCSCD
【摘要】 单细胞多模态测序技术是近年来检测细胞类型特异性和探索基因调控细胞过程的前沿生物技术方法,根据单细胞不同组学的联合运用,可形成13种组合模式,从而形成了"多维度"、"多尺度"测序的特点.本文从针灸单细胞多模态数据库的建立、数据的预处理、预测模...
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【中文期刊】 龚其雨 陈磊 《上海交通大学学报（医学版）》 2022年42卷4期 472-481页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的·探究循环及浸润性B细胞亚群在结直肠癌免疫微环境中的作用,探寻B细胞发育的潜在驱动机制,分析免疫微环境中B细胞与其他免疫细胞的互作关系及通信分子的功能,并寻找可能的调控途径以促进B细胞的抗肿瘤效应.方法·收集3例结直肠癌患者的癌旁(正常...
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【中文期刊】 邱丹丹 《肾脏病与透析肾移植杂志》 2022年31卷3期 256-260页ISTICCSCDCA
【摘要】 近10年来,通过单细胞RNA测序获取单个细胞基因表达谱、鉴定细胞类型和功能已取得重大进展.然而细胞在不同组织内的空间位置信息对于进一步鉴定细胞类型,明确细胞功能变化和细胞间相互作用,探索组织内环境改变及其同疾病发生发展的关系至关重要.空间转...
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【中文期刊】 滕小娟 林静霞 等 《皮肤性病诊疗学杂志》 2022年29卷3期 197-205页
【摘要】 目的 研究皮肤自然衰老过程中基因表达和免疫微环境的动态变化.方法 收集GTE x项目中699个皮肤组织转录组测序数据(RNA-seq),依据年龄段分为年轻组(20～39岁)和衰老组(60～79岁),进行差异基因表达分析.用CIBERSORT...
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【中文期刊】 李丁 王婉瑩 等 《中草药》 2025年56卷2期 731-741页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 整合多组学策略为中药安全性评价开辟了新的研究视角,单细胞转录组学、蛋白质修饰组学、代谢组学、影像组学等前沿组学技术实现了从分子、细胞、组织到系统乃至整体不同层面揭示中药的毒性效应机制,帮助识别中药潜在毒性成分并发现特征生物标志物.基于中国知...
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【中文期刊】 顾蕾 张誉露 等 《生物技术通报》 2024年40卷11期 125-141页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 单细胞多组学技术为生命科学和医学注入新的活力,能够从更微观的细胞尺度、更高维的时空角度、更交叉的组学视野来探索生命的未知、拓展医学的边界.单细胞蛋白质组学是从时间和空间上研究单个或单一类型细胞的蛋白质表达异质性.尽管存在通量、灵敏度、分辨率...
【关键词】 单细胞蛋白质组学；质谱；细胞尺度的时空蛋白质组学技术；
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