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【中文期刊】 任鹏 段乐乐  《软件》 2024年45卷4期 24-28页

【摘要】 在新药研发中,药物与靶标的结合亲和力是一个关键指标,对于它的准确预测对加速药物筛选至关重要.近年来,随着深度学习技术的应用,药物与靶标的结合亲和力预测取得了显著进步,受到了广泛关注.然而,现有方法大多忽略药物的结构信息,且缺乏学习蛋白质的序...

【关键词】 图注意力网络； 蛋白质语言模型； 药物靶标亲和力；

【中文期刊】 王雪 孙长岗  《世界中医药》 2020年15卷12期 1692-1698,1704页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的:目前青黛已是治疗急性幼粒细胞白血病(APL)的临床有效药物,但其分子机制与物质基础仍不明确.基于此本研究构建青黛与APL可视化药靶蛋白模型,以探究青黛作用于APL的分子机制.方法:通过GEO数据库检索APL微阵列芯片分析APL差异表达...

【关键词】 急性幼粒细胞白血病； 青黛； 药靶蛋白模型；

【中文期刊】 闫文芬 衡洋  等 《中国药理学通报》 2015年4期 586-590页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 目的：建立以α-突触核蛋白损伤为靶点筛选抗帕金森病创新药物的细胞模型。方法通过 PCR 方法扩增目的基因，分子克隆技术构建原核表达载体。融合载体转化至大肠杆菌诱导后表达重组α-突触核蛋白，亲和层析法纯化目的蛋白并通过蛋白免疫印迹和质谱技术进...

【关键词】 α-突触核蛋白； 毒性作用； 帕金森病；

【中文期刊】 《中国神经再生研究（英文版）》 2018年13卷12期 2173-2181页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Decreased expression of brain-derived neurotrophic factor (BDNF) plays an important role in the pathogenesis of Alzheime...

【关键词】 nerve regeneration； Alzheimer's disease； exogenous brain-derived neurotrophic factor；

【中文期刊】 李占潮 戴宗  等 《化学研究与应用》 2014年9期 1483-1486页

【摘要】 蛋白质与蛋白质相互作用的识别有助于研究蛋白质功能和发现潜在的药物靶标。本研究采用氨基酸组成、二肽组成、三联子组成、组成、转变、分布和自相关特征对蛋白质与蛋白质相互作用对进行表征。基于最小冗余最大相关方法选择最优特征子集，结合支持向量机对酵母...

【关键词】 蛋白质相互作用； 最小冗余最大相关； 支持向量机；

【中文期刊】 《华中科技大学学报（医学英德文版）》 2005年25卷1期 48-50,58页 SCIMEDLINE

【摘要】 To study the influence of siRNA targeting survivin gene on the biological behavior of hepatocellular carcinoma (HCC), on...

【关键词】 hepatoeellular carcinoma； siRNA； survivin；

【中文期刊】 《中医杂志（英文版）》 2011年31卷2期 88-97页 SCIMEDLINECSCDCA

【摘要】 Obiective:Observing the expression changes of serum proteome in model rats after intervention of the Granules of Elimina...

【关键词】 Granules of Eliminating Phlegm and Removing Blood Stasis,also known as GEPRB； Diabetes deafness,also known as DD； two-dimentional electrophoresis,also known as 2-DE；

【外文期刊】 Wei,W. ; Tweardy,D.J. ; 等 《Stem Cells》 2014年32卷10期 2571-2582页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Cancer stem cells; Cell signaling; Drug target;

【外文期刊】 Hu, ShanShan ; Xia, DeNan ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2021年18卷4期 1315-1324页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Drugs; Proteins; Feature extraction;

【外文期刊】 Hussain,M. ; Fazil,T. ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2012年30卷5期 574-584页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Drug targets; Molecular dynamics; Protein modeling;

【外文期刊】 Keller TH ; Pichota A ; 等 《Current opinion in chemical biology》 2006年10卷4期 357-361页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 MARKETED ORAL-DRUGS; PROTEIN DRUGGABILITY; MOLECULAR-PROPERTIES;

