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【中文期刊】 贺依依 欧阳勤 等 《药学教育》 2020年36卷6期 47-50页
【摘要】 随着计算机科学和信息技术的高速发展,药物信息数据库的提出及其相关研究的开展,给现代药物化学的教学改革带来了新的机遇和挑战.将药物信息数据库融入药物化学基础知识教学[1],创新课堂教学模式,加深学生对基础知识的理解,培养学生学习能力,提升学习...
【关键词】 药物信息数据库；PDB数据库；DrugBank数据库；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 廖志华 谌容 等 《生物学教学》 2006年31卷1期 61-62页PKU
【摘要】 生物学信息数据库是生物信息学教学和学习最重要的资料和数据来源.本文介绍以GenBank为代表的核酸数据库、以SWISS-PROT为代表的蛋白质数据库和以PBD为代表的蛋白质结构数据库.
【关键词】 生物学信息数据库；GenBanK；SWISS-PROT；
- 概要：
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【中文期刊】 赖云锋 陈献文 等 《中国药物经济学》 2019年14卷1期 21-25页
【摘要】 目的 通过实证分析不同渠道医院呼吸系统用药相关数据,了解中国呼吸系统疾病药物利用现状.方法 从中国三个医药市场数据库(CHIS数据库、PDB数据库和MENET数据库)获取医院呼吸系统疾病用药相关数据,利用Excel软件进行整理、分析,了解中...
- 概要：
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【中文期刊】 刘伟 黄伊子 等 《生物信息学》 2015年1期 35-39页ISTIC
【摘要】 随着21世纪分子生物学研究的蓬勃发展，RNA二级结构预测成为其中一项重要内容。由于RNA二级结构预测的准确性最为关键，因此寻找高精度且易操作的二级结构预测工具显得非常重要。本文选取三种简单且易操作的二级结构预测软件，先基于PDB数据库收录的...
- 概要：
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【中文期刊】 刘妍 《电子测试》 2016年13期 161-161,170页
【摘要】 随着生物信息学的高速发展，人们通过蛋白质序列测定和结构分析获得大量的蛋白质结构数据，从而建立了众多的蛋白质结构数据库。本文主要介绍了六种蛋白质结构数据库，并对PDB数据库进行了深入分析，阐述了蛋白质序列和结构的切片数据库之间的联系和内在规律...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 刘伟 丁祖泉 等 《上海生物医学工程》 2006年27卷1期 20-25页CA
【摘要】 分子模拟技术为蛋白质的研究提供了一种崭新的手段,在理论上解决了结构预测和功能分析以及蛋白质工程实施方面所面临的难题.它在蛋白质的结构预测和模建工作中占有举足轻重的地位,实现了生物技术与计算机技术的完美结合.本文简要阐述了该技术的基本步骤和工...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈桂芳 李艳利 《中国生物化学与分子生物学报》 2022年38卷1期 120-125页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 本文旨在与从事生物化学教学的教师分享几个实用素材,正在学习生物化学的学生亦可直接使用.素材包括多媒体类例如绪论导入歌曲"Biochemistry",ATP合酶工作原理的视频,RCSB PDB蛋白质结构数据库,RasMol分子图像观察软件等;...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 高柳莺 戎浩 等 《病毒学报》 2018年34卷5期 683-691页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 RIVEM是一款通过球面投射的方式在平面上绘制二十面体病毒衣壳结构的软件工具,因为开发时间较早,目前无法直接识别RCSB PDB数据库中绝大多数肠道病毒的三维结构文件.为此本研究发展了将RCSB PDB坐标体系转换到RIVEM PDB坐标体...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 于欣萍 王诗尧 等 《中华中医药学刊》 2025年43卷4期 82-89,后插22-后插26页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于生物信息学探究肝癌发生发展的潜在分子机制,筛选并验证鳖甲煎丸对肝癌起调控作用的机制和靶点.方法 下载GEO数据库中的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)单细胞数据,处理后进行通讯分析、富集与代谢分析...
【关键词】 肝癌；鳖甲煎丸；scRNA-seq分析；
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【中文期刊】 陈真妮 戴瑛 等 《中药药理与临床》 2025年41卷3期 61-67页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:基于分子对接、表面等离子体共振技术(SPR)、慢病毒转染构建刺突蛋白稳定表达细胞株、qPCR、Western blot及假病毒中和测定技术等探究姜黄素抑制新冠肺炎病毒(SARS-CoV-2)的作用.方法:通过pubchem数据库获取姜...
