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【中文期刊】 郭昭兴 万修华 《眼科新进展》 2024年44卷1期 76-79页 ISTICPKUCA
【摘要】 蛋白质聚集在白内障发病过程中扮演着重要角色.近年来,基因测序技术和其他分子生物学技术广泛应用于蛋白质聚集现象的研究,其内在机制被逐渐阐明.基因突变、异构化与共价修饰、化合物和离子作用、蛋白质相互作用均是蛋白质聚集发生的原因.本文围绕上述四点...
【中文期刊】 史宁 乃菲沙·买买提 等 《东南大学学报（医学版）》 2024年43卷3期 346-355页 ISTICCA
【摘要】 目的:探讨特发性肺纤维化(IPF)治疗的新途径.方法:通过生物信息学算法来探索与IPF进展相关的共同表达基因和生物途径.应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别两组数据集重叠的共表达基因模块.随后,利用GEO公共数据集公布的基因表达数据...
【中文期刊】 曾春艳 李俊 等 《南昌大学学报（医学版）》 2024年64卷5期 81-87页 ISTIC
【摘要】 目的 了解急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)的生物学和分子发病机制,为预防和治疗AP提供依据.方法 从基因表达总库数据库获取基因表达数据集GSE109227、GSE3644和GSE65146,其中包括AP小鼠和对照小鼠...
【中文期刊】 章广能 张育芳 等 《生物信息学》 2024年22卷4期 287-295页 ISTIC
【摘要】 化合物-蛋白质互作的鉴定对药物发现、靶标鉴定,网络药理学和蛋白质功能的阐明等至关重要.本文开发了一种基于表示学习的图神经网络预测化合物-蛋白质互作模型.首先利用Word2vec表示学习方法自动提取化合物和蛋白质的特征;然后将特征输入构建图神...
【关键词】 化合物-蛋白质相互作用； 表示学习； 图神经网络；
【中文期刊】 汪居安 王居义 等 《安徽医药》 2023年27卷6期 1083-1087,后插1-后插2页 ISTICCA
【摘要】 目的 通过网络药理学和分子对接技术探讨郁金-丁香药对抗肝纤维化的作用机制.方法 于2022年1月8日检索中药系统药理学数据平台(TCMSP)获取郁金和丁香的有效活性成分及相关靶点并进行筛选和预测;肝纤维化相关靶点的数据通过NCBI基因数据、...
【中文期刊】 吴娓娓 王建军 等 《神经疾病与精神卫生》 2023年23卷8期 550-556页 ISTIC
【摘要】 目的 使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别强迫症的共表达模块和枢纽基因.方法 从基因表达数据库(GEO)下载GSE60190数据集,对15例强迫症患者和14名健康对照者的尸脑背外侧前额叶皮质(DLPFC)基因表达数据进行分析.通过W...
【关键词】 强迫性障碍； 加权基因共表达网络分析； 功能富集分析；
【中文期刊】 宓庆坤 商立民 等 《军事医学》 2023年47卷3期 210-216,222页 ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 在酵母细胞中建立基于酵母增强型红色荧光蛋白(yEmRFP)的双分子荧光互补技术,用于直观地检测蛋白质相互作用.方法 利用分子克隆技术将yEmRFP的N端片段(1～159 aa,RN159)和C端片段(160～236 aa,RC160)...
【关键词】 双分子荧光互补； 蛋白质相互作用； 酵母增强型红色荧光蛋白；
【中文期刊】 李钰鑫 阎美卉 等 《世界中医药》 2022年17卷16期 2251-2257页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的:采用网络药理学及分子对接研究"黄芪-附子"药对治疗慢性心力衰竭的作用靶点及其相关信号通路,并进一步分析其治疗慢性心力衰竭的潜在机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Uniprot数据库等获取黄芪-附子药对的活性...
【中文期刊】 马馨蕊 吕晓东 等 《世界中医药》 2022年17卷11期 1560-1564页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的:运用网络药理学的研究方法探讨三子养亲汤治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对三子养亲汤中药物的化学成分、作用靶标进行检索与筛选;利用GeneCards数据库对COPD的相关...
【中文期刊】 吴怡 邵思梦 等 《分析化学》 2023年51卷1期 112-119页
【摘要】 利用超高效液相色谱-轨道阱高分辨质谱(UHPLC-Orbitrap-MS)结合链霉亲和素包被的96孔板的方法筛选人参复杂体系中蓖麻凝集素120(RCA 120)的寡糖结合剂.将RCA 120修饰的96孔板与溶菌酶修饰的96孔板分别与寡糖标准...
