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【中文期刊】 秦立峰 王加强 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷19期 4069-4075页 ISTICPKUCA
【摘要】 背景:颗粒细胞的状态很大程度上影响卵母细胞的质量.随着高龄女性在辅助生殖中占比不断增多,为了能更好地评估卵母细胞的质量,此研究在转录水平对不同年龄段患者来源的颗粒细胞进行了检测.目的:探究低龄和高龄患者颗粒细胞mRNA及长链非编码RNA表达...
【中文期刊】 须凌峰 张月姣 等 《实用口腔医学杂志》 2024年40卷1期 36-42页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨下颌髁突软骨祖细胞对流体剪切力的反应.方法:对体外培养的软骨祖细胞施以可致细胞退变的流体剪切力刺激,然后做第二代高通量RNA测序.使用DESeq2软件筛选差异基因,做基因本体(GO)功能富集分析、京都基因和基因百科全书(KEGG)...
【中文期刊】 杜明阳 马健芝 等 《植物遗传资源学报》 2024年25卷10期 1781-1792页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 甘油-3-磷酸醜基转移酶(GPAT,glycerol-3-phosphate acyltransferase)是三酰甘油(TAG,triacylglycerol)生物合成的核心酶,在植物生长发育以及抗逆过程中发挥重要作用.本研究基于蒿叶猪毛...
【中文期刊】 杨品 任振华 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷7期 1196-1213页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 多模态组学数据的联合运用在揭示细胞异质性和解析细胞命运调控机制方面具有重要意义,目前已有多种方法被开发,用于处理不同组学模态数据的整合.本研究通过对应用于不同整合任务的多种数据整合方法进行性能评测,为相关领域的研究提供有益参考.使用6个联合...
【中文期刊】 林兴雨 尹新明 等 《昆虫学报》 2024年67卷10期 1428-1438页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]基于低覆盖度全基因组测序数据和转录组数据重新构建蜡蝉总科(Fulgoroidea)高阶元类群之间的系统发育关系,为理解蜡蝉总科的系统发育关系提供基因组数据.[方法]利用二代测序技术获得了蛾蜡蝉科蜡蝉Flatidasp.1种的低覆盖度...
【中文期刊】 程宇飞 董林林 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2024年26卷2期 472-481页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 通过对党参蛋白激酶SnRK2家族鉴定,以及对其与转录因子的相关性进行初步解析,为党参抗根腐病机制的解析及高抗性优质党参新品种培育提供数据支撑.方法 基于党参转录组,采用生物信息学手段对CpSnRK2基因家族进行系统性研究.结果 在党参...
【中文期刊】 章君华 卢莹莹 等 《浙江医学》 2024年46卷20期 2210-2213,2217,后插3页 ISTICCA
【摘要】 目的 分析与子痫前期(PE)相关的转录组内含子多聚腺苷酸化(IPA)现象.方法 从GEO数据库中收集到90例PE相关样本的转录组数据.采用STAR比对到人类基因组hg38,利用IPAFinder软件分析比对文件中的IPA现象.Miranda...
【中文期刊】 丁跃 陈琛 等 《食品科学》 2024年45卷2期 172-177页
【摘要】 为了提高枯草芽孢杆菌生长和产孢效率,在30 L发酵罐水平考察了苹果酸对菌株DF生长代谢的影响.发酵16～27 h耦合pH 8.0流加苹果酸(终质量分数1.5％)使得生物量(22 h)达到3.68× 1010 CFU/mL,较对照提高71.9...
【中文期刊】 王玉凤 孟缘 等 《广西植物》 2023年43卷10期 1861-1875页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 AP2/ERF转录因子在植物生长发育和响应非生物胁迫中发挥着重要作用.为探究欧耧斗菜(Aquilegia vulgaris)中AP2/ERF对盐胁迫的响应,该研究基于前期试验获得的盐胁迫下转录组数据,通过生物信息学方法筛选欧耧斗菜4P2/E...
【中文期刊】 宋南 王淼淼 等 《昆虫学报》 2023年66卷12期 1626-1637页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]本研究旨在利用白蚁转录组和低覆盖度全基因组测序(low-coverage whole-genome sequencing)数据重建白蚁领科(Termitoidae)昆虫内高阶元类群(科和亚科)之间的系统发育关系,为研究白蚁系统进化提...
