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【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2012年10卷2期 58-73页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 In the realm of bioinformatics and computational biology,the most rudimentary data upon which all the analysis is built ...
【关键词】 Genome assembly； Next-generation sequencing； Comparative assembly；
【中文期刊】 《定量生物学（英文版）》 2019年7卷4期 278-292页
【摘要】 Background:De novo genome assembly relies on two kinds of graphs:de Bruijn graphs and overlap graphs.Overlap graphs are ...
【外文期刊】 Pan, Tony ; Nihalani, Rahul ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2020年17卷1期 136-148页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Si, Xiuhua ; Wang, Qian ; 等 《Bioengineered》 2017年8卷6期 750-758页
【关键词】 De Bruijn graph; gene splicing; Hadoop;
【外文期刊】 Medvedev, P ; Brudno, M ; 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2009年16卷8期 1101-1116页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Bonissone, Stefano R. ; Pevzner, Pavel A. ; 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2016年23卷6期 483-494页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 antibody repertoire analysis; immunoglobulin classification; de Bruijn graph;
【外文期刊】 Hormozdiari, Farhad ; Eskin, Eleazar ; 《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》 2015年13卷2期 MEDLINE
【关键词】 Genome assembly; De Bruijn graph; high-throughput sequencing;
【外文期刊】 Theiler James ; Korber Bette ; 《Statistics in medicine》 2018年37卷2期 181-194页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Bilal Wajid ; Erchin Serpedin ; 等 《International journal of computational biology and drug design》 2015年8卷3期 226-250页
【关键词】 next generation sequencing; genome assembly; reference assisted assembly;
【外文期刊】 Mingzhu Sun ; Erli Pang ; 等 《Molecular ecology resources》 2023年23卷2期 499-510页
【关键词】 de Bruijn graph; ploidy estimation; polyploidy;
【外文期刊】 Hosseini, Zeinab Zare ; Rahimi, Shekoufeh Kolahdouz ; 等 《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》 2021年19卷2期 MEDLINE
【关键词】 Short read genome assembly; Next Generation sequencing; de Bruijn graph;
【外文期刊】 Simpson, Jared T. ; Durbin, Richard ; 《Bioinformatics》 2010年26卷12期 i367-i373页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 vertebrate genome; sequence assembly; de Bruijn graph;
【外文期刊】 Anderson JW ; Fox KR ; 等 《Journal of Mathematical Biology》 2006年52卷3期 307-342页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 DNA sequencing; universal footprinting template; de Bruijn graph;
【外文期刊】 Wei, Ze-Gang ; Zhang, Shao-Wu ; 《Journal of Theoretical Biology》 2017年425卷 80-87页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 de Bruijn graph; Clustering; Operational taxonomic units;
【外文期刊】 Chechetkin VR. ; 《Journal of Theoretical Biology》 2003年222卷2期 177-188页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Genetic code; Molecular evolution; Mutational and translational stability;
【外文期刊】 Orenstein, Yaron ; 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2020年27卷3期 376-385页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Almodaresi, Fatemeh ; Pandey, Prashant ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2020年27卷4期 485-499页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 compression schemes; de bruijn graph; proximate membership query;
【外文期刊】 Chen, Qingfeng ; Lan, Chaowang ; 等 《Briefings in functional genomics》 2017年16卷6期 361-378页
【关键词】 DNA assembly; de Bruijn graph; fragment;
【外文期刊】 Zheng, Hongyu ; Kingsford, Carl ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2021年28卷4期 395-409页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 de Bruijn graph; depathing set; minimizers;
【外文期刊】 Pellow, David ; Pu, Lianrong ; 等 《Genome research》 2023年33卷7期 1154-1161页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 DE-BRUIJN GRAPHS; SEQUENCE;
【外文期刊】 Shulan Tian ; Huihuang Yan ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2018年19卷5期 893-904页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 de Bruijn graph; exome sequencing; human leukocyte antigen;
【外文期刊】 Wajid, Bilal ; Serpedin, Erchin ; 《Briefings in functional genomics》 2016年15卷1期 1-9页
【关键词】 genome assembly; next-generation sequencing; comparative assembly;
【外文期刊】 Nowak, Robert M. ; 《Biocybernetics and biomedical engineering》 2015年35卷4期 276-283页
【关键词】 Genome assembler; Repetitive sequences; Mathematical model;
【外文期刊】 Hongzhe Guo ; Yilei Fu ; 等 2021年18卷6期 2157-2166页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Bioinformatics; Genomics; Data structures;
【外文期刊】 Liu, Yuansheng ; Lan, Chaowang ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2020年17卷3期 899-905页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 ANTON BANKEVICH ; SERGEY NURK ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2012年19卷5期 455-477页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 assembly; de Bruijn graph; single cell;
【外文期刊】 SERGEY NURK ; ANTON BANKEVICH ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2013年20卷10期 714-737页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Navin,Rustagi ; Oliver A,Hampton ; 等 《BMC bioinformatics》 2016年17卷 188页 SCIMEDLINEBP
【关键词】 AML; Assembly; Cancer genetics;
【外文期刊】 Hongyu,Zheng ; Guillaume,Marçais ; 等 《Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology》 2023年30卷12期 1251-1276页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 de Bruijn graphs; k-mer counting; minimizers;
【外文期刊】 Alexandre,Souvorov ; Richa,Agarwala ; 《BMC bioinformatics》 2021年22卷1期 375页 SCIMEDLINEBP
【关键词】 Antimicrobial resistance; De-novo assembly; Illumina reads;
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