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【中文期刊】 傅东升 艾克热木江·木合热木  《中国组织工程研究》 2025年29卷20期 4379-4388页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:多指畸形患者中参与Heghog信号通路的一些转录因子发生异常表达,这些转录因子调控大量靶基因的表达,从而影响细胞的功能.目的:通过单细胞转录组分析多指畸形患者的转录组特征.方法:从GEO公共数据库中下载4例多指畸形患者细胞间质和上皮细...

【关键词】 多指畸形； 转录因子； 生物信息学；

【中文期刊】 王瑾瑾 崔文飞  等 《南方医科大学学报》 2024年44卷7期 1243-1255页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 结合GEO数据库利用网络药理学、分子对接技术及动物实验探究鬼箭羽治疗糖尿病肾病(DKD)的潜在作用机制.方法 通过TCMSP、PubChem及Swiss Target Prediction数据库获取鬼箭羽的活性成分和作用靶点.利用GE...

【关键词】 鬼箭羽； 糖尿病肾病； GEO数据库；

【中文期刊】 黄海燕 翁嘉灏  等 《世界中医药》 2024年19卷10期 1369-1378,1385页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的:本研究拟验证参附汤这一经典名方是否通过铁死亡缓解心力衰竭.方法:网络药理学寻找参附汤、心力衰竭、铁死亡重叠基因.Metascape数据库进行基因本体(GO)富集分析及富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路预测.用阿霉素对H...

【关键词】 参附汤； 心力衰竭； 网络药理学；

【中文期刊】 张宏 展淑琴  《实用临床医药杂志》 2024年28卷19期 22-26,32页 ISTICCA

【摘要】 目的 基于生物信息学分析筛选阿尔茨海默病(AD)的核心基因,并对可能的致病信号通路进行分析.方法 从基因表达综合(GEO)数据库中下载AD相关基因芯片数据,筛选出GSE227221和GSE162873数据集.应用GEO2R在线分析软件筛选A...

【关键词】 阿尔茨海默病； 生物信息学分析； 免疫功能紊乱；

【中文期刊】 郭社卫 甄英伟  等 《中华神经外科疾病研究杂志》 2024年18卷5期 15-21页 ISTICCA

【摘要】 目的 基于中国脑胶质瘤基因组图谱数据库(CGGA)资料分析,构建有效预测胶质母细胞瘤(GBM)患者预后的列线图模型,以期为临床治疗提供帮助.方法 从CGGA数据库获取下载全基因转录组_693(mRNAseq_693)测序数据及临床数据,应用...

【关键词】 胶质母细胞瘤； 中国脑胶质瘤基因组图谱数据库； 基因本体分析；

【中文期刊】 陈启庭 林洪  等 《中国医院用药评价与分析》 2024年24卷6期 655-661页 ISTIC

【摘要】 目的:探讨活血化瘀中药药对川芎-赤芍拮抗动脉粥样硬化的潜在分子机制及药理过程.方法:使用R语言Limma包分析GEO数据库GSE43292 数据集,对有表达差异的动脉粥样硬化基因进行筛选和提取.川芎-赤芍药对所含的化学活性组分及靶点通过中药...

【关键词】 川芎-赤芍药对； 动脉粥样硬化； GEO数据库联合网络药理学；

【中文期刊】 姚曼曼 路月亭  等 《海南医学》 2024年35卷24期 3613-3620页 ISTICCA

【摘要】 目的 筛选天然多酚类化合物原花青素(procyanidin,PC)与OSCC相关的核心靶点及其调控机制,并探讨其对患者预后的影响,为PC在OSCC中的临床应用提供理论依据.方法 通过网络药理学方法筛选PC与OSCC的交集靶点,构建蛋白-蛋白...

【关键词】 原花青素； 口腔鳞状细胞癌； 网络药理学；

【中文期刊】 曹莎莎 李铭  等 《东南大学学报（医学版）》 2024年43卷3期 311-322页 ISTICCA

【摘要】 目的:基于丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路相关基因(MRGs)构建预后模型,提高食管鳞状细胞癌(ESCC)患者的预后效果.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)获取ESCC患者的相关信息,从京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库获取M...

【关键词】 食管鳞癌； 丝裂原活化蛋白激酶信号通路； 预后；

【中文期刊】 翟倩雯 郭玥  等 《亚太传统医药》 2024年20卷12期 126-132页

【摘要】 目的:明确叉头框蛋白O(FoxO)在呼吸道合胞病毒(RSV)感染疾病中的表达及意义,探究麻杏石甘汤是否通过调控FoxO信号通路治疗RSV感染疾病.方法:从基因数据存储的公共平台获得RSV感染人支气管上皮细胞(BEAS-2B细胞)差异表达基因...

【关键词】 麻杏石甘汤； 呼吸道合胞病毒； 基因微阵列数据库；

【中文期刊】 许泽波 孙文栋  等 《医学理论与实践》 2024年37卷18期 3066-3068,3100页

【摘要】 目的:结直肠侧向发育型肿瘤(LST)检出率逐年升高,但其发病机制尚不明确.本研究将通过生物信息学方法分析该疾病mRNA表达数据集,探讨其发病机制.方法:利用差异基因分析,明确GSE77635中LST与正常对照组差异基因表达的情况,并对差异基...

