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【中文期刊】 卫泽刚 侯一凡  等 《宝鸡文理学院学报（自然科学版）》 2022年42卷1期 80-88页

【摘要】 目的 针对大规模16S rRNA基因序列聚类问题,对目前一些常见的OTUs划分算法,从不同数据集及多种评价指标方面进行比较研究.方法 在模拟数据集与真实数据集上,对现有12种经典OTUs划分算法进行了定量对比研究,并分析了这些算法的优缺点及...

【关键词】 聚类； 操作分类单元； 微生物；

【中文期刊】 谭春桃 李欢  等 《草业科学》 2019年36卷2期 531-539页

【摘要】 肠道微生物在宿主的生理活动、免疫调节以及健康方面均有重要的作用.尽管已有报道表明高原鼠兔肠道菌群和食物、环境有关,但对于野生和室内饲养条件下,取食不同食物的高原鼠兔肠道菌群是否存在差异尚不清楚.本研究利用16S rRNA 基因高通量测序技术...

【关键词】 高原鼠兔； 微生物； 16S rRNA；

【中文期刊】 周晨 张绍武  等 《北京生物医学工程》 2014年33卷6期 591-597页 ISTIC

【摘要】 目的 随着高通量测序技术的发展,产生了大量的微生物16S rRNA基因序列数据.对该数据进行精确的微生物操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)划分,有助于了解环境中微生物的种群组成及分布.方法 本文在真...

【关键词】 聚类； 操作分类单元； 16S rRNA基因；

【中文期刊】 张颖 乌日娜  等 《食品科学》 2017年38卷14期 30-35页

【摘要】 以东北传统自然发酵豆酱为研究对象,采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技术结合高通量测序...

【关键词】 东北传统发酵豆酱； PCR-DGGE； 微生物多样性测序；

【中文期刊】 轩断断 黎元莉  等 《中华预防医学杂志》 2022年56卷4期 512-518页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 为探讨海南岛的小泡巨鼠肠道微生物群落组成及其菌群多样性。2019年12月于海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室提取25只海南岛的成年小泡巨鼠（14只雄和11只雌性）粪便样本DNA，基于IonS5TMXL测序平台，利用单端测序（Singl...

【关键词】 肠道微生物； 高通量测序； 操作分类单元；

【中文期刊】 孙凤春 王微  等 《特别健康》 2018年22期 51-52页

【摘要】 用宏基因组技术研究不同比例锯末牛粪堆肥产物中微生物的组成和分布.结果表明,牛粪与锯末质量比为2:1、3:1、4:1的3个堆肥样本中微生物可操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)有较大的差异,其中含量最...

【关键词】 牛粪堆肥； 宏基因组； 微生物；

【中文期刊】 张建光 周军  等 《现代畜牧兽医》 2025年1期 25-31页

【摘要】 试验旨在研究卵泡发育正常和异常的哈萨克马粪便微生物差异.试验期内,所有母马均处于统一饲养管理条件和配种条件,配种成功后使用B超仪检测卵泡发育情况,选取卵泡发育正常和卵泡发育异常的母马各10匹,即正常组(zc组)和异常组(yc组).采集试验母...

【关键词】 卵泡； 哈萨克马； 粪便微生物；

【中文期刊】 邹建琴 黄萌  《福建医药杂志》 2025年47卷2期 12-16页 CA

【摘要】 目的 本研究旨在探讨肠道微生态对自然流产的影响.方法 收集20例自然流产患者和20例健康对照者的粪便样本.经过16SrRNA基因测序后,对获得的原始标签进行质量过滤以获得高质量测序标签,然后将其分类到微生物基因组中.所有有效标签被聚类为操作...

