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            【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2009年7卷4期 200-208页SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【摘要】 Microarray data are often extremely asymmetric in dimensionality,such as thou-sands or even tens of thousands of genes b...

            【关键词】 microarray dataant colony optimizationmarker gene selection

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            【中文期刊】 李建更   高志坤   等 《生物学杂志》 2010年27卷2期 1-4页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 将研究重点从单个基因转移到基因信号通路,结合随机森林与信号通路分析了一组胃癌微阵列数据.通过研究基因在通路中的情况以及通路中的基因对胃癌肠型、弥漫型和正常组织样本的分类能力,扩展了随机森林在生物学中的应用,为胃癌的研究提供了新的思路.

            【关键词】 胃癌微阵列随机森林

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            【中文期刊】 刘洋   杨俊华   等 《中国卒中杂志》 2024年19卷4期 431-439页ISTICPKU

            【摘要】 目的 本研究对烟雾病患者血管样本的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行生物信息学鉴定和分析,旨在探讨烟雾病的潜在发病机制.方法 本研究以烟雾病和颈内动脉瘤患者大脑血管样本为研究对象.利用...

            【关键词】 烟雾病生物信息学分析基因表达数据

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            【中文期刊】 《中国神经再生研究(英文版)》 2019年14卷6期 1099-1104页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 A Schwann cell has regenerative capabilities and is an important cell in the peripheral nervous system.This microarray s...

            【关键词】 Schwann cellsbig data analysisperipheral nerve degeneration

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            【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2008年6卷2期 83-90页SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【摘要】 Microarray data based tumor diagnosis is a very interesting topic in bioinformatics. One of the key problems is the disc...

            【关键词】 microarray datainformative gene selectionclustering analysis

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            【中文期刊】 《基因组、蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2006年4卷4期 245-252页SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【摘要】 Computational analysis is essential for transforming the masses of microarray data into a mechanistic understanding of c...

            【关键词】 DNA microarray datacolon cancergene functional module

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            【中文期刊】 曹文君   侯国强   等 《中国卫生统计》 2013年30卷4期 484-486页ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的 从统计理论角度探讨基因集分析方法,初步建立微阵列数据基因集统计分析理论框架.方法 采用计算机模拟技术,比较不同原假设、理论分布生成方法在进行基因集分析时的统计学性质.结果 自限性原假设方法ROC曲线下面积AUC为0.858.而竞争性原...

            【关键词】 微阵列数据基因集方法统计理论

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            【中文期刊】 孔薇   黄晨曦   等 《安徽医科大学学报》 2013年48卷10期 1252-1255页ISTICPKUCA

            【摘要】 运用独立成分分析(ICA)方法对乳腺癌基因表达谱数据进行特征提取,并采用聚类及可视化的可靠性评估方法(ICASSO)对所提取的独立成分(IC)进行评估和综合可得到与疾病更加密切相关的显著基因.结果显示,通过与乳腺癌发病的相关性分析,选取显著...

            【关键词】 乳腺癌基因表达谱数据独立成分分析

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            【中文期刊】 孔薇   崔地博   等 《中国生物医学工程学报》 2013年32卷4期 418-425页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 解析转录因子与靶基因之间相互调节的关系并构建转录调控网络,对研究阿尔茨海默症(AD)的致病机理、早期诊断及制药等具有重要意义.网络成分分析(NCA)是一种能够动态预测转录因子活性并表现其影响关系的方法.本研究利用转录因子对靶基因的调控作用,...

            【关键词】 阿尔茨海默症网络成分分析转录因子

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            【中文期刊】 缪冉   冷冬   等 《临床和实验医学杂志》 2017年16卷7期 629-632页ISTIC

            【摘要】 目的 分析肺动脉高压(PAH)肺组织来源的表达谱基因芯片数据,研究差异表达基因.方法 检索基因表达谱汇编数据库中GSE15197数据.用非监督性聚类、监督性分类、主成分分析的方法得到可以将PAH肺组织样本与正常对照区分开的显著差异的特征基因...