【关键词】 超高效液相色谱-质谱技术； 人参； 寡糖；
【中文期刊】 田天 周丹 等 《临床医学研究与实践》 2023年8卷7期 5-9页
【摘要】 目的 基于网络药理学探讨飞扬肠胃炎胶囊治疗胃溃疡的作用机制.方法 采用文献法检索收集飞扬肠胃炎胶囊的化合物成分,并通过SwissADME对成分进行筛选.使用SwissTargetPrediction数据库对化合物成分进行靶点预测.借助Gen...
【中文期刊】 张芷源 《现代医药卫生》 2023年39卷18期 3173-3177页
【摘要】 蛋白质是生命物质的基础,其通过与其他生物分子形成复合物或蛋白-蛋白相互作用来维持细胞完整结构和功能,控制不同的生命过程.研究蛋白质相互作用的传统方法具有一定的局限性,邻近依赖生物素鉴定技术的出现可以在一定程度上弥补缺陷.而进一步优化后的Tu...
【关键词】 蛋白质-蛋白质相互作用； 邻近标记； TurboID；
【中文期刊】 欧阳玉梅 《生物化学与生物物理进展》 2009年36卷3期 280-287页 SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 结构域是进化上的保守序列单元,是蛋白质的结构和功能的标准组件.典型的两个蛋白质间的相互作用涉及特殊结构域间的结合,而且识别相互作用结构域对于在结构域水平上彻底理解蛋白质的功能与进化、构建蛋白质相互作用网络、分析生物学通路等十分重要.目前,依...
【关键词】 蛋白质相互作用(PPI)； 蛋白质结构域； 结构域相互作用(DDI)；
【中文期刊】 周水娟 郭忠建 《生物技术进展》 2022年12卷6期 825-836页
【摘要】 病毒侵染宿主的过程存在着一系列相互作用,了解病毒与宿主之间的蛋白质相互作用对于深入研究病毒具有重要意义.在众多研究蛋白质相互作用的方法中,双分子荧光互补技术(bimolecular fluorescence complementation,...
【中文期刊】 朱徐东 黄丽萍 等 《药品评价》 2022年19卷18期 1089-1095页 CA
【摘要】 目的:基于网络药理学探讨黄精防治阿尔茨海默病(AD)的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库(TCMSP)、实验室获取以及查阅文献收集黄精化学成分并利用Swiss?ADME筛选中药活性成分;Swiss?target?prediction平...
【中文期刊】 蔡欣 白波 等 《中国药理学通报》 2012年28卷1期 8-12页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 传统观点认为,G蛋白偶联受体与G蛋白、调节蛋白、GRKs以及arrestins间的相互作用是连续的,其中涉及多个蛋白质之间快速的集合和解聚.而实际上,GPCRs和相关靶分子之间的作用是通过一系列细胞内蛋白质-蛋白质相互作用的信号转导网络来实...
【关键词】 蛋白质-蛋白质相互作用； 高阶寡聚体； 信号转导；
【中文期刊】 周颖 李冰樱 等 《植物学报》 2012年47卷1期 55-64页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 14-3-3蛋白是高度保守并在真核生物中普遍存在的一类调节蛋白.不同的14-3-3蛋白同工型具有不同的细胞特异性,并通过识别特异的磷酸化序列与靶蛋白相互作用,被称为蛋白质与蛋白质相互作用的桥梁蛋白.在植物生长发育过程中,14-3-3蛋白通过...
【关键词】 14-3-3蛋白； 植物发育； 蛋白质-蛋白质相互作用；
【中文期刊】 朱小东 郭亚 等 《中华放射医学与防护杂志》 2012年32卷1期 20-24页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用蛋白质相互作用网络图,寻找鼻咽癌放射抗拒相关的分子标志物,探讨鼻咽癌放射抗拒机制.方法 应用全基因组表达谱芯片,初步筛选出2种不同放射敏感性细胞株CNE-2R与CNE-2的差异表达基因.采用计算机软件随机选取4个差异表达基因,分别...