【关键词】 肠道微生态； 炎症标志物； 自然流产；

【中文期刊】 叶艺洁 张芯语  等 《食品研究与开发》 2025年46卷2期 32-39页

【摘要】 为分析新疆恰玛古内生细菌多样性,挖掘潜在的微生物资源及功能,利用高通量测序法对新疆恰玛古内生细菌结构组成进行分析,同时对传统培养法分离筛选得到的内生细菌进行 16S rRNA基因序列分子鉴定,进而对菌株的益生特性进行研究.高通量测序结果显示...

【关键词】 新疆恰玛古； 内生细菌； 高通量测序；

【中文期刊】 张凤霞 殷丽君  等 《食品研究与开发》 2025年46卷5期 204-211页

【摘要】 豆豉是中国传统特色发酵豆制品调味料,因其独特风味而备受消费者青睐.豆豉的生产过程由多个操作单元组成,操作单元的差异能使豆豉的挥发性风味有所区别,主要是由改变发酵体系中微生物组成所造成的.微生物分泌的酶系能将大豆中大分子营养物质水解成小分子营...

【关键词】 发酵豆制品； 豆豉； 微生物多样性；

【学位论文】 作者： 卫泽刚 导师：张绍武  西北工业大学  控制科学与工程 控制理论与控制工程（博士） 2019年

【摘要】 随着高通量测序技术的不断发展，产生了海量生物序列数据，如何有效挖掘分析这些数据面临巨大挑战。而基于高通量测序技术发展的宏基因组学，不依赖传统微生物纯培养技术，直接提取环境样本中全部微生物遗传物质，从DNA、RNA序列出发，研究样本中所包含的...

【关键词】 微生物操作单元； 动态多种子更新；

【学位论文】 作者： 常秦 导师：栾贻会 孙丰珠 李洪哲  山东大学  数学 概率论与数理统计（博士） 2012年

【摘要】 宏基因组学，广泛指研究直接来自环境的基因材料的学科，被认为是微生物发展中的一个里程碑。它不仅仅使得对未培养或者不可培养的微生物的研究成为可能，也使得研究同一环境中的微生物在自然条件下的相互作用以及微生物和环境条件的相互作用成为可能。随着测序...

【关键词】 宏基因组； 微生物群落比较；

【中文期刊】 严卓彦 吴益春  等 《中国药品标准》 2024年25卷6期 536-544页 CA

【摘要】 目的:评价宏基因组扩增子测序法在药品污染微生物检测中的应用价值.方法:采用分离培养法和扩增子测序法同时对16批中成药中的细菌和真菌进行检测.培养法得到的细菌和真菌分别用16srDNA和ITS测序法结合生物质谱进行鉴定.扩增子测序结果通过97...

【关键词】 扩增子测序； 中成药； 微生物污染；

【中文期刊】 付江岚 王岐本  等 《湘南学院学报》 2024年45卷2期 119-125页

【摘要】 本研究基于Illumina MiSeq高通量测序技术,分析酒曲中微生物菌群的组成和多样性,并利用PICRUSt和FAPROTAX进行功能预测.研究结果表明,白露米酒曲(CB)的物种丰富度、群落多样性均最大.经可操作分类单元分析共检出13个菌...

【关键词】 酒曲； 微生物多样性； 高通量测序；

【中文期刊】 汪倩 谢超  等 《食品研究与开发》 2024年45卷5期 107-113页

【摘要】 为研究空间电场技术对带鱼的保鲜效果,采用高通量测序(Illumina Miseq)技术,对舟山带鱼在空间电场结合微冻保鲜贮藏期间菌相变化及其碱基段进行基因测序,通过操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)...

【关键词】 空间电场； 带鱼； 保鲜运输；

【中文期刊】 樊哲 吕嘉丽  等 《中国卫生统计》 2023年40卷4期 636-640页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 目的 微生物组研究中的典型数据是由操作分类单元(OTU)计数组成,这些数据具有零膨胀、过离散、偏态等特点,常常被研究者忽视.本文旨在介绍微生物组学数据关联分析方法,并提出相关研究策略.方法 根据微生物组学数据特点,本文拟从线性相关分析和非线...

