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【中文期刊】 张一 李雪琴 等 《生物学杂志》 2017年34卷6期 101-104页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 减数分裂重组并非以统一的频率发生在基因组上,而是在某些区域重组频率较高,在另一些区域重组频率较低.减数分裂重组位点的刻画与识别对于认识重组机制具有重要意义.提出了一种新的DNA序列的3-D图形表示,并将其与Z-曲线相结合,借助正规化的ALE...
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【中文期刊】 刘立伟 刘铁晖 《生物信息学》 2017年15卷1期 55-58页ISTIC
【摘要】 本研究提出了一种新的RNA二级结构的图形表示方法,这种方法不同于以往的表示方式.根据所提出的RNA二级结构的图形表示,将对9种病毒的RNA二级结构进行图形表示,构建系统进化树,进行序列间相似性的比较和分析.根据最终结果,可以很清晰地发现,A...
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【中文期刊】 张玉森 廖波 《生物数学学报》 2007年22卷4期 583-590页ISTIC
【摘要】 基于DNA序列的3D图形表示,通过L/L矩阵的规范化最大特征值组成的3维向量来刻画了DNA序列.并基于这种方法,用β-globin基因的第一个外显子分析了11个物种的相似性问题.
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【中文期刊】 李丹丹 赵会仁 等 《南阳师范学院学报》 2011年10卷6期 17-20页
【摘要】 基于氨基酸的五字母模型,提出蛋白质序列的一种二维图形表示方法,然后证明这种图是非退化的.最后用该方法给出了8个物种的β球蛋白序列的图形表示.
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【中文期刊】 吴绍根 刘娅琴 等 《计算机应用研究》 2018年35卷7期 2233-2236页
【摘要】 针对计算机视觉和模式识别中几何形状的相似性判定问题,GCT(geometry complex transform,几何复变换)对几何形状的相似性判定能够给出与人类视觉一致的判定结果,但是GCT变换只能表示和判定封闭的几何图形形状.G-GCT...
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【中文期刊】 李丹丹 王俊 等 《生物信息学》 2009年7卷1期 60-63页ISTIC
【摘要】 基于氨基酸的五字母模型,给出蛋白质序列的一种新的三维图形表示,然后构造一个12维向量来刻画蛋白质序列,这个向量的分量是与12个图形相对应的D/D矩阵的正规化的ALE-指标.最后基于S结构蛋白对冠状病毒进行系统发生分析来阐明该方法的有用性.
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【中文期刊】 李玲 南旭莹 等 《渤海大学学报(自然科学版)》 2013年1期 1-7页
【摘要】 在生物信息学中,传统的序列比对算法在理论基础和计算上都具有局限性,此近二十年人们提出和发展了很多序列比较的数学方法.本文综述了较有代表性的几种:图形表示及其矩阵不变量方法;研究生物大分子二级结构的拓扑图论方法;基字出现频率的统计学方法;Ko...
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【中文期刊】 崔凤玉 《山东大学学报（工学版）》 2006年36卷4期 29-32页
【摘要】 介绍了一个基于Java开发的可视化的图形编辑交互框架Tsingway Studio,详细说明了系统数据模型、图素的定义和表示,以及视图调整、交互控制和图例编辑、绘制等实现过程,并在此基础上实现了面向特定应用、特定用户和定制特定功能的图形编辑...
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【中文期刊】 王墨耘 傅小兰 《心理学报》 2004年36卷2期 160-167页
【摘要】 在用图形方式集中呈现信息的条件下,用因果力大小比较的实验范式检验效力PC理论.233名大学生被试对不同化学药物影响动物基因变异的能力做大小比较判断.结果发现,对单一因果关系因果力大小的比较判断具有以下3个特点:(1)不对称性:在预防原因条件...
