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【中文期刊】 梅曼 王晨璨 等 《植物研究》 2025年45卷1期 3-14页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 空间转录组(spatial transcriptomics,ST)是一种用于从空间层面上解析RNA-seq数据的技术,利用该技术解析单个组织切片中的所有mRNA.空间条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着,使得在mR...
- 概要:
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【中文期刊】 孙元洁 常清贤 《妇产与遗传(电子版)》 2024年14卷2期 29-34页
【摘要】 通过高分辨率的空间转录组数据,能够揭示不同功能区域的细胞构成及基因差异化表达信息.在胚胎发育领域,该技术为理解分子机制提供新视角;在母胎关系研究中,可揭示母胎界面基因表达变化,有助于深入理解母胎相互作用.此外,空间转录组技术还为识别妊娠并发...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 李洁 陈晨 等 《内科急危重症杂志》 2023年29卷3期 177-180页ISTIC
【摘要】 肝脏是人体重要的免疫器官,在检测、捕获、清除病原体和外来抗原中发挥着重大作用.本文主要简述高通量单细胞及空间组学技术解析肝脏在感染性疾病中的应用.随着高通量单细胞技术的发展,现在可以在单细胞水平上破译复杂器官和疑难疾病的异质性、分化、细胞间...
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- 结论:
【中文期刊】 邱丹丹 《肾脏病与透析肾移植杂志》 2022年31卷3期 256-260页ISTICCSCDCA
【摘要】 近10年来,通过单细胞RNA测序获取单个细胞基因表达谱、鉴定细胞类型和功能已取得重大进展.然而细胞在不同组织内的空间位置信息对于进一步鉴定细胞类型,明确细胞功能变化和细胞间相互作用,探索组织内环境改变及其同疾病发生发展的关系至关重要.空间转...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 危莹 张小丹 等 《生物化学与生物物理进展》 2022年49卷3期 561-571页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 空间转录组技术旨在对细胞的基因表达进行定量测量,同时提供细胞在组织空间的具体位置信息.与传统的转录组技术相比,空间转录组技术能获得细胞在组织生理环境下真实的基因表达特征,以及与微环境的关系,进一步推进对正常和病理状态下细胞特性的理解.近年来...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 杨佳凤 陈鹏璐 等 《中国细胞生物学学报》 2021年43卷2期 476-483页MEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术是一项新兴的研究单个细胞转录水平的技术,其从数千个平行的细胞中生成转录谱,揭示个体细胞基因组的差异性表达,反映细胞间的异质性,从而鉴定出不同细胞类型,形成组织...
【关键词】 单细胞转录组测序技术;细胞类型;空间转录组;
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【中文期刊】 孟小高 彭广敦 《生命科学》 2022年34卷1期 99-106页
【摘要】 肺是呼吸系统中最重要的器官,承担气体交换功能.在肺的发育过程中,首先形成的是气道,包括气管、支气管、小支气管等结构;而后形成远端具有气体交换功能的肺泡结构.肺发育是一个复杂精细的过程,其发育起源及各细胞系间的异质性一直是数年来关注的重点.随...
- 概要:
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【学位论文】 作者:孙航导师:管仁初 吉林大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术(硕士) 2023年
【摘要】 空间转录组测序技术于2020年被《NatureMethods》杂志评为年度技术,近3年来该技术发展迅速。与单细胞RNA测序(single-cellRNAsequencing,scRNA-seq)技术相比,空间转录组测序技术既可以获得基因表达...
- 概要:
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- 结论:
【学位论文】 作者:赵海潮导师:赵浩亮 山西医科大学 临床医学 外科学(博士) 2022年
【摘要】
目的:
肝癌(livercancer)是我国最常见的恶性肿瘤之一,位居全球恶性肿瘤发病率的第6位,肿瘤死亡率的第3位。其中,85%的原发性肝癌为肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)。近年来,对于肝癌的...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 冷玉洁 陈思雨 等 《成都医学院学报》 2025年20卷3期 361-366页ISTICCA
【摘要】 目的 通过转录组测序分析经鼻胰岛素改善小鼠高原认知功能障碍的分子机制.方法 实验分为常氧对照组(C)、高原组(H)和胰岛素治疗组(HI).H组和HI组小鼠放入高原舱,模拟海拔6 000 m,HI组经鼻给予胰岛素7 d(17.5 μL).通过...
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【学位论文】 作者:肖镜舒导师:蔡军 中国科学院大学 生物学 生物工程(硕士) 2020年
【摘要】 单细胞转录组测序技术(Single-cell RNA-seq)是一种可以获得单个细胞转录组数据的测序技术,相比传统的转录组测序技术得到多个细胞基因表达值的平均值,单细胞转录组测序技术能得到单个细胞的转录表达数据;细胞所处的空间位置通常与之命...
