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            【中文期刊】 徐慧  周海健  等 《中华预防医学杂志》 2021年55卷4期 512-516页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:分析郑州市某三甲医院耐碳青霉烯类抗生素肺炎克雷伯菌(CRKP)的基因组分型特征。方法:于2019年12月4日至2020年1月10日,自郑州市某三甲教学医院各临床科室送检且开展微生物检测的标本中分离出67株CRKP菌株。通过将全基因组测...

            【关键词】 克雷伯菌, 肺炎基因组细菌医院

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            【中文期刊】 张欢畅  段云峰  等 《微生物学通报》 2020年47卷6期 1876-1887页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [背景]母乳是一个重要的益生菌筛选库,其中植物乳杆菌是一种用途广泛、适应性强的益生菌.然而不同菌株具有不同的功能,现有的生理生化方法对其潜在益生特性研究十分有限,有必要采用高通量的方法寻找具有种群特异性的优质益生菌.[目的]结合菌株生化特征...

            【关键词】 植物乳杆菌益生菌基因组测序

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            【中文期刊】 张倩茹  李甲  等 《中华检验医学杂志》 2020年43卷9期 912-916页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:开展耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)全基因组测序,揭示CRKP院内耐药基因流行状态,指导医院感染防控的开展。方法:收集蚌埠市第三人民医院2018年11月至2019年3月临床分离的CRKP,用VITEK-2 Compact分析仪进行...

            【关键词】 克雷伯菌,肺炎抗药性,细菌全基因组关联研究

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            【中文期刊】 张雪英  叶红  等 《中华微生物学和免疫学杂志》 2018年38卷6期 446-450页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 目的 用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术结合16S rRNA基因测序鉴定动弯杆菌,并通过全基因组测序分析动弯杆菌的耐药基因及该菌属种间亲缘关系.方法 将65例细菌性阴道病(bacterial vaginosi...

            【关键词】 动弯杆菌细菌性阴道病(BV)MALDI-TOF MS

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            【学位论文】 作者:谭小琴导师:林炜铁   华南理工大学   生物学 微生物学(硕士) 2016年

            【摘要】 硫氧化细菌在碳硫循环中扮演着重要的角色,而珠江作为我国第二大河流生态系统对我国南部的社会和经济有着重要的影响,本文研究了硫氧化细菌在珠江广州段水域中的组成、群落多样性、以及种群丰度.以珠江水体广州段的水域上中下游坦尾、白蚬壳、穗石、南沙四个...

            【关键词】 硫氧化细菌RubisCO

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            【中文期刊】 沈应博  史晓敏  等 《生物工程学报》 2019年35卷4期 541-557页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 随着耐药细菌的大量出现及广泛传播, 细菌耐药性成为全球备受关注的问题.耐药细菌的特征如耐药基因、毒力因子、质粒分型等以及不同菌株间亲缘关系对于细菌耐药性流行病学及分子生物学的研究有着十分重要的意义.但是传统的技术手段如聚合酶链式反应 (Po...

            【关键词】 耐药性基因组测序生物信息学

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            【中文期刊】 陈上  赵瑞  等 《微生物学通报》 2019年46卷10期 2665-2672页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [背景]随着碳青霉烯类和多粘菌素类可转移耐药基因的发现及扩散,多重耐药革兰氏阴性细菌感染更加难以治疗.[目的]筛选有效拮抗革兰氏阴性菌的菌株,为新型抗生素的发掘奠定基础.[方法]利用胰蛋白胨大豆琼脂培养基筛选土壤源细菌,通过16S rRNA...

            【关键词】 类芽孢杆菌抗菌活性多粘菌素E

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            【中文期刊】 荆颖  罗燕萍  等 《中华检验医学杂志》 2019年42卷3期 209-213页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 了解解放军总医院沙门菌流行情况及耐药基因特征,为沙门菌的感染防治提供依据.方法 回顾性研究,收集78株2015至2017年沙门菌临床分离株,患者年龄(49±21)岁,以中青年为主,临床样本主要来自粪便和静脉血,分别占44.87%(35...

            【关键词】 沙门菌属抗药性,细菌多位点测序分型

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            【中文期刊】 李曼莉  王利君  等 《微生物学通报》 2019年46卷1期 139-150页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [背景]IncFII-FIA-FIB型质粒广泛存在于肠杆菌科细菌中,介导了许多耐药基因的水平转移,并导致细菌多重耐药问题日益严重.[目的]分析IncFII-FIA-FIB型多重耐药质粒pBTR-CTXM的基因组结构,并研究其介导大肠杆菌BT...

            【关键词】 大肠杆菌IncFII-FIA-FIB型质粒pBTR-CTXM

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            【中文期刊】 王亚楠  胡永飞  等 《生物工程学报》 2018年34卷8期 1226-1233页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 畜牧养殖业中大量抗生素的使用,导致养殖动物及其相关环境中存在大量的耐药基因/耐药细菌.这些耐药基因可以借助基因水平转移等方式在环境中进一步扩散,甚至进入食品动物随食物链传播,对生态环境、食品安全和人类健康造成极大的威胁.随着基因组学研究手段...

