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【中文期刊】 周海廷 《生物技术》 2002年12卷5期 33-34页ISTICCA
【摘要】 用非数学语言描述了隐马尔科夫过程(hidden markov model,HMM),介绍了HMM用于基因识别的原理及基于HMM开发的、比较常用的基因识别程序.
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 周海廷 《绵阳经济技术高等专科学校学报》 2002年19卷4期 1-6页
【摘要】 经过20多年的努力,匿名基因组序列基因识别领域取得了引人入胜的成就.基因识别程序已经从最初识别细菌基因组编码蛋白质区域向预测具有多外显子脊椎动物基因的详细结构发起挑战.在基因识别的过程中,计算方法扮演着重要的角色.不过对预测的结果进行实验验...
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【学位论文】 作者：窦运涛 导师：张春霆 天津大学 生物学 生物物理学（硕士） 2005年
【摘要】 本论文的主要内容是原核生物蛋白质编码基因识别以及通过序列比对的方法确定微生物的必需基因。具体内容如下： 第一部分介绍了人类基因组和模式生物基因组计划，引出了生物信息学的发展背景和主要研究内容以及主要的蛋白质编码基因识别算法和基因识...
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- 结论：
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 曾昭书 王黎 等 《郑州大学学报（医学版）》 2010年45卷3期 378-381页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:在全基因组中查找能够在世界各大人群中通用的高个体识别力单核苷酸多态性(SNPs)位点,以期为SNPs应用于法医学个体识别奠定基础.方法:从国际人类基因组单体型图计划(HapMap)数据库下载270名个体各约4 000 000个全基因组...
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【中文期刊】 卢建红 唐运莲 等 《微生物学报》 2008年48卷3期 385-390页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为了在Epstein-Barr病毒(EBV)172kb的基因组中引入突变以研究基因功能,建立了一种简单有效的基因操作方法.在载体pcDNA3.1(+)上操作,将两端含有重组蛋白FLP识别位点(FRT)的卡那霉素筛选标记基因(kan)与鼻咽癌...
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【中文期刊】 史良 尉春艳 等 《中国生物医学工程学报》 2005年24卷1期 74-79页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 根据现代科学对基因的认识,应用了隐马尔科夫模型(HMM)的算法,以大量核酸序列为信息来源,通过计算机计算来寻找未知基因的大体位置;再通过基因的固有结构特征及密码子使用的偏向性,使用加权距离判别法来准确地定位基因,以图形及文本的形式输出,从而...
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【中文期刊】 禹胄 李涛 等 《微生物学报》 2003年43卷6期 805-808页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 利用生物信息学方法和工具开发了微生物基因组注释系统(Microbial genome annotation package, MGAP),并用于蓝细菌PCC7002的基因组注释.该系统由基因组注释系统和基于Web的用户接口程序两部分组成.基...
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【中文期刊】 金危危 覃瑞 等 《遗传》 2001年23卷3期 263-266页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 分别以水稻1号染色体上混合标记的8个紧密连锁的RFLP(平均约1.7 kb)和5号染色体的BAC克隆44B4 (137 kb)，以及12号染色体单个RFLP RG397（约1.5 kb）为探针,在水稻染色体上进行了荧光原位杂交(FISH)。...
【关键词】 荧光原位杂交(FISH)；检出率；RFLP,BAC；
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【中文期刊】 邱志敏 《实用癌症杂志》 2018年33卷5期 868-870页ISTIC
【摘要】 人体的免疫系统是人体进行免疫应答和免疫功能的重要存在,免疫系统具有识别和排除抗原性异物、和人体其他系统协调,一起维护人体生理平衡的功能.免疫系统完善的人体依旧可以导致肿瘤的发生,提示人们恶性肿瘤可以逃避免疫监视,具有免疫逃逸功能[1].程序...
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【中文期刊】 马琛茹 关泉林 等 《医学综述》 2018年24卷11期 2135-2139页ISTICCA
【摘要】 免疫检查点治疗是目前肿瘤学领域最有前途的方法之一,已在多种实体瘤中观察到长期缓解,但在结直肠癌(CRC)的应用仍未取得可观的成果. CRC肿瘤微环境的相关研究发现,升高的Foxp3 +肿瘤浸润淋巴细胞与CD+8T细胞有关,提示预后良好.错配...
