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【中文期刊】 郭倩 陈婕 等 《临床荟萃》 2025年40卷7期 608-618页ISTICCA
【摘要】 目的 利用微阵列数据集确定多囊卵巢综合征(PCOS)新的遗传靶点,并揭示导致PCOS发生发展的分子基础.方法 对来自基因表达综合数据库的3个独立PCOS数据集进行了全面分析,使用R软件进行数据处理和规范化.对差异表达基因(DEG)与PCOS...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 庄震坤 李颖 等 《中西医结合心脑血管病杂志》 2024年22卷6期 975-987页ISTIC
【摘要】 目的:通过网络药理学、微阵列数据分析和分子对接探讨四君子汤治疗缺血性心力衰竭的作用机制.方法:采用R软件对GEO数据库中下载的缺血性心力衰竭(HF)的微阵列数据进行分析;借助中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)数据库获取四君子汤中4...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《中国神经再生研究（英文版）》 2019年14卷6期 1099-1104页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 A Schwann cell has regenerative capabilities and is an important cell in the peripheral nervous system.This microarray s...
【关键词】 Schwann cells；big data analysis；peripheral nerve degeneration；
- 概要：
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【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2008年6卷2期 83-90页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Microarray data based tumor diagnosis is a very interesting topic in bioinformatics. One of the key problems is the disc...
【关键词】 microarray data；informative gene selection；clustering analysis；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 《基因组、蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2007年5卷1期 45-52页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 We have previously developed a combined signal/variance distribution model that accounts for the particular statistical ...
【关键词】 transcriptome；microarray analysis；signal/variance distribution；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 曹文君 侯国强 等 《中国卫生统计》 2013年30卷4期 484-486页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 从统计理论角度探讨基因集分析方法,初步建立微阵列数据基因集统计分析理论框架.方法 采用计算机模拟技术,比较不同原假设、理论分布生成方法在进行基因集分析时的统计学性质.结果 自限性原假设方法ROC曲线下面积AUC为0.858.而竞争性原...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孔薇 黄晨曦 等 《安徽医科大学学报》 2013年48卷10期 1252-1255页ISTICPKUCA
【摘要】 运用独立成分分析(ICA)方法对乳腺癌基因表达谱数据进行特征提取,并采用聚类及可视化的可靠性评估方法(ICASSO)对所提取的独立成分(IC)进行评估和综合可得到与疾病更加密切相关的显著基因.结果显示,通过与乳腺癌发病的相关性分析,选取显著...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 黄伟 刘战民 等 《中国生物医学工程学报》 2010年29卷1期 77-85页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 对基因芯片表达谱的聚类分析有助于发现共表达的基因,而共表达的特性往往是共调控基因所拥有的性质.因此,对基因表达谱的准确聚类将有利于更加准确地发现基因之间的调控关系.本研究使用机器学习中的等度规映射、局部线性嵌入、拉普拉斯特征根映射等流形学习...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 荀鹏程 钱国华 等 《中国卫生统计》 2009年26卷2期 147-149,153页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 探究判别分析驱动的微阵列数据之降维策略.方法 3步降维策略.即首先采用"单变量检验FDR控制"结合"相关矩阵差值综合评分法"的预选维;其次采用PCA、PLS等方法作进一步降维;最后用逐步判别的思想筛选.结果 以Alon等的结肠癌数据为...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《动物模型与实验医学（英文）》 2018年1卷3期 189-193页
【摘要】 There are a lot of biological and experimental data from genomics, proteomics, drug screening, medicinal chemistry, etc....
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 任重鲁 李金明 《计算机工程与科学》 2014年36卷7期 1389-1397页
【摘要】 基因芯片是微阵列技术的典型代表,它具有高通量的特性和同时检测全部基因组基因表达水平的能力.应用微阵列芯片的一个主要目的是基因表达模式的发现,即在基因组水平发现功能相似,生物学过程相关的基因簇;或者将样本分类,发现样本的各种亚型.例如根据基因...
