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            1. Toward predictable universal genetic circuit design

            【中文期刊】 Yuanli Gao Baojun Wang  《定量生物学（英文版）》 2024年12卷2期 225-229页

            【摘要】 In the past 2 decades,synthetic biologists have applied systematic engineering principles to genetic circuit design to d...

            【关键词】 circuit predictability； genetic circuit design； host independent；

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            2. 合成基因线路的工程化设计研究进展与展望

            【中文期刊】 高歌 边旗  等 《合成生物学》 2025年6卷1期 45-64页

            【摘要】 合成基因线路利用合成生物学的技术和方法,将生物元件进行重新设计与构建,使人工设计的生物分子线路在活细胞中行使特定生物功能,在生物制造、医疗健康以及环境监测等领域具有巨大的潜力.但其工程化设计仍受到各种因素的制约,包括正交元器件数量有限、大规...

            【关键词】 合成生物学； 基因线路设计； 正交化；

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            3. Synthetic circuits, devices and modules

            【中文期刊】 《蛋白质与细胞》 2010年01卷11期 974-978页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 The aim of synthetic biology is to design artificial biological systems for novel applications. From an engineering pers...

            【关键词】 synthetic biology； genetic circuit； synthetic device；

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            4. BioMaster: An Integrated Database and Analytic Platform to Provide Comprehensive Information About BioBrick Parts.

            【外文期刊】 Beibei,Wang ; Huayi,Yang ; 等 《Frontiers in microbiology》 2021年12卷 593979页

            【关键词】 BioBrick parts; database integration; genetic circuit design;

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            5. End-to-end computational approach to the design of RNA biosensors for detecting miRNA biomarkers of cervical cancer.

            【外文期刊】 Priyannth Ramasami S,Baabu ; Shivaramakrishna,Srinivasan ; 等 《Synthetic and systems biotechnology》 2022年7卷2期 802-814页

            【关键词】 Cervical cancer biosensor; Genetic circuit design; Machine learning;

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            6. Mitigating Winner-Take-All Resource Competition through Antithetic Control Mechanism. oa

            【外文期刊】 Suchana,Chakravarty ; Rishabh,Guttal ; 等 《ACS synthetic biology》 2024年13卷12期 4050-4060页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 controller resource consumption; genetic circuit design; modularity;

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            7. Multiplexing cell-cell communication. oa

            【外文期刊】 John T,Sexton ; Jeffrey J,Tabor ; 《Molecular systems biology》 2020年16卷7期 e9618页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 CRISPRi; cell-cell communication; genetic circuit design;

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            8. Growth Defects and Loss-of-Function in Synthetic Gene Circuits.

            【外文期刊】 Evangelos-Marios,Nikolados ; Andrea Y,Weiße ; 等 《ACS synthetic biology》 2019年8卷6期 1231-1240页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 genetic burden; genetic logic gates; host-circuit interactions;

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            9. Precision design of stable genetic circuits carried in highly-insulated E. coli genomic landing pads. oa

            【外文期刊】 Yongjin,Park ; Amin,Espah Borujeni ; 等 《Molecular systems biology》 2020年16卷8期 e9584页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 gene regulatory network; genetic circuit design automation; genome editing;

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            10. Design of Four Small-Molecule-Inducible Systems in the Yeast Chromosome, Applied to Optimize Terpene Biosynthesis. oa

            【外文期刊】 Jong Hyun,Park ; Marcelo C,Bassalo ; 等 《ACS synthetic biology》 2023年12卷4期 1119-1132页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Escherichia coli Marionette; design-build-test-learn (DBTL) cycle; fungi;

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            11. Realizing Antithetic Integral Feedback Control in Mammalian Cells.

            【外文期刊】 Timothy,Frei ; Mustafa,Khammash ; 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2024年2774卷 85-98页

            【关键词】 Biomolecular control system; Genetic circuit design; Integral feedback;

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            12. Contemporary Tools for Regulating Gene Expression in Bacteria.

            【外文期刊】 Ross,Kent ; Neil,Dixon ; 《Trends in biotechnology》 2020年38卷3期 316-333页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 de-coupling growth and production; dynamic regulation; genetic circuit design;

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            13. Analysis of primitive genetic interactions for the design of a genetic signal differentiator.

            【外文期刊】 Wolfgang,Halter ; Richard M,Murray ; 等 《Synthetic biology (Oxford, England)》 2019年4卷1期 ysz015页

            【关键词】 combinatorial promoters; genetic circuit design; signal differentiator;

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            14. Memory and Combinatorial Logic Based on DNA Inversions: Dynamics and Evolutionary Stability.