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【学位论文】 作者：高雅 导师：张艳萍 桂喜民 河北工程大学 统计学 应用统计（硕士） 2021年
【摘要】 随着后基因组时代的到来，蛋白质组学成为生物信息学的研究重点，而在蛋白质组学研究中，蛋白质序列的相似性分析是最基本和最重要的问题之一。目前，在高通量测序技术背景下，基于序列比对的方法无法满足快速分析的需求，从而非序列比对方法受到更多研究者的青...
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【学位论文】 作者：郑卓 导师：李春 渤海大学 数学 应用数学（硕士） 2020年
【摘要】 随着生物技术的快速发展，近年来关于生物学的研究逐渐由积累数据向解释数据和分析数据等知识领域偏移，因此生物信息学便应运而生并迅速成为相关交叉学科的前沿。生物信息学，顾名思义即研究生物学数据信息的学科，它是一门新兴交叉学科，是以数学的计算方法和...
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【学位论文】 作者：穆增超 导师：李国君 山东大学 数学 运筹学与控制论（博士） 2018年
【摘要】
随着测序技术的发展，各种生物数据库中的蛋白质序列数量呈爆炸式增长。这些新测定的蛋白质序列迫切需要我们开发新的算法来比较它们与已知蛋白家族序列的相似性，进而预测它们的结构和功能。
鉴于传统的序列比对算法自身存在的一些缺陷，目前，通过...
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【学位论文】 作者：黄嘉禾 导师：贺平安 浙江理工大学 数学 数学（硕士） 2018年
【摘要】 构建计算模型分析海量的蛋白序列数据并实现其信息的准确识别是生物信息学领域研究中的重点问题。这里数据的定量描述和模型构建是蛋白序列分析的关键。蛋白序列图形表示方法拥有计算简单、易数值刻画和可用于处理大量数据等优点，自提出以来备受研究者们的关注...
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【学位论文】 作者：孙丹丹 导师：张玉森 山东大学 数学 运筹学与控制论（硕士） 2017年
【摘要】
人类基因组计划的顺利实行与测序技术的急速发展，造成了生物序列数量的急剧增多。面对数以万计的数据，如何发现潜藏在生物数据中的生物信息，分析这些生物序列间的关系，是分子生物学研究中的重要任务。
作为构成生命体的物质基础，蛋白质在各种生...
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【学位论文】 作者：肖文莉 导师：李玉双 燕山大学 数学 运筹学与控制论（硕士） 2016年
【摘要】 生物信息学是80年代末随着人类基因组计划的启动而兴起的一门交叉学科。它是一门与人类生存与生活都息息相关的学科。由于现今社会科技的迅猛发展以及生存环境的日益恶化，越来越多的人开始关注生物信息学，企图寻找新的方法，用以改善和解决所面临的问题。在...
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【学位论文】 作者：李卫红 导师：张玉森 山东大学 数学 运筹学与控制论（硕士） 2016年
【摘要】 生命体的核酸和蛋白质序列在进化过程中具有相对的稳定性，同时包含着海量信息。对生命体进行研究，归根结底是对核酸、蛋白质等生物大分子进行研究。对生物序列的研究分析，有助于研究生物序列之间的关系，解读生物遗传信息，从而能够为人类治愈各类疾病、提前...
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【学位论文】 作者：王科 导师：张屹 河北科技大学 数学 数学（硕士） 2016年
【摘要】 随着人类基因组计划的完成和模式生物基因组计划的全面实施，产生了大量的生物数据。生物学研究的重心由数据的采集积累向数据的解读分析过渡。生物信息学就是在这样的大背景下应运而生，其主要的研究内容是科学的处理分析生物数据，从中提取其所包含的生物信息...
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【学位论文】 作者：喻道莉 导师：贺平安 浙江理工大学 数学 数学（硕士） 2015年
【摘要】
图形表示方法作为生物序列比较分析的方法之一，由于其具有可视性、易于数值刻画的特点，已经被广泛应用在生物信息学的研究中。本文主要工作是提出两种新的图形表示并将其分别应用在序列相似性分析和亚细胞定位预测中。
本文基于核苷酸三联体、氨基...
