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【中文期刊】 陈璐 常新宇  等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷11期 4860-4865页

【摘要】 旨在探究感染早期宿主细胞的天然免疫应答和抗病毒反应,本研究将鸡传染性支气管炎病毒(infectious bronchitis virus,IBV)Beaudette株感染鸡巨噬细胞HD11,2 h后提取细胞总RNA反转录成cDNA,采用Il...

【关键词】 鸡传染性支气管炎病毒； 鸡巨噬细胞HD11； 高通量测序；

【中文期刊】 曹策 宋鉴书  等 《中国药理学通报》 2025年41卷3期 482-490页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 目的 观察丹酚酸B(salvianolic acid B,SalB)抗H9c2细胞氧糖剥夺/再复(oxygen glucose deprivation/re-oxygena-tion,OGD/R)损伤机制.方法 CCK-8筛选SalB对OG...

【关键词】 丹酚酸B； 转录组高通量测序； H9c2心肌细胞；

【中文期刊】 刘兆峰 杨学军  《中国组织工程研究》 2025年29卷20期 4351-4360页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:椎间盘退变是下腰痛最常见的原因,然而其发病机制尚不完全清楚,因此探索预防和治疗椎间盘退变的新策略势在必行.单细胞转录组测序技术可以在单个细胞水平对mRNA进行高通量测序,揭示细胞的异质性和特定亚群,深入了解椎间盘退变发生发展的调控机制...

【关键词】 单细胞转录组测序； 椎间盘退变； 椎间盘；

【中文期刊】 彭启艳 潘秀奎  等 《昆虫学报》 2024年67卷8期 1039-1049页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]本研究旨在建立皂角豆象Megabruchidius dorsalis雌雄成虫触角转录组数据库,挖掘皂角豆象嗅觉相关基因.[方法]采用高通量测序平台Illumina HiSeq对皂角豆象雌雄成虫触角进行转录组测序、序列组装、功能注释及...

【关键词】 皂角豆象； 触角转录组； 高通量测序；

【中文期刊】 姚秋凤 张力健  等 《海军军医大学学报》 2024年45卷12期 1508-1520页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 通过生物信息学技术分析寨卡病毒(ZIKV)感染人神经母细胞瘤细胞SH-SY5Y后的转录组数据,拟找出参与ZIKV致病机制的潜在基因.方法 用ZIKV感染SH-SY5Y细胞,提取细胞总RNA后用转录组测序技术分析筛选出差异表达基因(DE...

【关键词】 寨卡病毒； 神经病变； 高通量测序；

【中文期刊】 俎高钰 李凤娇  等 《解剖学报》 2024年55卷4期 482-492页 ISTICCSCDCABP

【摘要】 目的 分析人基底神经节各核团的分子标志物以及不同核团间、不同性别、疾病相关的差异表达,探讨差异表达基因的生物学功能.方法 针对来源于10具人尸脑45个基底神经节核团样本,按是否有神经疾病分为对照组和帕金森病组,对照组按性别分为女性和男性组,...

【关键词】 基底神经节； 帕金森病； 高通量转录组测序；

【中文期刊】 许星月 郭依琳  等 《肿瘤基础与临床》 2024年37卷3期 256-261页

【摘要】 目的 通过高通量测序及生信分析,挖掘子宫颈癌淋巴结转移调控机制.方法 收集 3 例淋巴结转移、3 例无淋巴结转移的子宫颈癌组织,全转录组高通量测序筛选差异表达信使RNA(mRNA)、微小RNA(miRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)...

【关键词】 子宫颈癌； 全转录组高通量测序； 淋巴结转移；

【中文期刊】 杜炫星 牛敏敏  等 《环境昆虫学报》 2023年45卷5期 1318-1332页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 李白盾蚧Pseudaulacaspisprunicola(Maskell)寄主范围广泛,是一种重要的入侵害虫.本研究利用高通量测序平台(Illumina NovaSeq 6000)对李白盾蚧进行转录组测序、de novo从头组装及功能注释,...

【关键词】 李白盾蚧； 高通量测序； 转录组分析；

【中文期刊】 薛增昇 闫喜中  等 《昆虫学报》 2023年66卷5期 642-652页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]建立菜粉蝶Pierisrapae成虫触角转录组数据库,利用生物信息学和分子生物学手段深入挖掘菜粉蝶基因数据信息.[方法]采用高通量测序平台(Illumina NovaSeq 6000)对菜粉蝶成虫触角进行转录组测序、序列组装、功能注...

【关键词】 菜粉蝶； 触角转录组； 高通量测序；

【中文期刊】 邓美菁 赵萍  《昆虫学报》 2023年66卷9期 1221-1232页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]建立刺猎蝽属Sclomina 3种的转录组数据库,分析近缘种间转录组表达差异,探讨在转录组水平的种间趋异情况.[方法]采用Illumina HiSeq?4000高通量测序平台进行刺猎蝽属齿缘刺猎蝽S.erinacea、兴仁刺猎蝽S....