- 概要：
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【中文期刊】 李彦荣 陈振东 等 《中国男科学杂志》 2025年39卷2期 34-44页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 明晰淫羊藿 黄芪防治少弱精子症的药效物质和溶出与配比的相互关系、作用机制及理论效果.方法 HPLC法测定淫羊藿 黄芪不同配比时主要药效物质含量.GeneCards和UniProt数据库获得少弱精子症靶点基因,TCMSP数据库筛选淫羊藿...
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【中文期刊】 王铎 王围 等 《中国中医药图书情报杂志》 2025年49卷2期 64-71页
【摘要】 目的 基于网络药理学和分子对接探讨黄芪-山药、葛根-丹参治疗2型糖尿病(T2DM)合并冠心病(CAD)的作用机制.方法 通过TCMSP、UniProt并结合文献报道,检索黄芪-山药、葛根-丹参化学成分及其作用靶点,通过Cytoscape3....
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【中文期刊】 孙宇 宋添力 等 《中国食物与营养》 2025年31卷5期 71-77页
【摘要】 目的:利用网络药理学和分子对接技术探讨黄精治疗糖尿病的潜在活性成分及作用机制.方法:通过TCMSP中草药系统药理学平台和DisGeNET数据库、NCB数据库、TTD数据库分别获取药物的化学成分、作用靶点及疾病的相关靶点;利用Cytoscap...
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【中文期刊】 梁金悦 吴欢 等 《中医临床研究》 2025年17卷12期 105-109页
【摘要】 分子对接技术作为计算机辅助药物设计领域的一项重要技术,广泛应用于虚拟筛选药物的活性成分和研究新药组方设计等药理学领域,其优势在于能够从大量的药物原料中迅速筛选出药物先导化合物,显著缩短新药研发周期,节省研发经费,避免药物研究过程中的盲目性....
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【中文期刊】 赵丽红 徐凤 等 《临床合理用药》 2025年18卷14期 26-28,32,封3页
【摘要】 目的 运用网络药理学和分子对接技术分析白城甘草改善顺铂诱导的急性肾损伤(AKI)关键靶点.方法 通过TCMSP数据库和UniProt数据库检索白城甘草的化学成分,将潜在靶点蛋白转化为基因.通过GeneCards、OMIM和Disgent数据...
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【中文期刊】 成佳聪 李智慧 等 《南方医科大学学报》 2024年44卷1期 179-186页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过生物信息学方法预测早幼粒细胞白血病蛋白与TAK1结合蛋白的相互作用,并通过免疫共沉淀方法进行实验验证.方法 使用Rosetta软件,采用比较建模的方法,构建TAB1蛋白的三维模型;在PDB数据库中检索PML蛋白二级结构,并解析其晶...
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【中文期刊】 任建芳 罗毅冲 等 《医用生物力学》 2024年39卷1期 46-54页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究力对FLNa-Ig21/αⅡbβ3-CT稳定性的影响及调控机制.方法 FLNa-Ig21/αⅡbβ3-CT晶体结构取自PDB数据库.通过平衡和拉伸分子动力学模拟,分析复合物生理环境下稳定性以及力诱导的解折叠路径和力学稳定性.结果 ...
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【中文期刊】 韩静 李吉英 等 《南昌大学学报（医学版）》 2024年64卷5期 29-43页ISTIC
【摘要】 目的 利用分子对接技术探究余甘子多酚与衰老相关神经退行性疾病基因的相互作用.方法 从PDB数据库获取乙酰胆碱酯酶(AchE)、丁酰胆碱酯酶(BchE)和单胺氧化酶(MAO)受体结构文件,以及从pubc-hem数据库获取余甘子中11种多酚物质...
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【中文期刊】 龙文明 陈亮 等 《安徽医药》 2024年28卷12期 2354-2358,后插3-后插4页ISTICCA
【摘要】 目的 基于网络药理学和分子对接探讨梓木草抗炎的作用机制.方法 2023年1-3月,首先利用网络药理学研究方法在文献中检索梓木草成分,并通过TCMSP数据库、PubChem数据库获取成分结构式及3D结构,同时将成分结构导入Swiss Targ...
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【中文期刊】 曹晓 冯艳青 等 《空军军医大学学报》 2024年45卷10期 1123-1128页
【摘要】 目的 应用网络药理学和分子对接技术探讨藤黄中主要成分藤黄酸(GA)在牙周炎治疗中的作用及分子机制.方法 使用SwissTargetPrediction、SEA及SuperPred数据库获取GA的相关靶点;利用GeneCards、DisGeN...
