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【中文期刊】 王炳超 许黎明 等 《广西植物》 2025年45卷6期 1046-1059页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为解释喀斯特森林乔木根际土壤共生菌根真菌及其关联类群,探究不同菌根类型乔木根系的抗旱性,该文主要通过PacBio三代测序和测定压力-容积曲线的方法,对广西河池市木论国家级自然保护区内17个树种的根系及根际土壤真菌进行了研究.结果表明:(1)...
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【中文期刊】 夏悦昕 杨宜承 等 《临床输血与检验》 2025年27卷3期 306-309页ISTICCA
【摘要】 目的 对17例在ABO血型鉴定中出现混合视野的血液标本进行单倍体基因型的测定以期准确鉴定ABO血型.方法 利用免疫血清学试验鉴定ABO表型,采用PacBio单分子实时荧光(single molecule real-time,SMRT)测序技...
【关键词】 ABO基因分型;PacBio三代测序;混合视野;
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【中文期刊】 刘亚东 刘忠宇 等 《生物信息学》 2025年23卷3期 175-183页ISTIC
【摘要】 DNA甲基化是存在于真核细胞中的一种关键的表观遗传修饰形式,它能在不改变碱基序列的前提下控制基因表达,并影响生物的发展进程.研究DNA甲基化有助于揭示发育过程中的表观遗传调控机制,为疾病诊断和精准医疗的发展提供重要支撑.Pacific Bi...
【关键词】 DNA甲基化;PacBio测序技术;深度学习;
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【中文期刊】 李蕊蕊 崔丛丛 等 《中国输血杂志》 2025年38卷3期 421-425页ISTICCA
【摘要】 目的 利用PacBio三代测序技术对 1 例ABO血型正、反定型不符的患者标本进行检测,以明确其血型,探讨血清学方法与分子生物学方法在确定嵌合体血型中的应用.方法 血型血清学试验方法;PCR基因扩增ABO基因第 1~7 号外显子并进行San...
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【中文期刊】 马玉洁 孙东兰 等 《中国组织化学与细胞化学杂志》 2025年34卷3期 220-226,263页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨通过PacBio三代测序技术检测血友病A患者及携带者F8基因变异的可行性.方法 采集临床上已确诊血友病A的患者外周血样本,采用高分辨染色体核型分析技术,进行细胞遗传学检测,并提取基因组DNA,使用PacBio三代测序技术进行分子遗...
【关键词】 血友病A;F8基因;PacBio三代测序;
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【中文期刊】 杨叙 张珂 等 《上海中医药大学学报》 2025年39卷4期 17-24页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的:分析独一味全长转录组测序数据,解析独一味中环烯醚萜苷类化合物的合成途径.方法:利用PacBio SMRT全长转录组测序和超高效液相色谱-飞行时间质谱(UHPLC-QTOF-MS/MS)代谢组学技术,对独一味的全长转录组和代谢产物进行分...
【关键词】 独一味;环烯醚萜苷;PacBio SMRT测序;
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【中文期刊】 姚丹 周文才 等 《昆虫学报》 2024年67卷5期 611-621页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]中华蜜蜂Apis cerana cerana是东方蜜蜂Apis cerana在中国地区分布最广泛的亚种,在地理适应和生态多样性方面有显著优势.中华蜜蜂的低温适应性优于西方蜜蜂A.mellifera,可用于高海拔高山地区和冬季蜜源的采...
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【中文期刊】 崔文燕 刘金华 等 《临床输血与检验》 2024年26卷2期 262-266页ISTICCA
【摘要】 目的 利用PacBio三代测序技术鉴定c.586T>C突变导致的Bel亚型,并分析Bel亚型家系的血型血清学特点.方法 ABO血型表型检测使用血清学方法,对ABO正反定型不符的家系标本进行ABO基因第6、7号外显子Sanger测序.利用Pa...
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【中文期刊】 夏悦昕 邵林楠 等 《临床输血与检验》 2024年26卷6期 792-796页ISTICCA
【摘要】 目的 利用血清学及PacBio三代测序技术鉴定1例罕见cisAB亚型,利用分子对接探讨糖基转移酶氨基酸突变导致亚型的分子机制.方法 利用免疫血清学试验鉴定ABO表型,利用PacBio三代测序方法鉴定其基因型.突变后的糖基转移酶同源建模和分子...
【关键词】 cisAB亚型;PacBio三代测序;同源建模;
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【中文期刊】 孙铭声 陈星宇 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2023年25卷8期 2726-2734页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 基于"肠-脑"相关理论观察针刺对偏头痛模型大鼠肠道菌群和中枢炎症的影响,以阐明针刺治疗偏头痛的"肠-脑"作用机制.方法 采用硝酸甘油皮下注射法制作偏头痛大鼠模型,并随机分为模型组和针刺组,每组6只,另设空白对照组6只进行常规捆绑固定....
