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【中文期刊】 张虎 黄欣 等 《药学研究》 2023年42卷9期 654-660页 ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学和关联性图谱(CMap)数据库筛选肺癌相关基因及其潜在的治疗药物,为肺癌的治疗提供新思路.方法 从基因表达数据库(GEO)中选择GSE89039、GSE118370 和GSE136043,采用R软件筛选差异表达基因(DE...
【中文期刊】 张雨阳 赵莉 等 《南方农业学报》 2023年54卷3期 657-668页
【摘要】 [目的]基于转录组测序技术筛选出罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)雌雄样本脑和胸神经组织中的差异表达基因(DEGs),为揭示其生长发育的性别二态性及开展分子辅助育种提供理论依据.[方法]通过TRIzol提取罗氏沼...
【中文期刊】 潘以红 范雪萌 等 《生物学杂志》 2019年36卷2期 22-27,40页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了识别肺癌发展过程中的关键基因,揭示其发展的潜在机制,得到肺癌的预测模型,从GEO(Gene Ex-pression Omnibus)数据库下载了基因芯片GSE19188和GSE40791进行研究.首先对基因表达数据分析得到805个同趋势...
【关键词】 肺癌； 差异表达基因(DEGs)； 蛋白质交互(PPI)网络；
【中文期刊】 陈菁 郑伟 等 《西北植物学报》 2017年37卷3期 470-477页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 该研究采用Illumina Hi-Seq2500高通量测序技术,对叶背有纤维和无纤维发育的两组钩苞大丁草(Gerbera delavayi Franch.)叶片样品的cDNA进行转录组测序,分析其叶背毡毛纤维发育机理.测序结果得到了108 ...
【中文期刊】 康舒淇 朱田田 等 《中国药学杂志》 2024年59卷12期 1100-1109页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 对当归[Angelica sinensis(Oliv.)Diels]主栽品种"岷归1号"和"岷归2号"进行转录组测序差异比较分析,挖掘当归响应干旱胁迫关键基因.方法 以两品种当归的新鲜叶片和根组织为研究材料构建cDNA文库,利用二代高...
【中文期刊】 廖杨梅 赵国春 等 《生物技术通报》 2024年40卷7期 197-206页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]探究无患子(Sapindus mukorossi Gaertn.)雄性不育品种'琦蕊'雄花不同发育时期的细胞学特征及差异表达基因,为深入解析无患子雄性不育发生的分子机制提供理论依据.[方法]在观察雄花花药不同发育过程的细胞学特点基础...
【中文期刊】 刘亚娟 郑航辉 等 《微生物学报》 2024年64卷9期 3453-3473页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 ThiD在腾冲嗜热厌氧杆菌中由thiD编码,是硫铵素合成途径的关键酶.thiD的结构和功能已在真菌、酵母菌和植物中得到阐明.然而,thiD在嗜热生物中的功能仍不清楚.[目的]探讨腾冲嗜热厌氧杆菌的嗜热机制并揭示thiD在不同温度下的功能及在...
【中文期刊】 林玲 莫国东 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷4期 663-674页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 生长激素(growth hormone,GH)不仅能调节动物的代谢、生长、发育和生殖,也能调节动物的免疫系统.本研究旨在通过转录组测序及生物信息学技术分析GH影响J亚群禽白血病病毒(subgroup J avian leukosis vir...
【关键词】 差异表达基因(DEGs)； 生长激素(GH)； J亚群禽白血病病毒(ALV-J)；
【中文期刊】 蒲帝宏 叶姿妤 等 《生物学杂志》 2024年41卷2期 32-38页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为探究核糖体蛋白RPS6 亚基肽段对S180 肿瘤细胞基因表达的影响及抑制肿瘤细胞的关键分子和信号通路,以S180 荷瘤小鼠为模型,用RPS6 亚基肽段处理S180 荷瘤小鼠,对S180 肿瘤细胞进行Illumina测序获得差异表达的基因,...
【中文期刊】 丁宁 杨青山 等 《中国医学物理学杂志》 2024年41卷4期 512-520页 ISTICCSCD
【摘要】 目的:通过生物信息分析探索骨性关节炎中滑膜组织的基因变化.方法:从GEO数据库中获取GSE55235和GSE12021数据,分析数据得到差异表达基因(DEGs).再对DEGs进行功能富集分析、蛋白互作网路分析、hub基因分析等.最后分析预测...