- 概要：
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【中文期刊】 林勤 林斯达 等 《计算机与现代化》 2014年12期 11-14页
【摘要】 针对目前双聚类算法很少考虑所得聚类结果整体的划分质量问题，提出一种基于PA指标的双聚类算法。该算法选定一种衡量所有簇划分效果的PA指标来构造双聚类的模型，运用启发式贪心策略，通过迭代增删行列的方式挖掘出划分效果较高的几个双聚类。将所提算法与...
- 概要：
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【中文期刊】 刘洋 杨俊华 等 《中国卒中杂志》 2024年19卷4期 431-439页ISTICPKU
【摘要】 目的 本研究对烟雾病患者血管样本的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行生物信息学鉴定和分析,旨在探讨烟雾病的潜在发病机制.方法 本研究以烟雾病和颈内动脉瘤患者大脑血管样本为研究对象.利用...
- 概要：
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【中文期刊】 Jhansi Venkata Nagamani Josyula Prathima Talari 等 《感染医学（英文）》 2023年1期 19-30页
【摘要】 Background:Dengue is a major arthropod-borne viral disease spreading rapidly across the globe.The absence of vaccines an...
【关键词】 Dengue fever；Severe dengue；Microarray；
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【中文期刊】 孔薇 王娟 等 《生物医学工程学杂志》 2014年31卷3期 662-670页MEDLINEISTICPKUCA
【摘要】 基因之间存在多种多样的表达调控活动,一般认为这些调控关系隐含在基因表达谱中.因此,可以根据基因表达数据对基因调控状态进行建模,以挖掘具有生物学意义的信息及隐含在其中的基因调控关系.本文分别利用独立成分分析(ICA)和非负矩阵分解(NMF)这...
- 概要：
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【中文期刊】 刘明 王米渠 等 《生物医学工程学杂志》 2010年27卷5期 1166-1168,1196页MEDLINEISTICPKUCA
【摘要】 表达谱芯片数据分析是一个非常关键的步骤,如何挖掘出与研究目标相关的信息并进行生物学专业解释,是目前基因表达谱数据分析领域所面临的一个重要挑战,而基因功能富集分析的出现为解决这一瓶颈问题提出了合理的方案.重点介绍了基因功能富集分析的原理、相关...
- 概要：
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【中文期刊】 许优沁 张庆芬 等 《解剖学报》 2017年48卷1期 37-42页ISTICCSCDCABP
【摘要】 目的 从基因水平揭示放射前后人外周血细胞的变化.方法 从基因表达数据库(GEO)中下载两组经放射处理后人外周血基因芯片数据,利用Qlucore Omics Explorer 3.0软件筛选差异表达基因,STRING、DAVID等在线分析工具...
- 概要：
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【中文期刊】 李曼达 孟琰 等 《现代生物医学进展》 2015年15卷4期 737-739页ISTICCA
【摘要】 目的:唇腭裂是口腔颌面部最常见的先天性畸形,危害严重.miRNA在细胞分化,生物发育及疾病发生发展过程中发挥巨大作用,越来越多的受到科研人员的关注.本课题对唇腭裂患儿下调表达的miRNA与唇腭裂相关性进行验证研究,为miRNA应用在唇腭裂防...
- 概要：
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【中文期刊】 赵洪波 潘玉春 《国际遗传学杂志》 2010年33卷5期 280-283页ISTICCA
【摘要】 微阵列技术被越来越广泛地应用于生物学的各个领域,但一般实验样本量较小,造成分析结果可靠性不高.在模式生物和人方面,因为技术平台相同、研究目的相同或者相似,而使很多单独研究可以整合起来进行统一分析.元分析可以有效地将相似实验的结果进行合并,增...
- 概要：
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【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2010年8卷1期 57-71页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 In view of potential application to biomedical diagnosis,tight transcriptome data quality control is compulsory.Usually,...
