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【中文期刊】 Xiaolu Li Ye Yang 等 《中国神经再生研究（英文版）》 2024年19卷12期 2723-2734页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Immune changes and inflammatory responses have been identified as central events in the pathological process of spinal c...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 Cunte Chen Yangqiu Li 《中国癌症研究（英文版）》 2023年35卷3期 245-251页SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Co-expression of immune checkpoint(IC)molecules can exacerbate T cell exhaustion in patients with hematological malignan...
【关键词】 Immune checkpoint；T cell exhaustion；co-expression pattern；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 蔡溦 朱御坤 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷18期 3747-3757页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:低度慢性炎症被认为在骨关节炎的发病机制中起着核心作用,但是具体的分子机制目前仍不清楚.目的:筛选和探讨骨关节炎中的潜在枢纽基因及免疫细胞的浸润情况.方法:将来自GPL570平台的GSE206848数据集与来自GPL96平台的GSE55...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 李鑫 慈百全 等 《微生物学杂志》 2025年45卷1期 24-33页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 研究噬菌体裂解酶对细菌生物被膜(Bacterial biofilm,BBF)的作用效果及转录机制.细菌生物被膜的形成是细菌耐药性产生的重要原因之一.金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是常见的易形成生物被膜的致病微生...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李晶 鞠苇杭 等 《山东大学学报（医学版）》 2025年63卷9期 31-39页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 基于单细胞转录组学数据,探究多种癌症组织中不同细胞类型的基因共表达规律.方法 依托大规模公共单细胞转录组学数据,运用CS-CORE方法为 6 种常见的细胞类型在 5 种不同的癌症中分别构建了细胞类型特异性的基因共表达图谱.结果 共获得...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 何田田 李泓毅 等 《中国肿瘤生物治疗杂志》 2025年32卷7期 716-722页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨贝沙罗汀治疗双打击淋巴瘤(DHL)的分子机制,为DHL治疗提供潜在靶点和实验依据.方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载GSE44164和GSE43677表达谱数据集,筛选出差异表达基因(...
【关键词】 双打击淋巴瘤；贝沙罗汀；基于加权基因共表达网络分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 雷建园 陈琳 等 《临床与实验病理学杂志》 2025年41卷6期 799-802页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探讨TTF-1/p40共表达非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的临床病理特点.方法 回顾性分析4例TTF-1/p40共表达NSCLC的临床病理资料,采用免疫组化EnVision两步法检测蛋...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李加根 陈跃平 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷26期 5595-5607页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:类风湿关节炎发病机制至今尚未完全清晰,近来有研究表明线粒体自噬与类风湿关节炎存在关联性,但关键机制有待深入探究.目的:利用多机器学习算法鉴定和验证类风湿关节炎中线粒体自噬过程的核心互作基因并解析其免疫调控过程.方法:从GEO数据库整理...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 武英楷 史高龙 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷2期 294-301页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:类风湿关节炎是一种全身的免疫相关性疾病,主要病理特点是关节滑膜炎性增生及关节软骨的破坏,其发病机制目前尚不明确,迫切需要发现新的具有高度敏感性和特异性的诊断标志物.目的:联合使用生物信息学技术及计算机学习算法,识别并筛选类风湿关节炎患...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周未来 李俊 等 《中国免疫学杂志》 2025年41卷2期 287-294页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:利用生物信息学方法寻找与哮喘发病相关的关键基因并讨论其分子机制.方法:对GSE143303芯片数据进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选出与哮喘发病显著相关的模块,并对模块基因进行蛋白质相互作用(PPI)网络分析、功能及通路富...
【关键词】 支气管哮喘；支气管镜管腔内活检；加权基因共表达网络分析；
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- 结论：
【中文期刊】 刘雅妮 杨静欢 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷5期 1091-1100页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:纤维肌痛综合征作为常见风湿病,其发病与中枢敏化及免疫异常有关,但具体过程尚未阐明,缺乏特异性诊断标志物,不断探索该病的发病机制具有重要的临床意义.目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)等生物信息学方法和机器学习算法筛选纤维肌痛...
- 概要：
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【中文期刊】 方柔柔 张韩香 等 《中西医结合心脑血管病杂志》 2025年23卷18期 2742-2752页ISTIC
【摘要】 目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和机器学习算法对动脉粥样硬化(AS)血管测序数据集进行分析,探讨AS的潜在靶点,以期为临床治疗和药物研发提供依据.方法:从基因表达综合数据库(GEO)中下载AS基因表达数据集GSE40231.利...
