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【中文期刊】 陈立炜 任天一 等 《药物评价研究》 2025年48卷7期 1828-1839页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 运用GEO芯片、网络药理学及分子对接技术探究炙甘草汤治疗肺纤维化的作用靶点及其潜在机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM、ETCM数据库获取炙甘草汤的化学成分靶点并利用Uniprot校正靶点...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李小妹 黄士蒙 等 《药物生物技术》 2024年31卷1期 20-28页ISTICCA
【摘要】 研究旨在探寻糖尿病和心力衰竭之间可能存在的关联,并评估纤维化相关基因在其中发挥的作用.从GEO数据库中下载心力衰竭的单细胞测序和转录组测序数据;从CTD数据库中下载与糖尿病相关的基因;通过GO和KEGG通路富集分析寻找与糖尿病相关心力衰竭密...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黎滨茹 李琳琳 等 《解剖科学进展》 2024年30卷2期 153-156,160页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学筛选出潜在的具有早期诊断及判断胃癌预后的生物标志物.方法 应用GEO2R从GEO数据集筛选出差异表达基因,应用GO/KEGG进行功能富集分析,使用STRING工具生成蛋白互作网络,再利用Cytoscape的MCODE插件...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 董又滋 赵泉霖 《时珍国医国药》 2022年33卷6期 1500-1505页PKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用生物信息学的方法分析黄芪多糖(APS)治疗2型糖尿病(T2DM)的关键基因.方法 通过基因表达汇编(GEO)数据库分别下载APS和T2DM的相关芯片数据集,借助GEO2R在线分析工具筛选差异基因,分别构建靶点互作关系(PPI)网络...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 梁潇 段彦苍 等 《中华中医药杂志》 2021年36卷4期 1984-1988页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:研究反复移植失败(RIF)患者子宫内膜局部免疫细胞的浸润模式,分析RIF患者可能的免疫学病因及其免疫调节机制.方法:从基因表达综合(GEO)数据库中下载正常女性及RIF患者子宫内膜的基因表达谱芯片数据集,通过CIBERSORT软件计算...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黄晓燕 邹孟龙 等 《中药新药与临床药理》 2021年32卷6期 815-824页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过网络药理学方法联合GEO数据库预测黄芪治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的核心活性成分及靶点,并通过分子对接初步验证.方法 利用中药系统药理分析平台(TCMSP)提取黄芪的活性成分及对应靶点,借助Uni...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 樊竹 王树鑫 等 《中国皮肤性病学杂志》 2021年35卷12期 1336-1341页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 运用生物信息学方法分析尖锐湿疣相关差异表达基因,探讨并了解尖锐湿疣发生发展过程的可能分子机制.方法 本研究从GEO数据库中选择基因表达谱GSE140662数据集,采用R语言limma包对数据集进行差异分析,筛选出尖锐湿疣组织与正常人上...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李萍 《生物技术》 2022年32卷6期 715-720,736页ISTICCA
【摘要】 [目的]探究COL1A1基因在胰腺癌中的表达及临床意义.[方法]收集Oncomine和NCBI/GEO Profiles数据库中关于COL1A1的信息,对目前数据库中资料再次进行分析,并对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析,使...
【关键词】 胰腺癌；COL1A1；Oncomine 数据库；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 程武 张美玲 等 《中国卫生检验杂志》 2022年32卷13期 1552-1555页ISTIC
【摘要】 目的 初步探讨透明质酸介导的运动性受体(HMMR)在肝细胞癌中的表达及其与患者预后的相关性.方法 运用GEO数据库分析筛选合适的人肝癌芯片数据,利用GEO2R在线分析差异基因;采用HPA数据库分析肝癌组织与肝正常组织的表达差异性;运用Kap...
【关键词】 透明质酸介导的运动性受体；肝细胞癌；GEO数据库；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郝谦 陈勇 《生物医学工程与临床》 2022年26卷2期 212-218页ISTICCA
【摘要】 目的 拟利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法筛选出与脓毒症发生、预后相关的关键基因,为今后的研究提供线索.方法 从基因表达(GEO)数据库中通过筛选数据集中样本数大于100,含有脓毒症患者和健康对照组,且有脓毒症患者预后情况数据集,...
