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【中文期刊】 龚俊杰 王平 等 《深圳大学学报（理工版）》 2021年38卷5期 517-527页
【摘要】 三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)是乳腺癌中恶性程度较高的一种病理分型,因其病理呈现雌激素受体、孕激素受体和人类表皮生长因子受体2均为阴性的特殊性,使得目前药物治疗效果不甚理想,探究与TNB...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 于曼 张幸 《中国职业医学》 2021年48卷1期 51-58页ISTICCA
【摘要】 目的 基于公共数据库中恶性胸膜间皮瘤(MPM)的基因芯片和二代测序数据集,筛选与MPM发生发展相关的信号通路、生物标志物和预后相关基因.方法 从基因表达数据库下载MPM基因芯片表达数据集GSE51024和GSE2549,分别包括MPM患者8...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 郭亚 马红兵 等 《中华放射医学与防护杂志》 2017年37卷10期 730-735页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 寻找食管癌放射抗拒关键分子及通路,从分子水平揭示食管癌放射抗拒发生机制.方法 从基因芯片公共数据库GEO中下载食管癌放射抗拒相关芯片数据(GSE61772,GSE61620);进一步运用GEO2R进行差异基因分析,利用DAVID、St...
- 概要：
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【学位论文】 作者：马雪导师：田小飞 西安医学院 临床医学 肿瘤学（硕士） 2023年
【摘要】 背景：宫颈癌（Cervicalcancer,CC）为全世界女性最常见的恶性肿瘤之一，严重威胁女性的身心健康。早发现、早诊断、早治疗，是当期宫颈癌的诊治专家共识。寻找宫颈癌的差异表达基因（Differentiallyexpressedgene...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 高雅宁 李健 等 《中华临床免疫和变态反应杂志》 2023年17卷1期 27-33页ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学技术分析重症哮喘患者支气管内膜差异表达基因(DEGs)及其在重症哮喘发病中的可能作用.方法 从基因芯片公共数据库(GEO)下载重症哮喘患者支气管内膜研究芯片和测序数据,应用R和Rstudio软件中的limma包获得差异表...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 林思彤 陈罡 等 《右江医学》 2023年51卷3期 245-250页
【摘要】 目的 探讨纺锤体与着丝粒相关蛋白3(SKA3)在食管鳞状细胞癌(ESCC)中的表达意义及其与临床病理参数的相关性.方法 采用免疫组织化学染色法检测SKA3蛋白在75例食管鳞状细胞癌组织和20例正常食管组织中的表达,并分析其与临床病理特征的关...
【关键词】 纺锤体与着丝粒相关蛋白3；食管鳞状细胞癌；临床病理参数；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 周艳杰 张莉莉 等 《中国实用神经疾病杂志》 2022年25卷3期 276-282页ISTIC
【摘要】 目的 对家族性偏瘫性偏头痛1型(FHM1)小鼠诱发皮质扩散性抑制(CSD)后皮质转录本中发现的差异表达基因(DEGs)进行生物信息学分析和治疗药物预测.方法 利用R软件中的Deseq2包从基因芯片公共数据库(GEO)发表的FHM1小鼠诱发C...
【关键词】 家族性偏瘫性偏头痛1型；差异表达基因；生物信息学；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 曹俊宇 肖莹 等 《西安交通大学学报（医学版）》 2019年40卷2期 235-242页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过对胰腺癌转移相关基因芯片数据进行生物信息学分析,为探索胰腺癌转移的分子机制提供理论依据.方法 从基因芯片公共数据库(GEO)下载胰腺癌转移相关基因芯片数据,经R语言数据预处理及筛选差异表达基因后,分别通过DAVID在线分析软件、S...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨媛媛 黄冠江 等 《听力学及言语疾病杂志》 2019年27卷4期 398-405页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用基因表达数据库查找6月龄的听力正常CBA小鼠和耳蜗性聋小鼠的表达谱基因芯片的原始数据,对关键通路和差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行数据库挖掘和分析,为耳蜗性聋的治疗提供参考...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 任晓梅 杨景锋 等 《西安交通大学学报（医学版）》 2018年39卷2期 266-270页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析糖尿病肾病的发病原因及其与心血管疾病发生的关系,为二者的早期诊断和临床治疗提供依据.方法 从Pubmed基因芯片公共数据库(GEO Database)中下载糖尿病肾病基因芯片数据,将数据导入R语言、QOE、STRING、GCBI及...