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【中文期刊】 陈明雪 温泽宇 等 《天津师范大学学报（自然科学版）》 2024年44卷2期 42-49页
【摘要】 为了挖掘生物活性高、靶点明确的新型抗痛风药物先导化合物,以黄嘌呤氧化酶(xanthine oxidase,XOD)为靶标虚拟筛选小分子抑制剂.从PDB数据库下载XOD蛋白晶体结构,经Schr?dinger 2018中的"Protein pr...
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【中文期刊】 宋泽龙 吉旭彬 等 《滨州医学院学报》 2024年47卷3期 217-222页
【摘要】 目的 通过网络药理学及分子对接对玉屏风散药物成分、作用靶点进行数据挖掘、分析,以探究玉屏风散促进创口愈合的作用机制.方法 TCMSP检索玉屏风散有效成分、相关靶点,使用GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD、Drug-Ban...
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【中文期刊】 唐祖丽 《黑龙江科学》 2024年15卷18期 120-123,127页
【摘要】 通过网络药理学和分子对接技术探讨姜黄素治疗胃癌的作用机制.姜黄素靶点通过Super Pred与Swiss Target Prediction数据库进行筛选,胃癌作用靶点通过Dis GeNET、Therapeutic Target Datab...
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【中文期刊】 李灵巧 楼毅云 《浙江临床医学》 2023年25卷3期 323-326页ISTIC
【摘要】 目的 基于网络药理学和分子对接研究育麟协定方调控细胞自噬的物质基础和分子生物学机制.方法 运用TCMSP数据库筛选育麟协定方活性成分及靶标;运用DrugBank、GeneCards和OMIM数据库获取细胞自噬靶点;借助Venny2.1得到育...
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【中文期刊】 刘迪晖 梁小弟 等 《新疆医科大学学报》 2023年46卷3期 285-293页ISTICCA
【摘要】 目的 探究小鼠前脂肪细胞分化过程中STAU1对Foxp1 mRNA转录后的调控作用.方法 培养3T3-L1前脂肪细胞,采用鸡尾酒法诱导其分化为成熟脂肪细胞,分别收取第0天和第4天样本进行RNA测序筛选出差异倍数(FC)>2的转录因子;提取第...
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【学位论文】 作者：王戈 导师：徐莹莹 南方医科大学 生物医学工程 生物医学工程（硕士） 2022年
【摘要】 蛋白质亚细胞位置描述的是蛋白质在细胞中的具体出现位置，与蛋白功能密切相关，很多蛋白质的定位异常也被证实与癌症等疾病有关，所以，确定细胞内的蛋白质亚细胞位置至关重要。近些年来，关于蛋白质亚细胞定位的研究工作进展迅速，为了节省时间与实验成本，智...
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【中文期刊】 曾巧辉 郭槟勇 等 《现代食品科技》 2023年39卷6期 142-153页
【摘要】 兼具糖尿病的新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)患者病死率明显偏高,抑制Ⅱ型糖尿病关键酶二肽基肽酶 4(DPP-Ⅳ)和新冠肺炎病毒主蛋白酶(SARS-CoV-2 Mpro)的活性能缓解相应...
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【中文期刊】 闫平 张彦 等 《中国食品添加剂》 2023年34卷4期 96-105页
【摘要】 目的:通过体外酶抑制剂实验,将活性成分与核心蛋白分子对接,初步阐明光果莸提取物对"三高"的作用.方法:以抑制率为指标,测定提取物对四种酶活性的抑制作用;测定提取物中黄酮、酚酸含量,采用高效液相色谱法测定核心活性成分野黄芩苷、木犀草苷的含量....
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【中文期刊】 王东海 菅富元 等 《山东化工》 2023年52卷15期 200-207页
【摘要】 建立了一个癌症分子靶点及其配体综合查询系统,在此系统中对肿瘤靶点及其配体(包括小分子抑制剂、抗体类药物、特异性配体蛋白)进行介绍、汇总.系统以网页形式可以快速浏览历年来研究成果较多的癌症分子靶点,并给出这些靶点的蛋白信息,并实现了与Unip...
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- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘启平 周俊豪 等 《重庆医学》 2022年51卷23期 4065-4071页MEDLINEISTICCA
【摘要】 目的 应用网络药理学和分子对接技术探讨麻杏石甘汤加减方治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的机制.方法 首先在TCMSP数据库中查找、筛选麻杏石甘汤加减方基本中药组成的有效化学成分及靶点,并利用Uniptro数据库将靶点转换为相应基因名...
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