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【中文期刊】 许雅静 吴鹰 等 《昆虫学报》 2022年65卷1期 63-72页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]本研究旨在利用已获得的PacBio单分子实时(single molecule real-time,SMRT)测序数据对蜜蜂球囊菌Ascosphaera apis菌丝(AaM)和孢子(AaS)中的转录因子(TF)、融合基因和RNA编辑...
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【中文期刊】 薛倩 邢伟杰 等 《中国畜牧兽医》 2023年50卷10期 3869-3881页
【摘要】 [目的]汶上芦花鸡为中国唯一的芦花羽地方鸡品种资源,芦花基因可伴性遗传,芦花羽性状可用于雏鸡的自别雌雄.试验旨在丰富家鸡基因组信息,获取汶上芦花鸡全基因组序列,为鸡伴性芦花羽分子机制研究提供材料.[方法]以汶上芦花鸡为试验动物,基于BGI ...
【关键词】 汶上芦花鸡;基因组组装;PacBio三代测序技术;
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【中文期刊】 魏灿灿 李然 等 《口腔生物医学》 2022年2期 86-91页ISTIC
【摘要】 目的:通过宏基因组学方法结合Pacbio SMRT高通量测序技术探究孤独症谱系障碍(ASD)儿童中口腔健康和罹患龋齿者的唾液微生物菌群的组成及其差异.方法:收集42名ASD儿童唾液样本,其中无龋组22名,高龋组20名,提取DNA进行聚合酶链...
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【中文期刊】 蔡宏宇 刘文俊 等 《中国食品学报》 2022年22卷2期 291-300页
【摘要】 传统酸马奶受制作环境和工艺的影响,其菌群结构有所不同.本文运用Pacbio SMRT测序技术,基于乳酸菌特异性引物对新疆部分地区酸马奶和鲜马奶的乳酸菌菌群进行研究,结果表明:鲜马奶中乳酸菌丰富,以瑞士乳杆菌(35.52%)、唾液链球菌(10...
【关键词】 马奶;Pacbio SMRT测序;乳酸菌特异性引物;
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【中文期刊】 王娜 余秀蓉 等 《细胞与分子免疫学杂志》 2025年41卷2期 148-153页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 对本院肿瘤患者类孟买血型进行精准鉴定,促进本实验室的疑难血型鉴定体系的建立,为实现患者精准输血提供基础.方法 回顾性分析本院2019-01-01/2023-12-31的91 874例肿瘤患者血型结果,采用常规血清学检测血型,检出疑似类...
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【中文期刊】 柳延虎 王璐 等 《遗传》 2015年3期 259-268页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 单分子 DNA 测序技术是近10年发展起来的新一代测序技术,也称为第三代测序技术,包括单分子实时测序、真正单分子测序、单分子纳米孔测序等技术。文章介绍了单分子实时(Single-molecule real-time,SMRT)测序技术的基本...
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【中文期刊】 史大伟 邢军 等 《中国乳品工业》 2021年49卷2期 19-23页
【摘要】 利用PacBio SMRT测序技术,对采集自新疆喀什地区牧民家中的开菲尔进行0~96 h发酵过程中细菌群落的结构演替进行分析.研究结果如下:在整个发酵过程中芽孢杆菌(Bacillus)、肠杆菌属(Enterobacter)和气单胞菌属(Ae...
- 概要:
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【中文期刊】 谷生丽 刘谏君 等 《吉首大学学报(自然科学版)》 2020年41卷3期 28-35页
【摘要】 利用Illumina和Pacbio测序技术对扬子鳃蛭(Ozobranchus jantseanus)线粒体基因组全序列进行测序及注释,并与NCBI数据库中蛭纲(Hirudinea)其他物种的线粒体全序列的排列方式和系统进化关系进行了比较,以...
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【中文期刊】 崔文燕 杨贺才 等 《中华医学遗传学杂志》 2025年42卷3期 274-281页MEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 目的:利用PacBio长读长测序技术分析Duffy血型基因在河南回族人群中的遗传多样性。方法:随机选取30例上三代均为河南回族的个体作为研究对象,利用PacBio长读长测序技术检测其Duffy血型基因的全长序列,测定预测表型和基因型频率的分...