【关键词】 微生物组学； 多组学； 关联分析；

【中文期刊】 徐琳 高开成  等 《昆明医科大学学报》 2023年44卷8期 37-43页 ISTICCA

【摘要】 目的 探究参苓白术散(SLBZS)干预甲基苯丙胺(METH)诱导小鼠肠道微生物种群的作用机制.方法 SPF级C57BL/6J小鼠,分为生理盐水组、METH组、SLBZS+METH组,后两组使用METH注射 3 周,以及METH注射后参苓白术...

【关键词】 参苓白术散； 甲基苯丙胺； 肠道菌群；

【中文期刊】 江昀 胡亚洲  等 《水生生物学报》 2022年46卷9期 1332-1340页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 为探究不同健康状态下棘胸蛙(Paaspinosa,David)肠道菌群结构,文章对13个健康(Health组)、19个患歪头病(WHD组)和18个患蓝眼病(BED组)的棘胸蛙肠道微生物总DNA进行16S rRNA V4—V5高变区测序.结果...

【关键词】 肠道菌群； 健康状态； 脱铁菌门；

【中文期刊】 缪承杜 叶沛铭  等 《食品安全质量检测学报》 2023年14卷11期 147-153页

【摘要】 目的 分析蓝莓中细菌和真菌菌群的组成及其多样性,探究不同蓝莓样品中微生物的暴露水平.方法 构建了蓝莓中微生物菌群的基因组文库,利用高通量测序技术分析 5 种蓝莓中细菌和真菌菌群的组成及其多样性,借助微生物属水平和种水平分析比较蓝莓中细菌和真...

【关键词】 蓝莓； 高通量测序； 微生物菌群；

【中文期刊】 刘珍妮 谢华亮  等 《动物营养学报》 2023年35卷11期 7110-7122页

【摘要】 本试验旨在探究蚯蚓液对13～43周龄蛋鸡产蛋性能、蛋品质、血清生化指标和肠道健康的影响.选取432只体重接近的13周龄海兰粉蛋鸡,随机分为4组,每组6个重复,每个重复18只.对照组饲粮中不添加蚯蚓液,1％、2％和3％蚯蚓液组饲粮中分别添加1...

【关键词】 蚯蚓液； 蛋鸡； 产蛋性能；

【中文期刊】 温红瑞 高昌鹏  等 《动物营养学报》 2023年35卷10期 6546-6559页

【摘要】 本试验旨在探究饲粮中添加单宁和裂壶藻粉对滩羊生长性能及瘤胃菌群多样性的影响.选取体重[(25.53±3.18)kg]相近的5月龄健康滩羊公羔48只,随机均分为4组,每组12个重复,对照组饲喂基础饲粮,试验Ⅰ组饲喂基础饲粮+0.4％单宁,试验...

【关键词】 单宁； 裂壶藻粉； 滩羊；

【中文期刊】 张心怡 谢秀烨  等 《福州大学学报（自然科学版）》 2023年51卷3期 431-438页

【摘要】 采用高通量扩增子测序技术,对山羊瘤胃微生物宏基因组第10 家族(GH10)和第11 家族(GH11)木聚糖酶基因多样性进行分析.经序列拼接、过滤和可操作分类单元聚类(<95％),获得 348 个GH10 木聚糖酶基因.GH10 木聚糖酶基因...

【关键词】 木聚糖酶； 瘤胃； 基因多样性；

【中文期刊】 聂黔丽 王修俊  等 《食品科学》 2022年43卷14期 158-164页

【摘要】 以遵义细菌型干豆豉为研究对象,采用高通量测序技术分析该地区细菌型干豆豉菌群结构,并对其风味品质进行分析.根据多样性指数和可操作分类单元相对丰度综合分析得到该细菌型豆豉的主要贡献菌群为芽孢杆菌,少量的乳杆菌也是该豆豉发酵的重要细菌,二者协同发...