            【关键词】 养殖动物养殖环境细菌耐药

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            【中文期刊】 刘东立  张义  等 《中国学校卫生》 2018年39卷5期 741-746页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 对陕西省3起寄宿制学校感染性腹泻暴发事件进行流行病学调查、病原分离鉴定及分子溯源分析,为科学指导临床诊断治疗及流行病学调查工作提供参考.方法 对陕西省3起寄宿制学校感染性腹泻事件开展现场调查,描述疫情三间分布,分析流行特征.采集病例肛...

            【关键词】 农村人口志贺菌,宋氏痢疾

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            【中文期刊】 余宏盛  郭红  等 《中华妇产科杂志》 2018年53卷2期 111-114页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 随着我国"二孩"政策的调整,高龄(≥35岁)孕妇的数量迅速增加.据文献报道,高龄孕妇胎儿的染色体异常率为4.33%,且随孕妇年龄增加而显著升高[1].高龄妊娠造成胎儿遗传缺陷的原因为,随着年龄增加孕妇卵母细胞的老化,有害环境因素等的影响易造...

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            【中文期刊】 郝巍  纪志远  等 《植物遗传资源学报》 2018年19卷3期 523-530页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 水稻白叶枯病是最重要的水稻细菌性病害,严重威胁水稻生产和粮食安全.培育和种植抗白叶枯病水稻新品种是控制该病害最经济、有效、环保的技术手段.W6023是本课题组早期通过普通野生稻与IR24杂交创制的抗病基因导入系,前期转录组测序结果显示,Po...

            【关键词】 水稻水稻白叶枯病水稻白叶枯病菌

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            【中文期刊】 李松  屈平华  等 《中华检验医学杂志》 2018年41卷8期 583-588页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 建立新型弯曲菌—"胎儿弯曲菌龟亚种(C.fetus subsp.testudinum)"质谱超级图谱库,为临床提供新的检测平台.方法 对收集的建库菌株采用Illumina二代测序平台2000/miSeq进行高通量全基因组测序,JAVA...

            【关键词】 胎儿弯曲杆菌菌血症基因组

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            【中文期刊】 谢周杰  张昭  等 《生物工程学报》 2017年33卷9期 1547-1554页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 口腔生物被膜是由数百种微生物构成的复杂微生物群体.变形链球菌作为其中的重要一员,被认为是引起龋病的主要病原菌.变形链球菌在牙齿表面以生物被膜形式生长的能力和它产酸耐酸的特点赋予其致龋性.不同的变形链球菌菌株之间保留了多样的次级代谢形式,这是...

            【关键词】 变形链球菌次级代谢细菌

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            【中文期刊】 车洁  陈霞  等 《疾病监测》 2017年32卷9期 757-763页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 细菌耐药问题严重地威胁着人类健康和公共卫生安全,也给临床、实验室检测、监测细菌耐药性工作带来严峻挑战.基于抗菌药物敏感性试验和聚合酶链式反应技术的细菌耐药性检测方法是目前最常用的方法,随着基因芯片技术、全基因组测序技术、微流控技术等新兴技术...

            【关键词】 耐药药物敏感性试验新技术

            OA
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            【中文期刊】 梅枫  孔雯  等 《微生物学报》 2017年57卷5期 701-709页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 [目的]分离并鉴定1株具有尼古丁降解能力的细菌,研究其尼古丁降解特性并对其降解基因进行分析,为尼古丁微生物降解提供基础.[方法]从烟草种植地土壤中分离1株具有尼古丁降解能力的细菌,通过16S rRNA基因和生理生化特性对该菌株进行鉴定,检测...

            【关键词】 尼古丁根癌土壤杆菌SCUEC1菌株降解特性

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            【中文期刊】 陈南  朱璟  等 《微生物学报》 2017年57卷4期 526-538页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 [目的]通过实验室培养模拟自然环境微生物相互作用,进而找到影响细菌基因型和表型的基因.[方法]将大肠杆菌和金黄色葡萄球菌在实验室条件下进行单独培养和两两混合培养并连续转接,通过得到的数量表型与最大生长速率表型做全基因组关联分析(GWAS),...

            【关键词】 微生物竞争基因组重测序全基因组关联分析

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            【中文期刊】 斯丹  杨致邦  等 《第三军医大学学报》 2017年39卷13期 1352-1359页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 研究细菌对地塞米松类甾体激素的降解作用及其分子机制,为构建清除水环境医源性地塞米松类药物污染的工程菌奠定基础.方法 采用富集培养法从医院废水中分离降解地塞米松的细菌,采用固相萃取-高效液相色谱(HPLC)法检测细菌对地塞米松的降解效能...

            【关键词】 地塞米松降解伯克霍尔德菌

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            【中文期刊】 戎振  霍颖异  等 《微生物学通报》 2017年44卷7期 1622-1630页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]克隆表达海洋细菌Altererythrobacter epoxidivorans CGMCC 1.7731T中的酯酶基因e22,并研究其酶学性质.[方法]分析菌株的全基因组序列,筛选获得一个酯酶基因e22,将其克隆至pET-28a载...

