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【中文期刊】 布娅·米然别克 贺欢 等 《临床消化病杂志》 2024年36卷4期 239-244页ISTICCA
【摘要】 [目的]通过生物信息学方法挖掘溃疡性结肠炎(ulcerative colititis,UC)致病关键基因.[方法]从公共基因芯片数据平台下载GSE53306和GSE38713基因芯片数据集,对UC活动期患者、UC静止期患者和健康志愿者进行分...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 沈艳 刘战民 等 《生物信息学》 2010年8卷1期 16-19页ISTIC
【摘要】 基于Homin的基因共表达网络的比较分析,发现人类基因共表达网络和蛋白质相互作用数据之间存在一定的相关性.采用基因本体论对这两个网络重叠区域进行基因分类后发现,这些编码的蛋白质主要集中在对刺激物的应答途径之中.通过对该途径中的蛋白质相互作用...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 叶星 刘仁仪 《中国组织工程研究》 2025年29卷24期 5237-5244页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:海马体对认知功能至关重要,运动有望提升认知并缓解认知衰退,然而其分子机制尚不明了.生物信息学通过分析运动对海马体分子表达的影响,从而揭示关键机制,为理解运动如何促进认知及制定干预策略提供新的视角.目的:采用生物信息学方法深入分析自主运...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黎明霞 刘伟锐 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2025年27卷5期 1485-1500页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 采用网络药理学和分子对接技术预测莪术-三棱(Curcumae Rhizoma-Sparganii Rhizoma,CR-SR)药对调控血管生成抗肺癌作用机制,并通过斑马鱼模型进行初步验证.方法 采用网络药理学方法筛选CR和SR的活性成...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘淏文 乔卫平 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷3期 563-571页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:成骨细胞是负责骨骼形成和重塑的主要细胞类型,其功能的正常发挥受到多种信号通路的精密调控,其中,骨形态发生蛋白和Wnt信号通路在成骨过程中起着关键作用.目的:综述了骨形态发生蛋白/Wnt信号通路在调控成骨细胞功能中的作用,并分析其在不同...
【关键词】 骨形态发生蛋白信号通路；Wnt信号通路；成骨；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 甘叶娜 韩晟 等 《中国药物警戒》 2025年22卷2期 162-168,中插4-中插7页ISTIC
【摘要】 目的 探讨基于网络药理学探讨大承气汤治疗退行性腰椎管狭窄症(Degenerative Lumbar Spinal Stenosis,DLSS)的分子机制.方法 检索建库至 2024 年7月10日,中药系统药理学数据库与分析平台(Tradit...
【关键词】 大承气汤；芦丁；5,7,4’-三甲基芹菜素；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 许佳 马旺明 等 《环球中医药》 2025年18卷4期 655-663页ISTICCA
【摘要】 目的 利用网络药理学和分子对接技术,探索侧柏双参方治疗雄激素性脱发(androgenetic alopecia,AGA)的潜在分子机制,并进行实验验证.方法 运用GeneCards、OMIM数据库检索AGA靶点,利用TCMSP数据库收集侧柏...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吕刚 唐燕娣 《中华神经外科疾病研究杂志》 2025年19卷4期 66-72页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨家族性高胆固醇血症(FH)和阿尔茨海默病(AD)共同的病理生理机制.方法 从基因表达综合数据库(GEO)下载FH和AD的表达矩阵,分别为GSE13985和GSE5281.通过limma包分析鉴定共同的差异表达基因(DEG).随后对...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王心雨 张奇 《实用肿瘤学杂志》 2025年3期 208-215页ISTICCA
【摘要】 目的 筛选食管癌诊断和预后标志物,探究其潜在作用机制,为食管癌的早期诊断和精准治疗提供新思路.方法 提取并分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)食管癌转录组测序数据(RNA-seq)中的蛋白编码基因,...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王书恒 刘薇薇 等 《医学研究杂志》 2025年54卷3期 54-61,89页ISTIC
【摘要】 目的 膀胱癌(bladder cancer,BLCA)是常见的疾病,其发病机制不清楚,本研究旨在发现膀胱癌的关键基因,为今后的预防和治疗提供依据.方法 从美国生物技术信息中心NCBI的GEO(Gene Expression Omnibus)...