【关键词】 微卫星不稳定性结直肠癌；肿瘤微环境；细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4；
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【中文期刊】 蒋学俊 熊伶俐 等 《中国心血管病研究》 2017年15卷3期 193-197页ISTICCA
【摘要】 近年来,随着人们饮食、营养结构和生活方式的改变,心脑血管疾病已经成为危害人类健康的头号杀手.而高血压是心脑血管疾病的罪魁祸首,是我国最常见的心脑血管疾病,同时也是世界各国和地区主要的慢性流行病之一[1].高血压可导致心脏、脑、血管、肾脏等器...
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【中文期刊】 郎书源 杜武英 等 《热带医学杂志》 2008年8卷7期 642-645,663页ISTICCA
【摘要】 目的 分析和预测亚洲牛带绦虫WD40基因及其编码蛋白的结构和特性,用于指导其生物学功能的实验研究.方法 利用美国国家生物技术信息中心(NCBI,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)、瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系...
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【中文期刊】 徐劲 陈守义 等 《热带医学杂志》 2005年5卷5期 574-575页ISTICCA
【摘要】 目的通过筛选eDNA文库识别华支睾吸虫新基因,为进一步研究其功能及其应用奠定基础.方法对华支睾吸虫cDNA文库进行筛选,通过Blastn程序进行序列比对,识别华支睾吸虫新基因,并应用软件程序对其进行分析.结果筛选到一个475bp的核酸序列,...
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【中文期刊】 刘佳佳 羊建 等 《中国药物与临床》 2005年5卷3期 165-167页ISTICCA
【摘要】 <篇首> 细胞有两种基本的死亡形式,一是主动死亡--程序化细胞死亡(programmed cell death,PCD);二是被动死亡--坏死.PCD中最常见和研究得最多的是细胞凋亡(apoptosis),其病理学特征表现为核固缩、胞质空泡、胞...
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【中文期刊】 史良 尉春艳 等 《北京生物医学工程》 2004年23卷1期 73-74页ISTIC
【摘要】 <篇首> 众所周知,核酸测序技术已有实质性的发展,迄今为止,全世界完成整个基因组序列测定的物种已超过25种,人类基因组的全序列测定也已基本完成,但是知道了基因组全序列并不等于知道了该种生物全部生活的奥秘.全序列中一个个具有生物功能的片断才称为基...
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【中文期刊】 李冬冬 王正志 《生物信息学》 2004年2卷1期 18-21页ISTIC
【摘要】 广义隐Markov模型(GHMM)是基因识别的一种重要模型,但是其计算量比传统的隐Markov模型大得多,以至于不能直接在基因识别中使用.根据原核生物基因的结构特点,提出了一种高效的简化算法,其计算量是序列长度的线性函数.在此基础上,构建了...
【关键词】 广义隐Markov模型；GHMM Viterbi算法；基因识别；
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【中文期刊】 许亮 卢向阳 等 《生命的化学》 2003年23卷6期 406-409页ISTIC
【摘要】 伴随着人类基因组计划的完成和后基因组计划的实施,对占人类基因组约97%的非编码序列的研究已展开.在人类、线虫、果蝇以及酵母等生物体中已经发现大量假基因.本文对假基因的命名与分类、结构特征、分布特点、产生过程、识别程序、假基因与蛋白质结构关系...
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【中文期刊】 丁琰 段君凯 等 《医学信息》 2016年29卷13期 117-118页
【摘要】 目的对先天性心脏病患者GATA4基因进行研究。方法分别对50例先天性心脏病病例及50例对照组GATA4基因全部外显子扩增并测序，并借助BLAST程序及Clustal W软件识别基因突变及分析突变氨基酸的保守性。结果在1例室间隔缺损患者的GA...
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【中文期刊】 赵建刚 《甘肃科技纵横》 2013年42卷8期 136-138页
【摘要】 基因表达式编程是根据遗传算法与遗传程序设计发展而来的一种新的遗传算法,也是一种新的数据挖掘方法,现在已经广泛用于人工智能、模式识别、图像处理以及生产调度等领域,本论述主要介绍其在医学领域的应用及展望.