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【学位论文】 作者：徐苏宁 导师：贺平安 浙江理工大学 数学 数学（硕士） 2015年
【摘要】 混沌学研究包括数学、物理学、生物学、气象学、工程学和经济学等众多学科。在生物序列的研究中，有一些学者将混沌学理论引入生物序列的分析研究，即所谓的混沌游戏图形表示（CGR），基于一个迭代函数将DNA序列的子串映射为空间的点，通过可视化的方法分...
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【学位论文】 作者：杨闫 导师：李春 渤海大学 数学 应用数学（硕士） 2014年
【摘要】 当人类基因组计划（Human Genome Project, HGP）呈上之际，人类开始进入了后基因组时代。在这一时代里，生物序列数据成指数增长，如何把有价值的生物信息从海量的生物序列数据中挖掘出来，已成为迫切需要解决的问题。本文研究机器学...
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【学位论文】 作者：李丹 导师：贺平安 浙江理工大学 数学 基础数学（硕士） 2012年
【摘要】
蛋白质序列数据的积累速度愈来愈快，简单方便的蛋白质序列分析方法显得尤为重要。近年来，许多有效的蛋白质序列分析方法被给出并被应用到蛋白序列的分析和比较。蛋白序列图形表示由于其可视性好、易于数值刻画受到许多研究者的关注。
基于氨基...
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【学位论文】 作者：孔芬 导师：姚玉华 浙江理工大学 数学 基础数学（硕士） 2012年
【摘要】 近年来，随着新一代高通量测序技术的出现，产生了越来越多的分子序列数据。面对海量的数据，如何对这些数据进行科学的分类、处理、分析和储存，给数学、计算机科学提出了严峻的挑战，生物学研究的重点开始由数据积累向数据分析和解释转变，计算生物学便在这种...
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【学位论文】 作者：颜军 导师：骆嘉伟 湖南大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2011年
【摘要】 随着人类基因组计划的实施和基因组测序技术的快速发展，生物学家已得到几百种生物的全基因组序列，这些序列的背后隐藏着丰富的生物学知识和生物学规律。基因组序列测定之后，识别序列中的蛋白质编码基因是进行基因组分析首先要解决的问题，本论文致力于蛋白质...
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【学位论文】 作者：李伟 导师：邱文元 兰州大学 化学 物理化学（硕士） 2010年
【摘要】 随着生物序列测序技术的飞速发展和一系列测序计划的实施与完成，DNA序列数据库中积累起了海量的序列数据信息。如何有效的处理、分析这些生物数据信息成为当今科学研究领域面临的一项艰巨任务和挑战。由于从DNA序列数据中直接的获取有用的信息时碰到了诸...
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【学位论文】 作者：杨柳 导师：李春 渤海大学 数学 应用数学（硕士） 2009年
【摘要】 随着人类基因组计划和一些模式生物基因组测序任务的相继完成或全面实施，生物序列和结构数据急剧增加。对这些数据进行科学的分析、处理和保存推动了分子生物学和数学以及计算机科学的结合，生物信息学应运而生。本文将在蛋白质序列的图形表示与相似性分析方面...
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【学位论文】 作者：黄国华 导师：廖波 湖南大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2009年
【摘要】 随着人类基因组计划(Human Genome Project，HGP)的顺利完成及各种模式生物基因组计划的相继实施，大量的生物分子数据源源不断地产生。对这些数据的保存、处理、分析和研究推动了分子生物学、数学及计算机科学的结合，由此发展起来的...
- 概要：
- 方法：
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【学位论文】 作者：唐晓婵 导师：邱文元 兰州大学 化学 化学 物理化学（硕士） 2009年
【摘要】 随着人类基因组计划的完成，以及各种生物基因组计划的相继实施和完成，由此产生了越来越多的生物分子序列数据。对这些序列数据进行科学的分析、处理推动了分子生物学的发展。随着生物序列数据的增长，生物分子序列的图形表示方法已成为研究生物序列的重要手段...
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