            【关键词】 肺动脉高压差异表达基因芯片数据

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            【中文期刊】 卫超   郑浩然   《北京生物医学工程》 2013年32卷3期 255-260页ISTIC

            【摘要】 目的 基因组尺度的代谢网络重构提供了一种从系统层面深入观察生物体的方法,由此重构得到的网络是个体的“全基因组网络”.鉴于这种网络不能反映出不同环境条件下细胞内的动态变化过程,本文给出一种从基因芯片数据出发对生物体的实时“工作网络”进行重构的...

            【关键词】 代谢网络重构微阵列数据基因芯片

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            【中文期刊】 林勤   林斯达   等 《计算机与现代化》 2014年12期 11-14页

            【摘要】 针对目前双聚类算法很少考虑所得聚类结果整体的划分质量问题,提出一种基于PA指标的双聚类算法。该算法选定一种衡量所有簇划分效果的PA指标来构造双聚类的模型,运用启发式贪心策略,通过迭代增删行列的方式挖掘出划分效果较高的几个双聚类。将所提算法与...

            【关键词】 PA指标双聚类GO分析

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            【中文期刊】 《自然科学进展(英文版)》 2008年18卷6期 741-750页

            【摘要】 Gene association study is one of the major challenges of biochip technology both for gene diagnosis where only a gene su...

            【关键词】 DNA microarray dataCurse of dimensionalityGene selection

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            【中文期刊】 Chiwen Qu   Heng Yao   等 《仿生工程学报(英文版)》 2025年22卷2期 901-930页SCIMEDLINEISTICCSCD

            【摘要】 DNA microarrays,a cornerstone in biomedicine,measure gene expression across thousands to tens of thousands of genes.Iden...

            【关键词】 Gene selectionLearning search algorithmGene expression data

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            【中文期刊】 Jhansi Venkata Nagamani Josyula   Prathima Talari   等 《感染医学(英文)》 2023年1期 19-30页

            【摘要】 Background:Dengue is a major arthropod-borne viral disease spreading rapidly across the globe.The absence of vaccines an...

            【关键词】 Dengue feverSevere dengueMicroarray

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            【中文期刊】 《细胞研究(英文版)》 2012年22卷3期 565-580页SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【摘要】 Classical algorithms aiming at identifying biological pathways significantly related to studying conditions frequently r...

            【关键词】 gene weightingfunctional association networkpathway analysis

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            【中文期刊】 《分子植物(英文版)》 2011年04卷4期 713-729页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 Detection of cis-regulatory elements, such as transcription factor binding sites (TFBS), through utilization of ortholog...

            【关键词】 Hormone biologybioinformaticscomparative genomics

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            【中文期刊】 孔薇   王娟   等 《生物医学工程学杂志》 2014年31卷3期 662-670页MEDLINEISTICPKUCA

            【摘要】 基因之间存在多种多样的表达调控活动,一般认为这些调控关系隐含在基因表达谱中.因此,可以根据基因表达数据对基因调控状态进行建模,以挖掘具有生物学意义的信息及隐含在其中的基因调控关系.本文分别利用独立成分分析(ICA)和非负矩阵分解(NMF)这...

            【关键词】 矩阵分解微阵列基因表达数据独立成分分析

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            【中文期刊】 许优沁   张庆芬   等 《解剖学报》 2017年48卷1期 37-42页ISTICCSCDCABP

            【摘要】 目的 从基因水平揭示放射前后人外周血细胞的变化.方法 从基因表达数据库(GEO)中下载两组经放射处理后人外周血基因芯片数据,利用Qlucore Omics Explorer 3.0软件筛选差异表达基因,STRING、DAVID等在线分析工具...