- 概要：
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【中文期刊】 孙娜 史传道 等 《中华骨质疏松和骨矿盐疾病杂志》 2018年11卷4期 369-374页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 利用基因芯片公共数据库中RNA标本芯片数据,分析绝经后骨密度降低程度不同的骨质疏松症患者外周血基因表达谱及分子网络变化.方法 从基因芯片公共数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载美国奥马哈20名绝经后妇...
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【中文期刊】 任晓梅 辛宝 等 《浙江大学学报（医学版）》 2017年46卷4期 433-438页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨低盐饮食对哺乳动物心脏组织基因表达谱的影响,并分析差异表达基因可能涉及的分子生物学功能.方法:从基因芯片公共数据库(GEO)中获取低盐饮食心脏组织基因芯片数据(GSE17149),将数据导入Qlucore OmicsExplore...
【关键词】 膳食,限钠；心血管疾病/预防和控制；动脉粥样硬化/病理生理学；
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【中文期刊】 廖小方 赵中洪 等 《中国病理生理杂志》 2014年30卷2期 256-261页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨甘氨双唑钠(CMNa)协同顺铂对肺腺癌细胞中p21表达的影响及其分子机制.方法:使用NCBI公共数据库分析顺铂对人肺腺癌细胞作用的mRNA芯片数据,寻找差异基因;对人肺腺癌A549细胞系用CMNa和顺铂处理,用real-time ...
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【中文期刊】 周烨 石嵘 等 《南方医科大学学报》 2011年31卷1期 180-183页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 从分子水平揭示癫痫的发病机制,为癫痫的基础研究和临床治疗提供新思路.方法 从基因芯片公共数据库GEO中下载癫痫相关基因芯片数据,利用String、KEGG、Panther等在线分析软件对差异表达基因进行生物信息学分析.结果 在71个差...
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【中文期刊】 谢崇波 金谷雷 等 《遗传》 2010年32卷6期 639-646页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 研究拟南芥在高浓度盐处理环境下的基因调控网络, 有助于了解其在盐胁迫环境下保持正常生长的防御机制.针对目前广泛研究的SOS (Salt Overly Sensitive)耐盐机制, 文章整合公共数据库中盐胁迫相关的拟南芥基因组表达谱芯片, ...
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【中文期刊】 胡静静 滕丽萍 等 《中国生物工程杂志》 2005年25卷7期 71-75页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 利用高密度寡核苷酸芯片技术对大鼠胚胎胰腺发育中晚期(E12.5,E18.5,E15.5)调节内外分泌部细胞发育分化及功能代谢的基因的表达趋势进行研究.并用RT-PCR进行验证.用获得的基因信息对NCBI等公共数据库进行检索,结果发现对细胞的...
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【中文期刊】 刘梅 刘炎 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2005年21卷6期 791-795页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为探讨tropic1808基因作用的分子机制,采用高密度寡核苷酸芯片(Affymetrix芯片)对表达tropic1808基因和空载体的PC12细胞株进行转录水平分析.基于获得的基因表达信息,对UCSC、TRANSFAC、NCBI等公共数据...
【关键词】 tropic1808；基因芯片；表达谱；
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【中文期刊】 李强 王喻 等 《医学综述》 2019年25卷14期 2879-2885,2892页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学方法分析前列腺癌基因表达谱芯片及测序数据,筛选前列腺癌差异表达基因及其转移相关的基因.方法 前列腺癌转移相关数据取自基因芯片公共数据库(GSE6919),前列腺癌及正常组织数据取自癌症基因组图谱数据库(TCGA).利用R...
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【中文期刊】 鄢传经 胡清林 等 《胃肠病学和肝病学杂志》 2019年28卷6期 637-643页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨胃腺癌组织中新型生物标志物,及其对胃腺癌患者生存预后和诊断的价值分析.方法 从基因组公共数据库批量获取胃腺癌患者的临床资料及肿瘤组织或正常组织的基因表达芯片数据,采用配对检验和加权基因共表达分析的方法,筛选差异基因(P ＜0.05...
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【中文期刊】 郭亚收 徐晓峰 等 《现代肿瘤医学》 2019年27卷8期 1281-1284页ISTICCA
【摘要】 目的:分析高危前列腺癌(high-risk prostate cancer)患者前列腺癌组织基因表达芯片数据的生物学网络调控及关键蛋白,为高危前列腺癌的诊断及治疗提供新的理论依据.方法:从基因芯片公共数据库(Gene Expression ...