【关键词】 脓毒症；GEO数据库；固醇调节元件结合蛋白裂解激活蛋白(SCAP)；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 朱有为 王文政 等 《中国药物依赖性杂志》 2022年31卷5期 395-400页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 应用生物信息学方法筛选可卡因使用障碍的核心基因和信号通路.方法 从基因表达综合数据库下载基因表达数据集GSE54839.应用R软件筛选差异表达基因.使用DAVID数据库进行基因富集分析.使用STRING数据库构建蛋白互作网络,使用cy...
- 概要：
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【中文期刊】 毛琳慎 任维 等 《时珍国医国药》 2021年32卷9期 2140-2144页PKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于GEO数据库多芯片联合分析与网络药理学相结合,探索黄芪治疗心肌缺血再灌注损伤(Myocardial is-chemia-reperfusion injury,MIRI)的作用机制.方法 通过GEO数据库获得GSE108940与GS...
- 概要：
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【中文期刊】 骆帝 梁学振 等 《中华中医药学刊》 2020年38卷11期 171-176,后插29-后插30页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于生物信息学和网络药理学初步分析葛根素治疗股骨头坏死的关键分子机制,为股骨头坏死的治疗提供新的研究方向与靶点.方法 葛根素是中药葛根主要的提取物成分,是一种植物性雌激素.通过中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)数据库、物质和...
- 概要：
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【中文期刊】 梁学振 骆帝 等 《中华中医药学刊》 2019年37卷11期 2628-2631,后插8页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:基于生物信息学和网络药理学初步分析葛根素治疗骨质疏松的关键分子机制,为骨质疏松症的治疗提供新的靶点.方法:通过TCMSP数据库分析葛根素的化学属性,检索GEO公共数据库中关于葛根素和骨质疏松症的相关芯片,借助R语言分析差异基因,分别构...
- 概要：
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【中文期刊】 刘云峰 王林 等 《基因组学与应用生物学》 2019年38卷10期 4763-4768页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 EVI1基因高表达的AML患者对化疗药物有耐药性,总体生存率低.寻找针对EVI1高表达AML的潜在治疗新靶点,对于提高这类病人存活率具有重要意义.本研究从GEO数据库获取EVI1高表达和低表达AML的表达谱,利用R软件Limma包进行差异表...
- 概要：
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【中文期刊】 白鹿原 安兰花 等 《中医药导报》 2021年27卷7期 152-157,164页ISTIC
【摘要】 目的:基于网络药理学和分子对接,初步探寻浙贝母治疗急性髓系白血病(AML)作用机制.方法:通过TCMSP数据库联合Swiss Target Prediction数据库,筛选浙贝母化学成分并预测相关靶点,通过GeneCards、OMIM、DR...
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【中文期刊】 肖又德 王丹 等 《生物医学工程与临床》 2021年25卷3期 352-358页ISTICCA
【摘要】 目的 通过分析基因表达汇总(GEO)数据库中胃癌组织的数据,评估黏着斑蛋白(SVIL)基因在胃癌中的表达情况,探讨SVIL对胃癌患者预后的意义,并分析预测其作用机制.方法 通过GEO数据库下载基因芯片GSE84437数据,该数据内包含433...
【关键词】 胃癌；黏着斑蛋白(SVIL)基因；GEO数据库；
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【中文期刊】 王维 郭志玲 等 《生物医学工程与临床》 2021年25卷3期 359-365页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学技术分析与胃低级别上皮内瘤变(LGIN)发病相关的重要信号通路并筛选出关键基因,以期为LGIN的精确诊断及早期干预提供新的理论依据.方法 选择美国国立生物中心的基因表达汇总(GEO)数据库(https://www.ncb...
- 概要：
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【中文期刊】 杨欣 李亚辉 等 《沈阳药科大学学报》 2021年38卷12期 1309-1318页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 基于网络药理学及GEO数据集初步探索白术防治2型糖尿病的分子机制.方法 根据标准流程对GEO数据库中基因芯片数据(GSE7014)进行收集处理、整合,对芯片数据进行归一化校正,用已编制好的R语言程序进行差异基因分析.通过TCMSP数据...
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【中文期刊】 高丽娟 赵欣 等 《生理学报》 2018年70卷4期 361-368页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 本文旨在采用生物信息学方法筛选重度抑郁症发病机制相关基因.以美国国家生物技术信息中心 (NCBI) 网站GEO公共数据库中GSE98793芯片数据为研究对象, 用R语言limma包筛选出116个差异表达基因 (differentially ...
