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【中文期刊】 刘萌萌 《四川生理科学杂志》 2024年46卷10期 2125-2131页
【摘要】 目的:通过加权基因共表达网络分析筛选结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)潜在的生物标志物.方法:下载基因表达综合数据库(Gene expression omnibus,GEO)中的基因表达谱GSE44076 和GSE218...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 温中庆 张强 等 《华中科技大学学报（医学版）》 2022年51卷2期 158-166页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过生物信息学方法鉴定与结直肠癌相关的核心基因,并初步验证.方法 从TCGA数据库中下载正常人和结肠腺癌(COAD)患者的临床资料和基因表达数据;从GEO数据库中下载275例结直肠癌患者的肿瘤组织及其癌旁正常组织基因表达数据.通过差异...
【关键词】 结直肠癌；加权基因共表达网络分析；差异表达基因；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 禹志远 董海平 等 《上海交通大学学报（医学版）》 2025年45卷10期 1308-1319页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的·开发一种多算法协同的计算生物学策略,构建吗啡耐受外周神经调控网络的预测模型,并筛选高置信度候选靶标.方法·构建不同吗啡用药时长的小鼠模型,采集其背根神经节(dorsal root ganglion,DRG)组织开展批量RNA测序,以表...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王珠 何传辉 等 《中国心血管病研究》 2025年23卷10期 949-956页ISTICCA
【摘要】 目的 基于自噬相关基因建立一个动脉粥样硬化(AS)的诊断模型并对该模型进行验证.方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)下载了GSE1009...
【关键词】 动脉粥样硬化；自噬相关差异表达基因；诊断；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘继涛 徐涛 等 《临床检验杂志》 2025年43卷9期 695-701页ISTICCA
【摘要】 目的 运用生物信息学方法筛选与急性缺血性卒中(acute ischemic stroke,AIS)相关的枢纽基因及信号通路,探寻潜在生物学标志物,以期为AIS的机制研究提供新证据.方法 从GEO数据库(gene expression omn...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郭峰 王晨宇 等 《现代泌尿外科杂志》 2025年30卷3期 215-222页ISTICCA
【摘要】 目的 采用生物信息学分析筛选与肾透明细胞癌(KIRC)发生密切相关的分子生物标志物,并验证其在临床样本中的表达水平.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取KIRCⅠ期 mRNA测序数据,用主成分分析(PCA)降维处理,筛选差异表达基因...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 严毅进 王欢 等 《临床外科杂志》 2025年33卷7期 735-740页ISTIC
【摘要】 目的 探讨泛素样含植物同源结构域和环指结构域蛋白1(UHRF1)基因在软组织肉瘤(soft tissue sarcoma,STS)中的表达模式和分子功能及其与STS临床特征、预后的相关性.方法 从TCGA选取263例STS组织的RNA数据及...
【关键词】 泛素样含植物同源结构域和环指结构域蛋白1；软组织肉瘤；临床特征；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张舟 黄碧 等 《岭南现代临床外科》 2025年25卷1期 12-18页
【摘要】 目的 本研究旨在通过比较不完全射频消融(IRFA)处理肝细胞癌(HCC)患者与HCC的基因表达谱,识别与IRFA处理HCC相关的差异表达基因,并提供潜在治疗靶点.方法 从GEO数据库中下载GSE212604数据集,根据是否接受IRFA治疗分...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈曼娜 温悦 《海峡药学》 2025年37卷7期 17-27页
【摘要】 目的 通过生物信息学的方法挖掘免疫球蛋白A肾病(IgA Nephropathy,IgAN)的关键基因,为IgAN提供新的诊断标志物及免疫细胞浸润特征,并预测IgAN治疗的有效药物.方法 从GEO数据库下载合并GSE73953和GSE9379...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 何启旺 夏宇阳 等 《中华骨质疏松和骨矿盐疾病杂志》 2024年17卷5期 430-445页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 基于生物信息学分析肌少症(sarcopenia)与阿尔茨海默病(Alzheimer disease,AD)差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),为进一步揭示二者相关分子机制及诊断、治疗...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张丽娜 姜晓琳 等 《中华中医药学刊》 2024年42卷6期 179-182,后插28-后插31页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法识别肥胖型多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)的关键基因,...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张冠 杨登科 《联勤军事医学》 2024年38卷11期 966-970页ISTIC
【摘要】 目的 研究肾结石的关键差异基因、信号通路及蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,从而寻找潜在的诊疗靶点,为难治性、复发性、遗传高风险性结石提供新的诊疗思路.方法 基于生物信息学方法和R...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 张桢淳 李永唯 等 《中国动脉硬化杂志》 2024年32卷4期 310-318页ISTICCA
【摘要】 [目的]从空间与基因共表达网络的角度揭示跨种属的缺血性心力衰竭机制.[方法]从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库(NCBI-GEO)中检索获得GSE210374和GSE57338高通量测序数据,利用R语言软件程序包分析筛选在心肌梗死大鼠...