【关键词】 刺猎蝽属； 高通量测序； 转录组；

【中文期刊】 顾小亮 殷文豪  等 《环境昆虫学报》 2023年45卷3期 719-730页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 颜氏大疣蛛Macrothele yani个体大、毒性强、易取毒,是农林生态系统中害虫的重要天敌,也是天然药物研究工作者进行新药挖掘和毒液开发利用的重要选择对象.本研究利用高通量测序平台Illumina Hiseq 2000 对颜氏大疣蛛雌雄...

【关键词】 颜氏大疣蛛； 高通量测序； 转录组；

【中文期刊】 邓小书 卫秋阳  等 《中国现代中药》 2023年25卷8期 1635-1645页 ISTICCA

【摘要】 目的:探索人工培殖冬虫夏草Cordyceps sinensis(BerK.)Sacc.外观品质形成的分子基础.方法:以重庆和康定人工培殖冬虫夏草僵虫为材料,利用Illumina Hiseq 2500 高通量测序技术进行转录组测序分析,基于差...

【关键词】 冬虫夏草； 僵虫； 高通量测序；

【中文期刊】 赵旺生 李柯锐  等 《南方农业学报》 2023年54卷5期 1273-1282页

【摘要】 [目的]探明牦牛和犏牛的附睾尾部差异表达基因(DEGs),筛选出与精子成熟和贮存密切相关的功能基因,为揭示犏牛精子发生及其成熟过程的分子机制打下理论基础.[方法]以牦牛和犏牛的附睾尾部为研究对象,通过Illumina 127-HiSeq 2...

【关键词】 牦牛； 犏牛； 附睾尾部；

【中文期刊】 苗小荣 唐柳茹  等 《现代园艺》 2023年46卷23期 11-13页

【摘要】 粗根茎莎草是海岸沙丘生态系统的重要组成部分.为了解析自然生长条件下粗根茎莎草基因表达情况,采用高通量测序技术,对海滨自然生长的粗根茎莎草的根、茎和叶混合样品进行转录组测序分析.结果显示,粗根茎莎草一共获得高通量测序数据8.44 Gb,Q30...

【关键词】 粗根茎莎草； 高通量测序； 转录组；

【中文期刊】 李媛媛 赵金红  《环境昆虫学报》 2021年43卷6期 1485-1492页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 玉米象Sitophilus zeamais是一种世界性的储粮害虫,但其基因信息尚不完善.本研究利用高通量测序平台Illumina HiSeq TM2000对玉米象成虫进行转录组测序,总计获得64358条unigenes,总长度3948175...

【关键词】 玉米象； 高通量测序； 转录组；

【中文期刊】 孙涛 张示渊  等 《环境昆虫学报》 2021年43卷6期 1493-1503页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 本研究采用Illumina HiSeq TM 2500测序平台对阿尔泰蝠蛾Hepialus altaicola Wang幼虫进行转录组测序及生物信息学分析.经序列拼接后共获得100133个Unigenes,总长度86319112 bp,平均...

【关键词】 阿尔泰蝠蛾； 转录组； 基因注释；

【中文期刊】 滕云 邱宗波  等 《植物研究》 2021年41卷3期 354-361页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 采用Illumina HiSeqTM2500高通量测序技术,获得泡桐维管形成层及木质部区组织转录组的109021918条clean reads(16.35 Gb).将clean reads从头组装得到104432个单基因簇(Unigene)...

【关键词】 泡桐； 维管形成层； 高通量测序；

【中文期刊】 邹小仓 于仁峰  等 《军事医学》 2022年46卷8期 576-583页 ISTICCSCDCA

【摘要】 目的 构建血清饥饿预处理的人永生化角质形成细胞(HaCaT)光老化模型.通过多组学关联分析,探索中波紫外线(UVB)照射对HaCaT细胞光老化过程的生物学影响.方法 血清饥饿法预处理HaCaT细胞24 h,对HaCaT细胞进行20 mJ/c...

【关键词】 光老化模型； 人永生化角质形成细胞； 高通量测序；

【中文期刊】 黄丽萍 乔博灵  等 《陕西中医》 2022年43卷1期 28-32页 ISTICCA

【摘要】 目的:探寻益气复脉/参芪扶正注射液发挥补气作用的潜在靶基因及其生物学功能.方法:利用高通量转录组测序技术,考察气虚患者经益气复脉/参芪扶正注射液治疗后,其外周血单核细胞的差异表达基因、GO(Gene Ontotology)分析及KEGG(K...

【关键词】 补气； 益气复脉； 参芪扶正；

【中文期刊】 李静宇 徐友阳  等 《广州中医药大学学报》 2022年39卷10期 2387-2393页 ISTICCA

【摘要】 [目的]利用高通量测序技术获得中泰南五味子的转录组信息.[方法]中泰南五味子叶片总RNA经过提取、建库、测序、de novo组装,获得Unigene序列,再进行注释和比对,得到中泰南五味子转录组的遗传信息.[结果]共获得29915条Unig...