- 概要：
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【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2008年6卷2期 74-82页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 We propose a new, method for tumor classification from gene expression data, which mainly contains three steps. Firstly,...
【关键词】 independent component analysis；feature selection；support vector machine；
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【中文期刊】 《华中科技大学学报（医学）（英德文版）》 2010年30卷3期 354-359页SCIMEDLINECSCD
【摘要】 The purpose of this study was to pool information in epithelial ovarian cancer by combining studies using Affymetrix exp...
【关键词】 epithelial ovarian cancer；biomarkers；microarray analysis；
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【中文期刊】 陶文惠 王帆 等 《胃肠病学》 2017年22卷1期 4-9页ISTICCA
【摘要】 背景：应用生物信息学方法能有效挖掘基因芯片数据，并对单基因功能进行预测分析。目的：对与溃疡性结肠炎（ UC）发病、疾病活动和生物治疗疗效相关的CRELD2基因进行生物信息学分析，为深入研究该基因的生物学功能及其参与UC发生、发展的分子机制提...
- 概要：
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【中文期刊】 缪冉 冷冬 等 《临床和实验医学杂志》 2017年16卷7期 629-632页ISTIC
【摘要】 目的 分析肺动脉高压(PAH)肺组织来源的表达谱基因芯片数据,研究差异表达基因.方法 检索基因表达谱汇编数据库中GSE15197数据.用非监督性聚类、监督性分类、主成分分析的方法得到可以将PAH肺组织样本与正常对照区分开的显著差异的特征基因...
- 概要：
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【中文期刊】 安宇 吴柏林 《国际生殖健康/计划生育杂志》 2014年3期 157-161,210页ISTICCA
【摘要】 染色体微阵列芯片分析（CMA）包括比较基因组杂交微阵列（array CGH）和单核苷酸多态微阵列（SNP array），可以在全基因组范围内高分辨检测染色体的微缺失和微重复，与传统染色体核型分析和荧光原位杂交（FISH）检测相比，具有高通量...
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【中文期刊】 罗万春 易东 等 《计算机工程》 2011年37卷2期 20-21,24页
【摘要】 针对离散的基因芯片表达数据难以进行系统分析的问题,提出基因芯片数据的y～n曲线模型,将级基因芯片数据转化为唯一的一列信号,从而可以对其进行多尺度分析.对人类胎儿脑发育过程中大脑皮质基因表达基于y～n曲线模型进行小波多尺度降噪,结果证明,y～...
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【中文期刊】 《细胞研究（英文版）》 2012年22卷3期 565-580页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 Classical algorithms aiming at identifying biological pathways significantly related to studying conditions frequently r...
【关键词】 gene weighting；functional association network；pathway analysis；
- 概要：
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【中文期刊】 郭磊 郭晓波 等 《中华病理学杂志》 2010年39卷7期 436-441页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过对基因芯片数据库中一组大样本胃癌表达谱芯片的数据挖掘分析,筛选并验证与临床病理分期及预后密切相关的基因.方法 检索基因表达谱芯片数据库,对其中符合分析要求(大样本、病理分型、临床病理分期以及随访资料齐全)的胃癌表达谱芯片数据进行再...
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【中文期刊】 周才秀 王忠 等 《现代生物医学进展》 2009年9卷7期 1352-1355页ISTICCA
【摘要】 如今生物信息学领域有一个共识,即基因组学和蛋白组学研究产生了爆炸性的微阵列数据,如何利用这些数据构建基因调控网络也成为一个研究热点.文章利用相关的软件平台实现对基因调控网络的构建,并对网络进行分析,在生物信息学、系统生物学、生物医学等领域起...
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【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2015年3期 169-176页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Analysis of microarray data is associated with the methodological problems of high dimension and small sample size. Vari...
【关键词】 Microarray；Elastic net；Lasso；
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