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【中文期刊】 李钦青 辛彦利 等 《中国药学（英文版）》 2024年33卷11期 1025-1039页ISTICCSCDCA
【摘要】 本研究旨在通过生物信息学分析,探讨女贞子治疗糖尿病肾病(DN)的可能机制.本研究通过对DN相关数据集和女贞子基因靶点进行初步的数据库检索,做了全面的调查.随后,采用ssGSEA方法对药物靶基因集进行评分,并根据这些评分对受试者进行分类.此外...
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【中文期刊】 周子寒 彭绍亮 等 《生物化学与生物物理进展》 2017年44卷1期 58-69页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 高通量测序技术的发展正在逐渐改变诸多生物学领域的研究方法.为应对突发疫情以及新发未知微生物威胁的需求,微生物鉴定技术逐渐从传统的物理化学方法及核酸杂交等分子水平方法进一步走向利用无需培养的测序数据进行快速分析检测.随之而来的是对高通量数据分...
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【中文期刊】 谢恩礼 詹建国 《医用生物力学》 2021年36卷6期 984-989页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究目前步态生物力学大数据分析的前沿进展.方法 以2011～2020年步态生物力学大数据分析相关的科技文献为研究对象,运用内容分析法,从主题结构、层级水平、模型类型和分析技术4个方面进行分析与讨论,并在此基础上对步态生物力学大数据分析...
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【中文期刊】 李肃义 唐世杰 等 《生物医学工程学杂志》 2020年37卷2期 349-357页MEDLINEISTICPKUCA
【摘要】 传统生物医学数据分析技术在大数据时代背景下,面临着巨大挑战,而深度学习技术在生物医学分析领域的应用,迎来了巨大的发展机遇.本文综述了深度学习在生物医学数据分析领域的最新研究进展.首先阐述了深度学习方法及工具,随后以时间为主线,围绕生物医学问...
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【中文期刊】 阿基业 何骏 等 《药学学报》 2018年53卷6期 929-937页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 代谢组学研究所产生多变量数据常采用主成分分析方法进行处理和评价,主成分分析涉及抽象的空间模型、复杂的理论计算、精细的数据转换,需要准确理解和把握主成分分析算法原理和特点.本文从主成分、主成分得分、主成分载荷、缩放与权重、偏最小二乘关联分析与...
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【中文期刊】 樊隽轩 黄冰 等 《古生物学报》 2016年55卷2期 220-243页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 定量方法在古生物学研究中的应用由来已久.经过一个半世纪的逐步发展,尤其是上世纪七十年代随着计算机技术的快速普及,各种数学理论及方法很快应用于化石的形态、分类、分布和演化过程等领域的研究,并演变出许多重要的交叉学科和新的研究方向.笔者等初步总...
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【中文期刊】 张琴 吴艳 《中医药管理杂志》 2021年29卷1期 184-185页
【摘要】 目的:探讨以数据分析为依托提升生物安全管理在检验科中的应用价值.方法:选取2019年4月～2020年4月经医院检验科进行相关指标检测的120例患者设为研究对象,随机均分为观察组、对照组,每组60例.对照组采用检验科常规管理方法,注重对检验环...
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【中文期刊】 邵光耀 杨军 《青岛大学学报（医学版）》 2020年56卷3期 347-351页ISTICCA
【摘要】 目的 对动脉粥样硬化(AS)病人基因芯片数据进行分析,寻找AS发生发展相关的潜在基因.方法 下载GEO数据库中高通量基因芯片数据集GSE43292和GSE28829,行GO基因功能注释和通路分析,然后进行蛋白相互作用网络分析并可视化.结果 ...
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【中文期刊】 裘炯良 孙志 等 《中华卫生杀虫药械》 2016年22卷6期 559-562页ISTICCA
【摘要】 目的 探索国际航行船舶不同部位截获外来医学媒介生物的风险性及高风险位置之间的相关性.方法 以宁波港为研究范围,开展为期一年半的船舶外来媒介生物携带情况调查,将到港外来医学媒介生物截获阳性的1 472艘次国际航行船舶列为研究对象,应用饼图法及...
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【学位论文】 作者：陈卫导师：张国庆 中国科学院大学 生物学 生物工程（硕士） 2022年
【摘要】 代谢组学是生物医学中发展和变化最快的领域之一。虽然非靶向代谢组学的数据分析需求越来越多，但是已有的非靶向代谢组学数据分析工具存在不足，包括数据分析功能方面不够完整，数据管理方面比较简单等。为了更加有效的方便科研人员处理非靶向代谢组学数据，我...