【中文期刊】 李红 穆姣 等 《临床检验杂志》 2024年42卷6期 461-465页 ISTICCA
【摘要】 目的 应用生物信息学方法筛选系统性红斑狼疮(SLE)妊娠并发先兆子痫(PE)的关键基因,并分析其生物学功能.方法 从高通量基因表达(GEO)数据库下载SLE妊娠并发PE相关数据集GSE108497,利用R软件筛选差异表达基因(DEGs).采...
【中文期刊】 王晶 董辉 等 《生物信息学》 2024年22卷3期 183-191页 ISTIC
【摘要】 采用生物信息学方法,通过公共数据库,分析系统性红斑狼疮(SLE)N6-甲基腺苷(m6A)修饰谱系.基于公共数据建立SLE m6A传修饰表达谱,分析m6A相关的DEGs在SLE中的潜在作用;利用ADEx数据库获取DEGs,利用m6A GEO数...
【中文期刊】 翟立公 李港回 等 《微生物学报》 2023年63卷8期 3219-3234页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]研究高渗胁迫条件下德尔卑沙门氏菌(Salmonella enterica subsp.enterica Derby,S.Derby)的转录组调控机制,分析差异表达基因(differentially expressed genes,D...
【关键词】 高渗胁迫； 德尔卑沙门氏菌； 差异表达基因(DEGs)；
【中文期刊】 李鑫玉 唐秀琴 等 《中国酿造》 2024年43卷4期 123-128页
【摘要】 为探讨cdc50基因对酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)细胞功能的影响,该研究以PYM14质粒为模板,采用醋酸锂转化法对野生型酿酒酵母BY4742进行cdc50基因敲除,测定突变菌株Δcdc50生长情况,分别对野生...
【中文期刊】 何雅慧 陈芝涛 等 《中国医药科学》 2024年14卷9期 26-30页
【摘要】 目的 基于生物信息学分析探索肝细胞癌(HCC)中潜在的核心基因和关键通路,为HCC的诊断和治疗提供新思路.方法 本研究使用基因表达数据库(GEO数据库)下载数据集,通过GEO2R在线工具和韦恩图工具筛选出差异表达基因(DEGs),利用STR...
【中文期刊】 杨旻珉 屠海慧 等 《水生生物学报》 2023年47卷4期 581-593页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为探究罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)急性低温应激响应的基因表达模式,研究以罗氏沼虾成虾为研究对象,分别设置实验组(16℃)和对照组(24℃),实验组从24℃急性降温(2℃/1h)至16℃后的0、1h、3h、6...
【中文期刊】 张娟 高艳 等 《昆虫学报》 2023年66卷7期 896-908页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]本研究旨在筛选西方蜜蜂Apis mellifera采集蜂咽下腺中高表达的基因,为进一步筛选和研究蜜蜂采集行为相关基因提供依据.[方法]基于前期已获得西方蜜蜂3日龄工蜂(3d_W)、10日龄哺育蜂(10 d_N)、10日龄采集蜂(10...
【中文期刊】 永胜 高玉杰 等 《山西医科大学学报》 2023年54卷6期 791-799页 ISTICCA
【摘要】 目的 基于转录组学测序技术研究高原低氧条件下IL-17与Th17细胞信号通路诱导小鼠肾脏组织炎症发生机制.方法 C57BL/6小鼠分别饲养于海拔4 200 m(高原组)和海拔400 m(平原组)的环境下30 d,无菌取小鼠肾脏组织采用转录组...
【中文期刊】 顾凤群 李卫红 等 《西部中医药》 2023年36卷6期 44-50页 ISTIC
【摘要】 目的:探讨子宫内膜异位症发病机制的关键基因及相应的有效中药.方法:从基因芯片数据库(gene expression omnibus,GEO)下载有关子宫内膜异位症表达的GSE25628(数据集),利用在线GE02R筛选具有显著差异的差异表达...