【关键词】 动脉粥样硬化；加权基因共表达网络分析；机器学习；
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【中文期刊】 毛建云 张明婷 等 《心脏杂志》 2025年37卷4期 410-419页ISTICCA
【摘要】 目的 基于 WGCNA法探讨心房颤动(AF)射频消融术后复发的机制.方法 采用 limma法分析GSE2240、GSE41177、GSE115574中AF和窦性心律的差异基因,采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定AF关联性最强的基因...
【关键词】 心房颤动复发；沙库巴曲缬沙坦联合胺碘酮；加权基因共表达网络分析；
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【中文期刊】 王苗茜 马明峰 《中西医结合心脑血管病杂志》 2025年23卷16期 2411-2424页ISTIC
【摘要】 目的:使用生物信息学分析鉴定动脉粥样硬化(AS)中缺氧和铁死亡相关差异基因.方法:对GSE12288、GSE97210和GSE28829进行生物信息学分析.采用"limma"软件包鉴定差异表达基因(DEG).进行不同种类的富集分析,以找出相...
- 概要：
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【中文期刊】 高浏璐 梁昭君 等 《胃肠病学和肝病学杂志》 2025年34卷6期 799-808页ISTICCA
【摘要】 目的 利用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)识别肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)潜在的生物标志物和治疗靶点,旨在...
【关键词】 肝细胞癌；加权基因共表达网络分析；生物标志物；
- 概要：
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【中文期刊】 桑珍珍 冯顺易 等 《安徽医药》 2025年29卷5期 940-944,后插2-后插4页ISTICCA
【摘要】 目的 旨在识别急性胰腺炎相关脓毒症的关键基因.方法 2023年3―9月从GEO数据库下载基因数据集.采用WGCNA确定急性胰腺炎和脓毒症的枢纽模块,并将两个模块交叉以确定与急性胰腺炎相关脓毒症有关的共同基因.采用R软件筛选出急性胰腺炎和脓毒...
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【中文期刊】 高玥 张行 等 《现代医学》 2025年53卷6期 883-892页ISTIC
【摘要】 目的:本研究旨在利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘与急性髓系白血病(AML)基因表达谱中生存相关的基因,并分析其与AML患者生存预后的关系.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载AML患者基因表达和临床数据并进行预处理.利用...
【关键词】 急性髓系白血病；加权基因共表达网络；蛋白磷酸酶Mg2+/Mn2+依赖性1J；
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【中文期刊】 秦冲 王振辉 等 《现代医学》 2025年53卷4期 546-558页ISTIC
【摘要】 目的:探讨免疫细胞相关基因在糖尿病心肌病(DCM)中的作用,并探讨其潜在机制.方法:采用单样本基因集富集分析探讨样本的免疫浸润情况.通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘与免疫浸润相关的基因.通过富集分析,分析这些基因的功能.基因间的...
【关键词】 糖尿病心肌病；辅助性T细胞17；加权基因共表达网络分析；
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【中文期刊】 张莉 龚政 等 《临床检验杂志》 2025年43卷2期 136-143页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学方法筛选狼疮性肾炎(LN)的关键表达基因,寻找诊断LN的潜在生物标志物,探讨LN的发病机制.方法 从高通量基因表达(GEO)数据库下载慢性肾脏病相关的GSE99339数据集,用WGCNA方法筛选与LN相关的核心模块.获取...
【关键词】 高通量基因表达；狼疮性肾炎；加权基因共表达网络分析；
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【中文期刊】 郭峰 王晨宇 等 《现代泌尿外科杂志》 2025年30卷3期 215-222页ISTICCA
【摘要】 目的 采用生物信息学分析筛选与肾透明细胞癌(KIRC)发生密切相关的分子生物标志物,并验证其在临床样本中的表达水平.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取KIRCⅠ期 mRNA测序数据,用主成分分析(PCA)降维处理,筛选差异表达基因...
- 概要：
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【中文期刊】 杨锦明 李玉生 等 《天津中医药大学学报》 2025年44卷3期 208-215页ISTICCA
【摘要】 [目的]研究旨在鉴定骨关节炎(OA)中的自噬相关基因,并筛选其靶向中药成分.[方法]从基因表达综合数据库下载微阵列数据集GSE55235和GSE55457进行分析.分别筛选OA样本和健康对照样本之间的差异表达基因.然后分别对GSE55235...