【关键词】 膀胱癌；生物信息学；加权基因共表达网络分析；
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【中文期刊】 白者乔 蒋红红 等 《发育医学电子杂志》 2025年13卷3期 167-174页
【摘要】 目的 采用生物信息学方法对早发性卵巢功能不全(premature ovarian insufficiency,POI)患者的转录组芯片数据进行深入分析,旨在鉴定出该疾病的特征基因和关键通路,以期对POI的分子遗传机制有更精确的理解,进而为其...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 徐秀峰 徐龙武 等 《山东第二医科大学学报》 2025年47卷4期 281-287页
【摘要】 目的 基于生物信息学方法探究单侧梅尼埃病(Meniere's disease,MD)的分子机制.方法 在基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)获取GSE109558数据集,通过R语言limma包筛选差异表达...
【关键词】 生物信息学；加权基因共表达网络分析；梅尼埃病；
- 概要：
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【中文期刊】 孙连伟 连雪全 等 《医学信息》 2025年38卷8期 167-171页
【摘要】 药物-靶标预测是现代药物研发中至关重要的一个环节,它克服了传统药物研发中发现和验证药物-靶标对的高成本和周期长等问题.药物-靶标相互作用(DTI)预测和药物-靶标亲和力(DTA)预测都是药物-靶标预测的任务.预测药物-靶标相互作用,筛选出具...
- 概要：
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【中文期刊】 Xinyang Zhou Yehua Lv 等 《中国神经再生研究（英文版）》 2024年19卷8期 1812-1821页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Exosomes exhibit complex biological functions and mediate a variety of biological processes,such as promoting axonal reg...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 袁超 练庆海 等 《器官移植》 2024年15卷1期 90-101页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 筛选酒精性肝炎(AH)的自噬关键基因,探讨AH潜在的生物标志物和治疗靶点.方法 采用基因表达综合数据库(GEO)中的2个AH基因芯片和从MSigDB、GeneCards数据库中获得的自噬相关数据集,通过加权基因共表达网络分析(WGCN...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 秦金金 曹辰媛 等 《山东大学学报（医学版）》 2024年62卷1期 31-37页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探讨子痫前期高通量生物信息学分析与核心发病基因.方法 选取基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)2 个关于子痫前期编码基因芯片数据进行生物信息学分析.通过R语言对2 组数据进行均一化矫正,其后找到...
【关键词】 子痫前期；高通量生物信息学分析；基因本体富集分析；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 吕艳华 钟小云 等 《护理研究》 2024年38卷21期 3768-3778页ISTICPKU
【摘要】 目的:基于临床生物信息学探讨白藜芦醇对自闭症谱系障碍(ASD)的潜在治疗作用.方法:从基因表达综合数据库(GEO)中获取白藜芦醇和ASD的全基因组表达谱数据;分别对白藜芦醇和ASD的全基因组表达谱数据进行差异基因分析、基因本体(GO)富集分...
- 概要：
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【中文期刊】 袁琳慧 刘新 《国际眼科杂志》 2024年24卷6期 857-863页ISTICCA
【摘要】 目的:通过生物信息学方法探究氧诱导小鼠视网膜新生血管(OIR)模型中与免疫相关的关键基因以及免疫细胞浸润水平.方法:从GEO数据库获取基因芯片数据集,采用R语言环境中"limma"包获得差异表达基因(DEGs),并进行GO功能富集和KEGG...
【关键词】 氧诱导视网膜新生血管；生物信息学；免疫浸润；
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【中文期刊】 曾倩 石瑀 等 《岭南心血管病杂志》 2024年30卷1期 57-66页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学技术探究心力衰竭(heart failure,HF)和认知障碍共同的生物学过程及基因特征,为后续分子机制研究提供思路.方法 从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)下载HF数据集GS...
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【中文期刊】 张冠 杨登科 《联勤军事医学》 2024年38卷11期 966-970页ISTIC
【摘要】 目的 研究肾结石的关键差异基因、信号通路及蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,从而寻找潜在的诊疗靶点,为难治性、复发性、遗传高风险性结石提供新的诊疗思路.方法 基于生物信息学方法和R...
