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【中文期刊】 张达轩 戴沈汝  等 《遗传》 2025年47卷1期 34-45页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 广袤的亚洲北部地区,包括西伯利亚、蒙古高原以及中国北方地区,不仅是欧亚大陆上人群交流的十字路口,也是连接美洲大陆的重要桥梁,这一区域对于探索人类起源、追踪人类迁移路线以及阐释演化机制具有独特且不可替代的重要性.尽管由于样本发掘数量有限、保存...

【关键词】 基因组学研究； 古DNA； 亚洲北部；

【中文期刊】 胡蝶 李雪林  等 《基因组学与应用生物学》 2025年44卷1期 20-29页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 为了解棉花(Gossypium spp.)体细胞胚胎发生过程中早期非胚性愈伤组织诱导的表观遗传学变化,利用全基因组甲基化测序(whole-genome bisulfite sequencing,WGBS)技术,对陆地棉(Gossypium ...

【关键词】 棉花； 愈伤组织； DNA甲基化；

【中文期刊】 杨尚栋 肖洋  等 《西安交通大学学报（医学版）》 2025年46卷1期 162-168页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 建立病原宏基因组测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)DNA检测流程的性能验证方案.方法 设计参考品并收集临床样本,从检测限、重复性、稳健性、抗干扰能力、特异性和准确性等维度评价...

【关键词】 病原宏基因组测序(mNGS)； DNA检测； 性能验证；

【中文期刊】 邹珂珂 张静  等 《西部医学》 2025年37卷2期 212-219页 ISTIC

【摘要】 目的 为评估对中国乙型肝炎病毒(HBV)感染人群具有潜在疗效的siRNA化合物,构建一种针对中国流行株代表性HBV的细胞模型.方法 选择中国大范围流行的1416条B2HBV基因组序列和1 636条C2 HBV基因组序列整合构建中国HBV参考...

【关键词】 siRNA； 中国HBV参考基因组； 细胞模型；

【中文期刊】 谷思雨 陈凯  等 《水生生物学报》 2024年48卷8期 1443-1458页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 水生态系统是保障国家生态安全的重要基础.水生生物在水生态系统中扮演着核心角色,是研究水体演变的重要依据,是维护水生态健康的关键.传统水生生物调查和监测通常采用形态学方法,但其存在专业知识要求高、难以标准化和自动化及费时耗力等缺陷.环境DNA...

【关键词】 环境DNA技术； 标准化； 水生生物监测；

【中文期刊】 梁羽 吴薇  《遗传》 2024年46卷10期 779-794页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 近十几年来,随着高通量测序技术的不断发展,越来越多针对不同类型DNA损伤的测序检测方法被开发并应用于相关研究.这些技术的发展不仅帮助解析不同损伤类型对应修复途径的动态调控过程,揭示关键作用因子及功能,发现新脆性热点,更极大促进了人们对于诸如...

【关键词】 DNA损伤； 高通量测序； 基因组不稳定；

【中文期刊】 高鑫祯 唐露  等 《广西植物》 2024年44卷1期 1-14页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 飘带兜兰(Paphiopedilum parishii)分布范围狭窄,仅在中国、缅甸、泰国以及老挝有少量分布.近年来,因生境破坏和人为滥采而导致飘带兜兰野生种群极度缩减.为开发种内多态性的分子标记用于保护生物学研究,该研究对飘带兜兰4个野生...

【关键词】 叶绿体全基因组； 飘带兜兰； 序列差异；

【中文期刊】 罗晗睿 王罗云  等 《西北植物学报》 2024年44卷6期 891-903页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]探索胡颓子科叶绿体基因组演化趋势,为胡颓子科植物物种鉴定以及资源开发利用提供理论依据.[方法]该研究从头组装并注释了沙棘属和野牛果属共4个类群的叶绿体基因组,结合已发表的叶绿体基因组序列,比较了胡颓子科各类群叶绿体基因组的基因构成、...

【关键词】 胡颓子科； 叶绿体基因组； 系统发育；

【中文期刊】 徐子健 江祉依  等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷6期 986-996页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 DNA甲基化作为一种表观遗传修饰,在植物的生长、发育和逆境反应中发挥着至关重要的作用.全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)被认为是DNA甲基化研究的"金标准",并且广泛应用于...

【关键词】 DNA甲基化； 全基因组甲基化测序； 序列比对；

【中文期刊】 古再丽努尔·穆萨 马骊  等 《植物遗传资源学报》 2024年25卷12期 2122-2135页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 为了解析干旱处理对白菜型油菜生理指标及DNA甲基化水平的影响,本研究对白菜型油菜陇油7号进行正常供水(对照)、干旱胁迫、干旱后复水3个处理,分析不同处理后油菜生理指标及DNA甲基化水平的变化.结果表明,与正常供水相比,当白菜型油菜受到干旱胁...

