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【外文期刊】 Sixto-López ; Y. ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2019年37卷3/4期 584-610页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 3Dthree-dimensional; docking; GAFFGeneralized Amber Force Field;
【外文期刊】 Endres RG ; Endres RG ; 等 《Molecular simulation》 2005年31卷11期 773-777页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 protein folding; molecular dynamics; force field;
【外文期刊】 Xiaoyun,Wu ; Yuanyuan,Wang ; 等 《Journal of biomolecular structure & dynamics》 2018年36卷12期 3106-3113页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 Food and Drug Administration (FDA); GAFF (general AMBER force field); ROS1 inhibitor;
【外文期刊】 Juan,Du ; Miaoxue,Qiu ; 等 《Journal of biomolecular structure & dynamics》 2019年37卷6期 1628-1640页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 6ECDCA: 6α-ethyl-chenodeoxycholic acid; AF1: activation function 1; DBD: DNA-binding domain;
【外文期刊】 Deyan,Wu ; Xuehua,Zheng ; 等 《Acta pharmaceutica Sinica. B》 2022年12卷3期 1351-1362页
【关键词】 ABFE, absolute binding free energy; BAR, Bennet acceptance ratio; Binding potencies;
【外文期刊】 Jorddy N,Cruz ; José F S,Costa ; 等 《Journal of biomolecular structure & dynamics》 2019年37卷6期 1616-1627页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 CNPq, National Council for Scientific and Technological Development; CoA, coenzyme A; FAS, fatty acid synthase;
【外文期刊】 Nathalia S V,Barbosa ; Yong,Zhang ; 等 《Journal of molecular modeling》 2017年23卷6期 194页 SCIMEDLINE
【关键词】 Dielectric constant; General AMBER force field; Glymes;
【外文期刊】 Bansal, Prateek D. ; Dutta, Soumajit ; 等 《Biophysical Journal》 2023年122卷7期 1400-1413页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; PROTEIN-COUPLED RECEPTORS; GENERAL FORCE-FIELD;
【外文期刊】 Rastelli G ; Degliesposti G ; 等 《Chemical biology and drug design》 2009年73卷3期 283-286页
【关键词】 AMBER; BEAR; binding free energy;
【外文期刊】 Slingsby, Jason G. ; Vyas, Shubham ; 等 《Molecular simulation》 2015年41卷16/18期 1449-1458页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoglycerol; phospholipid; G09;
【外文期刊】 Chowdhury S. ; Zhang W. ; 等 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 2003年68卷1期 63-75页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Hydrophobic clusters; Rate limiting step; Alanine-based peptide;
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