            【关键词】 海洋细菌碱性酯酶酶学性质

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            【中文期刊】 陈宏斌  黄加铭  等 《中华检验医学杂志》 2016年39卷11期 848-851页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:了解我国耐利奈唑胺葡萄球菌的耐药形势,探讨耐利胺唑胺菌株的耐药形成机制,为临床合理使用抗生素提供理论依据。方法收集2009至2012年全国9家医院分离的所有非重复的利奈唑胺耐药葡萄球菌共43株。通过微量肉汤稀释法测其MIC值,PCR方...

            【关键词】 葡萄球菌属乙酰胺类细菌蛋白质类

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            【中文期刊】 武雅蓉  杨瑞馥  等 《中华预防医学杂志》 2016年50卷6期 554-558页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 将群体遗传学的理论与方法应用于特定种群多个分离株的全基因组序列中,进行数据挖掘和分析的学科称为群体基因组学(population genomics)。近年来,测序技术的迅猛发展使得低成本、快速获得大量个体全基因组序列成为可能,这推动了群体基...

            【关键词】 大肠杆菌基因组遗传学,群体

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            【中文期刊】 杨璞玉  张军  《中华妇产科杂志》 2015年9期 703-708页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 先天性心脏病( congenital heart disease, CHD),是胎儿期心血管发育异常、发育障碍或出生后应该退化的组织未能退化所造成的心血管畸形,是控制心脏发育的基因产生突变以及这些基因在时间(发育阶段)和空间(组织特异性)调...

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            【中文期刊】 王鹏飞  王颖芳  等 《吉林大学学报(医学版)》 2015年41卷2期 261-268,后插3页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:检测志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR),并与GenBank全基因组中志贺菌重复序列和间隔序列对比,分析其结构特征及同源性.方法:利用PCR法扩增获得志贺菌CRISPR,采用生物信息学方法对重复序列及间隔序列进行同源性分...

            【关键词】 志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列重复序列

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            【中文期刊】 王志明  潘元龙  等 《微生物学报》 2012年52卷10期 1219-1227页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 [目的]对卡介苗( Bacillus Calmette-Guerin,BCG)美国株(BCG Tice)进行基因组补缺口(补洞)工作,以得到它的基因组完整序列.[方法]首先对BCG Tice进行高通量测序,使用SOAPdenovo软件对得到...

            【关键词】 卡介苗高GC补缺口

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            【中文期刊】 刘志恒  王剑  等 《微生物学报》 2011年51卷2期 141-153页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 由于放线菌在生物技术、医药卫生和环境治理等领域中的实际重要性,已经成为人们研究得最为深入的微生物类群之一.现代放线菌分类学是建立在对16S rRNA 基因保守分子序列的系统发育学分析基础上、综合利用多种微生物信息的多相分类学(polypha...

            【关键词】 放线细菌放线菌分类学基因组系统发育学

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            【中文期刊】 闫中强  沈定霞  《解放军医学杂志》 2011年36卷5期 541-542,544页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 <篇首> Fournier等[1]对鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii,AB)耐药株AYE和敏感株SDF的全基因组序列进行比较分析后,发现在多重耐药鲍曼不动杆菌(multidrug resistance A.bauma...

            【关键词】 鲍氏不动杆菌抗药性,细菌抗药性,多药

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            【中文期刊】 杨琛  《生物工程学报》 2010年26卷10期 1349-1356页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 微生物基因组学的迅速发展为从功能基因与蛋白,网络及其调控等不同的角度,全面理解与认识微生物的代谢过程,构建细胞工厂,提供了丰富的背景信息.基于基因组序列进行代谢网络重构,有助于发现新的代谢功能基因、调控元件、甚至新的代谢途径,从而优化设计细...

            【关键词】 比较基因组代谢途径重构调控网络重构

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            【中文期刊】 揣侠  谭文杰  《中国生物工程杂志》 2010年30卷5期 110-115页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 水痘-带状疱疹病毒(VZV)属于疱疹病毒科α亚科,其原发感染为水痘,潜伏再度激活则引起带状疱疹.目前对其基因功能和疫苗的减毒机制尚不十分清楚.细菌人工染色(BAC)是一种新的用于大分子DNA克隆的载体系统,它具有容量大、遗传稳定、操作简单等...

            【关键词】 水痘-带状疱疹病毒(VZV)细菌人工染色体(BAC)感染性克隆

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            【中文期刊】 陆庆宇  王其海  等 《中国生物工程杂志》 2009年29卷4期 56-60页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 福志贺氏菌属是一类革兰氏阴性杆菌,是引起人类细菌性痢疾的主要致病源.以福志贺氏痢疾杆菌2a型301株全基因组为模板、以pET22b-(+)为载体、克隆了一个关键基因:组氨酸合成途径中双功能焦磷酸水解酶和磷酸核糖环化水解酶蛋白(简称:sf20...

            【关键词】 组氨酸合成途径双功能蛋白PR-ATP焦磷酸水解酶

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