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【中文期刊】 李俊霖 郭淑红 等 《中草药》 2024年55卷7期 2366-2374页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 以蒙古黄芪Astragalus membranaceus var.mongholicus为材料,解析其叶绿体基因组的序列特征,并进行系统发育分析.方法 利用Illumina NovaSeq测序平台对蒙古黄芪叶绿体全基因组进行测序,完成...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 梁莹莹 吴文如 等 《中草药》 2024年55卷19期 6721-6729页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析苹婆Sterculia monosperma的叶绿体基因组结构信息,以及苹婆属的种间亲缘关系,为苹婆属的系统发育和物种鉴定研究提供参考.方法 基于DNBSEQ测序平台,对苹婆叶绿体基因组进行测序,利用生物信息学手段进行组装、注释和...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 龚秋怡 董姝洁 等 《中草药》 2024年55卷12期 4150-4158页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 以牛茄子Solanum capsicoides新鲜叶片为材料,对叶绿体基因组序列进行组装、注释和分析,探究牛茄子的序列特征和同属其他物种的系统发育关系.方法 基于Illumina HiSeq高通量测序,获得牛茄子完整叶绿体基因组序列,...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张瑜 杜晨晖 等 《中草药》 2023年54卷15期 4981-4991页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 以桔梗Platycodon grandiflorus为材料,分析其叶绿体基因组特征,探究不同地区桔梗叶绿体基因组的差异及桔梗科其他物种的系统发育关系.方法 利用Illumina NovaSeq测序平台对桔梗叶绿体全基因组进行测序,完成...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 刘雄伟 刘畅 等 《生物技术通报》 2023年39卷1期 232-242页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 基于Illumina平台对朱砂根和红凉伞叶绿体全基因组进行测序,利用生物信息学比较叶绿体基因组结构特征与变异程度,旨在明确朱砂根(Ardisia crenata)及红凉伞(Ardisia crenata var.bicolor)叶绿体基因组...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 张韵洁 李德铢 《植物分类与资源学报》 2011年33卷4期 365-375页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 系统发育基因组学是由系统发育研究和基因组学相结合产生的一门崭新的交叉学科.近年来,在植物系统发育研究中,基于叶绿体基因组的系统发育基因组学研究优势渐显端倪,为一些分类困难类群的系统学问题提出了解决方案,但同时也存在某些问题.本文结合近年来叶...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 宋菊 龙月红 等 《中草药》 2017年48卷24期 5070-5075页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 获取五加科叶绿体基因组的结构特征以及进化关系.方法 以已测序完成的10个属的20种五加科植物叶绿体基因组为研究对象,系统比较基因组间的差异,分析4个IR边界扩张与收缩情况,并以近缘物种当归为外类群,使用MEGA 4.0构建系统进化树,...
- 概要：
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【中文期刊】 高娜娜 赵志礼 等 《中草药》 2017年48卷15期 3210-3217页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 叶绿体普遍存在于绿色植物中,ycf15基因位于叶绿体基因组IR区,长度一般为250～550 bp,高度保守,目前对该基因研究较少.就有限的研究成果来看,其独特的序列结构及其显现的丰富多样的遗传信息不仅具有一定的物种鉴定意义,而且在植物系统进...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 荣正普 王杰敏 等 《中草药》 2025年56卷1期 269-281页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 为探究黄芩属药用植物叶绿体基因组密码子的使用偏好性及其影响因素,为黄芩属药用植物遗传育种、资源保护等研究提供理论依据.方法 从美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库中下载了16种黄芩属药用植物的叶绿体基因组,使用Codon W 1...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 赵艳林 陈渊 等 《中草药》 2025年56卷5期 1731-1746页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 以药用植物宽叶十万错Asystasia gangetica为研究对象,解析其叶绿体基因组结构特征,探究宽叶十万错在爵床族中的系统发育关系;方法 利用Illumina NovaSeq 6000测序平台对宽叶十万错叶绿体基因组进行测序,对...