【关键词】 骨关节炎；自噬相关基因；加权基因共表达网络分析；
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【中文期刊】 张伟国 陆秀宏 等 《中国医学物理学杂志》 2025年42卷1期 112-121页ISTICCSCD
【摘要】 目的:通过整合DNA甲基组数据和转录组数据构建基于增强子的非小细胞肺癌预后风险模型.方法:使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)从甲基化差异位点的增强子中识别非小细胞肺癌相关基因.并基于转录组数据通过LASSO-Cox回归算法构建并验证预...
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【中文期刊】 龚小龙 李娜 等 《中国医药导报》 2025年22卷21期 8-15,100页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学和实验验证挖掘与非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)相关的肝纤维化的潜在生物标志物.方法 从基因表达GEO数据库中提取2个RNA-Seq数据集(GSE135251、GSE162694).使用加权基因共表达网络分析,鉴定了与N...
【关键词】 非酒精性脂肪性肝病；肝纤维化；加权基因共表达网络分析；
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【中文期刊】 麻忠武 彭明晖 等 《肝胆胰外科杂志》 2025年37卷6期 402-410页ISTICCA
【摘要】 目的 探究胰腺导管腺癌(PDAC)微生物亚型及其与宿主基因组、肿瘤微环境的相互作用.方法 整合来源于GEO数据库的PDAC转录组数据和来源于BioProject数据库的PDAC宏基因组数据,通过非负矩阵分解(NMF)聚类确定PDAC肿瘤微生...
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【中文期刊】 李力 何晨江 等 《南昌大学学报（医学版）》 2025年65卷3期 1-14页ISTIC
【摘要】 目的 通过多组学数据挖掘和生物信息学分析,探讨甲状腺癌与牙周炎之间的共有分子网络及炎症-肿瘤交互机制.方法 从公共数据库获取牙周组织(包括牙周炎组织和正常牙周组织)和甲状腺组织(包括甲状腺癌组织和正常甲状腺组织)样本的转录组测序数据,预处理...
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【中文期刊】 向蕊 朱利塞 等 《中国动物传染病学报》 2025年33卷1期 134-140页
【摘要】 本研究利用原核系统表达了猪瘟病毒(CSFV)Erns和E2串联蛋白,通过切胶纯化的方法得到高纯度的目的蛋白作为包被抗原,经过各反应条件的优化初步建立ELISA方法,并对方法的特异性、敏感性和重复性进行检验,与商品化试剂盒以及IFA试验进行平...
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【中文期刊】 白雪 王启彤 等 《医学理论与实践》 2025年38卷1期 1-7,13页
【摘要】 目的:ATP结合盒(ABC)转运蛋白基因家族影响动脉粥样硬化疾病的发展,通过基因表达综合数据库(GEO)数据挖掘,研究ABC转运蛋白基因家族中与动脉粥样硬化(AS)诊断相关的基因,以探索潜在的AS标志物.方法:共纳入4个备选数据集(GSE4...
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【中文期刊】 赵陆华 徐霞 等 《医学理论与实践》 2025年38卷11期 1805-1808,1819页
【摘要】 目的:通过加权基因共表达网络联合机器学习探讨鉴定中性粒细胞胞外陷阱参与川崎病(KD)的机制及关键基因.方法:从GEO数据库下载GSE68004作为实验集,GSE18606作为验证集用于本研究,使用加权基因共表达网络(WGCNA)分析川崎病的...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 赵莹莹 张毅 等 《淮海医药》 2025年43卷4期 331-335,340页CA
【摘要】 目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和机器学习算法识别正常人群和冠状动脉粥样硬化性心脏病(CAD)患者心外膜脂肪组织(EAT)中基因表达特征.方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载获得GSE64554、GSE120774、GSE...
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【中文期刊】 方小燕 陈长明 《广东化工》 2025年52卷4期 52-56页
【摘要】 miRNA-23a是一种具有调节功能的非编码小分子RNA,大小约为19～24个核苷酸,广泛地参与细胞生长、分化、凋亡等重要生命过程.本研究将具有基因调控功能的miRNA-23a分子整合到质粒中,并与携带目的基因的质粒共转染到HCT116(H...
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