【关键词】 白菜型油菜； 干旱胁迫； 复水；

【中文期刊】 徐斌丰 宋月莹  等 《中国骨与关节杂志》 2024年13卷1期 51-56页 ISTICCA

【摘要】 Knee osteoarthritis is a complex genetic joint disease,and epigenetic factors play an important role in its development....

【关键词】 骨关节炎,膝； 表观基因组学； DNA甲基化；

【中文期刊】 李琳 张泽志  等 《湖北医药学院学报》 2024年43卷3期 247-251页 ISTICCA

【摘要】 目的:通过对虎耳草(Saxifraga stolonifera)进行物种鉴定和基因组大小测定,以更全面地开发其植物资源的遗传信息.方法:通过对虎耳草DNA条形码引物的筛选,发现ITS2+matK条形码可确认待测的植物样本为虎耳草.进一步利用...

【关键词】 虎耳草； DNA条形码； 系统发育树；

【中文期刊】 张丽静 贾彦彦  等 《实用肿瘤杂志》 2024年39卷2期 149-154页 ISTICCA

【摘要】 目的 分析p53和DNA损伤调节基因1(p53 and DNA damage regulated gene 1,PDRG1)在结直肠癌中的表达及其临床意义.方法 检索癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)...

【关键词】 结直肠癌； p53和DNA损伤调节基因1； 癌症基因组图谱；

【中文期刊】 孟文娜 浦香东  等 《中国现代中药》 2024年26卷10期 1645-1653页 ISTICCA

【摘要】 目的:基于败酱类药材基原植物的叶绿体基因组序列分析开发特定的DNA条形码,准确鉴别败酱草及其近缘种.方法:采用Illumina高通量测序技术对败酱科败酱属植物白花败酱、黄花败酱和异叶败酱的叶绿体基因组进行测序;采用生物信息学软件对基因组进行...

【关键词】 败酱草； 叶绿体基因组； 分子鉴定；

【中文期刊】 林亚茹 杨玺  等 《宁夏医科大学学报》 2024年46卷2期 146-152页 ISTIC

【摘要】 目的 利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库研究SSBP1 基因在肝细胞癌(HCC)组织中的表达情况,并探讨SSBP1 基因表达量与患者临床病理特征及预后的相关性.方法 基于TCGA数据库提取 374 例HCC组织及 50 例正常肝组织中SS...

【关键词】 线粒体单链DNA结合蛋白； 癌症基因组图谱； 肝细胞癌；

【中文期刊】 何静 王静  等 《国际生殖健康/计划生育杂志》 2024年43卷6期 462-466页 ISTICCA

【摘要】 目的:探讨染色体拷贝数变异测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)诊断1q21.1远端微缺失/微重复综合征合并先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)的临床应用...

【关键词】 DNA拷贝数变异； 全基因组测序； 染色体缺失；

【中文期刊】 罗湘胤 游磊  等 《湖北医药学院学报》 2024年43卷1期 13-17页 ISTICCA

【摘要】 目的:鉴定采集到的冷水花属植物样本并测定其基因组大小.方法:用聚合酶链式反应扩增样品的ITS2、rbcL和psbA-trnH序列并测序,通过比对Nr核酸数据库确定物种;以玉米Mo17 为对照,用流式细胞术测定其基因组大小.结果:本研究采集到...

【关键词】 冷水花； DNA条形码； 流式细胞术；

【中文期刊】 张荣 张蕊  等 《中国计划生育学杂志》 2024年32卷11期 2645-2648页 ISTIC

【摘要】 目的:探讨染色体微阵列芯片技术(CMA)、低深度全基因组测序技术(CNV-seq)对引产胎儿DNA异常的诊断价值及病因检出情况.方法:将2021年1月-2023年12月于本院进行引产的150例孕妇作为研究对象,以产前无创基因筛查(NIPT)...

【关键词】 产前诊断； 胎儿DNA异常； 染色体微阵列芯片技术；

【中文期刊】 纪桢 李晓洲  等 《天津医药》 2024年52卷5期 490-494页 MEDLINEISTICCA

【摘要】 目的 应用低深度全基因组拷贝数变异分析(CNV-seq)技术研究胚胎染色体异常在复发性流产(RSA)及偶发流产(SA)中的差异.方法 采集158例RSA患者(RSA组)和244例SA患者(SA组)的流产组织进行CNV-seq检测,对可疑染色...

【关键词】 流产,习惯性； 全基因组测序； DNA拷贝数变异；

【中文期刊】 朱鑫超 陆定其  等 《浙江中医药大学学报》 2024年48卷5期 530-540页 ISTIC

【摘要】 [目的]评价益气养阴祛瘀方治疗原发性干燥综合征(primary Sj?gren's syndrome,pSS)的疗效,并通过全基因组甲基化测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)技术研究中医药疗效...

