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【中文期刊】 彭紫依 张永超 等 《陆军军医大学学报》 2026年48卷3期 272-282页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 系统揭示胃癌不同转录元程序(meta-program,MP)的肿瘤微环境特征及其空间互作单元,探讨其潜在临床意义.方法 整合分析 2 个胃癌单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)数...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 杨宇 刘瑞剑 等 《现代泌尿外科杂志》 2026年31卷2期 187-192页ISTICCA
【摘要】 肾细胞癌是泌尿系统常见的恶性肿瘤之一,其高度异质性在疾病进展、治疗反应和预后中产生关键影响.本文聚焦肿瘤微环境在肾细胞癌异质性形成中的作用机制,系统综述了肿瘤内不同细胞类型间的互作网络、免疫治疗抑制状态的动态演化过程,以及肿瘤与基质细胞之间...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Hu-Yao Zhou Xia Wang 等 《中国神经再生研究（英文版）》 2025年20卷12期 3606-3619页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Secondary injury following spinal cord injury is primarily characterized by a complex inflammatory response,with residen...
【关键词】 acute inflammation；bioinformatics analysis；fibroblast；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Muhammad Junaid Eun Jeong Lee 等 《中国神经再生研究（英文版）》 2025年20卷6期 1525-1540页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Elucidating the complex dynamic cellular organization in the hypothalamus is critical for understanding its role in coor...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Yali Chen Yiyong Wei 等 《中国神经再生研究（英文版）》 2025年20卷11期 3302-3316页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Glial cells play crucial roles in regulating physiological and pathological functions,including sensation,the response t...
【关键词】 astrocyte；glial cell；human；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Maopeng Wang Yuanlin Wang 等 《食品科学与人类健康（英文）》 2025年14卷11期 4669-4681页SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Icariin is a natural product that possesses numerous pharmaceutical properties.Thus,this study aimed to investigate the ...
【关键词】 Icariin；Ferroptosis；Aged osteoporosis；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Shijin YUAN Yan XIA 等 《浙江大学学报（英文版）（B辑：生物医学和生物技术）》 2025年26卷4期 371-392页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Recent data suggest that vascular endothelial growth factor receptor inhibitor(VEGFRi)can enhance the anti-tumor activit...
【关键词】 Colorectal cancer(CRC)；Microsatellite stability(MSS)；Immunotherapy；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 姚琪 苏延池 等 《生理科学进展》 2025年56卷3期 219-225页ISTICPKUCA
【摘要】 空间转录组学(spatial transcriptomics)在识别特定基因表达模式、发现新的细胞类型标志物,以及揭示细胞自组织和共协作方面发挥重要作用.本文系统分类并回顾了近年来基于人工智能理论和技术开发的空间转录组学数据分析方法,这些方...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘改琴 杨琪 等 《中国卫生统计》 2025年42卷6期 843-848,855页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 探讨空间主成分分析(spatial principal component analysis,spatial PCA)在卵巢癌(ovarian cancer,OC)空间转录组学数据空间域识别中的应用,识别在基因表达和组织学上空间一致的...
【关键词】 spatial PCA降维；空间转录组；空间域识别；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李刘佳钰 王成 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2025年41卷11期 1610-1621页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)因其多向分化潜能和免疫调节特性,在再生医学中具有广阔应用前景,但其功能异质性和微环境依赖性仍是临床应用的重大挑战.近年来,单细胞转录物组测序(single-cell tr...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 孙瑞状 乔坤朋 等 《上海交通大学学报（医学版）》 2025年45卷11期 1490-1501页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的·探讨ATP结合盒转运蛋白A7(ATP-binding cassette subfamily A member 7,ABCA7)基因在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中的预后评估价值,为CRC的精准诊断和个性化治疗...