【关键词】 Duffy血型;PacBio长读长测序技术;回族;
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【中文期刊】 刘文俊 多拉娜 等 《中国食品学报》 2019年19卷4期 27-37页
【摘要】 通过纯培养方法结合PacBio三代测序技术对采自蒙古国的12份传统酸马奶中的乳酸菌多样性进行研究.应用传统的纯培养技术从12份传统酸马奶样品中分离出62株乳酸菌,通过16S rRNA基因序列分析和系统进化关系研究,62株乳酸菌被鉴定为5个属...
【关键词】 酸马奶;乳酸菌;PacBio SMRT测序技术;
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【中文期刊】 徐海燕 马慧敏 等 《中国食品学报》 2018年18卷1期 1-11页
【摘要】 目的:研究长期高脂饮食为主的肥胖个体的肠道细菌多样性,比较不同健康状态的肥胖者肠道菌群的差异.方法:对14个肥胖个体根据健康状况分为3组(健康组,H组;胃肠道疾病组,D组;慢性病组,T组),提取3组样品粪便细菌宏基因组DNA,扩增其16S ...
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【中文期刊】 钟伟民 张兴坦 等 《福建农林大学学报(自然科学版)》 2018年47卷5期 524-529页
【摘要】 本文介绍了PacBio测序在转录组学研究中的一些应用及PacBio测序数据分析常用的方法流程,根据PacBio测序的发展综述了PacBio测序经常遇到的一些问题及相应解决方案,并就PacBio测序技术所面临的挑战和未来的发展进行讨论.
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【中文期刊】 张蕾 赵志鑫 等 《微生物学报》 2023年63卷8期 3173-3186页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 初乳中的微生物在婴儿生长发育过程中具有多种有益作用.[目的]本研究分析了影响初乳微生物组成的多个因素,为后续探讨人初乳菌群的相关研究提供新思路.[方法]通过PacBio SMRT测序技术对 37 份采集自湖北恩施地区人初乳样本中细菌 16S...
【关键词】 初乳;地区;16S rRNA基因;
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【中文期刊】 俞晓玲 姜文倩 等 《生物化学与生物物理进展》 2020年47卷1期 5-16页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 从DNA双螺旋结构的发现开始,生命科学研究进入分子水平,在20世纪70年代出现的测序技术为破译遗传密码作出了巨大贡献.近几年出现的单分子测序技术,可以在单个分子水平读取核苷酸序列,也被称为第三代测序技术,主要代表有HeliScope、Nan...
【关键词】 单分子测序;HeliScope测序;纳米孔测序;
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【中文期刊】 孙明会 刘佳美 等 《微生物学报》 2022年62卷8期 2981-2994页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis)是一种专性侵染蜜蜂幼虫的致死性真菌病原.本研究旨在利用PacBio单分子实时(single molecule real-time,SMRT)测序技术对蜜蜂球囊菌孢子(AaS)中基因的可变...
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【中文期刊】 万萍 沈伟涛 等 《环境与职业医学》 2022年39卷9期 1011-1020页ISTICPKUCSCD
【摘要】 [背景]食管癌是常见的消化道肿瘤,中国是食管癌高发地区.有研究提示,肠道菌群与肿瘤等多种疾病的发生发展相关.受测序读长所限,传统的16S rDNA测序技术只能鉴定到属.[目的]本研究基于PacBio单分子实时(SMRT)测序技术在种水平筛选...
【关键词】 PacBio单分子实时测序技术;食管癌;肠道菌群;
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【中文期刊】 司诚 钟启文 等 《生物技术通报》 2022年38卷9期 180-190页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 香瓜茄又名人参果,具有抗氧化、抗肿瘤、抗糖尿病等多种生物活性.为丰富茄科作物基因组信息及进化发育历程,获取香瓜茄全基因组序列信息,同时为香瓜茄相关分子研究奠定基础.以香瓜茄植物组织为试验材料,基于Illumina HiSeq构建小片段文库进...
【关键词】 香瓜茄;基因组;PacBio三代测序技术;
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【中文期刊】 刘诗蓉 王红兰 等 《中草药》 2022年53卷4期 1148-1155页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探明半夏Pinellia ternate连作对根际土壤微生物群落的影响规律,以指导半夏连续高产栽培.方法 采用PacBio Sequel测序手段对正茬(CK)、连作一茬(A)、二茬(B)和三茬(C)半夏不同生长时期根际土壤微生物进行测...
- 概要:
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【中文期刊】 糜媛媛 韦依依 等 《中国病原生物学杂志》 2020年15卷8期 953-958页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 探讨妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)患者肠道菌群的改变特征,比较GDM患者和正常妊娠者组间肠道菌群的差异性. 方法 随机选取在本院进行常规检查的孕妇30例,其中GDM患者和正常妊娠者各...
【关键词】 16S rRNA;妊娠期糖尿病;PacBio SMRT测序;
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