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【中文期刊】 封立平 尼秀媚 等 《食品安全质量检测学报》 2013年4期 1207-1212页
【摘要】 目的建立番茄溃疡病菌的环介导等温核酸扩增技术检测方法。方法应用环介导等温核酸扩增技术(LAMP)对番茄溃疡病菌的16S rRNA 特异性基因进行扩增,采用4对引物识别目的片段的6个特异性区域,62℃恒温1 h完成扩增。结果设计的引物与对照菌...
【关键词】 番茄溃疡病菌；环介导等温核酸扩增技术；16SrRNA；
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【中文期刊】 禹江涛 王红阳 等 《河北联合大学学报（医学版）》 2012年14卷6期 804-806页
【摘要】 <篇首> 细胞凋亡是在基因严格控制下主动的细胞"自杀"行为,又称为细胞程序性死亡.细胞通过信号传导引起某些基因转录和翻译发生改变,引起细胞器缩小而不裂解,染色体DNA断裂,形成凋亡小体最终被巨噬细胞识别并吞噬.近年来有文献报道,睡眠呼吸暂停导致...
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【中文期刊】 金伟波 吴方丽 等 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 2006年34卷12期 97-100页
【摘要】 一些低丰度的miRNA和组织特异性miRNA往往很难发现,利用生物信息学方法,根据已知水稻miRNA的各种属性,设计miRNA前体预测程序--PreMiRFind,从全基因组范围中预测出1 375条miRNA前体,然后利用已知拟南芥的miR...
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【中文期刊】 孙学华 金树根 等 《中华传染病杂志》 2012年30卷5期 317-320页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 近年研究发现,先天免疫通过模式识别受体(pathogen recognition receptors,PRR)对外来病原体中病原体相关模式分子(pathogen-associated molecular pattern,PAMP)或机体自身...
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【中文期刊】 王欢 吴中明 《国外医学（病毒学分册）》 2005年12卷4期 104-106页ISTICPKU
【摘要】 <篇首> 细胞凋亡(apoptosis)是个体发育过程中基因调控下的细胞自杀活动,是多细胞有机体为调控机体发育、维护内环境稳定,由基因编码程序的细胞主动死亡过程.细胞首先接收、识别某些特殊的生理或病理性刺激信号,然后启动细胞特有的基因或基因群,...
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【中文期刊】 王红 黄惠英 等 《国际免疫学杂志》 2019年42卷6期 562-565页ISTICCA
【摘要】 目的 对胰腺癌中程序性死亡因子配体1(programmed death factor ligand 1,PD-L1)基因介导的内源竞争RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)ceRNA互作网络的机制解析及其预...
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【中文期刊】 晏春根 谢青 《国外医学(流行病学传染病学分册)》 2003年30卷3期 173-176页ISTICCA
【摘要】 宿主依靠先天免疫防御外源性病原生物的入侵,Toll样受体作为先天防御的重要组成部分,能识别病原相关分子模式、诱导抗微生物的基因表达及炎性细胞因子释放,同时也能触发树突细胞(DC)的成熟,而调节获得性免疫.宿主的某些内源性因子,如坏死细胞、热...
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【学位论文】 作者：袁亚洲 导师：郭锋彪 电子科技大学 生物医学工程 生物医学工程（硕士） 2017年
【摘要】 基因识别是对DNA序列进行分析，获取其中重要信息的第一步。目前测序技术的发展使得测序数据呈爆发式增涨，然而实验方法无法快速有效的从海量信息中获取知识，基于此运用计算机技术来识别基因的方法应运而生。在2015年，我们课题组研发了原核生物基因识...
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【学位论文】 作者：华志刚 导师：郭锋彪 电子科技大学 生物医学工程 生物医学工程（硕士） 2015年
【摘要】 在DNA序列中获取有用的信息和知识的首要一步就是从基因识别开始。随着全基因组序列数据呈指数级增长，从而导致依靠传统的实验方法无法跟上测序的速度，因此就产生了运用计算机算法来识别基因。在2003年，诞生了一个以DNA序列的Z曲线理论为基础的原...
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