- 概要：
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【中文期刊】 侯洁欣 戴吉 等 《中国血液流变学杂志》 2024年34卷2期 202-207页ISTICCA
【摘要】 目的 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定与病毒性脓毒症儿童患者相关的关键基因.方法 使用GSE119217数据集进行差异表达基因(DEGs)分析,筛选病毒性脓毒症儿童患者相关的DEGs.采用WGCNA筛选与脓毒症临床特征相关性最高...
- 概要：
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【中文期刊】 舒佳玉 王欢 等 《现代肿瘤医学》 2024年32卷19期 3636-3642页ISTICCA
【摘要】 目的:筛选口腔鳞状细胞癌(OSCC)中铁死亡相关新型生物标志物,并分析免疫细胞浸润情况.方法:从GEO数据库中下载OSCC数据集.利用R软件筛选差异表达基因(DEGs)并进行功能和通路富集分析,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)探究基...
- 概要：
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【中文期刊】 申杨 段子博 等 《天津医科大学学报》 2024年30卷5期 391-398页ISTIC
【摘要】 目的:利用生物信息学方法筛选外阴鳞状细胞癌(VSCC)的关键基因及分析免疫浸润特征.方法:从GEO数据库中下载VSCC相关基因表达数据,应用差异表达基因(DEGs)分析和加权基因共表达网络分析筛选出共同的DEGs,对DEGs进行富集分析.采...
【关键词】 外阴鳞状细胞癌；加权基因共表达网络分析；差异表达基因；
- 概要：
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【中文期刊】 李威材 秦刚 等 《实用肿瘤杂志》 2024年39卷4期 344-355页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学方法筛选出与骨肉瘤(osteosarcoma,OS)相关的关键基因,以作为OS的潜在诊断标志物和新治疗靶点.方法 从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中检索下载 2 个符合本研究...
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【中文期刊】 修占杰 刘佳玙 等 《天津医科大学学报》 2024年30卷6期 535-542页ISTIC
【摘要】 目的:基于强直性脊柱炎(AS)基因芯片数据,应用生物信息学分析方法识别免疫细胞亚型相关的关键基因及药物靶点预测.方法:GEO数据库下载AS基因表达数据,筛选差异表达基因(DEGs);运用R软件包进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全...
【关键词】 强直性脊柱炎；差异表达基因；加权基因共表达网络分析；
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【中文期刊】 杨新瑞 刘艳华 等 《包头医学院学报》 2024年40卷1期 30-35页CA
【摘要】 目的:通过生物信息学的方法挖掘帕金森病(Parkinson's disease,PD)的关键基因,为PD提供新的诊断标志物及免疫细胞浸润特征.方法:从高通量基因表达(gene expression omnibus,GEO)数据库下载合并GS...
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【中文期刊】 佘细虹 曾智 等 《内科》 2024年19卷3期 302-307页
【摘要】 目的 应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)联合差异表达基因(DEG)分析法鉴定重度抑郁症(MDD)的关键基因.方法 从基因表达数据库中获取MDD患者和健康志愿者死后脑组织mRNA微阵列数据.应用WGCNA和DEG分析法筛选与MDD最显著...
【关键词】 重度抑郁症；加权基因共表达网络分析；生物标志物；
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【中文期刊】 刘晓雅 常孟孟 等 《中国现代医生》 2024年62卷14期 6-10,18页
【摘要】 目的 利用基因共表达权重网络(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)探索与尿道下裂发病相关的潜在基因.方法 利用WGCNA算法将数据集GSE35034 处理并构建基因共表达权重...
