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【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2009年7卷4期 200-208页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Microarray data are often extremely asymmetric in dimensionality,such as thou-sands or even tens of thousands of genes b...
【关键词】 microarray data；ant colony optimization；marker gene selection；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《生物医学与环境科学（英文版）》 2010年23卷5期 384-390页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Objective The quality of microarray data influences the accuracy of comparative genomic analyses to a large extent.To en...
【关键词】 Array CGH；Data quality；Assessment；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2008年6卷3期 186-189页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 We developed an R function named "microarray outlier filter" (MOF) to assist in the identification of failed arrays. In ...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《生命科学研究》 2011年15卷5期 390-395页ISTICCA
【摘要】 In order to explore the bioleaching mechanism and improve the bioleaching efficiency,the microbial community in the biol...
【关键词】 microarray；ICP-AES；bioleaching；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郭倩 陈婕 等 《临床荟萃》 2025年40卷7期 608-618页ISTICCA
【摘要】 目的 利用微阵列数据集确定多囊卵巢综合征(PCOS)新的遗传靶点,并揭示导致PCOS发生发展的分子基础.方法 对来自基因表达综合数据库的3个独立PCOS数据集进行了全面分析,使用R软件进行数据处理和规范化.对差异表达基因(DEG)与PCOS...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 庄震坤 李颖 等 《中西医结合心脑血管病杂志》 2024年22卷6期 975-987页ISTIC
【摘要】 目的:通过网络药理学、微阵列数据分析和分子对接探讨四君子汤治疗缺血性心力衰竭的作用机制.方法:采用R软件对GEO数据库中下载的缺血性心力衰竭(HF)的微阵列数据进行分析;借助中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)数据库获取四君子汤中4...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《中国神经再生研究（英文版）》 2019年14卷6期 1099-1104页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 A Schwann cell has regenerative capabilities and is an important cell in the peripheral nervous system.This microarray s...
【关键词】 Schwann cells；big data analysis；peripheral nerve degeneration；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 尹畅 朱墨 等 《中国农业科学》 2023年56卷15期 3032-3039页
【摘要】 [背景]畜禽育种工作的核心是基因组估计育种值的准确性.不同水平的遗传标记密度对估计育种值的影响较大,随着基因分型技术的发展和高通量测序价格的下降,基于重测序数据的基因组选择研究不断涌现.理论上,标记密度更高可获得更高准确性的估计育种值.因为...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2008年6卷2期 83-90页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Microarray data based tumor diagnosis is a very interesting topic in bioinformatics. One of the key problems is the disc...
【关键词】 microarray data；informative gene selection；clustering analysis；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《基因组、蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2007年5卷1期 45-52页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 We have previously developed a combined signal/variance distribution model that accounts for the particular statistical ...
【关键词】 transcriptome；microarray analysis；signal/variance distribution；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《基因组、蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2006年4卷4期 245-252页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Computational analysis is essential for transforming the masses of microarray data into a mechanistic understanding of c...
【关键词】 DNA microarray data；colon cancer；gene functional module；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘会娟 侯艳 等 《中国卫生统计》 2018年35卷5期 642-645页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 探讨时间序列基因表达数据网络构建的ARTIVA模型与方法.方法 通过实例研究ARTIVA模型构建网络的效果.结果 实例分析表明,ARTIVA模型对时间序列数据具有良好的适应性,在具有3个时间点和9个时间点两种情况下,ARTIVA模型均...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 曹文君 侯国强 等 《中国卫生统计》 2013年30卷4期 484-486页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 从统计理论角度探讨基因集分析方法,初步建立微阵列数据基因集统计分析理论框架.方法 采用计算机模拟技术,比较不同原假设、理论分布生成方法在进行基因集分析时的统计学性质.结果 自限性原假设方法ROC曲线下面积AUC为0.858.而竞争性原...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 孔薇 黄晨曦 等 《安徽医科大学学报》 2013年48卷10期 1252-1255页ISTICPKUCA
【摘要】 运用独立成分分析(ICA)方法对乳腺癌基因表达谱数据进行特征提取,并采用聚类及可视化的可靠性评估方法(ICASSO)对所提取的独立成分(IC)进行评估和综合可得到与疾病更加密切相关的显著基因.结果显示,通过与乳腺癌发病的相关性分析,选取显著...
- 概要：
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【中文期刊】 孔薇 崔地博 等 《中国生物医学工程学报》 2013年32卷4期 418-425页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 解析转录因子与靶基因之间相互调节的关系并构建转录调控网络,对研究阿尔茨海默症(AD)的致病机理、早期诊断及制药等具有重要意义.网络成分分析(NCA)是一种能够动态预测转录因子活性并表现其影响关系的方法.本研究利用转录因子对靶基因的调控作用,...
- 概要：
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【中文期刊】 黄伟 刘战民 等 《中国生物医学工程学报》 2010年29卷1期 77-85页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 对基因芯片表达谱的聚类分析有助于发现共表达的基因,而共表达的特性往往是共调控基因所拥有的性质.因此,对基因表达谱的准确聚类将有利于更加准确地发现基因之间的调控关系.本研究使用机器学习中的等度规映射、局部线性嵌入、拉普拉斯特征根映射等流形学习...
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【中文期刊】 李建更 高志坤 等 《生物学杂志》 2010年27卷2期 1-4页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 将研究重点从单个基因转移到基因信号通路,结合随机森林与信号通路分析了一组胃癌微阵列数据.通过研究基因在通路中的情况以及通路中的基因对胃癌肠型、弥漫型和正常组织样本的分类能力,扩展了随机森林在生物学中的应用,为胃癌的研究提供了新的思路.