【关键词】 ATP结合盒转运蛋白A7；结直肠癌；空间转录组；
- 概要：
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【中文期刊】 曹红艳 刘改琴 等 《中国卫生统计》 2025年42卷4期 486-490,495页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 提出局部加权集成空间域识别(locally weighted ensemble based spatial domain identification,LWESDI)方法,探讨LWESDI方法在乳腺癌空间转录组学数据空间域识别中的应用...
- 概要：
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【中文期刊】 熊明福 孔思远 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2025年41卷11期 1566-1578页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 骨骼肌作为机体重要组织(约占体重40％),由肌纤维、肌肉干细胞和内皮细胞等多种细胞类型构成,通过时序与空间特异性调控参与运动、能量代谢及内环境稳态等生理过程.其发育分为胚胎期和出生后两个关键阶段,异常发育可导致肌营养不良等疾病,并直接影响畜...
- 概要：
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【中文期刊】 田雅昕 崔丁童 等 《中国卫生统计》 2025年42卷6期 826-834,842页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 探讨图注意力自动编码器框架(spatially resolved transcriptomics with an adaptive graph attention au-to-encoder,STAGATE)在乳腺癌空间转录组学数据中...
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【中文期刊】 任凯芳 傅全威 等 《创伤与急危重病医学》 2025年13卷2期 152-156页ISTIC
【摘要】 系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)是一种复杂的自身免疫性疾病,其病因涉及遗传、环境和免疫等多种因素[1].近年来,肾损伤、肺部受损和神经系统疾病等SLE并发症对患者的病死率和生活质量产生较大影...
- 概要：
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【中文期刊】 陈子睿 杨博然 等 《生物信息学》 2025年23卷1期 40-49页ISTIC
【摘要】 空间转录组(Spatial transcriptomics,ST)测序技术可以捕获多个细胞的空间位置信息,但无法达到单细胞分辨率,阻碍了对细胞类型异质性空间模式和基因表达特异性的解析.针对ST数据,本文提出了基于DenseNet网络结构和C...
- 概要：
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【中文期刊】 束长新 韦晨 等 《实用临床医药杂志》 2025年29卷7期 92-99页ISTICCA
【摘要】 目的 运用机器学习算法分析单细胞测序数据和空间转录组数据,探讨线粒体自噬相关基因在结肠癌中的作用.方法 采用支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)和随机森林算法筛选关键的线粒体自噬相关基因,结合单细胞测序数据和空间转录组数据,对细胞间相互...
- 概要：
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【中文期刊】 吴科俊 张嘉铭 等 《湖北医药学院学报》 2025年44卷6期 663-671页ISTICCA
【摘要】 目的:探讨E2F转录因子 5(E2F5)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达模式,对细胞增殖的影响及其与免疫微环境的关系.方法:利用10X Genomics Visium平台空间转录组数据分析E2F5 的空间分布特征;基于单细胞RNA测序数...
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【中文期刊】 耿逸凡 孔健达 等 《食品与药品》 2025年27卷3期 204-212页ISTICCA
【摘要】 目的 探究人脐带间充质干细胞(hUC-MSC)对帕金森病(PD)模型中少突胶质细胞(oligodendrocyte,OL)谱系的调控作用.方法 构建1-甲基-4苯基-1,2,3,6四氢吡啶(MPTP)诱导的PD小鼠模型,经尾静脉多次注射hU...
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【中文期刊】 万令飞 潘文婷 等 《生物技术进展》 2025年15卷4期 645-654页ISTICCA
【摘要】 肝脏疾病的发生和发展受到多种细胞类型及其空间组织方式的精细调控.空间转录组学(spatial transcriptomics,ST)可在组织切片水平实现基因表达的空间定位,目前已成为解析肝脏疾病微环境动态变化的重要技术.综述总结了ST技术在...
- 概要：
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【中文期刊】 葛秦涛 徐文浩 等 《现代泌尿外科杂志》 2025年30卷11期 938-946页ISTICCA
【摘要】 目的 分析肾透明细胞癌(ccRCC)中癌症相关成纤维细胞(CAF)的异质性谱系,并探讨抗原呈递CAF(apCAF)与三级淋巴结构(TLS)空间分布和形成之间的关系.方法 整合7个ccRCC单细胞测序转录组队列(n=88),运用Harmony...
