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            1. Attenuation of Marek's disease virus by codon pair deoptimization of a core gene

            【外文期刊】 Conrad, Steven J. ; Silva, Robert F. ; 等 《Virology》 2018年516卷 219-226页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Codon pair bias; Codon pair score; Deoptimization;

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            2. Codon pair bias deoptimization of essential genes in infectious laryngotracheitis virus reduces protein expression

            【外文期刊】 Vaz, Paola K. ; Armat, Marzieh ; 等 《The Journal of General Virology: A Federation of European Miorobiological Societies Journal》 2023年104卷4期 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 codon deoptimization; ICP8; ILTV;

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            3. Characterization of significant molecular determinants of virulence of Enterovirus 71 sub-genotype B4 in Rhabdomyosarcoma cells

            【外文期刊】 Yee, Pinn Tsin Isabel ; Mohamed, Reham Ahmed Hashim ; 等 《Virus Research: An International Journal of Molecular and Cellular Virology》 2017年238卷 243-252页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Enterovirus 71; Hand foot mouth disease; Virulence;

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            4. Codon and Codon-Pair Usage Tables (CoCoPUTs): Facilitating Genetic Variation Analyses and Recombinant Gene Design

            【外文期刊】 Alexaki, Aikaterini ; Kames, Jacob ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2019年431卷13期 2434-2441页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 codon-pair bias; codon context; dinucleotide frequency;

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            5. Betacoronaviruses genome analysis reveals evolution toward specific codons usage: Implications for SARS-CoV-2 mitigation strategies

            【外文期刊】 Lopes, Elisson N. ; Fonseca, Vagner ; 等 《Journal of Medical Virology》 2021年93卷9期 5630-5634页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 codon deoptimization; codon usage; coronaviruses;

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            6. Improved Recombinant Protein Yield Using a Godon Deoptimized DHFR Selectable Marker in a CHEF1 Expression Plasmid

            【外文期刊】 Amy D. Westwood ; Daniel A. Rowe ; 等 《Biotechnology Progress》 2010年26卷6期 1558-1566页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 codon deoptimization; recombinant protein expression; DHFR;

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            7. Codon Deoptimization of UL54 in meq-Deleted Marek's Disease Vaccine Candidate Eliminates Lymphoid Atrophy but Reduces Vaccinal Protection

            【外文期刊】 Conrad, Steven J. ; Hearn, Cari J. ; 等 《Avian Diseases》 2020年64卷3期 243-246页

            【关键词】 MDV; UL54; dicodon;

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            8. Significance of arginine 20 in the 2A protease for swine vesicular disease virus pathogenicity

            【外文期刊】 Inoue T ; Zhang ZD ; 等 《The Journal of General Virology: A Federation of European Miorobiological Societies Journal》 2007年88卷8期 2275-2279页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 COMPLETE NUCLEOTIDE-SEQUENCE; PROTEIN-SYNTHESIS; 2A PROTEASE;

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            9. Attenuation of a dengue virus replicon by codon deoptimization of nonstructural genes

            【外文期刊】 《Vaccine》 2019年37卷21期 2857-2863页

            【关键词】 Dengue; Codon deoptimization; Replicon;

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            10. Downregulating viral gene expression: codon usage bias manipulation for the generation of novel influenza A virus vaccines

            【外文期刊】 Baker, Steven F. ; Nogales, Aitor ; 等 《Future Virology》 2015年10卷6期 715-730页

            【关键词】 codon deoptimization; codon-pair bias; codon usage bias;

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            11. Rationalizing the development of live attenuated virus vaccines

            【外文期刊】 Lauring, Adam S. ; Jones, Jeremy O. ; 等 《Nature biotechnology》 2010年28卷6期 573-579页

            【关键词】 replication fidelity; codon deoptimization;

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            12. EFFECT OF MUTATION RESULTED FROM ERROR PRONE PCR ON THE STRENGTH OF PROMOTER ACTIVITY

            【外文期刊】 《Journal of Experimental Zoology India》 2019年22卷2期 981-986页

            【关键词】 Error prone PCR; promoter and deoptimization;

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            13. Vaccinia Virus Attenuation by Codon Deoptimization of the A24R Gene for Vaccine Development.

            【外文期刊】 María M,Lorenzo ; Aitor,Nogales ; 等 《Microbiology spectrum》 2022年10卷3期 e0027222页

            【关键词】 A24R gene; GFP; codon bias;

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            14. Codon pair bias deoptimization of the major oncogene meq of a very virulent Marek's disease virus.

            【外文期刊】 Pratik Hemant,Khedkar ; Nikolaus,Osterrieder ; 等 《The Journal of general virology》 2018年99卷12期 1705-1716页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Marek’s disease virus; attenuation; codon pair bias deoptimization;

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            15. Mechanism of Virus Attenuation by Codon Pair Deoptimization.

