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【中文期刊】 程呈 卢帅 等 《中华损伤与修复杂志（电子版）》 2025年20卷2期 99-106页ISTICCA
【摘要】 目的探究在非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）发展过程中发生显著变化的炎症损伤相关核心基因。方法从基因表达数据库（GEO）的GSE167523 数据集中选择98 例NAFLD 患者，通过基因集变异分析（GSVA）计算炎症指数。 设置高炎症指数和...
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【中文期刊】 谭玲芳 周克兵 《中华肺部疾病杂志（电子版）》 2023年16卷3期 329-334页ISTIC
【摘要】 目的:为寻找支气管哮喘患者潜在的诊断生物标志物，基于生物信息学分析方法。方法:从基因表达芯片(GEO)数据库获得以哮喘患者和健康志愿者为试验对象的GSE41861和GSE64913支气管上皮细胞基因表达数据集。通过对高通量芯片数据进行提取，...
- 概要：
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【中文期刊】 张敏洁 王雅晳 等 《中华临床医师杂志(电子版)》 2023年17卷4期 438-445页ISTICCA
【摘要】 目的:基于基因表达数据库（GEO）运用生物信息学分析筛选与大鼠心肌缺血再灌注损伤（MIRI）相关的关键基因（Hub gene）、通路及候选药物。方法:从GEO数据库下载大鼠GSE122020数据集并利用GEO2R在线工具筛选差异表达基因（D...
- 概要：
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【中文期刊】 华杨 孙劲禹 等 《中华心脏与心律电子杂志》 2023年11卷1期 32-38页
【摘要】 目的:利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）方法筛选与肥厚型心肌病（HCM）发生相关的关键基因，为今后的研究提供线索。方法:首先，从公共基因表达数据库（GEO）下载GSE36961和GSE160997数据集，使用R语言中的“limma”和...
- 概要：
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【中文期刊】 于曼 余珉 等 《中华劳动卫生职业病杂志》 2021年39卷2期 91-98页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:分析恶性胸膜间皮瘤（MPM）基因突变概况和高频突变基因的表达水平，筛选出影响MPM患者预后的关键分子和临床病理因素。方法:于2020年3月，分别从癌症基因组图谱（TCGA）数据库和人类肿瘤相关基因表达汇编（GEO）数据库下载86例MP...
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【中文期刊】 王玉 杨雪 等 《中草药》 2020年51卷20期 5207-5219页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 采用GEO数据库、整合药理学平台v2.0和分子对接技术探讨大黄抗肝癌的活性成分及其分子机制.方法 利用中医药整合药理学平台(TCMIP)筛选中药大黄的活性成分,借助TCMIP及Swisstarget在线数据库预测作用靶点;从GEO数据...
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【中文期刊】 胡鑫 高悦 等 《中国肿瘤生物治疗杂志》 2020年27卷8期 903-910页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:运用生物信息学方法结合基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)筛选参与胃癌发生发展的关键基因,以获得用于胃癌诊断、治疗靶标选择及预后判断相关分子标志物.方法:从GEO数据库中下载与胃癌(gastric ...
- 概要：
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【中文期刊】 颜朝阳 徐同欣 等 《中国肿瘤生物治疗杂志》 2020年27卷12期 1393-1398页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:通过TCGA和GEO数据库筛选与食管腺癌相关的关键基因,并分析其生物学功能、相关信号通路和临床意义.方法:综合TCGA数据库食管腺癌数据和GEO数据库GSE92396芯片数据,使用R软件的DEseq2包和Limma包进行差异表达基因分...
- 概要：
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【中文期刊】 贺利平 陈毅斐 等 《中华医学杂志》 2017年97卷38期 3022-3027页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨前列腺素D2合成酶(PTGDS)在非小细胞肺癌(NSCLC)[包括肺腺癌(ADC)和肺鳞癌(SCC)]中的作用及可能的机制.方法 首先,通过基因表达汇编(GEO)数据库对PTGDS在ADC和SCC中各自的蛋白表达进行分析.然后,通...
【关键词】 基因表达汇编(GEO)数据库；前列腺素D2合成酶；非小细胞肺癌；
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【中文期刊】 姜秋竹 杨会 等 《国际移植与血液净化杂志》 2021年19卷2期 8-12页
【摘要】 目的:寻找肾脏纤维化发生的关键基因和潜在机制，为肾脏纤维化早期诊断和治疗提供评估手段和新思路。方法:在基因表达综合数据库(GEO数据库)中进行搜索找出信息芯片GSE102515，筛选出差异基因，找出下调基因和上调基因。通过DAVID数据库对...