- 概要：
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【中文期刊】 李贤菁 邓巧玲 等 《中国循证心血管医学杂志》 2019年11卷7期 782-786页ISTIC
【摘要】 基因芯片技术原理为杂交测序,即碱基互补配对原则.基因芯片技术发展迅速,是进行基因分析的有力工具.由于基因芯片类型及其数据格式的多样性,对基因组数据进行全面和完整的分析具有重要意义.R是一个免费、开源的统计分析软件,通过加载不同包,能实现对不...
【关键词】 R软件；基因芯片数据；metaMA分析流程；
- 概要：
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【中文期刊】 缪冉 冷冬 等 《临床和实验医学杂志》 2017年16卷7期 629-632页ISTIC
【摘要】 目的 分析肺动脉高压(PAH)肺组织来源的表达谱基因芯片数据,研究差异表达基因.方法 检索基因表达谱汇编数据库中GSE15197数据.用非监督性聚类、监督性分类、主成分分析的方法得到可以将PAH肺组织样本与正常对照区分开的显著差异的特征基因...
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【中文期刊】 张杨 张威 等 《生物技术通讯》 2014年6期 875-879页ISTICCA
【摘要】 微阵列技术已广泛应用于生物学和医学研究领域，如肿瘤的诊断和分型、预测和治疗，理解肿瘤的发生机制、生物学通路和基因网络。统计学方法在这一科学挑战中的地位至关重要。我们综述了微阵列实验数据分析的统计学方法最新发展，主要描述了微阵列数据的标准化、...
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【中文期刊】 卫超 郑浩然 《北京生物医学工程》 2013年32卷3期 255-260页ISTIC
【摘要】 目的 基因组尺度的代谢网络重构提供了一种从系统层面深入观察生物体的方法,由此重构得到的网络是个体的“全基因组网络”.鉴于这种网络不能反映出不同环境条件下细胞内的动态变化过程,本文给出一种从基因芯片数据出发对生物体的实时“工作网络”进行重构的...
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【中文期刊】 刘玉杰 刘毅慧 《生物信息学》 2011年09卷3期 255-258,262页ISTIC
【摘要】 特征提取和分类是模式识别中的关键问题.结合小波分析理论和支持向量机理论,构造分类器模型,将前列腺癌基因芯片数据分成癌症和正常两种.提取小波低频系数表征原始数据并送入支持向量机分类器分类,实验证明:提取db1小波4层分解下的低频系数,送入分类...
【关键词】 小波分析；支持向量机；前列腺癌基因芯片数据；
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【中文期刊】 《动物模型与实验医学（英文）》 2018年1卷3期 189-193页MEDLINECSCDBP
【摘要】 There are a lot of biological and experimental data from genomics, proteomics, drug screening, medicinal chemistry, etc....
- 概要：
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【中文期刊】 任重鲁 李金明 《计算机工程与科学》 2014年36卷7期 1389-1397页
【摘要】 基因芯片是微阵列技术的典型代表,它具有高通量的特性和同时检测全部基因组基因表达水平的能力.应用微阵列芯片的一个主要目的是基因表达模式的发现,即在基因组水平发现功能相似,生物学过程相关的基因簇;或者将样本分类,发现样本的各种亚型.例如根据基因...
- 概要：
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【中文期刊】 林勤 林斯达 等 《计算机与现代化》 2014年12期 11-14页
【摘要】 针对目前双聚类算法很少考虑所得聚类结果整体的划分质量问题，提出一种基于PA指标的双聚类算法。该算法选定一种衡量所有簇划分效果的PA指标来构造双聚类的模型，运用启发式贪心策略，通过迭代增删行列的方式挖掘出划分效果较高的几个双聚类。将所提算法与...
- 概要：
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【中文期刊】 《自然科学进展（英文版）》 2008年18卷6期 741-750页
【摘要】 Gene association study is one of the major challenges of biochip technology both for gene diagnosis where only a gene su...
【关键词】 DNA microarray data；Curse of dimensionality；Gene selection；
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【中文期刊】 张小白 王惠南 等 《计算机与应用化学》 2007年24卷12期 1611-1616页
【摘要】 微阵列数据中的缺失值会对随后的数据分析造成影响.因此,正确地估计这些缺失值是很必要的.将一个k值选取算法结合到有序的局部最小二乘填补算法中,提出了一种无参数的缺失值填补方法(SLLSkimpute).该方法的三个特点是:第一,无需事先确定参...
- 概要：
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【中文期刊】 陈雯雯 张锋 《生物技术》 2025年35卷2期 169-176,145页ISTICCA
【摘要】 [目的]基于微阵列数据挖掘乳腺癌的生物标志物,筛选其靶向中药.[方法]下载乳腺癌的临床微阵列数据以筛选差异表达基因,构建基因共表达网络,并基于12种算法筛选核心基因.通过卡普兰迈尔(Kaplan-Meier)和比例风险回归模型(Cox pr...
- 概要：
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【中文期刊】 Jhansi Venkata Nagamani Josyula Prathima Talari 等 《感染医学（英文）》 2023年1期 19-30页
【摘要】 Background:Dengue is a major arthropod-borne viral disease spreading rapidly across the globe.The absence of vaccines an...
【关键词】 Dengue fever；Severe dengue；Microarray；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《中国免疫学杂志（英文版）》 2011年08卷1期 88-91页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The multifunctional protein p100 is a vital transcriptional regulator that increases gene transcription by forming a phy...
【关键词】 chromatin immunoprecipitation；microarray；p100 protein；
- 概要：
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