- 概要：
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【中文期刊】 李斌 苏香萍 等 《生物技术通报》 2025年41卷3期 240-254页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]探究玄参科(Scrophulariaceae)叶绿体基因组(chloroplast DNA,cpDNA)的特征及其系统发育关系.[方法]对湖北玄参进行DNA测序,通过组装与注释获得了其叶绿体基因组序列,并从GenBank下载46条玄...
- 概要：
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【中文期刊】 杜雨 李效雄 等 《中草药》 2024年55卷4期 1316-1325页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究枸杞密码子的使用模式及影响因素.方法 基于中国枸杞Lycium chinense、黄果枸杞L.barbarum和白果枸杞L.ruthenicum的叶绿体基因组,利用CodonW 1.4.2软件、Python软件和Excel软件等分...
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【中文期刊】 马海霞 张亚颖 等 《中草药》 2024年55卷17期 5972-5981页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究角蒿属Incarvillea Juss.药用植物叶绿体基因组特征、变异程度及系统发育关系,为角蒿属物种分子鉴定、系统发育及药用植物资源保护等研究提供参考.方法 以5种角蒿属药用植物为研究对象,通过高通量测序获取密生波罗花叶绿体基因...
- 概要：
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【中文期刊】 张晶晶 袁庆 等 《中草药》 2024年55卷9期 3085-3097页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 揭示忍冬属囊管组16种植物叶绿体基因组特征及系统发育关系.方法 以16种囊管组植物为研究材料,利用CodonW、EMBOSS、Excel等软件分析其叶绿体基因组密码子使用偏好性;利用IRscope、mVISTA、DNAsp进行叶绿体基...
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【中文期刊】 刘晓轩 陈思雅 等 《中草药》 2024年55卷15期 5201-5211页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于文献计量学对国内外中药DNA条形码的相关研究进行分析,进而了解此领域研究现状,揭示研究热点和趋势以及提供参考和指导.方法 收集整理Web of Science核心合集数据库和中国知网(CNKI)数据库中2000年至2023年12月...
- 概要：
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【中文期刊】 杨雨青 谭娟 等 《生物技术通报》 2024年40卷2期 20-30页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 多数植物叶绿体基因组为双链环状DNA,具有保守的四分体结构、非重组、单倍体、单亲遗传、进化速率适中、序列和结构高度保守等特征,可为植物进化等提供有用信息.茶树种质资源丰富,其复杂的起源、进化、分类等方面缺乏有效鉴评,而有碍于对其高效保护与创...
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【中文期刊】 徐荣 宋文政 等 《中草药》 2024年55卷20期 7093-7100页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析药用植物富民枳Poncirus polyandra叶绿体基因组蛋白编码基因密码子使用模式及影响因素.方法 以富民枳叶绿体基因组53个蛋白编码基因为材料,利用CodonW软件、CUSP在线程序和R语言等整理并分析基因密码子使用偏性参...
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【中文期刊】 代国娜 尚明越 等 《中草药》 2024年55卷11期 3835-3844页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究百合属Lilium药用植物叶绿体基因组密码子使用偏性及影响因素,为百合属药用植物育种提供理论参考.方法 使用CodonW1.4.2、CUSP、SPSS等软件分析9种百合属药用植物的密码子偏好性.结果 9种百合属植物密码子不同位点的...
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【中文期刊】 尹明华 范馨月 等 《中草药》 2024年55卷21期 7444-7461页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 解析广丰千金薯Dioscorea opposite叶绿体基因组信息序列特征和确定其在薯蓣属的系统位置.方法 利用高通量测序技术对广丰千金薯叶片进行核基因组重测序,并利用生物信息学相关工具对组装得到的叶绿体基因组进行注释、序列特征和系统...
