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【中文期刊】 张宗源 岳丹丹 等 《生物学杂志》 2025年42卷2期 33-39页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了筛选一株产细菌素乳酸菌,并对其进行细菌素基因簇的挖掘,以大肠杆菌、金黄色葡萄球菌为指示菌,通过常规方法初筛和复筛后筛选出1株抑菌能力较强的产细菌素的戊糖乳杆菌Lpe59.全基因组测序结果显示,菌株Lpe59基因组大小为3 274 558...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨梅 牛鹏威 等 《基因组学与应用生物学》 2025年44卷4期 370-380页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 由革兰阴性菌水稻黄单胞菌(Xanthomonas Campestris pv.oryzae,Xoc)引起的细菌性条斑病(bacterial leaf streak,BLS)是水稻生产区最具破坏性的病害之一,尤其是在潮湿的热带、亚热带地区.本...
【关键词】 水稻黄单胞菌(Xoc)；细菌性条斑病(BLS)；水稻；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘轶 匡慧慧 等 《中华医院感染学杂志》 2024年34卷20期 3041-3045页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 对一株多药耐药肺炎克雷伯菌进行全基因组测序并对全部耐药基因进行分析.方法 2023年10月从一名脑梗死患者的尿液中常规方法分离肺炎克雷伯菌,进行鉴定和药敏试验,并通过16sRNA测序进行菌株确认,采用三代测序技术进行全基因组测序,通过...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 许一丹 谢成彬 等 《检验医学与临床》 2024年21卷9期 1224-1228,1234页ISTICCA
【摘要】 目的 通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)、16 S rRNA序列分析和全基因组测序(WGS)对从临床标本中分离的 1 株疑似盐单胞菌进行菌种鉴定,比较 3 种方法的鉴定结果.方法 采用MALDI-TOF MS对...
【关键词】 细菌鉴定；基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱；16S rRNA序列；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 邓安霞 王子豪 等 《中国急救医学》 2024年44卷12期 1070-1078页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 应用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)技术探究免疫细胞特征与细菌性肺炎之间的相关性.方法 选取已知731种免疫细胞特征,从全基因组关联研究(genome-wide association study,...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孟人杰 罗楠 等 《军事医学》 2024年48卷3期 213-218页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 利用深度学习方法,鉴别基因组相似度很高的大肠杆菌和志贺菌,为临床诊断和疫情防控提供参考依据.方法 提出一种迁移学习大规模预训练蛋白质语言模型的卷积神经网络(CNN),用于细菌类型鉴别,该方法可在属水平上实现对细菌类型的快速准确鉴别.为...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 马浩天 李杨 等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷12期 5117-5127页
【摘要】 [目的]贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)CM7-4是从海水中分离的具有良好抗菌活性的芽孢杆菌.本试验旨在探究贝莱斯芽孢杆菌CM7-4的抗菌机理,并对其全基因组序列进行分析,以期挖掘其抗菌等功能特性基因.[方法]通过酸...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈志娜 尹琳琳 等 《食品科学》 2024年45卷22期 43-50页
【摘要】 为了深入挖掘对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)具有显著抑制作用的植物乳植杆菌CHEN1细菌素基因簇,使用PacBio RS和Illumina测序平台...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 任青霞 户行宇 等 《中国食品学报》 2024年24卷9期 184-193页
【摘要】 目前乳酸菌发酵产细菌素的含量较低,因此优化产细菌素的发酵条件是最直接的方式.对分离自内蒙古传统干酪的植物乳杆菌NMGL2的抗生素药敏性、溶血性以及全基因组序列进行分析,结果表明该菌株无明显毒力作用,不携带高毒力因子,抗性基因无转移风险.对植...
【关键词】 植物乳杆菌NMGL2；全基因组测序；安全性；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 纪帅奇 乌日娜 等 《食品科学》 2024年45卷2期 57-63页
【摘要】 为了详细解析枯草芽孢杆菌SNBS-3的基因组特征,本研究在前期研究基础上,采用Illumina二代测序技术和第三代高通量Pacbio测序平台,对从传统豆酱中筛选得到的枯草芽孢杆菌SNBS-3进行全基因组测序,获得菌株基因组特征信息、基因功能...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 苏惠 王云飞 等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷7期 3166-3175页
【摘要】 [目的]研究1株乳杆菌所产细菌素的稳定性,并挖掘其编码基因簇.[方法]取来自内蒙古自治区巴彦淖尔市的传统泡菜置于MRS肉汤中,37 ℃培养12 h分离细菌.以鼠伤寒沙门菌为指示菌进行抑菌试验,对分离菌株进行筛选,并对菌株进行16S rRNA...