- 概要：
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【中文期刊】 赵弘毅 丁伟健 等 《生物信息学》 2024年22卷2期 124-133页ISTIC
【摘要】 基于抑郁症的全基因组关联分析研究(GWAS),对于获得的单核苷酸多态性位点(SNP)使用Haploreg软件进行基因注释,得到SNP注释的102 个易感基因..使用MAGMA软件对GWAS的汇总统计数据做基因水平的分析,获得了270 个校正...
【关键词】 单细胞测序；抑郁症易感基因；抗抑郁药物靶点,神经细胞；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 徐聪聪 叶燕平 等 《南昌大学学报（医学版）》 2024年64卷6期 42-49,79页ISTIC
【摘要】 目的 探索心肌缺血-再灌注(I/R)损伤中铁死亡相关基因的表达及功能,通过构建分子网络及其验证分析,为心肌I/R损伤的治疗提供新的分子靶点.方法 对GSE108940数据库中的基因表达数据进行标准化处理,利用火山图和热图筛选差异表达基因(D...
【关键词】 心肌缺血-再灌注损伤；铁死亡；差异表达基因；
- 概要：
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【中文期刊】 李威材 秦刚 等 《实用肿瘤杂志》 2024年39卷4期 344-355页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学方法筛选出与骨肉瘤(osteosarcoma,OS)相关的关键基因,以作为OS的潜在诊断标志物和新治疗靶点.方法 从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中检索下载 2 个符合本研究...
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【中文期刊】 樊宁丹 王敏 等 《临床精神医学杂志》 2024年34卷6期 425-429页ISTICCA
【摘要】 目的:基于转录组水平探索抑郁症的病因学机制.方法:检测157例抑郁症患者及135名健康对照者的外周血转录组学数据.使用加权基因共表达网络分析,寻找与抑郁症相关的基因共表达模块,利用基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基...
【关键词】 抑郁症；转录组学；加权基因共表达网络分析；
- 概要：
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【中文期刊】 尚艳花 邓敬华 等 《世界中西医结合杂志》 2024年19卷3期 542-549页ISTIC
【摘要】 目的 基于网络药理学分析麻射安金丸治疗慢性阻塞性肺疾病(Chronic obstructive pulmonary dis-ease,COPD)的潜在机制.方法 应用TCMSP中药系统药理学数据库及相关文献资料等检索麻射安金丸中的生物活性成...
- 概要：
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【中文期刊】 曹家兴 张旺 等 《医学研究杂志》 2024年53卷1期 113-120页ISTIC
【摘要】 目的 整合生物信息学挖掘并分析与基底型乳腺癌(basal-like breast cancer,BLBC)的预后相关的核心基因.方法 首先,从GEO数据库中遴选与乳腺癌分子分型相关的数据集,数据处理后利用WGCNA筛选与BLBC相关的模块....
【关键词】 基底型乳腺癌；加权基因共表达网络分析；免疫浸润；
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【中文期刊】 解笳 邓翼遥 等 《中医临床研究》 2024年16卷9期 1-9页
【摘要】 目的:揭示川芎治疗糖尿病肾病(Diabetic Kidney Disease,DKD)的药理机制,探索治疗DKD的新策略.方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和SwissTargetPrediction数据库检索川芎的成分...
- 概要：
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【中文期刊】 吴黛黛 倪约翰 等 《中国现代医生》 2024年62卷27期 84-90,94页
【摘要】 目的 探讨绝经后骨质疏松的发病机制,并基于逆向网络药理学进行靶点和中药成分的分子对接验证及中药组方预测.方法 利用韦恩图提取并展示"骨质疏松"与"绝经后"的共有靶点;对提取的共有靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘萌萌 《四川生理科学杂志》 2024年46卷10期 2125-2131页
【摘要】 目的:通过加权基因共表达网络分析筛选结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)潜在的生物标志物.方法:下载基因表达综合数据库(Gene expression omnibus,GEO)中的基因表达谱GSE44076 和GSE218...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 徐海鹏 姜雅亨 等 《中国现代医生》 2024年62卷18期 1-7,12页
【摘要】 目的 对青少年特发性脊柱侧凸(adolescent idiopathic scoliosis,AIS)患者间质干细胞的基因芯片数据进行生物信息学分析,探究AIS致病机制和治疗靶点.方法 从基因表达综合数据库(gene expression ...
【关键词】 青少年特发性脊柱侧凸；加权基因共表达网络分析；生物信息学；
- 概要：
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