【关键词】 结直肠侧向发育型肿瘤； GEO数据库； 差异基因分析；

【中文期刊】 吴敏 朱可芯  等 《临床合理用药》 2024年17卷14期 19-22,28页

【摘要】 目的 利用数据挖掘技术,整理基于调控核转录因子-κB(NF-κB)通路中药复方治疗慢性肾脏病(CKD)的相关文献,分析该通路中药用药的特点与规律.方法 通过中国知网数据库检索基于NF-κB通路研究中药复方治疗CKD的相关文献,将涉及的中药复...

【关键词】 慢性肾脏病； 中药复方； NF-κB通路；

【中文期刊】 李鹏  《首都食品与医药》 2024年31卷23期 14-17页

【摘要】 目的 采用生物信息分析方法探讨SHP-1基因在卵巢癌中的表达、信号通路和预后关系.方法 在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中检索SHP-1基因,分析SHP-1基因在人实体肿瘤中的表达情况.应用相互作用基因/蛋白在线检索工具(STRING)建...

【关键词】 卵巢癌； TCGA数据库； SHP-1基因；

【中文期刊】 徐晓敏 房城  等 《世界中医药》 2023年18卷5期 600-605页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的:在肾脏代谢组学技术基础上,探讨黄芩-白芍药对对2型糖尿病(T2DM)的防治机制,并通过寻找内源性潜在生物标志物,寻找其相关代谢通路.方法:非糖尿病健康同窝出生仔畜(db/m小鼠)为空白组,同时选择血糖值高于11.1 mol/L的糖尿病...

【关键词】 2型糖尿病； 代谢组学； 肾脏组织；

【中文期刊】 袁艳 杨烨  等 《中国药理学通报》 2023年39卷5期 961-969页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 目的 探索头花蓼(Polygonum capitatum,PC)治疗幽门螺杆菌相关性胃炎(Helicobacter Pylori associated gastritis,HAG)的作用机制.方法 运用数据库识别PC活性化合物的作用靶点及H...

【关键词】 头花蓼； 幽门螺杆菌相关性胃炎； 网络药理学；

【中文期刊】 韩玲 陈琴  等 《中国医药导报》 2023年20卷13期 13-17页 ISTICCA

【摘要】 目的 基于生物信息学分析miR-143调控Toll样受体2(TLR2)信号通路对溃疡性结肠炎(UC)的影响.方法 在GEO数据库中下载GSE75214、GSE53306、GSE48958基因数据集及miRNA数据集GSE68306进行分析....

【关键词】 溃疡性结肠炎； 生物信息学分析； GEO数据库；

【中文期刊】 朱翠雯 马甜甜  等 《分子诊断与治疗杂志》 2023年15卷4期 549-553页 ISTIC

【摘要】 目的 基于癌症基因图谱(TCGA)数据库,分析DEAD-BOX RNA解旋酶(DDX27)基因在肝细胞癌中的表达、临床意义以及分子信号通路.方法 通过TCGA数据库下载的肝细胞癌相关的表达数据和临床特征数据,运用R.4.0.3软件和Stra...

【关键词】 DDX27； 肝细胞癌； TCGA数据库；

【中文期刊】 付佳音 莫非  等 《贵州医科大学学报》 2023年48卷3期 285-292页 ISTIC

【摘要】 目的 探讨胃癌(GC)组织中碳酸酐酶(CAⅨ)的临床意义及其分子机制.方法 采用基因表达谱动态数据分析(GEPIA2)数据库预测GC组织中CAⅨ基因的差异性表达,利用癌症数据分析(UALCAN)数据库分析CAⅨ表达与GC患者临床病理特征的关...

【关键词】 数据挖掘； 胃肿瘤； 碳酸酐酶Ⅸ；

【中文期刊】 张迁 刘娟  等 《国际检验医学杂志》 2023年44卷6期 704-707页 ISTICCA

【摘要】 目的 探讨基于GEO数据库分析黄褐斑基因表达的差异性,并对差异表达基因调控的功能通路进行分析.方法 将2021年4月作为时间截点,基于GEO数据库筛选黄褐斑相关基因表达谱,选择"chloas-ma"为筛选条件,"human"为物种类型.使用...

【关键词】 黄褐斑； GEO数据库； 基因；

【中文期刊】 李婉莹 贺磊  等 《山西医药杂志》 2023年52卷11期 866-870页 ISTICCA

【摘要】 目的 借助CiteSpace软件的合作网络共现和关键词聚类等多项功能对结肠炎与信号通路领域进行可视化分析,阐述当前发展现状并尝试预测未来发展趋势和前沿热点.方法 检索2000年1月至2022年9月中国知网、万方数据知识服务平台、维普网及We...

【关键词】 结肠炎； 数据可视化； 信号通路；

【中文期刊】 陈广芳 文昌晖  《西部中医药》 2023年36卷9期 25-34页 ISTIC

【摘要】 目的:通过基因表达数据库(GEO)芯片分析及分子对接方法探讨槲皮素对银屑病外周血中性粒细胞弹性蛋白酶(neutrophil elastase,NE)的分子机制.方法:从公共GEO下载GSE106087芯片数据,筛选差异靶点基因;收集中药系统...