【外文期刊】 Ghaghada KB ; Saul J ; 等 《Journal of Controlled Release: Official Journal of the Controlled Release Society》 2005年104卷1期 113-128页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 receptor; ligand; tethered ligands;

【外文期刊】 Ohminato, Noriaki ; Nagayasu, Miho ; 等 2021年51卷1/12期 968-976页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 In vitro; in vivo correlation (IVIVC); heat shock protein 90 (HSP90) inhibitor;

【外文期刊】 Marholz, Laura J. ; Federspiel, Joel D. ; 等 《Journal of proteome research》 2021年20卷9期 4272-4283页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 kinase; targeted proteomics; chemoproteomics;

【外文期刊】 Prathipati, P ; Ma, NL ; 等 《Journal of proteome research》 2009年8卷6期 2788-2798页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 TB chemogenomics; antiTB drugs; Tb proteome;

【外文期刊】 Bima, Abdulhadi Ibrahim Hussain ; Elsamanoudy, Ayman Zaky ; 等 2022年77卷5期 1481-1496页

【关键词】 Obesity; MC4R; Protein Modeling;

【外文期刊】 González-Díaz,H. ; Arrasate,S. ; 等 《Current topics in medicinal chemistry》 2013年13卷5期 619-641页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Artificial neural networks; Drug-target networks; Multi-target QSAR;

【外文期刊】 A. M. U. B,Mahfuz ; Muhammad Nasir,Iqbal ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2022年40卷19期 9509-9521页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Antibiotic resistance; drug target; ribonucleotide reductase;

【外文期刊】 Georrge, J.J. ; Umrania, V.V. ; 《Applied biochemistry and biotechnology, Part A. enzyme engineering and biotechnology》 2012年167卷5期 1377-1395页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 ADMET; BLAST; DEG;

【外文期刊】 Joanna E. Raczynska ; Ivan G. Shabalin ; 等 《Drug resistance updates: reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy》 2018年40卷 1-12页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Antibiotic resistance; Metallo-β-Lactamase; New Delhi metallo-β-lactamase (NDM);

【外文期刊】 Thomas Klabunde ; Gerhard Hessler ; 《Chembiochem: A European journal of chemical biology》 2002年3卷10期 929-946页

【关键词】 drug design; focused libraries; g-protein-coupled receptors;

【外文期刊】 Yu, Zhimiao ; Lu, Jiarui ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2021年18卷4期 1305-1314页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Drugs; Proteins; Feature extraction;

【外文期刊】 Caprari, Silvia ; Brandi, Valentina ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2020年38卷15/16期 4508-4520页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Pseudomonas aeruginosa; periplasmic proteins; molecular modeling;

【外文期刊】 Das, Sonali ; Banerjee, Anindyajit ; 等 2020年295卷29期 9934-9947页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Leishmania; transgenic parasite; molecular modeling;

【外文期刊】 Christian Gausterer ; Mathias Mliller ; 等 《Anti-Inflammatory & Anti-allergy Agents in Medicinal Chemistry》 2007年6卷1期 29-45页

【关键词】 Jak protein tyrosine kinases; cytokines; drug target;

【外文期刊】 Maria del Carmen Fernandez-Alonso ; Dolores Diaz ; 等 《Current Protein and Peptide Science》 2012年13卷8期 816-830页

【关键词】 NMR; molecular modeling; protein-ligand interactions;

【外文期刊】 Priya, Vishnu ; Singh, Sanjeev K. ; 等 《Molecular pharmaceutics》 2023年20卷1期 663-679页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 abciximab; antithrombotic; rutin;

【外文期刊】 Imtiaz, Syed Asad ; Saeed, Sania ; 等 《Future microbiology》 2020年15卷18期

【关键词】 de novo modeling; Enterococcus faecalis; epitope prediction;

【外文期刊】 Croxford ; A.L. ; 等 《Immunity》 2015年43卷3期 502-514页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 chemokine receptor CCR2; cryopyrin; granulocyte macrophage colony stimulating factor;

【外文期刊】 Pliakos, Konstantinos ; Vens, Celine ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2021年18卷4期 1596-1607页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Drugs; Proteins; Diffusion tensor imaging;