【关键词】 细菌型豆豉； 高通量测序； 菌落结构；

【中文期刊】 薛蓓 卢灏泽  等 《食品科学》 2022年43卷14期 176-182页

【摘要】 为探明西藏不同海拔地区的曲拉中微生物群落结构差异,采用高通量测序技术对采自低海拔、中海拔、高海拔3个组别共40份牦牛曲拉样品进行测序.结果表明,不同组样品间微生物多样性存在差异.随着海拔高度的增加,曲拉样品中细菌菌群的多样性与丰富度都呈下降...

【关键词】 群落结构； 高通量测序； 牦牛曲拉；

【中文期刊】 沈芳 杨英魁  等 《动物营养学报》 2022年34卷9期 5931-5941页

【摘要】 本试验旨在研究不同饲养方式对6月龄断奶牦牛犊牛生长性能、瘤胃发酵及菌群结构的影响.试验选择30头出生日期接近、体重在(51.72±3.15)kg的健康牦牛犊牛,随机分为舍饲组和放牧组,每组15头.舍饲组犊牛饲粮精粗比为65:35,放牧组犊牛...

【关键词】 牦牛犊牛； 饲养方式； 生长性能；

【中文期刊】 唐林 郭柯宇  等 《食品科学》 2022年43卷12期 203-209页

【摘要】 应用传统培养方法结合高通量测序技术分析屠宰分割过程中猪胴体表面微生物污染情况,并对屠宰车间刀具和分割车间接触面进行细菌菌落计数,以确定屠宰分割过程中的关键污染环节.结果表明:测序共得到881 458个有效序列,864个可操作分类单元,样品共...

【关键词】 猪胴体表面； 屠宰分割； 传统培养方法；

【中文期刊】 韩龙 张天祎  等 《食品安全质量检测学报》 2022年13卷21期 7065-7072页

【摘要】 目的 揭示普洱曼歇坝咖啡果干法加工初期微生物群落结构变化规律.方法 以普洱市曼歇坝干法加工咖啡果为样本,采用高通量16S rDNA和ITS扩增子测序技术分析加工初期不同时间点咖啡果细菌与真菌多样性.结果 从全部样品共获得623个细菌操作分类...

【关键词】 咖啡； 干法加工； 高通量测序；

【中文期刊】 俞和韦 王中康  等 《微生物学报》 2008年48卷4期 439-445页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]分析贡嘎蝠蛾肠道(Hepialus gonggaensis)幼虫肠道真菌多样性.[方法]采用常规分离与分子鉴定的方法和基于ITS(internal transcribed spacer)基因的RFLP方法,建立贡嘎蝠蛾幼虫肠道真菌的...

【关键词】 贡嘎蝠蛾； ITS序列； 真菌多样性；

【中文期刊】 高平平 晁群芳  等 《生态学报》 2003年23卷10期 1963-1969页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 应用TGGE指纹图谱技术对两个曝气池细菌种群的动态变化及多样性进行了研究.每3d进行1次,共8个监测时期中同一曝气池活性污泥的16S rDNA V3-PCR TGGE指纹图谱基本一致,图谱间的相似性系数(Cs)为100%.同一曝气池不同位点...

【关键词】 降酚活性污泥； 微生物种群结构； 动态变化；

【中文期刊】 韩春春 佘跃惠  等 《生物技术》 2012年22卷1期 67-72页 ISTICCA

【摘要】 目的:研究长庆油田延9低渗透油藏微生物群落,为实施微生物提高原油采收率提供指导和依据.方法:长庆油田延9油藏三口不同油井(柳28 -46、柳28 -47和柳27-45)的油水样品建立16S rDNA克隆文库进行研究.结果:构建了柳28 -4...

【关键词】 微生物群落； 16S rDNA克隆文库； 低渗透油藏；