【关键词】 原发性干燥综合征； 益气养阴祛瘀方； 全基因组甲基化测序；

【中文期刊】 焦雪丽 张鑫  等 《中华卫生杀虫药械》 2024年30卷4期 354-358页 ISTICCA

【摘要】 目的 在保持褐黄血蜱Haemaphysalis flava寄生蜱虫体形态完整的前提下,综合比较 95℃水浴法、改良碱裂解法、离心柱法 3 种提取方法对蜱组织DNA提取质量的差异,筛选适用于蜱鉴定分型的高效稳定基因组DNA提取方法.方法 取蜱...

【关键词】 褐黄血蜱； 寄生蜱； 基因组DNA；

【中文期刊】 王学英  《罕少疾病杂志》 2024年31卷4期 54-56页

【摘要】 目的 探究乙型肝炎(HBV)前基因组RNA(pgRNA)联合共价闭合环状DNA(cccDNA)对慢性乙型肝炎(CHB)患者抗病毒疗效的预测价值.方法 收集2019年8月至2022年8月期间于本院进行抗病毒治疗的96例CHB患者的临床资料,根...

【关键词】 乙型肝炎； 前基因组RNA； 共价闭合环状DNA；

【中文期刊】 陶莹 廖长秀  等 《广州化工》 2024年52卷2期 140-142页

【摘要】 对现有DNA提取试剂盒进行改良,减少DNA提取成本,寻找经济、稳定的提取方法.将96 份血液标本分为A、B两组,各48 份,组内按外周血体积分为250 μL、500 μL、750 μL三组.A组(试剂盒法)采用杭州倍沃医学科技公司的血液基因...

【关键词】 外周血； 基因组DNA； 提取；

【中文期刊】 段春燕 王晓凌  《湖南农业大学学报（自然科学版）》 2024年50卷3期 27-34页

【摘要】 采用Illumina HiSeq X Ten平台测序和生物信息法对唐古特扁桃叶绿体基因组序列特征进行解析.结果表明:唐古特扁桃叶绿体基因组为四分体式结构,完整叶绿体基因组序列全长158 166 bp,G+C含量 36.8%,注释131个基因...

【关键词】 唐古特扁桃； 叶绿体基因组； 生物信息学；

【中文期刊】 陈南珠 李俊良  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷9期 3853-3863页

【摘要】 旨在探讨MKRN3基因在野生型猪和克隆猪中的印记状态及其DNA甲基化水平.本研究利用西方猪种(杜洛克猪)与本地猪种(巴马猪或荣昌猪)中存在的种间单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),检测MK...

【关键词】 DNA甲基化； 猪； DMR；

【中文期刊】 牛一凡 李崇阳  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷8期 3436-3445页

【摘要】 旨在通过二代测序技术评估不同单细胞全基因组扩增(single cell whole genome amplification,scWGA)体系对牛微量血液基因组DNA的扩增效果,建立微量DNA全基因组扩增体系.本研究分别采用MDA(mult...

【关键词】 全基因组扩增； MDA； MALBAC；

【中文期刊】 黎环 林勇  《福建医药杂志》 2024年46卷4期 35-38页 CA

【摘要】 目的 研究血清乙肝病毒前基因组RNA(HBV pgRNA)检测结果与慢性乙型肝炎(CHB)低表面抗原患者不同乙肝病毒的血清学指标之间的相关性.方法 收集福建医科大学孟超肝胆医院慢性乙型肝炎低表面抗原患者共计148例纳入研究.临床样本进行HB...

【关键词】 慢性乙型肝炎； HBsAg； HBsAb；

【中文期刊】 亢春彦 王丹丹  等 《中国老年学杂志》 2023年43卷13期 3118-3122页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库探讨吸烟史肺鳞癌患者的DNA甲基化谱特点.方法 从TCGA数据库下载吸烟史肺鳞癌患者(213 例)及非吸烟史肺鳞癌患者(178 例)的临床数据、甲基化DNA芯片数据,首先分析两组患者总生存(OS)和...

【关键词】 癌症基因组图谱(TCGA)； 肺鳞癌； 吸烟；

【中文期刊】 王新华 杨延昕  等 《中国实验血液学杂志》 2023年31卷3期 746-752页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:探讨一种新的基于血液的、多组学、多维度的疗效评估方法在淋巴瘤患者疗效监测中的作用.方法:抽取患者10 ml外周血,通过cfDNA的低深度全基因组测序来评估基因组拷贝数畸变(CNA)和片段化模式(FS),同时检测一组血浆蛋白标志物(PT...

【关键词】 外周血； cfDNA； 全基因组测序；

【中文期刊】 吴欣仪 王蒙  等 《广西植物》 2023年43卷8期 1414-1427页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 物种的遗传多样性是决定物种适应性和生存能力的关键因素.生境片段化是造成生物多样性丧失的重要因素之一,对植物种群的遗传多样性有着重要影响.水角(Hydrocera triflora)作为一种濒危植物,其遗传多样性状况和濒危机制尚未有报道.该文...

【关键词】 生境片段化； 简化基因组测序； 遗传多样性；