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【中文期刊】 孙娜 郭亚收 等 《实用预防医学》 2019年26卷7期 771-775页ISTICCA
【摘要】 目的 采用生物信息学研究方法分析大气污染对儿童外周血基因表达谱的影响,为后期预防、诊断及治疗提供一定的理论参考依据. 方法 从基因芯片公共数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载一组来自不同大气污染暴露下外周血...
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【中文期刊】 蒋永升 沈洋 等 《肝胆胰外科杂志》 2019年31卷8期 481-485页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨G蛋白偶联受体C型家族5A基因(GPRC5A)在胰腺癌组织中的表达情况及对患者预后的预测作用,探究GPRC5A对胰腺癌有氧糖酵解的影响.方法 利用Gene Expression Omnibus(GEO)、The Cancer Ge...
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【中文期刊】 康恩铭 章薇 等 《中华神经外科疾病研究杂志》 2018年17卷1期 27-31页ISTICCA
【摘要】 目的 胶质母细胞瘤(GBM)的胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(CpG)岛岸区(GCI shores)甲基化改变较CpG岛甲基化改变频率更高,但是其与GBM的关系目前尚不清楚.方法 利用肿瘤与癌症基因图谱计划(TCGA),基因表达公共数据库(GEO)中...
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【中文期刊】 向梦 张婷 等 《胃肠病学》 2018年23卷8期 466-471页ISTICCA
【摘要】 背景:结肠癌是最常见的恶性肿瘤之一,生物信息学方法能有效挖掘基因芯片数据,筛选结肠癌相关的候选生物标记物.目的:使用生物信息学方法并结合肿瘤公共数据库的分析来筛选结肠癌可能的生物标记物.方法:从GEO数据库中下载GSE44861基因表达谱,...
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【中文期刊】 刘玉智 门剑龙 等 《临床检验杂志》 2018年36卷8期 574-578页ISTICCA
【摘要】 目的 综合分析表达谱芯片与DNA甲基化芯片,探索鼻咽癌发生、发展的分子靶标与潜在治疗靶点.方法 在GEO公共数据库下载编号为GSE64634的表达谱芯片数据以及编号为GSE52068的DNA甲基化芯片数据;利用R语言的相关工具包对表达谱芯片...
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【中文期刊】 刘玉智 门剑龙 等 《天津医药》 2018年46卷6期 610-614页MEDLINEISTICCA
【摘要】 目的 在分子水平探索鼻咽癌的发病机制,筛选鼻咽癌诊断或治疗的潜在分子靶标.方法 在GEO公共数据库中下载编号为GSE12452和GSE13597的基因芯片数据(包含鼻咽癌和对照鼻炎黏膜组织数据),利用R编程语言的相关工具包对原始芯片数据进行...
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【中文期刊】 陈路嘉 朱彦辉 等 《广州医科大学学报》 2018年46卷3期 12-19页ISTIC
【摘要】 目的:初步探索雌激素受体(ER)阳性绝经后肥胖乳腺癌的相关基因及可能涉及的信号通路.方法:从GEO公共数据库下载含体质指数(BMI)信息的ER阳性绝经后乳腺癌基因芯片数据集(GSE70947),共获得13例肥胖乳腺癌和38例非肥胖乳腺癌的基...
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【中文期刊】 李丹辉 朱建华 等 《浙江医学》 2017年39卷24期 2232-2235页ISTICCA
【摘要】 目的 从基因水平揭示心肌梗死的发病机制,为心肌梗死的基础研究和临床治疗提供新思路.方法 从基因芯片公共数据库GEO(gene expression omnibus,GEO)中下载心肌梗死相关基因芯片数据,利用GENE-E进行差异基因分析,筛...
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【中文期刊】 闫瑞娟 臧雯雯 《泰山医学院学报》 2019年40卷1期 18-20页
【摘要】 目的 通过生物信息学分析方法,在分子水平探讨糖尿病肾病的发病机制,为研究糖尿病肾病提供新思路.方法 在公共数据库GEO中下载糖尿病肾病相关的芯片数据,利用在线GEO2R工具筛选出实验组与对照组之间的差异基因,用DAVID、STRING、cy...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黄梦岚 吴红 等 《蛇志》 2019年31卷2期 188-192,201页
【摘要】 目的 探究转录抑制因子GA T A结合基因1(TRPS1)在胃癌中的表达水平及其与表达相关基因的细胞功能及信号通路.方法 通过筛选基因表达谱数据动态分析(GEPIA)、基因芯片表达谱公共数据库(GEO)数据,对TRPS1在胃癌组织中的数据进...
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