【关键词】 单细胞转录组测序技术 ; 冰冻切片 ;
- 概要:
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【中文期刊】 许泽玫红 杨如玉 等 《国际妇产科学杂志》 2024年51卷1期 82-86页ISTICCA
【摘要】 子宫内膜异位症(endometriosis,EMs)是育龄期妇女常见疾病,发病机制尚未明确.该病有着独特的类肿瘤表现,由细胞成分(如巨噬细胞、自然杀伤细胞和T淋巴细胞等)和非细胞成分共同构成的免疫微环境在异位病灶的发生发展中起重要作用.空间...
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【中文期刊】 刘腾 李鑫 等 《生物信息学》 2024年22卷4期 270-276页ISTIC
【摘要】 空间转录组测序技术能够在生成基因表达谱的同时,保留细胞在组织内部的位置信息.如何充分利用基因表达谱和空间位置信息来识别空间区域,完成细胞亚群聚类是空间转录组学数据分析的基础和关键.本文提出基于变分自编码器和图神经网络结合的空间转录组细胞亚群...
- 概要:
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【中文期刊】 汪启凡 苏国庆 等 《中国肿瘤外科杂志》 2024年16卷6期 603-609页ISTICCA
【摘要】 肿瘤微环境(TME)中细胞之间的相互作用是影响肿瘤进展和患者转归的重要因素,而传统的组学手段无法真实反映TME中细胞的位置和通讯信息.空间组学技术的出现为解决上述问题提供了新的机遇.从空间层面解析TME,有助于全面地理解肿瘤的生物学行为和进...
- 概要:
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【中文期刊】 关双 刘溪 等 《中国现代医生》 2024年62卷2期 108-111页
【摘要】 空间表达变异基因的识别是阐明空间转录组学的基础.空间表达变异基因的分析需应用空间转录组数据相关公共存储库和计算技术.本文综述空间转录组学应用于空间表达变异基因识别的计算方法,阐述空间表达变异基因识别在肿瘤异质性研究中的应用进展,以进一步理解...
- 概要:
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【中文期刊】 万令飞 潘文婷 等 《生物技术进展》 2024年14卷5期 793-804页
【摘要】 肝纤维化是一种严重威胁人类健康的疾病,单细胞转录组测序技术为揭示其复杂的病理机制提供了全新途径.传统的研究方法在识别肝纤维化中不同细胞亚群及其基因表达变化方面存在局限,难以深入理解疾病机制.概述了单细胞转录组测序技术在肝纤维化过程中对不同细...
- 概要:
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【中文期刊】 董艳 李军 等 《世界中医药》 2023年18卷14期 2081-2087,2091页ISTICPKUCA
【摘要】 中医药是我国的传统和特色医学,一直以来为人们的健康保驾护航,但随着现代医学的发展,它逐渐面临着如何实现客观化、精确化和靶向化的难题.转录组学是连接基因与表型的桥梁,决定遗传物质表达与否,受外源和内源因素的共同调控,能反映内部基因组与外部物理...
- 概要:
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【中文期刊】 焦作义 李鉴 《兰州大学学报(医学版)》 2023年49卷8期 1-5页ISTIC
【摘要】 空间多组学技术是一种综合性的研究方法,旨在结合多个分子组学层面与组织的空间信息,以便更全面地理解生物体内分子之间的相互作用和空间分布[1],揭示生物系统的复杂性和多样性[2].肿瘤组织在空间上表现出多种类型和状态的异质性.
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【中文期刊】 谢意 郏科人 等 《肿瘤综合治疗电子杂志》 2023年9卷3期 74-81页
【摘要】 空间多组学技术包括空间转录组学、空间蛋白质组学和空间代谢组学等技术.相较于传统测序和单细胞组学,空间多组学保留了重要的分子空间位置,多维度揭示分子间相互作用及功能状态.在肿瘤学领域,空间多组学技术能将肿瘤细胞及其间质二维结构分辨至细胞以及亚...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 戴丹 何雯婷 等 《中国研究型医院》 2022年9卷6期 65-69页
【摘要】 肿瘤内异质性(ITH)和肿瘤免疫微环境的异质性是肿瘤进展和耐药性的关键因素.单细胞测序技术(scRNA-seq)是在混杂样品中检测特定细胞的遗传信息,为发现肿瘤细胞内变异以及肿瘤的发展提供线索.数字空间多组学技术(DSP)将蛋白组和转录组与...