            【关键词】 放射损伤基因芯片生物信息学

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            【中文期刊】 赵洪波   潘玉春   《国际遗传学杂志》 2010年33卷5期 280-283页ISTICCA

            【摘要】 微阵列技术被越来越广泛地应用于生物学的各个领域,但一般实验样本量较小,造成分析结果可靠性不高.在模式生物和人方面,因为技术平台相同、研究目的相同或者相似,而使很多单独研究可以整合起来进行统一分析.元分析可以有效地将相似实验的结果进行合并,增...

            【关键词】 微阵列元分析基因表达

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            【中文期刊】 《中国高等学校学术文摘·生物学》 2009年4卷4期 414-418页MEDLINEISTICCA

            【摘要】 With the popularization of microarray experi-ments in biomedical laboratories, how to make context-specific knowledge di...

            【关键词】 gene expressionbiological networkcontext

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            【中文期刊】 《国际口腔科学杂志(英文版)》 2012年04卷1期 7-13页SCIMEDLINEISTICCSCD

            【摘要】 Epithelial-mesenchymal interactions (EMIs) are critical for tooth development.Molecular mechanisms mediating these inter...

            【关键词】 genelaser capture microdissectionmicroarray

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            【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2008年6卷2期 74-82页SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【摘要】 We propose a new, method for tumor classification from gene expression data, which mainly contains three steps. Firstly,...

            【关键词】 independent component analysisfeature selectionsupport vector machine

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            【中文期刊】 《世界胃肠病学杂志(英文版)》 2006年12卷40期 6473-6499页SCIMEDLINEISTIC

            【摘要】 AIM: To determine the gene expression profile data for the whole liver during development of dimethylnitrosamine (DMN)-i...

            【关键词】 Liver fibrosisGene expressionMicroarray

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            【中文期刊】 汪进   黄明辉   等 《中国癌症研究(英文版)》 2002年14卷1期 5-10页SCIMEDLINEISTICCSCDCA

            【摘要】 Objective: A single mechanistic pathway cannot explain the genesis of drug resistance in cancer. Drug resistance in canc...

            【关键词】 cDNA microarrayDifferential gene expressionMultidrug resistance

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            【中文期刊】 方志俊   黄文秀   等 《中国癌症研究(英文版)》 2002年14卷1期 11-17页SCIMEDLINEISTICCSCDCA

            【摘要】 Objective: Ajoene, a major compound extracted from crashed garlic, has been shown to have antitumor, antimycotic, antimi...

            【关键词】 AjoenecDNA microarray cDNAGene expression profiles

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            【中文期刊】 《细胞研究(英文版)》 2002年12卷2期 105-115页SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【摘要】 The wealth of DNA data generated by the human genome project coupling with recently invented high-throughput gene expres...

            【关键词】 MicroarraySAGEcardiovascular diseases

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            【中文期刊】 《华中科技大学学报(医学)(英德文版)》 2010年30卷3期 354-359页SCIMEDLINECSCD

            【摘要】 The purpose of this study was to pool information in epithelial ovarian cancer by combining studies using Affymetrix exp...

            【关键词】 epithelial ovarian cancerbiomarkersmicroarray analysis

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            【中文期刊】 蒋燕明   李力   《中国肿瘤临床》 2016年43卷19期 840-844页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:基于芯片数据采用生物信息学方法,挖掘与宫颈上皮内瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)进展相关的信号通路和潜在差异表达基因。方法:在GEO数据库中筛选CIN进展相关mRNA表达谱芯片数据,...

            【关键词】 宫颈上皮内瘤变进展表达谱

            浏览:245 被引:15 下载:90
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            【中文期刊】 黄伟   刘战民   等 《中国生物医学工程学报》 2010年29卷1期 77-85页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 对基因芯片表达谱的聚类分析有助于发现共表达的基因,而共表达的特性往往是共调控基因所拥有的性质.因此,对基因表达谱的准确聚类将有利于更加准确地发现基因之间的调控关系.本研究使用机器学习中的等度规映射、局部线性嵌入、拉普拉斯特征根映射等流形学习...

            【关键词】 非线性降维流形学习聚类分析

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