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【中文期刊】 刘满 黄永熙 等 《生物技术进展》 2024年14卷3期 451-458页
【摘要】 为了探讨新城疫病毒与鸡链球菌二者各自感染鸡后的共同基因及其分子相互作用机理,深入了解二者协同感染关系,从GEO数据库中获取新城疫病毒和链球菌临床上感染鸡的相关基因芯片数据集,进行生物信息学数据二次挖掘,并开展了GO功能注释、KEGG通路分析...
- 概要：
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【中文期刊】 侯志娟 文普帅 《中国医科大学学报》 2023年52卷2期 126-131页ISTICPKUCABP
【摘要】 目的 通过生物信息学方法探讨结直肠癌转移的分子机制,为结直肠癌转移提供潜在的治疗靶点.方法 从高通量基因表达数据库(GEO)下载GSE41568数据集,用Limma软件包筛选转移性和原发性结直肠癌的差异表达基因;通过加权基因共表达网络分析(...
- 概要：
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【中文期刊】 董博清 李杨 等 《器官移植》 2023年14卷1期 83-92页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 鉴定肾移植术后排斥反应中巨噬细胞M1亚型表达的相关基因并构建风险模型预测移植肾存活.方法 在基因表达综合(GEO)数据库下载肾移植术后的GSE36059及GSE21374数据集.GSE36059包括发生排斥反应和稳定移植物的样本,使用...
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【中文期刊】 朱虹颖 王建波 《介入放射学杂志》 2023年32卷9期 875-880页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 从分子水平探索支架内再狭窄(ISR)的关键基因,以及ISR的发病机制.方法 通过基因表达综合(GEO)公共数据库获取GSE46560数据集,利用R语言的limma包分析获得ISR组与对照之间的差异表达基因(DEG),并对外周血的微阵列...
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【中文期刊】 黄子葵 李斐 等 《中国医学科学院学报》 2023年45卷4期 597-607页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于系统生物信息学分析鼻咽癌样本基因芯片数据,筛选鼻咽癌的潜在预测基因,并对其进行实验验证.方法 通过基因表达综合数据库筛选鼻咽癌数据集,通过limma包进行差异分析,加权基因共表达网络包进行加权基因共表达网络分析,绘制韦恩图寻找共同...
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【中文期刊】 桑珍珍 杨栋梁 等 《中国急救医学》 2023年43卷5期 376-382页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 识别2019新型冠状病毒感染(COVID-19)相关脓毒症的关键基因和信号通路.方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载基因芯片数据.采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-ex...
【关键词】 关键基因；2019新型冠状病毒感染(COVID-19)；脓毒症；
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- 方法：
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【中文期刊】 梅玉洁 安恒庆 等 《新疆医科大学学报》 2023年46卷2期 259-263页ISTICCA
【摘要】 目的 基于公共数据库构建前列腺癌的预后风险预测模型.方法 下载TCGA数据库中前列腺癌相关数据及GEO数据库的GSE104131数据集,对GSE104131测序数据进行加权基因共表达网络分析,得到关联前列腺癌(PCa)组织最高的关键模块,并...
【关键词】 前列腺癌；加权基因共表达网络分析；差异表达；
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- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 高雅宁 李健 等 《中华临床免疫和变态反应杂志》 2023年17卷1期 27-33页ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学技术分析重症哮喘患者支气管内膜差异表达基因(DEGs)及其在重症哮喘发病中的可能作用.方法 从基因芯片公共数据库(GEO)下载重症哮喘患者支气管内膜研究芯片和测序数据,应用R和Rstudio软件中的limma包获得差异表...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 钱晗 曹梦菲 等 《实用临床医药杂志》 2023年27卷3期 21-28,34页ISTICCA
【摘要】 目的 基于外周血单个核细胞(PBMCs)寻找心肌梗死潜在的生物学标志物.方法 从基因表达综合(GEO)数据库中下载心肌梗死患者PBMCs的测序数据集GSE59867,基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和差异表达基因(DEGs)探讨心肌...
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