- 概要:
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【中文期刊】 宋金益 胡海洋 《科技与创新》 2022年16期 173-177页
【摘要】 单细胞转录组测序是近年来测序技术领域的重要创新.其不仅已成为探索生物异质性最有力的途径之一,且在单个细胞中操纵皮克级RNA的卓越能力赋予了基于单细胞测序相关研究前所未有的时间和空间分辨率,极大推进了众多生命医药领域的创新性应用.对单细胞转录...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 刘岩 常德 等 《解放军医学院学报》 2014年35卷12期 1234-1236,1256页ISTICCA
【摘要】 目的 筛选空间环境诱变的肺炎克雷伯菌突变株及并进行全转录组分析.方法 利用Biolog生化反应板从搭载于神舟八号飞船的肺炎克雷伯菌中筛选突变株,然后采用高通量测序技术对突变株全转录组测序,原始测序数据经处理后进行基因表达注释和差异表达基因的...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 张成 周承哲 等 《生物工程学报》 2024年40卷4期 971-987页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 植物细胞基因表达的异质性是造成组织功能差异的关键因素.近年来,利用空间转录组测序技术研究植物特定生物学问题已取得较大突破,现已成功应用于细胞发育、细胞鉴定和抗逆应激等方面.为探究空间转录组测序技术在植物中的应用,本文对空间转录组测序技术的发...
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【中文期刊】 姜宇佳 荆泽华 等 《中国生物工程杂志》 2024年44卷1期 19-31页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 时空组学技术(spatiotemporal omics technology)是对组织或细胞在连续的时间和空间维度内观测或检测生命多组学表达和调控特征的技术统称,可以在亚细胞、细胞、组织、器官、个体、群体和进化水平解析由遗传分子决定的生命现...
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【中文期刊】 马莉 崔海星 等 《中国生物工程杂志》 2023年43卷8期 111-117页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 空间组学以分子的视角揭示细胞间的微环境互作及空间异质性,在神经科学、癌症研究和发育生物学等领域发挥重要作用.该技术的学术热度较高,却一直处于"垄断式"发展.从空间组学技术在全球和中国专利申请的整体情况入手,分析了该领域全球和中国相关专利申请...
- 概要:
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【中文期刊】 胡懿凡 胡静涵 等 《海军军医大学学报》 2023年44卷7期 808-815页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 单细胞转录组测序联合空间转录组测序可解析组织内每一个细胞的转录组表达谱和空间位置信息,有助于探究细胞的基因表达水平和组织的三维重建,解读细胞异质性,理解细胞间的联系和相互作用,对于深入探讨疾病发生和发展的细胞与分子机制具有重要意义.纤维化疾...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 杨鹏挥 金丽君 等 《中国中药杂志》 2022年47卷15期 3977-3985页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 单细胞组学技术是近年来发展极为迅速的新兴技术之一,可在单细胞尺度上实现多种组学信息的无偏、高通量获取.目前,单细胞组学技术凭借其强大的组织异质性解析力,已成为深入理解组织的功能结构、揭示复杂疾病过程和阐明药物作用机制的革命性工具.针对破解中...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 乔凯琳 袁双虎 《中华肿瘤防治杂志》 2022年29卷17期 1243-1248,1263页ISTICPKUCA
【摘要】 近年来,空间转录组学蓬勃发展,新技术不断涌现,在肿瘤研究等领域广泛应用.与传统转录组技术相比,空间转录组技术不仅可以检测细胞的基因表达水平,还能获得基因在组织内的空间位置信息,在研究肿瘤的异质性、微环境和免疫等方面提供了巨大帮助.虽然空间转...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 周馨蓓 张伟 等 《环境与职业医学》 2022年39卷12期 1350-1358页ISTICPKUCSCD
【摘要】 [背景]单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)和空间转录组测序技术的兴起使得肺部疾病得以深入研究,但这两者在矽肺中的研究甚少.[目的]利用scRNA-seq联合空间转录组测序技术探索矽肺巨噬细胞中差异表达基因(DEGs)和潜在诊断基因....
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 郭俊璠 黄行许 等 《生命的化学》 2022年42卷1期 1-11页ISTICCA
【摘要】 基于CRISPR的单细胞转录组测序技术是将单细胞转录组测序技术与CRISPR集中筛选技术结合,用于研究传统技术无法完成的细胞异质性、细胞谱系追踪、细胞互作及空间位置、药物作用靶点预测和鉴定等.本文简单比较了六种最常用的单细胞转录组测序技术,...
【关键词】 单细胞转录组测序技术;Perturb-Seq;CRISP-Seq;
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