【中文期刊】 高航 杨治 等 《山西医药杂志》 2023年52卷13期 963-966页 ISTICCA
【摘要】 目的 探索激素性股骨头坏死(SONFH)基因表达上的差异,筛选出关键致病基因,为SONFH诊疗提供新的靶点.方法 选取我院 2020 年 12 月至 2021 年 6 月SONFH患者和股骨颈骨折患者 18例作为研究对象,SONFH患者设为...
【中文期刊】 王芳 包怡华 等 《山西医科大学学报》 2023年54卷6期 808-813页 ISTICCA
【摘要】 目的 利用转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术探讨抗叶酸代谢药物甲氨蝶呤(methotrexate,MTX)处理的小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cells,mESC)基因转录表达的变化,...
【中文期刊】 李寒 徐新建 等 《昆虫学报》 2022年65卷8期 949-957页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]本研究旨在分析西方蜜蜂Apis mellifera工蜂蛹中期可能存在的低温应对机制以及低温对中期蛹发育的不利影响.[方法]对西方蜜蜂工蜂8 d封盖子进行低温(20℃)处理96 h(T),以未经低温胁迫的8 d封盖子为对照(CK),通...
【中文期刊】 赵旺生 李柯锐 等 《南方农业学报》 2023年54卷5期 1273-1282页
【摘要】 [目的]探明牦牛和犏牛的附睾尾部差异表达基因(DEGs),筛选出与精子成熟和贮存密切相关的功能基因,为揭示犏牛精子发生及其成熟过程的分子机制打下理论基础.[方法]以牦牛和犏牛的附睾尾部为研究对象,通过Illumina 127-HiSeq 2...
【中文期刊】 张宇 王金开 等 《南方农业学报》 2023年54卷3期 815-828页
【摘要】 [目的]分析白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryae,Xoo)侵染不同时间点的水稻转录组数据,了解其响应侵染过程中抗病相关基因的表达情况,为明确水稻对白叶枯病菌感病机制以及培育新的抗白叶枯病水稻品种提供理论参考.[...
【关键词】 水稻； 转录组； 差异表达基因(DEGs)；
【中文期刊】 霍慧霞 马雅静 《临床医学研究与实践》 2023年8卷13期 18-21页
【摘要】 目的 应用生物信息学技术筛选与活动性肺结核(ATB)有关的基因作为诊断标志物.方法 使用R包"GEOquery"从基因表达综合数据库(GEO)下载GSE19435、GSE83456训练集和GSE34608验证集,筛选ATB患者(ATB组)和...
【中文期刊】 孙伯辰 刘琳 《现代医药卫生》 2023年39卷11期 1829-1833页
【摘要】 目的 利用生物信息学方法筛选骨关节炎进展相关的差异表达基因(DEGs).方法 在基因表达组学数据库(GEO)下载GSE206848数据集,运用GEO2R在线工具进行分析,并筛选DEGs;利用R语言绘制火山图和热图.然后对DEGs进行GO功能...
【中文期刊】 郝丽芬 燕孟娇 等 《西北植物学报》 2021年41卷2期 197-211页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 油菜黑胫病是造成油菜产量损失的病害之一,致病菌为Leptosphaeria biglobosa.该研究采用形态学观察和转录组测序技术,分析油菜接种病原菌Leptosphaeria biglobosa 4、12、24、36、48和96 h后的...
【关键词】 差异表达基因(DEGs)； Leptosphaeriabiglobosa； 植物-病原菌互作；
【中文期刊】 周大祥 龙泉洲 等 《微生物学杂志》 2021年41卷5期 80-88页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了挖掘茄科罗尔斯通氏菌(Ralstonia solanacearum)致病相关基因,分别提取致病性(RS+)和无致病性(RS-)茄科罗尔斯通氏菌的总RNA进行转录组测序.两组测序数据经组装后得到5111条Contigs,RS-和RS+对比...
【中文期刊】 智鹏柯 石见 等 《检验医学与临床》 2022年19卷14期 1882-1885,1890页 ISTICCA
【摘要】 目的 采用生物信息学技术探讨胃癌发生及进展的机制.方法 采用GEO分析数据集GSE54129中胃癌组织标本与正常胃黏膜组织标本的差异表达基因(DEGs),然后用DAVID数据库对DEGs进行富集分析,STRING构建蛋白质相互作用(PPI)...
【关键词】 胃癌； VCAN； miR-203a-3p.1；
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