【关键词】 中泰南五味子； 转录组； 生物信息学；

【中文期刊】 郑凯 任华亮  等 《基础医学与临床》 2022年42卷7期 1139-1143页 ISTICCA

【摘要】 主动脉扩张性疾病以主动脉夹层和主动脉瘤为代表,是血管外科最危险的疾病,该疾病的发病机制尚不十分明确.单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术能在单个细胞水平研究细胞异质性,识别新的细胞状态和群体,为研究主动脉疾病的发生和发展机制提供了一种...

【关键词】 主动脉疾病； 单细胞RNA测序； 单细胞转录组测序；

【中文期刊】 郭翠 徐祎敏  等 《上海中医药杂志》 2022年56卷2期 54-60页 ISTICCSCDCA

【摘要】 目的 利用二代测序技术探讨蚕梅方在转录组学层面上抗结直肠癌活性的作用机制.方法 将来源于《本草纲目》中治疗肠风的核心药物乌梅及僵蚕组方为蚕梅方,对RKO细胞(肠癌细胞)进行干扰,采用二代高通量测序平台(Illumina Hi-Seq)测序技...

【关键词】 蚕梅方； 结直肠癌； 转录组学；

【中文期刊】 蒋月丽 李彤  等 《环境昆虫学报》 2020年42卷1期 128-136页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 麦红吸浆虫Sitodiplosis mosellana (Gehin)是一种世界性的小麦害虫.为获得其转录组信息,本研究采用新一代高通量测序技术Illumina HiSeq TM2000对麦红吸浆虫成虫转录组进行测序.共获得转录组样本数据量...

【关键词】 麦红吸浆虫； 高通量测序； 转录组；

【中文期刊】 张雨 夏铭泽  等 《植物研究》 2020年40卷3期 458-467页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 为了增强对资源植物山莨菪的深入了解,本研究采用高通量测序技术对山莨菪进行转录组测序分析,经过处理得到71 463个Unigenes.通过与多个数据库进行比对,对基因进行分类和分析注释,最终成功获得注释的基因有47 624条.将Unigene...

【关键词】 山莨菪； 转录组； 高通量测序；

【中文期刊】 李涛 张泽坤  等 《福建农林大学学报（自然科学版）》 2022年51卷2期 145-154页

【摘要】 单细胞转录组测序(scRNA-seq)使研究人员能够在单细胞分辨率下研究基因的表达,了解细胞的动态发育轨迹.然而,单细胞分辨率的基因表达矩阵往往具有高维度和高稀疏性的特点,使后续数据处理面临巨大的挑战.因此,本文综述了scRNA-seq数据...

【关键词】 单细胞转录组测序； 降噪； 高通量；

【中文期刊】 刘江 张艳峰  等 《山西大学学报（自然科学版）》 2022年45卷6期 1675-1681页

【摘要】 本研究采用高通量测序技术Illumina平台测定角倍蚜与其唯一第一寄主植物盐肤木转录组序列,共获得角倍蚜Unigenes 25 077条,盐肤木Unigenes 40 003条,与NR、GO和KEGG等数据库进行比对注释角倍蚜和盐肤木转录组...

【关键词】 角倍蚜； 寄主植物； 高通量测序；

【中文期刊】 李逍凡 陈沁  等 《食品安全质量检测学报》 2022年13卷21期 6882-6888页

【摘要】 克罗诺杆菌(Cronobacter)是一种兼性厌氧的革兰氏阴性菌,会引起婴幼儿脑膜炎等多种疾病,严重危害人类健康.高通量转录组测序技术是一种具体测定各基因表达量的测序方法,不仅可以全面研究全新的转录本,还能获得更准确、详细的研究结果.本文综...

【关键词】 高通量转录组测序技术； 克罗诺杆菌； 毒力因子；

【中文期刊】 岳倩倩 赵永霞  等 《中国酿造》 2022年41卷12期 134-138页

【摘要】 分别以钰态氮、亚硝态氮为氮源培养安卡红曲霉(Monascus anka)GZUM-25,采用Illumina二代测序平台(Illumina Hiseq)对红曲霉GZUM-25进行转录组测序分析,分析不同氮源条件下调控红曲霉菌丝生长和产色素的...

【关键词】 红曲霉； 转录组； 高通量测序；

【中文期刊】 韩霜 余静雅  等 《中国野生植物资源》 2022年41卷8期 1-7,36页 CSCD

【摘要】 利用高通量测序技术对高山绣线菊叶片进行转录组测序,获得的转录组数据可用来进行拼接、功能注释、表达水平及差异等分析.组装拼接后获得53892条Unigenes.与多个数据库进行比对后,31627条Unigenes成功注释到NR库;16166条...

【关键词】 高山绣线菊； 高通量测序； 转录组；

【中文期刊】 石田培 张莉  《遗传》 2019年41卷3期 193-205页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 RNA作为一种大分子参与基因编码、解码、调控、表达等多种生物学过程.目前,对RNA的功能研究主要通过全转录组测序方法来完成.全转录组研究可以对基因结构与功能进行更深层次地分析和探究,揭示基因表达与生命现象之间的内在联系.现阶段,基于高通量测...

【关键词】 基因表达； 全转录组； RNA测序技术；