- 概要：
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【中文期刊】 郭丹 李元敬 等 《黑龙江大学自然科学学报》 2023年40卷4期 425-433页
【摘要】 为全面了解汉氏葡糖醋杆菌(Komagataeibacter hansenii,K.hansenii)HDM1-3 的发酵特性,为提高纤维素产量提供基因组信息,对其基因组数据进行测序分析.采用PacBio RS Ⅱ平台对该菌株进行全基因组测序...
【关键词】 汉氏葡糖醋杆菌HDM1-3；细菌纤维素；全基因组测序；
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【中文期刊】 郑雪 梁琪 等 《食品科学》 2023年44卷20期 119-126页
【摘要】 融合魏斯氏菌(Weissella confusa)ZW2 1是1 株具有良好抗菌活性的牦牛乳源乳酸菌,为探索其抗菌机理,分析其全基因组序列并挖掘该菌株的抗菌等功能特性基因.本研究基于Illumina NovaSeq PE150平台对W.co...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 涂会鑫 董文龙 《中国兽医杂志》 2023年59卷11期 42-46页
【摘要】 前期研究从内蒙古手工奶酪中筛选出1株可拮抗金黄色葡萄球菌的乳酸菌Lacticaseibacillus saniviri(LS-1).为探究LS-1的全基因组信息,挖掘其潜在细菌素编码基因簇,本试验对LS-1进行全基因组测序,对编码基因进行预...
【关键词】 细菌素；乳酸菌；Lacticaseibacillus saniviri；
- 概要：
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【中文期刊】 王芹 《医学检验与临床》 2023年34卷8期 26-30页
【摘要】 目的:对我院分离的两株亚胺培南中介奇异变形杆菌进行全基因组测序并分析其耐药特征.方法:选取两株亚胺培南中介奇异变形杆菌(Ⅱ-PMI,Imipenem-Intermediate Proteus mirabilis).按照CLSI2020年公布...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 季乐财 张乐平 等 《中国防痨杂志》 2021年43卷2期 166-170页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过全基因组测序技术分析深圳市耐多药结核分枝杆菌(MDR-MTB)的耐药性检测情况,为MDR-TB患者的治疗及防控提供科学依据.方法 选取2013-2017年存储于深圳市慢性病防治中心结核病实验室并成功复苏的420株MDR-MTB临床...
- 概要：
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【中文期刊】 林本夫 任欣悦 等 《中国动物检疫》 2022年39卷6期 125-131页
【摘要】 为探讨细菌全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)技术在基层沙门氏菌防控中的优势与可行性,对前期分离的9株沙门氏菌进行细菌全基因组测序,并进行血清型预测、多位点序列分型(multilocus sequence ...
- 概要：
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【中文期刊】 杨超 杨瑞馥 等 《遗传》 2018年40卷1期 57-65页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 随着测序技术的发展和全基因组序列的不断积累,全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)在人类复杂疾病研究中取得了丰硕成果,10余年间发现了数以万计的疾病风险因子.同样,GWAS也为探索细菌表型的...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 史志远 陈楠 等 《食品安全质量检测学报》 2021年12卷17期 6826-6834页
【摘要】 目的 对分离自母乳、婴儿肠道的植物乳杆菌进行全基因组测序,分析菌株间亲缘关系和细菌素合成相关基因.方法 采用Illumina高通量测序平台对不同来源的植物乳杆菌进行全基因组测序,质控过滤后的数据经Unicycler组装获得基因组精细图,通过...
- 概要：
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【中文期刊】 李萧 王淼 《工业微生物》 2020年50卷2期 7-14页ISTICCA
【摘要】 细菌纤维素(BC)是一种新型的可再生、可降解的生物高分子材料.为了最大程度的发挥BC生产菌株K.rhaeticus 315的生产能力,本文首先对K.rhaeticus 315进行全基因组测序,通过功能基因的注释、分析碳源代谢流向.结果 显示...