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【学位论文】 作者：黄子铭导师：蒋华良 郑明月 中国科学院大学 药学 药物设计学（硕士） 2022年
【摘要】 伴随着高通量测序技术的发展，大量的组学数据被积累起来。如何从生物组学大数据中挖掘有价值的信息并应用于医学和药学领域是目前组学数据分析的重大挑战。面对高度复杂、维度惊人的生物学数据，越来越多的人工智能方法被应用于组学数据分析。本论文的研究工作...
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【学位论文】 作者：苏晓泉导师：徐健 中国科学院大学 生物学 微生物学（博士） 2018年
【摘要】 微生物组是微生物行使其功能的基本单元，在解决健康、环保、生物能源等重大问题上有巨大潜力。目前，微生物组数据正在呈指数级增长，然而“群落对群落”式的微生物组搜索尚无高效解决方案，严重阻碍了对海量数据的深入解读。此中的技术难点包括如何降低海量样...
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【学位论文】 作者：孔杰导师：陈赛娟 中国科学院大学 生物学 生物化学与分子生物学（硕士） 2017年
【摘要】 单细胞测序技术能够实现单细胞分辨率水平的序列分析研究，探测细胞间异质性，被广泛用于诸如识别肿瘤细胞亚群、阐明肿瘤抗性机制等诸多研究。单细胞测序数据具有高转录本丢失、高测序噪声、高生物学差异等有别于传统测序数据的特征。对其进行充分的探索，需要...
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【学位论文】 作者：李付海导师：马尽文 北京大学 数学 应用数学（博士） 2008年
【摘要】 细胞的研究在生物医学中具有重要的地位。细胞是生命体的基本构成和功能单位。细胞的生长、分裂和死亡模式维系着生命的存在，但也会导致生命的终结。单个细胞内部包含了完整的遗传信息，其内在的信息系统决定了细胞如何应对外部的刺激以及细胞的功能，控制着整...
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【学位论文】 作者：石宝晨导师：陈润生 中国科学院生物物理研究所 生物学 生物物理学（博士） 2006年
【摘要】
在攻读博士学位期间，笔者主要在如下三个方面从事了一些生物信息学的研究工作，包括对实验生物学的生物信息学技术支持、数据分析以及应用聚类方法在高通量数据的整合分析方面进行了探索。
基于合作单位在单分子操纵和纳米PCR扩增技术方面的...
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【学位论文】 作者：刘翟导师：罗静初 魏丽萍 北京大学 生物学 生物学(生物信息学)（博士） 2005年
【摘要】 本博士论文包括两部分。第一部分介绍一种自行开发的原核生物转录因子预测新方法。第二部分主要介绍本院有关实验室产生的拟南芥、水稻和棉花DNA和蛋白质序列数据分析。 转录因子是基因转录调控过程中起重要作用的生物大分子。开发快速有效的转录...
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【学位论文】 作者：朱赛楠导师：马林茂 姚晨 中国疾病预防控制中心 公共卫生与预防医学 流行病与卫生统计学（硕士） 2004年
【摘要】 通过生物利用度研究对药品进行生物等效性评价是药物研究中的一项重要内容。1992年FDA公布了第一个生物利用度－生物等效性研究的试验设计和数据分析的指导原则，之后，随着仿制药生产的日益广泛和人们对药物生物等效性认识的发展，对生物等效性评价的要...
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【学位论文】 作者：包雷导师：孙之荣 清华大学 生物学 生物物理（博士） 2002年
【摘要】 在后基因组时代，功能基因组学研究充满了机遇和挑战。基因芯片技术是功能基因组学研究手段上一个非常重要的突破。它所产生的大规模基因表达数据一方面极大地加速了功能基因组学的发展，另一方面也为数据挖掘和知识发现提出了很大的挑战。功能基因组学的一项重...
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【中文期刊】 汤佳宁 孙洋 《药学学报》 2024年59卷8期 2192-2198页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 计算生物学(computational biology)属于生物学的一个分支,是指开发和应用数据分析及理论的方法、数学建模和计算机仿真技术等,用于生物学、行为学和社会群体系统的研究的一门学科.近年来,计算生物学越来越受到重视,这主要是因为高...
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【中文期刊】 李辰 刘紫涵 等 《生物技术》 2024年34卷1期 27-34页ISTICCA
【摘要】 [目的]在马铃薯基因组水平上鉴定木质形成素类蛋白(Xylogen-like protein,XYLP)基因家族,分析其理化性质及基因的表达模式.[方法]用生信学方法鉴定马铃薯XYLPs,分析其理化性质、亚细胞定位、进化关系、蛋白质结构、基因...