【关键词】 银屑病； 基因表达数据库； 中性粒细胞；

【中文期刊】 付兴前 郭礼跃  等 《世界中医药》 2022年17卷5期 736-742页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的:基于数据挖掘和网络药理学探讨治疗肝肾亏虚型膝骨关节炎的用药规律及其作用机制.方法:通过检索国家知识基础设施数据库(CNKI)近10年治疗肝肾亏虚型膝骨关节炎的方剂,运用中医传承辅助平台建立数据库,利用该软件的熵聚类等算法,总结出治疗肝...

【关键词】 膝骨关节炎； 网络药理学； 数据挖掘；

【中文期刊】 霍叶琳 王月  等 《南方医科大学学报》 2022年42卷2期 190-200页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 通过挖掘GEPIA数据库中的基因信息,分析T细胞免疫球蛋白黏蛋白分子3(TIM-3)基因在上皮性卵巢癌(EOC)中的表达及作用机制.方法 采用GEPIA数据库在线分析TIM-3基因在EOC组织和正常卵巢组织中的表达水平.收集2018年...

【关键词】 GEPIA数据库； 上皮性卵巢癌； TIM-3基因；

【中文期刊】 张艳 周庆兵  等 《世界中医药》 2022年17卷9期 1254-1258,1264页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的:探究调节DNA甲基化的中药活性成分和用药规律.方法:运用GeneCards数据库获取DNA甲基化相关基因靶点,通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)查找靶基因相关的活性成分和中药,纳入条件为类药性≥0.18,口服生物利用度≥...

【关键词】 DNA甲基化； 表观遗传学； 数据挖掘；

【中文期刊】 徐魁 李敏才  《中国老年学杂志》 2022年42卷8期 1971-1974页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的 基于2型糖尿病(T2DM)患者内皮细胞中基因芯片数据分析差异性表达基因、信号传导通路及蛋白质网络.方法 从基因表达数据库(GEO)下载GSE92724数据,数据预处理后,使用R软件分析T2DM与对照组中内皮细胞差异表达基因,运用基因富...

【关键词】 糖尿病； 内皮细胞； 基因表达数据库；

【中文期刊】 陈士林 罗赣  《世界中医药》 2022年17卷4期 489-493,498页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的:基于数据挖掘和网络药理学探究中医古方治疗冠心病的配伍规律及作用机制.方法:从国家人口与健康科学数据共享平台提供的中医古方数据集V1.0中筛选治疗冠心病的方剂,通过SPSS Statistics25.0、SPSS Modeler14.1...

【关键词】 数据挖掘； 网络药理学； 冠心病；

【中文期刊】 韩夏夏 蒋扬  等 《上海交通大学学报（医学版）》 2022年42卷9期 1197-1207页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的·利用生物信息学方法研究系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)患者免疫细胞亚群的代谢通路活化水平.方法·从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载SL...

【关键词】 系统性红斑狼疮； 代谢通路； 基因表达综合数据库；

【中文期刊】 薛娜 肖莹  等 《中国免疫学杂志》 2022年38卷23期 2847-2851页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:利用多重生物信息分析挖掘和预测干燥综合征(SS)发病过程的核心基因及关键通路.方法:GEO数据库下载SS基因数据GSE97614,利用R语言中limma数据包进行均一化数据处理,GEO2R分析筛选差异表达基因(DEGs).多重生物信息...

【关键词】 生物信息学； GEO数据库； 核心基因；

【中文期刊】 金璐  《科技资讯》 2023年21卷4期 15-18页

【摘要】 数字通信相关技术以及计算机技术的快速发展极大地推动了高速数据传输的需求,PCIe Gen5信号速率已经达到32 Gb/s,在数据采集、雷达通信、遥感探测等领域,数据量的日益增大和数据处理的日益复杂化,使高速数据传输逐渐成为通信系统设计中的关...

【关键词】 Xilinx； XDMA； 数据通路；

【中文期刊】 李伟  《中国继续医学教育》 2023年15卷10期 170-173页

【摘要】 医学研究生教育的目标,是培养出具备较高临床诊疗水平和科研水平的医学生.然而,临床实践与科研实践往往难以兼顾,是目前医学研究生教育中面临的难题.肿瘤发生的原因,往往是由于基因的突变或表达异常.近年来,测序、芯片等高通量检测技术的普及,为肿瘤学...

【关键词】 肿瘤学； 研究生教育； 生物信息学；

【中文期刊】 梁宇堃 陈良全  等 《内蒙古医学杂志》 2023年55卷4期 385-390页

【摘要】 目的 运用癌症基因组图谱(TCGA)数据库,探究高迁移率族蛋白B1(high mobility group box 1,HMGB1)在结肠癌组织样本和正常组织样本中的表达情况,挖掘其与结肠癌临床特征的相关性.方法 运用生物信息学方法从TCG...

【关键词】 HMGB1； 结肠癌； TCGA数据库；