            【外文期刊】 Nicole,Groenke ; Jakob,Trimpert ; 等 《Cell reports》 2020年31卷4期 107586页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 attenuation; codon bias; codon pair bias;

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            16. Novel strategies for development of hemorrhagic fever arenavirus live-attenuated vaccines. oa

            【外文期刊】 Luis,Martinez-Sobrido ; Juan Carlos,de la Torre ; 《Expert review of vaccines》 2016年15卷9期 1113-21页 SCIMEDLINECA

            【关键词】 Candid1; Junin virus (JUNV); Lassa virus (LASV);

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            17. Scalable live-attenuated SARS-CoV-2 vaccine candidate demonstrates preclinical safety and efficacy. oa

            【外文期刊】 Ying,Wang ; Chen,Yang ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2021年118卷29期 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 COVID-19; codon deoptimization; live attenuated;

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            18. COSMO: A dynamic programming algorithm for multicriteria codon optimization. oa

            【外文期刊】 Akito,Taneda ; Kiyoshi,Asai ; 《Computational and structural biotechnology journal》 2020年18卷 1811-1818页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Codon adaptation index; Codon optimization/deoptimization; Codon pair bias;

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            19. Genetic stability of genome-scale deoptimized RNA virus vaccine candidates under selective pressure. oa

            【外文期刊】 Cyril,Le Nouën ; Thomas,McCarty ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2017年114卷3期 E386-E395页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 codon pair deoptimization; genetic stability; live attenuated vaccine;

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            20. Attenuation of a dengue virus replicon by codon deoptimization of nonstructural genes.

            【外文期刊】 Gayathri,Manokaran ; Sujatmoko ; 等 《Vaccine》 2019年37卷21期 2857-2863页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Attenuation; Codon deoptimization; Dengue;

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            21. Codon and Codon-Pair Usage Tables (CoCoPUTs): Facilitating Genetic Variation Analyses and Recombinant Gene Design.

            【外文期刊】 Aikaterini,Alexaki ; Jacob,Kames ; 等 《Journal of molecular biology》 2019年431卷13期 2434-2441页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 GenBank; codon context; codon-pair bias;

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            22. Deoptimization of FMDV P1 Region Results in Robust Serotype-Independent Viral Attenuation. oa

            【外文期刊】 Gisselle N,Medina ; Edward,Spinard ; 等 《Viruses》 2023年15卷6期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 FMDV; codon-pair bias; deoptimization;

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            23. Evaluation of Potential In Vitro Recombination Events in Codon Deoptimized FMDV Strains. oa

            【外文期刊】 Edward,Spinard ; Ian,Fish ; 等 《Viruses》 2023年15卷3期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 FMDV; codon deoptimization; foot-and-mouth disease;

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            24. Evaluation and Determination of a Suitable Passage Number of Codon Pair Deoptimized PRRSV-1 Vaccine Candidate in Pigs. oa

            【外文期刊】 Min-A,Lee ; Su-Hwa,You ; 等 《Viruses》 2023年15卷5期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 ORF7; PRRSV-1; codon pair deoptimization;

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            25. Betacoronaviruses genome analysis reveals evolution toward specific codons usage: Implications for SARS-CoV-2 mitigation strategies. oa

            【外文期刊】 Elisson N,Lopes ; Vagner,Fonseca ; 等 《Journal of medical virology》 2021年93卷9期 5630-5634页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 COVID-19; SARS-CoV-2; codon deoptimization;

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            26. Newly developed mRNA vaccines induce immune responses in Litopenaeus vannamei shrimps during primary vaccination.

            【外文期刊】 SiouNing Aileen,See ; Subha,Bhassu ; 等 《Developmental and comparative immunology》 2024年162卷 105264页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Codon deoptimization; Safety; VP28;

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            27. Vaccine candidates generated by codon and codon pair deoptimization of enterovirus A71 protect against lethal challenge in mice.

            【外文期刊】 Michelle Hui Pheng,Lee ; Chee Wah,Tan ; 等 《Vaccine》 2021年39卷12期 1708-1720页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Codon deoptimization; Codon-pair deoptimization; Deoptimization;

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            28. Use of Synonymous Deoptimization to Derive Modified Live Attenuated Strains of Foot and Mouth Disease Virus.

            【外文期刊】 Fayna,Diaz-San Segundo ; Gisselle N,Medina ; 等 《Frontiers in microbiology》 2020年11卷 610286页

            【关键词】 FMD; FMDV; attenuation;

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            29. Reduced Protein Expression in a Virus Attenuated by Codon Deoptimization. oa

            【外文期刊】 Benjamin R,Jack ; Daniel R,Boutz ; 等 《G3 (Bethesda, Md.)》 2017年7卷9期 2957-2968页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 bacteriophage T7; codon deoptimization; recoding;

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            30. Development of live-attenuated arenavirus vaccines based on codon deoptimization of the viral glycoprotein. oa

            【外文期刊】 Benson Y H,Cheng ; Aitor,Nogales ; 等 《Virology》 2017年501卷 35-46页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Arenavirus; Codon deoptimization; Codon usage;

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