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【中文期刊】 朱仝飞 朱小庆 等 《中国药物化学杂志》 2024年34卷2期 120-125页ISTICCA
【摘要】 目的 对小花清风藤Sabia parviflora中的生物碱类成分进行研究.方法 采用硅胶柱色谱、Sephadex LH-20色谱、制备薄层色谱及重结晶等方法,对小花清风藤中的化学成分进行分离纯化,根据理化性质和波谱数据分析鉴定化合物结构....
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【中文期刊】 冯学超 邵雨彤 等 《生命科学》 2024年36卷12期 1572-1587页ISTICCSCD
【摘要】 空间转录组技术是一种通过测序或成像技术,在组织中进行基因空间表达检测的技术手段.该技术结合图像和建模分析算法,可以获得基因表达和各种细胞类型在组织中的空间分布模式.本文总结了空间转录组的实验检测原理和数据分析方法.在实验方法上,将目前的空间...
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【中文期刊】 郭兆刚 岳博 等 《解剖科学进展》 2024年30卷1期 102-104,108页ISTICCA
【摘要】 目的 研究非SMC粘合蛋白Ⅰ亚单位H(NCAPH)在胶质瘤的表达、预后以及参与的生物学功能.方法 下载并使用TCGA和GTEx数据库的表达谱数据分析NCAPH的表达水平;KM生存分析和COX回归分析NCAPH表达和患者预后的关系;GSEA分...
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【中文期刊】 孟德川 翟润翔 等 《中国海洋药物》 2024年43卷6期 62-72页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 通过分析中国海洋中药产品以及海洋中药专利数据,了解国内海洋中药产业发展现状,为促进海洋中药资源的合理开发利用、推动海洋生物医药产业健康发展提供参考.方法 通过《中华人民共和国药典》、国家医保信息业务编码标准数据库以及《中华海洋本草》获...
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【中文期刊】 吴耀棠 吴洋 等 《病毒学报》 2023年39卷2期 499-508页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 RNA干扰(RNA interference,RNAi)是宿主细胞抗病毒的关键方法之一,其核心切割酶Dicer会将病毒复制过程中产生的双链RNA切割成长度为21-23 nt小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA...
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【中文期刊】 王文娟 《生物化学与生物物理进展》 2021年48卷11期 1358-1364页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 荧光寿命是指荧光分子在回到基态前在激发态停留的平均时间.本文发展了基于荧光寿命测量来定量分子内和分子间相互作用的方法:通过G碱基猝灭对于荧光寿命的影响定量DNA二级结构的形成;通过荧光共振能量传递(FRET)中荧光寿命的变化来定量分子间的相...
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【中文期刊】 曾渝 陈磊 《现代免疫学》 2023年43卷3期 189-196页ISTIC
【摘要】 研究从大规模单细胞转录组测序数据出发,获得结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中肠道内分泌细胞(enteroendocrine cell,EEC)的单细胞转录组图谱;对此转录组测序数据作差异表达、功能以及拟时序分析,结果提...
【关键词】 单细胞转录组测序数据分析；结直肠癌；组学数据挖掘；
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【中文期刊】 邢永强 何泽学 等 《生物化学与生物物理进展》 2019年46卷11期 1118-1129页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 可变剪接是转录后重要的基因表达调控方式,也是转录组和蛋白质组多样性的重要来源.近年来随着拟南芥、水稻、玉米等植物转录组测序的完成,研究人员发现植物pre-mRNA可变剪接的发生与组织分化、发育等生物学过程密切相关.本工作基于GEO数据库的R...
- 概要：
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【中文期刊】 朱伯婧 智渊 等 《生物化学与生物物理进展》 2017年44卷10期 821-829页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 蛋白质糖基化作为最普遍、最重要的蛋白质修饰,一直是组学研究的焦点之一.近十几年来,N-连接糖蛋白质组学研究普遍采用的方法是将糖链与所修饰的多肽分开进行分析.该策略虽降低了分析难度,却也丢失了糖链与蛋白质糖基化位点间重要的对应关系信息.近年来...
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【中文期刊】 张霞 钱雪情 等 《天然产物研究与开发》 2021年33卷11期 1887-1893页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本论文对一株绳生毛壳霉(Chaetomium funicola CIB-604)的次级代谢产物进行了研究.采用硅胶柱层析、Sephadex LH-20凝胶柱层析、半制备液相等色谱方法从其大米固体发酵物中分离得到了8个化合物,通过1H NMR...
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