- 概要：
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【中文期刊】 周江林 彭小川 等 《生物技术通讯》 2018年29卷6期 844-850页ISTICCA
【摘要】 基因组变异进化是新型细菌病原体不断出现的重要原因之一,细菌可以通过获得或丢失一些基因及基因突变来获得新的特性和适应性,比如毒力增强或耐药性增强等,从而导致新流行亚型的出现,为临床诊断治疗、传染病监测防控带来极大挑战.全基因组测序方法可以有效...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 谷美 刘慧敏 等 《中国乳品工业》 2019年47卷5期 26-31页
【摘要】 细菌耐药性严重威胁人类健康和公共卫生安全,特别是菌株的多重耐药问题已是全球关注的热点话题.全基因组测序技术作为一种新型技术,在已知耐药基因型检测、耐药表型预测和潜在耐药基因确定等方面具有较好的敏感性和特异性.现将全基因组测序技术在细菌耐药性...
- 概要：
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【中文期刊】 何随彬 瞿瑜萍 等 《上海畜牧兽医通讯》 2017年3期 12-15页
【摘要】 全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study,GWAS)是近年来迅速兴起的一种新型基因组分析方法,它利用全基因组范围内筛选出高密度的分子标记对所研究的群体进行扫描,分析扫描得出的分子标记数据与表型性状之间关联...
【关键词】 全基因组关联分析(GWAS)；单核苷酸多态性(SNP)；畜禽；
- 概要：
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【中文期刊】 蒋琰 俞云松 《中华临床实验室管理电子杂志》 2016年4卷3期 134-138页
【摘要】 新一代高通量测序技术的成熟和普及使微生物基因组学获得长足发展,采用全基因组序列分析追踪和溯源临床重要耐药菌院内感染的暴发,已成为近年临床微生物研究领域的热点,并形成了一个新的学科方向——基因组流行病学.在将全基因组序列分析用于临床耐药菌流行...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：陈如言导师：郭小兵 郑州大学 临床医学 临床检验诊断学（硕士） 2024年
【摘要】
背景与目的
碳青霉烯类抗生素是目前临床上治疗多重耐药革兰阴性菌感染的重要选择。然而，随着其在临床及畜牧业上的广泛使用，耐碳青霉烯类细菌（Carbapenem-resistantOrganism,CRO）的分离率逐年升高。基于CRO...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：赵树川导师：黄红兰 吉林大学 生物学 微生物学（硕士） 2024年
【摘要】 医院不动杆菌是醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合体中的一种，是引起医院内获得性感染的常见病原体之一，常存在于静脉导管、呼吸机等医疗器械或非医疗器械表面，易引起肺炎、脑膜炎、尿路感染等多种病症，经常导致患者发生菌血症。医院不动杆菌可以在生物表面和非生物...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：肖晓导师：刘周 安徽医科大学 临床医学 临床检验诊断学（硕士） 2023年
【摘要】
目的：分析耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌（CRE）耐药性及临床感染特征，mcr-9阳性耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌（CRECL）质粒、耐药基因、毒力因子及亲缘性等特征，为临床CRE和mcr-9阳性CRECL感染监测和控制提供参考。
方法：（1...
【关键词】 耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌 ； 耐药性 ；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 余树坤 崔紫妍 等 《中国人兽共患病学报》 2025年41卷1期 61-66页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 对武汉市某区一起疑似产气荚膜梭菌引起的食物中毒事件进行分子分型溯源及耐药特征性分析.方法 采用FIlm ArrayTM检测系统和多重荧光定量PCR方法对中毒事件所涉样本进行病原菌初筛,根据初筛结果进行细菌分离培养和质谱鉴定分析,采用荧...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 唐伟 翁胜男 等 《中国感染控制杂志》 2025年24卷1期 23-29页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探索格氏乳球菌SHAMU-LG6所分泌的细菌素(初步命名为garvicin LG6)对不同溶血表型金黄色葡萄球菌的抗菌活性.方法 收集分离自2021-2023年安徽某医院临床患者的金黄色葡萄球菌,三点接种法检测金黄色葡萄球菌的溶血表型...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：解亚茹导师：陈磊 天津大学 化学工程与技术 化学工程与技术（博士） 2022年
【摘要】 蓝细菌是唯一可进行放氧光合作用的原核微生物，是地球重要的初级生产者。更重要的是，其作为光合底盘已被广泛的应用于多种生物燃料和高附加值化学品的合成。但是高光暴露导致蓝细菌中的光抑制和毒性物质活性氧（ROS）的过度积累，影响全球初级生产力，且极...
- 概要：
- 方法：
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