【中文期刊】 颜其燕 吴军华 等 《浙江医学》 2023年45卷24期 2684-2688页 ISTICCA
【摘要】 单细胞测序是一项新兴的测序技术,指在单个细胞水平上对细胞基因组和转录组等组学进行测序.相比传统的测序方法,单细胞测序在揭示生物异质性方面具有独特优势,有利于更深层次地揭示疾病发生、发展的机制.同时,单细胞测序在发现稀有细胞群体、展现细胞起源...
【中文期刊】 贠佳琦 杨洁冰 等 《昆虫学报》 2022年65卷12期 1571-1581页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]本研究旨在鉴定飞蝗Locusta migratoria雌成虫脂肪体中表达的G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR)基因,揭示其在飞蝗卵发育和卵巢生长中的功能.[方法]基于前期获得的第1个促性腺...
【中文期刊】 刘运 柳方圆 等 《四川动物》 2022年41卷6期 619-627页 ISTICPKU
【摘要】 豚鹿Axis porcinus是国家一级重点保护野生动物,为理解其基因表达上的基本特征,本研究采用RNA-seq技术对16个豚鹿血液样本进行了测序和从头组装,一共得到615548条unigenes,Contig N50为803 bp.将组装...
【中文期刊】 叶瑞 王莉君 等 《动物医学进展》 2023年44卷8期 97-101页
【摘要】 长爪沙鼠具有独特的生理学、解剖学和行为学特性,近年来已在医学和生物学等领域得到广泛研究和应用.作为一种多功能实验动物,长爪沙鼠可用于建立多种良好的寄生虫感染模型.随着基因组序列的公布,长爪沙鼠及其寄生虫感染模型的组学研究已经取得了明显进步....
【中文期刊】 暴会会 思彤 等 《云南师范大学学报（自然科学版）》 2023年43卷5期 13-18页
【摘要】 马铃薯野生种Solanium commersonii(CM)具有很强的抗冻性,对低温处理下不同时间点的抗寒材料CM及冷冻敏感材料StGp Phureja(DM)取样,进行转录组及代谢组测序,对116种酚酸类物质进行差异分析.结果表明,11种...
【中文期刊】 周理韡 郑书栋 等 《国际生殖健康/计划生育杂志》 2022年41卷6期 487-493页 ISTICCA
【摘要】 生物信息学(bioinformatics)在生殖系统的研究中被广泛应用于各个技术层面,包括基因组、转录组、蛋白组和代谢组.通过数据的系统化采集和可视化处理,生殖过程中各种关键分子的作用机制正逐步被发现并阐明.生物信息学技术在生殖系统研究中的...
【中文期刊】 徐凤娇 娄新宇 等 《中国真菌学杂志》 2022年17卷2期 94-98页 ISTICCSCD
【摘要】 目的 揭示小鼠骨髓源巨噬细胞(bone marrow-derived macrophages,BMMs)被烟曲霉(Aspergillus fumigatus)A1160c孢子侵染之后与未处理对照组BMMs相比表达出现差异的免疫信号通路及孢子...
【中文期刊】 蒋琬 袁杰 等 《军事医学》 2022年46卷1期 37-43页 ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 研究早期胚胎中等位基因表达不平衡的现象及其背后的调控因素.方法 基于两个不同品系纯合小鼠的正反交杂交实验设计,对早期胚胎中5个重要阶段的RNA测序数据进行生物信息学分析.结果 建立了识别基于正反交杂交品系中等位基因表达不平衡的工作流程...
【中文期刊】 吴松锋 朱云平 等 《生物化学与生物物理进展》 2005年32卷2期 99-105页 SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 转录组和蛋白质组比较研究发现,总体而言其间的相关性不高.根据数据的类型不同可以将现有的研究分为4类:单点比较、两点差异比较、多点时序比较和多点非时序比较.对其差异原因的研究和分析表明:除了由实验系统及数据类型不同导致的差异外,转录后蛋白质合...
【中文期刊】 孙晶 刘玉玮 等 《生态毒理学报》 2022年17卷3期 256-267页
【摘要】 氧化石墨烯(graphene oxide,GO)是目前十分重要的人工纳米材料,且极有可能被排放到环境中.因而GO与环境中的共存污染物多环芳烃(polycyclic aromatic hydrocarbons,PAHs)对水生生物的复合暴露毒...