【中文期刊】 张治国 牛旭艳 等 《中国骨质疏松杂志》 2011年17卷4期 279-290页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 建立基于骨质疏松症遗传相关基因的蛋白质相互作用网络,发现其中其中包含的分子复合物和未经研究或研究较少的与骨质疏松症相关的蛋白质.方法 基于OMIM数据库中与骨质疏松症发生相关的177个遗传基因,应用 Cytoscape软件及其插件Ag...
【关键词】 骨质疏松症； 在线人类孟德尔遗传数据库； 蛋白质相互作用网络；
【中文期刊】 张治国 牛旭艳 等 《中国组织工程研究与临床康复》 2011年15卷33期 6090-6094页 ISTICPKUCA
【摘要】 背景:在蛋白质相互作用网络的基础上研究骨质疏松症,可以更深入全面了解其发生发展机制.目的:建立基于骨质疏松症遗传相关基因的蛋白质相互作用网络,对其中所含分子复合物涉及的生物学通路进行预测.方法:筛选在线人类孟德尔遗传数据库中的骨质疏松症遗传...
【关键词】 蛋白质相互作用网络； 骨质疏松症； 在线人类孟德尔遗传数据库；
【中文期刊】 肖智权 唐夏 等 《中华神经医学杂志》 2010年9卷5期 480-486页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 构建帕金森病(PD)相关蛋白质相互作用网络. 方法 应用生物学信息方法 ,采用HGNC、OPHID和UniHI数据库收集所有PD相关蛋白及与PD相关蛋白相互作用的蛋白;利用ProteoLens软件绘制PD相关蛋白质相互作用网络;根据每...
【中文期刊】 张智 张正国 《中国生物医学工程学报》 2010年29卷2期 201-206页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 研究蛋白质-蛋白质相互作用是理解生命活动的基础.在蛋白质-蛋白质相互作用的研究过程中,产生了大量来源于实验和预测的数据.这些数据存储于彼此异构的数据库中.对上述异构数据库进行数据整合是实现共享和最大限度利用已有蛋白质-蛋白质相互作用数据必须...
【关键词】 蛋白质-蛋白质相互作用； 异构数据库； 数据整合；
【中文期刊】 王锋 张春雨 等 《植物学报》 2010年45卷5期 530-540页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 光激活荧光蛋白是指用特定光照射时,其荧光特性发生显著改变的一类荧光蛋白.借助光激活荧光蛋白的这种特性,可以实现对活细胞、细胞器或胞内分子的时空标记和追踪.该文介绍了目前光激活荧光蛋白的性质,并从多个方面对其应用进行了概括.包括分子标记与动态...
【中文期刊】 谢超 郜尽 等 《上海交通大学学报（医学版）》 2009年29卷4期 465-469页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 后基因组时代的最终目标是认识真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规律和生物学功能,即蛋白质组学研究.关键的挑战之一就是对蛋白质相互作用网络的研究,将有助于从系统角度加深对细胞结构和功能的认识,并且为新药靶位点的发现和药物设计提供理论基础.目前...
【中文期刊】 李哲谦 刘书朋 等 《中国生物医学工程学报》 2009年28卷5期 701-706页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 蛋白质与蛋白质相互作用研究是蛋白质组学的重要研究内容之一.本研究采用支持向量机学习方法,将氨基酸物理化学特性和序列信息方法相结合构建支持向量,选取DIP数据库中的酵母表达蛋白序列进行蛋白质相互作用预测.在34 000对酵母表达蛋白实验数据中...
【关键词】 蛋白质-蛋白质相互作用； 支持向量机； 离散信息度量函数；
【中文期刊】 张浩 侯跃芳 等 《中华医学图书情报杂志》 2012年21卷4期 64-67页 ISTICCA
【摘要】 目的:通过对蛋白质相互作用网络文献的同被引分析,得出其研究热点.方法:下载SCI数据库中蛋白质相互作用网络文献及其引文,统计引文频次,取被引频次超过33、累计百分比约为10%的58篇文献作为高被引论文,对来源-引文矩阵进行层次聚类分析,利用...
【中文期刊】 熊杰 邴志桐 等 《生物信息学》 2011年09卷3期 235-237,241页 ISTIC
【摘要】 蛋白质相互作用(PPI)网络,是目前系统研究蛋白质层面细胞活动的重要工具,PPI网络的度分布是研究复杂网络性质的重要物理量.随着蛋白质相互作用数据量不断的增加,其数据的可靠性是否会对PPI网络的度分布造成影响,并不确定.本文对四种模式生物的...
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