            【外文期刊】 Jesus,Fernandez-Rodriguez ; Lei,Yang ; 等 《ACS synthetic biology》 2015年4卷12期 1361-72页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 design automation; genetic circuit; genetic compiler;

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            15. Bayesian Optimization for Design of Multiscale Biological Circuits. oa

            【外文期刊】 Charlotte,Merzbacher ; Oisin,Mac Aodha ; 等 《ACS synthetic biology》 2023年12卷7期 2073-2082页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Bayesian optimization; dynamic pathway control; genetic circuit design;

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            16. Automated Design of Robust Genetic Circuits: Structural Variants and Parameter Uncertainty. oa

            【外文期刊】 Tobias,Schladt ; Nicolai,Engelmann ; 等 《ACS synthetic biology》 2021年10卷12期 3316-3329页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 cell-to-cell variability; circuit synthesis; genetic design automation;

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            17. Designing Biological Circuits: From Principles to Applications.

            【外文期刊】 Debomita,Chakraborty ; Raghunathan,Rengaswamy ; 等 《ACS synthetic biology》 2022年11卷4期 1377-1388页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 biological circuits; engineering biology; gene regulatory networks;

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            18. Resource Competition Shapes the Response of Genetic Circuits.

            【外文期刊】 Yili,Qian ; Hsin-Ho,Huang ; 等 《ACS synthetic biology》 2017年6卷7期 1263-1272页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 activation cascade; context dependence; genetic circuit;

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            19. Automated design and implementation of a NOR gate in Pseudomonas putida.

            【外文期刊】 Huseyin,Tas ; Lewis,Grozinger ; 等 《Synthetic biology (Oxford, England)》 2021年6卷1期 ysab024页

            【关键词】 Pseudomonas putida; computer-assisted design; genetic circuit;

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            20. Mitigating Host Burden of Genetic Circuits by Engineering Autonegatively Regulated Parts and Improving Functional Prediction.

            【外文期刊】 Ying,Guan ; Xinmao,Chen ; 等 《ACS synthetic biology》 2022年11卷7期 2361-2371页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 burden-free constraint; direct negative feedback; function dysregulation;

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            21. Algorithmic Programming of Sequential Logic and Genetic Circuits for Recording Biochemical Concentration in a Probiotic Bacterium. oa

            【外文期刊】 Matthew,Lebovich ; Min,Zeng ; 等 《ACS synthetic biology》 2023年12卷9期 2632-2649页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 engineered probiotic; genetic circuit design; genetically encoded biosensor;

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            22. Synthetic Biological Circuits within an Orthogonal Central Dogma. oa

            【外文期刊】 Alan,Costello ; Ahmed H,Badran ; 《Trends in biotechnology》 2021年39卷1期 59-71页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 bioengineering; biological orthogonalization; directed evolution;

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            23. Mechanistic modelling of tyrosine recombination reveals key parameters determining the performance of a CAR T cell switching circuit.

            【外文期刊】 Jack E,Bowyer ; Deboki,Chakravarti ; 等 《Engineering biology》 2020年4卷1期 10-19页

            【关键词】 CAR T cell; DNA; FlpO recombinase;

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            24. A domain swapping strategy to create modular transcriptional regulators for novel topology in genetic network. oa

            【外文期刊】 Clement T Y,Chan ; Vincenzo,Kennedy ; 等 《Biotechnology advances》 108345页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Domain swapping; Genetic circuit design; Protein engineering;

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            25. Design of Four Small-Molecule-Inducible Systems in the Yeast Chromosome, Applied to Optimize Terpene Biosynthesis

            【外文期刊】 Park, Jong Hyun ; Bassalo, Marcelo C. ; 等 《ACS Synthetic Biology》 2023年12卷4期 1119-1132页

            【关键词】 synthetic biology; systems biology; Escherichia coli Marionette;

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            26. Mitigating Host Burden of Genetic Circuits by Engineering Autonegatively Regulated Parts and Improving Functional Prediction

            【外文期刊】 Guan, Ying ; Chen, Xinmao ; 等 2022年11卷7期 2361-2371页

            【关键词】 genetic circuit; growth burden; function dysregulation;

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            27. Resource Competition Shapes the Response of Genetic Circuits

            【外文期刊】 《ACS Synthetic Biology》 2017年6卷7期 1263-1272页

            【关键词】 genetic circuit; context dependence; modularity;

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            28. Novel High-Throughput DNA Part Characterization Technique for Synthetic Biology

            【外文期刊】 Bak, Seong-Kun ; Seong, Wonjae ; 等 2022年32卷8期 1026-1033页 SCIEMEDLINE

            【关键词】 Synthetic biology; DNA parts; circuit design;

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            29. Algorithmic Programming of Sequential Logic and Genetic Circuits for Recording Biochemical Concentration in a Probiotic Bacterium

            【外文期刊】 Lebovich, Matthew ; Zeng, Min ; 等 《ACS Synthetic Biology》 2023年12卷9期 2632-2649页

            【关键词】 genetic circuit design; living diagnostics; engineered probiotic;

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            30. Memory and Combinatorial Logic Based on DNA Inversions: Dynamics and Evolutionary Stability

            【外文期刊】 Fernandez-Rodriguez, Jesus ; Yang, Lei ; 等 《ACS Synthetic Biology》 2015年4卷12期 1361-1372页

            【关键词】 synthetic biology; systems biology; genetic circuit;

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