【中文期刊】 张高华 于树涛 等 《遗传》 2019年41卷11期 1050-1059页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 高油酸花生(Arachishypogaea L.)油具有优异的营养成分和热氧化稳定性,有利于人体健康和工业生产.但是高油酸花生在发芽期间对温度比较敏感,限制了其在低温地区的引种.为了进一步了解高油酸花生在发芽期响应低温胁迫的分子机制,本研究...
【中文期刊】 陈丽洁 梁景耀 等 《中华皮肤科杂志》 2019年52卷10期 729-735页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨中重度特应性皮炎(AD)患者皮损和非皮损组织转录组差异表达基因,并阐述差异表达基因在AD发病机制中的作用.方法 2016年7-10月于广州市皮肤病防治所/广州医科大学皮肤病研究所门诊收集5例汉族AD患者的皮损和非皮损组织,运用二代...
【中文期刊】 叶兴状 刘丹 等 《植物研究》 2019年39卷2期 276-286页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为加强中国特有濒危植物半枫荷资源的保护与利用工作,采用高通量测序平台Illumina HiSeq 2500对其进行转录组测序,将得到的数据过滤后进行de novo组装并聚类去冗余,获得77 629个Unigenes,通过九大功能数据库比对、...
【中文期刊】 许文娟 宋雪燕 等 《安徽医科大学学报》 2019年54卷3期 359-363页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 拟探索在肺癌、乳腺癌等肿瘤组织中高表达的细胞趋化因子配体18(CCL18)对非小细胞肺癌细胞A549转录组的影响,分析其促进肿瘤发生发展的可能机制.方法 通过伤口愈合实验验证CCL18对A549迁移能力的影响;通过提取总RNA进行测序...
【中文期刊】 刘韬 魏文燕 等 《水生生物学报》 2019年43卷5期 969-976页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为鉴定鱼源鲁氏耶尔森氏菌(Yersinia ruckeri)SC09菌株水生环境中不同温度的转录组水平上的差异,研究采用链特异性转录组测序(Strand-specific RNA-seq)技术对菌体生理温度(28℃)和实验培养温度(37℃)...
【中文期刊】 李雨濛 马佳康 等 《医学研究生学报》 2019年32卷7期 715-719页 ISTICPKU
【摘要】 目的 食管鳞癌和腺癌在分组特征方面有多大的差异目前并不明确.文中旨在分析食管鳞癌、食管腺癌转录组分子特征的差异性.方法 下载TCGA数据库中食管鳞癌和腺癌转录组数据,筛选癌及癌旁组织差异表达的RNA(mRNA、lncRNA、miRNA),构...
【中文期刊】 彭淑贤 李浔 等 《南方医科大学学报》 2019年39卷6期 641-649页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 对非小细胞肺癌两种亚型肺腺癌和肺鳞状细胞癌的基因差异表达进行生物信息学分析,寻找非小细胞肺癌潜在的生物学标志物运用于临床诊断,进而提高患者生存率.方法 获取肺腺癌和肺鳞状细胞癌的基因表达谱分析数据集,使用R语言处理,t检验分析鉴定肺腺...
【中文期刊】 张少平 邱珊莲 等 《西北植物学报》 2019年39卷5期 808-816页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为获取紫背天葵(Cynura bicolor DC.)叶片中花青素种类及其合成调控基因等信息,该试验以紫背天葵叶背面紫色以及经处理叶背面几乎全绿(对照)的叶片为材料,进行转录组测序分析,同时进行6个相关差异表达基因的qRT-PCR分析和6种...
【中文期刊】 张少平 郑开斌 等 《热带亚热带植物学报》 2019年27卷6期 702-712页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为了解树葡萄(Myrciaria cauliflora)类黄酮合成相关酶差异表达基因信息,对其幼叶和成熟叶进行全转录组测序并比较分析.结果表明,从树葡萄幼叶和成熟叶中获得59321条单基因簇(Unigenes),在8大数据库共注释到3291...
【中文期刊】 刘晴 董燕玲 等 《中华实验眼科杂志》 2019年37卷9期 701-706页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析致角膜溃疡的金黄色葡萄球菌和正常人结膜囊分离的金黄色葡萄球菌的差异表达基因,探讨金黄色葡萄球菌性角膜溃疡可能的发病机制.方法 收集2018年1—8月在青岛眼科医院检验科分离培养的10株金黄色葡萄球菌,其中5株来自经培养证实的细菌性...
【关键词】 金黄色葡萄球菌/基因； 角膜炎/微生物学； 结膜囊；
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