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【中文期刊】 Wen-Jia Wang Liu-Xi Chu 等 《军事医学研究（英文版）》 2024年11卷3期 430-448页SCIMEDLINEISTICCSCD
【摘要】 The respiratory system's complex cellular heterogeneity presents unique challenges to researchers in this field.Although...
【关键词】 Spatial transcriptomics；Lung；Tumor；
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【中文期刊】 Panpan Chen Zihan Zhu 等 《药物分析学报（英文版）》 2024年14卷4期 552-561页SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Eclipta prostrata L.has been used in traditional medicine and known for its liver-protective properties for centuries.We...
【关键词】 Spatial metabolomics；Transcriptomics；Non-alcoholic fatty liver disease；
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【中文期刊】 付猛 宋海峰 等 《泌尿外科杂志（电子版）》 2025年17卷1期 62-67页
【摘要】 本文回顾了2024年良性前列腺增生领域的最新研究进展.在病理机制方面,研究明确了特定细胞亚群在前列腺增生结节形成中的关键作用,以及免疫细胞与增生之间的密切联系.昼夜节律研究的新发现提示其与前列腺增生症状的潜在关联.诊断技术上,磁共振成像和空...
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【中文期刊】 杨扬 杨洁 等 《数理医药学杂志》 2025年38卷12期 923-935页CA
【摘要】 目的 基于网络拓扑学、Bulk转录组学和空间转录组学探究绿茶多酚抗胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)的分子机制.方法 利用网络拓扑学分析绿茶多酚抗PAAD的潜在作用靶点,基于BEST平台和GSCA数据库评...
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【中文期刊】 胡洋僖 李晓凯 等 《中国医药科学》 2025年15卷3期 32-35页
【摘要】 空间转录组学技术能够对生物样本的组织空间进行多维度研究,不但可以分析空间组织特征,还可以研究组织细胞中的基因表达与细胞通讯互作.肝癌是发病率和病死率最高的实体恶性肿瘤之一,其中耐药性和免疫抑制微环境是引发肝癌复发转移,导致肿瘤相关死亡的主要...
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【中文期刊】 孙宇哲 郑惠文 等 《中国医学前沿杂志（电子版）》 2024年16卷8期 14-22页ISTICPKUCSCD
【摘要】 空间转录组学技术通过在基因表达分析中添加空间位置信息,为生物学研究,尤其在探索细胞老化和器官功能衰退方面提供了新的视角.本文综述了空间转录组学在脑衰老、皮肤衰老以及其他器官系统中的应用,并探讨了这些技术在揭示衰老机制中的重要作用.研究中使用...
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【中文期刊】 杨品 任振华 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷7期 1196-1213页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 多模态组学数据的联合运用在揭示细胞异质性和解析细胞命运调控机制方面具有重要意义,目前已有多种方法被开发,用于处理不同组学模态数据的整合.本研究通过对应用于不同整合任务的多种数据整合方法进行性能评测,为相关领域的研究提供有益参考.使用6个联合...
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【中文期刊】 贠文昕 何珍 等 《中国药理学与毒理学杂志》 2024年38卷8期 575-586页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过空间转录组技术探索慢性社交挫败应激(CSDS)模型小鼠纹状体转录组的变化,揭示其在抑郁症发生发展中的作用.方法 应用CSDS实验范式建立抑郁样小鼠模型,通过悬尾、强迫游泳、糖水偏爱和社会交互实验分别检测行为绝望、快感缺乏和社交障碍...
- 概要：
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【中文期刊】 Jianlin Du Xin Yuan 等 《药物分析学报（英文版）》 2023年13卷8期 894-907页SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Tbx18,Wt1,and Tcf21 have been identified as epicardial markers during the early embryonic stage.However,the gene markers...
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