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【中文期刊】 史云 刘洋 《中国妇幼保健》 2020年35卷2期 380-382页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨基于GEO数据库挖掘妊娠期高血压疾病患者胎盘潜在标志物及可能机制.方法 从GEO数据库中收集妊娠期疾病高血压疾病人群研究的胎盘mRNA基因芯片GSE98224,共计48例,并根据是否发生妊娠期高血压疾病将其分为两组,即妊娠期高血压...
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【中文期刊】 王斌 张亚萍 等 《中国生物制品学杂志》 2020年33卷10期 1104-1110页ISTICCSCDCABP
【摘要】 目的 筛选非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)预后的关键基因,并对其进行生物信息学分析及鉴定.方法 从公共数据库基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载NSC...
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【中文期刊】 黄振宜 宋佳 等 《中华内分泌外科杂志》 2020年14卷2期 119-123页ISTICCA
【摘要】 目的:利用生物信息学管理对乳腺癌和癌旁组织进行长链非编码RNA-生长停滞特异基因5（lncRNA GAS5）差异表达分析，以探讨GAS5对三阴性乳腺癌发生发展的影响。方法:用基因图谱计划（The Cancer Genome Atlas，TC...
【关键词】 长链非编码RNA；生长停滞特异性转录本5；三阴性乳腺癌；
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【中文期刊】 胡金朋 李学文 等 《中国妇幼保健》 2020年35卷1期 13-15页ISTICCA
【摘要】 目的 基于GEO数据库挖掘先兆子痫(PE)患者外周血潜在标志物及可能机制.方法 从GEO数据库中收集PE人群研究的外周血mRNA基因芯片GSE48424,共计36例,并根据是否发生PE将其分为两组,即PE组和对照组.在GEO2R平台内对各组...
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【中文期刊】 余斌 丁佑铭 等 《肿瘤学杂志》 2019年25卷10期 869-875页ISTICCA
【摘要】 [目的]探讨肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织中miR-621的表达及其临床意义,并对miR-621靶基因进行系统的生物信息学分析.[方法]基于GEO(Gene Expression Omnibus)和...
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【学位论文】 作者：何亮导师：所剑 吉林大学 临床医学 外科学（博士） 2017年
【摘要】 胃癌是威胁人类健康的全球性疾病.进展期胃癌即使经过规范化治疗,5年生存率仍低于30%.目前认为规范的D2手术后,术后的个体化治疗非常重要.而个体化治疗的热点为靶向治疗,合适的靶点选择是胃癌个体化治理的重要组成部分.本研究将高通量快速分析蛋白...
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【学位论文】 作者：陈军辉导师：杜红丽 华南理工大学 生物学 生物化学与分子生物学（硕士） 2014年
【摘要】 GEO数据库是美国生物技术信息中心(NCBI)的基因表达的综合库,是全球最大的基因芯片数据库之一.GEO数据库存储高通量的功能基因组数据主要以基因芯片表达数据为主,数据量呈指数增长.对于GEO数据库的挖掘方法主要包括差异表达基因的筛选,探究...
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【中文期刊】 安杰 牛云峰 等 《中华普通外科学文献（电子版）》 2024年18卷6期 430-436页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨LINC00520在胃癌中的功能和分子机制,揭示其在胃癌发展中潜在作用.方法 筛选GEO数据库中胃癌样本,寻找与胃癌恶性进展相关的差异表达基因.qPCR检测LINC00520在胃癌中的表达水平,细胞功能实验探索LINC00520对...
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【中文期刊】 林桦 秦超 等 《中华危重症医学杂志（电子版）》 2023年16卷6期 448-452页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 通过基因表达综合(GEO)数据库分析,筛选烧伤大鼠肝组织新的标志物,为其治疗提供理论基础.方法 采用GEO数据库GSE1860和GSE802数据集,分析24 h烧伤后肝组织的差异基因及共同表达的差异基因.选择3只健康成年雄性Sprag...
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【中文期刊】 李德馨 刘斌 等 《中国微生态学杂志》 2019年31卷5期 544-549页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过检测LHPP (phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase)在人胃腺癌组织和胃腺癌细胞系,以及幽门螺杆菌(Helicobacter pylo...
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【中文期刊】 陈靖 樊英 等 《热带医学杂志》 2010年10卷4期 367-371页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学方法 挖掘鼻咽癌上皮间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)发生的潜在分子机制.方法 从公共基因芯片数据库GEO(gene expression omnibus)中寻找并下...
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