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【中文期刊】 崔勇 马云 《基因组学与应用生物学》 2017年36卷6期 2221-2229页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 结核病(tuberculosis,TB)对人类具有非常大的威胁,感染过结核病的人占世界总人口数的三分之一,而且每年有造成超过一白万人的死亡.为了寻找可用于结核病诊断和治疗的分子标志物,我们从微阵列数据存储中心基因表达综合数据库(gene e...
- 概要：
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【中文期刊】 张厦栋 辛晓红 等 《中国分子心脏病学杂志》 2020年20卷1期 3255-3263页ISTICCA
【摘要】 目的 通过GEO数据库转录组和miRNA基因芯片数据筛选和分析动脉性肺动脉高压相关基因.方法 通过GEO数据库收集转录组数据集(GSE113439、GSE53408)和miRNA数据集(GSE21284、GSE55427).使用R3.5.2...
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【中文期刊】 林剑鹏 王巍 《中国医学工程》 2020年28卷12期 4-7页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨癌基因纺锤体与着丝粒相关蛋白3(SKA3)在结肠癌中的表达及临床意义.方法 在GEO数据库中选取GSE28000、GSE44076、GSE21815三个基因芯片作为目的基因芯片,分成肿瘤组和正常组两组,在三个基因芯片中筛选差异基因...
【关键词】 GEO数据库；纺锤体与着丝粒相关蛋白3；蛋白质免疫印迹；
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【中文期刊】 梁士楚 王翠 等 《临床心血管病杂志》 2020年36卷6期 516-522页ISTICCA
【摘要】 目的:寻找致心律失常性右室心肌病(ARVC)发病关键基因.方法:从GEO数据库获得人类ARVC现有信息芯片,筛选出ARVC心肌和正常心肌间差异基因.通过David数据库进行基因本体论(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路...
【关键词】 致心律失常性右室心肌病；关键基因；GEO数据库；
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【中文期刊】 何万勋 尤伟 等 《生物医学工程与临床》 2020年24卷4期 462-469页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学方法及网页统计工具筛选与乳腺癌的发病相关的枢纽基因(hub基因),并且联合蛋白数据库等多数据库比对,进一步分析生物学功能及与预后的相关性.方法 从GEO数据库中下载得到2个表达谱芯片数据集,利用在线工具GE02R比对数据...
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【中文期刊】 曹策 杨丽丽 等 《中草药》 2025年56卷14期 5108-5118页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究积雪草苷抑制转化生长因子-β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)诱导的心肌成纤维细胞活化的作用机制.方法 采用TGF-β1 诱导建立心肌成纤维细胞活化模型,给予积雪草苷处理后,采用CCK-...
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- 方法：
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【中文期刊】 蒋先伟 王明航 等 《中草药》 2025年56卷3期 919-932页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 支气管哮喘是严重影响全球公众健康的重大慢病之一,通过使用GEO数据集和孟德尔随机化方法确定哮喘新的遗传靶点,为临床治疗和机制研究提供依据.方法 通过基因表达综合数据库(GEO)获得相关数据集,获得数据后进行差异基因的表达数量性状位点(...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张哲 文丛 等 《现代预防医学》 2025年52卷6期 994-1000页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 利用孟德尔随机化方法(Mendelian randomization,MR)探讨桥本甲状腺炎(Hashimoto's thyroiditis,HT)与缺血性脑卒中(Ischemic stroke,IS)的因果关系,应用生物信息学方法筛...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 董鑫宇 曲明海 等 《药物评价研究》 2025年48卷5期 1200-1210页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 旨在通过网络药理学探讨姜黄素对肝脏缺血再灌注损伤(HIRI)的影响.方法 采集姜黄素的化学结构,并利用SwissTargetPrediction、PharmMapper等多个数据库确定潜在的靶点.使用UniProt数据库进行数据转换....
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- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘旭雯 冯阳 等 《现代药物与临床》 2025年40卷6期 1363-1370页ISTICCA
【摘要】 目的 通过基因表达综合(GEO)芯片数据和分子对接技术探讨莲子心治疗急性肝损伤(ALI)的潜在作用机制.方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取莲子心的化学成分及分子靶点;检索GEO数据库中ALI相关芯片数据,借助R语言分...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
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