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- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 冯展 江媛 等 《中草药》 2023年54卷5期 1540-1550页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 明确肉苁蓉属药用植物叶绿体基因组密码子使用偏性及影响因素.方法 以肉苁蓉Cistanche deserticola、盐生肉苁蓉C.salsa、沙苁蓉C.sinensis和管花肉苁蓉C.tubulosa为研究材料,利用CUSP在线软件、...
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【中文期刊】 代江鹏 蔡一鸣 等 《中草药》 2023年54卷9期 2907-2916页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究甘草属7种植物叶绿体基因组密码子使用模式及影响因素.方法 从NCBI获取国内已有的7种甘草属植物叶绿体全基因组,筛选得到49条共有蛋白编码序列,使用codonW 1.44、EMBOSS、SPSS 26.0等分析密码子偏好性相关参数...
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【中文期刊】 尚明越 王嘉乐 等 《中草药》 2023年54卷19期 6424-6433页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 解析紫皮石斛Dendrobium devonianum叶绿体基因组特征,并探讨石斛属系统发育关系.方法 采用Illumina技术对紫皮石斛进行测序,对其叶绿体基因组进行组装、注释和分析,并基于共有编码基因序列构建系统发育树.结果 紫皮...
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【中文期刊】 王星璐 李慧娟 等 《中草药》 2023年54卷11期 3655-3665页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 解析远志Polygala tenuifolia 叶绿体基因组信息序列特征和确定其在远志属的系统位置.方法 获得远志叶绿体基因组序列,借助 GeSeq、Chloroplot、MISA、REPute、Tandem repeats find...
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【中文期刊】 刘畅 曾宪法 等 《中草药》 2023年54卷8期 2558-2565页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究勾儿茶属药用植物多叶勾儿茶Berchemiapolyphylla及变种光枝勾儿茶B.polyphylla var.leioclada叶绿体基因组成及结构特征,同时为勾儿茶属系统发育及进化研究提供参考.方法 基于Illumina平台...
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【中文期刊】 丁怡宁 毕光耀 等 《中草药》 2023年54卷1期 262-271页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 以红花Carthamus tinctorius不同花色变异类型为材料,比较分析其叶绿体基因组结构及其与近缘类群的系统发育关系,为中药材红花种质资源鉴定和群体遗传学研究奠定基础.方法 利用华大MGISEQ-2000PE150测序平台,双...
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【中文期刊】 王馨 尹光耀 等 《中草药》 2023年54卷17期 5703-5715页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于北柴胡Bupleurum chinense叶绿体基因组筛选特异性DNA条形码,并利用特异DNA条形码鉴定不同产地北柴胡种质资源.方法 利用Illumina HiSeq X Ten平台对北柴胡进行叶绿体基因组测序,利用mVISTA软...
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【中文期刊】 罗瑶 胡本祥 等 《中草药》 2023年54卷18期 6065-6073页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 解析卵叶远志Polygala sibirica叶绿体因组的序列特征和系统发育关系.方法 利用CTAB法提取卵叶远志叶片基因组DNA,通过Illumina HiSeq平台测序,再用GetCellelle组装叶绿体基因组,通过MEGA 1...
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【中文期刊】 尹明华 余锾媛 等 《生物技术通报》 2023年39卷6期 233-247页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为分析江西铅山红芽芋叶绿体基因组的结构组成情况,判定其在芋属中的进化位置及与同芋属叶绿体基因组的区别,为芋属物种鉴定、遗传多样性分析和资源保护提供相关依据.使用Illumina NovaSeq 6000 测序平台对江西铅山红芽芋叶绿体基因组...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 周军辉 鬲晓敏 等 《中草药》 2023年54卷24期 8191-8199页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 以细辛药材为材料,采用高通量测序和生物信息学技术组装完整的叶绿体基因组序列,明确其结构特征、系统发育位置.方法 基于Illumina测序平台对细辛叶绿体基因组序列进行结构特征分析;同时,采用最大似然法(maximum likeliho...
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