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【中文期刊】 彭乔木 范诗秋  等 《吉首大学学报（自然科学版）》 2024年45卷5期 52-60页

【摘要】 为了阐明前列腺增生患者术前和术后尿液菌群特征,探究差异微生物类群发挥作用的机理,采用宏基因组鸟枪法对健康人群(对照)、前列腺增生患者术前和术后尿液样品进行测序,并利用相关软件进行生物信息学分析.结果表明:尿液微生物多样性呈现出术前组明显低于...

【关键词】 前列腺增生； 尿液菌群； 宏基因组测序；

【中文期刊】 刘芳 舒志强  等 《食品科学》 2024年45卷22期 73-84页

【摘要】 为了详细解析从仿刺参肠道中分离出1 株具有较高酶活力高产褐藻胶裂解酶菌株S10的基因组序列信息,进而深入挖掘与褐藻胶裂解酶相关的基因资源,本研究通过形态学观察和16S rRNA序列分析对菌株S10进行菌种鉴定,然后利用Illumina二代测...

【关键词】 褐藻胶裂解酶； 溶藻弧菌； 全基因组测序；

【中文期刊】 马浩天 李杨  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷12期 5117-5127页

【摘要】 [目的]贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)CM7-4是从海水中分离的具有良好抗菌活性的芽孢杆菌.本试验旨在探究贝莱斯芽孢杆菌CM7-4的抗菌机理,并对其全基因组序列进行分析,以期挖掘其抗菌等功能特性基因.[方法]通过酸...

【关键词】 芽孢杆菌； 全基因组测序； 细菌素；

【中文期刊】 罗婷 韩著  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷5期 2154-2167页

【摘要】 旨在进一步完善牛支原体全基因组数据库,阐明其生物学功能和遗传进化关系,对西藏牦牛源牛支原体T10株进行了全基因组测序及其序列分析.使用Nanopore和Illumina PE150测序平台对T10株进行全基因组序列测定,利用生物信息学对其进...

【关键词】 牦牛； 牛支原体； 全基因组测序；

【中文期刊】 郑雪 梁琪  等 《食品科学》 2023年44卷20期 119-126页

【摘要】 融合魏斯氏菌(Weissella confusa)ZW2 1是1 株具有良好抗菌活性的牦牛乳源乳酸菌,为探索其抗菌机理,分析其全基因组序列并挖掘该菌株的抗菌等功能特性基因.本研究基于Illumina NovaSeq PE150平台对W.co...

【关键词】 牦牛乳； 融合魏斯氏菌； 全基因组测序；

【中文期刊】 蒲思成 郑惠滨  等 《中国畜牧兽医》 2023年50卷11期 4545-4556页

【摘要】 [目的]本研究旨在通过研究1株牦牛源产细菌素屎肠球菌SWUN5732的基因组序列,发掘该菌种的关键功能性特征基因.[方法]通过Illumina PE150测序系统,对屎肠球菌SWUN5732进行基因组测序,并在GO、KEGG、COG和NR数...

【关键词】 牦牛酸奶； 屎肠球菌； 基因测序；

【中文期刊】 薛倩 邢伟杰  等 《中国畜牧兽医》 2023年50卷10期 3869-3881页

【摘要】 [目的]汶上芦花鸡为中国唯一的芦花羽地方鸡品种资源,芦花基因可伴性遗传,芦花羽性状可用于雏鸡的自别雌雄.试验旨在丰富家鸡基因组信息,获取汶上芦花鸡全基因组序列,为鸡伴性芦花羽分子机制研究提供材料.[方法]以汶上芦花鸡为试验动物,基于BGI ...

【关键词】 汶上芦花鸡； 基因组组装； PacBio三代测序技术；

【中文期刊】 王舸楠 李佳谦  等 《食品科学》 2023年44卷16期 213-219页

【摘要】 通过PacBio Sequel II及Illumina NovaSeq 6000测序平台对高产聚苹果酸(polymalic acid,PMLA)产黑色素短梗霉(Aureobasidium melanogenum)基因组进行测序,对测序得到的...

【关键词】 聚苹果酸； 产黑色素短梗霉； 基因组测序；

【中文期刊】 晋家正 李午佼  等 《四川动物》 2018年37卷2期 121-126页 ISTICPKU

【摘要】 以美洲大蠊Periplaneta americana为原料生产的康复新液等药品临床疗效显著,得到了广泛应用.本文以四川好医生攀西药业有限责任公司饲养的药用美洲大蠊为材料,首次采用Illumina HiSeq 2000和PacBio SMRT...

【关键词】 美洲大蠊； 药用昆虫； 全基因组测序；

【中文期刊】 王琦 陈秀玲  等 《微生物学通报》 2024年51卷8期 2986-3003页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 [背景]根际土壤中分布着丰富的微生物类群,其中不少微生物具有拮抗病原菌的能力,以此保护植株免受病害侵袭.[目的]分离并鉴定出一株具有促生作用的生防细菌,从基因组学与生物信息学角度探究生防菌的抑菌机制.[方法]采用平板稀释涂布法筛选出具有拮抗...

【关键词】 生防细菌； 拮抗作用； 全基因组测序；

【中文期刊】 张高川 王大慧  等 《基因组学与应用生物学》 2017年36卷11期 4693-4700页 ISTICPKUCSCDCA

【关键词】 出芽短梗霉； 全基因组； 测序；

【中文期刊】 Yisong Liu Qi Tang  等 《药学学报（英文版）》 2020年10卷2期 374-382页

【关键词】 Gelsemium elegans； Nanopore sequencing； Genome assembly；

【中文期刊】 陈勇 柳亦松  等 《生命科学研究》 2014年18卷1期 66-74页 ISTICCA

【关键词】 植物基因组测序； 三代测序； 组装；

【中文期刊】 刘君彦 李琳  等 《现代食品科技》 2015年31卷11期 155-162页

【摘要】 本文应用De novo测序技术对一种未经测序的啤酒易感乳杆菌进行全基因组研究,包括全基因组遗传信息的首次获取以及基因功能的生物信息学分析与注释.通过对1株从啤酒中分离获得的乳杆菌基因组DNA进行提取与纯化,构建了符合质量要求的测序文库,并进...

【关键词】 啤酒易感乳杆菌； De novo测序； 全基因组信息；

【外文期刊】 Wu CH ; Huang HZ ; 等 《Computational biology and chemistry》 2003年27卷1期 37-47页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 data integration; knowledge base; protein annotation;

【外文期刊】 Giglio, Michelle G. ; Collmer, Candace W. ; 等 《Trends in Microbiology》 2009年17卷7期 262-268页 SCISCIE

【关键词】 genome annotation; symbiotic interaction; gene ontology;

【外文期刊】 Zhang, Ying ; Zhang, Yanying ; 等 2021年60卷

【关键词】 Genome sequence; Metabacillus; Settlement and metamorphosis;

【外文期刊】 《Fungal Genetics and Biology》 2021年152卷 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Tan spot of wheat; Genetic mapping; ToxA;

【外文期刊】 Fleming K ; Kelley LA ; 等 《Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B. Biological Sciences》 2006年361卷1467期 441-451页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 bioinformatics; proteome annotation; protein function;

【外文期刊】 Jensen KT ; Petersen L ; 等 《FEMS Microbiology Letters》 2006年265卷1期 106-117页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Chlamydia trachomatis; gene prediction; overlapping genes;

【外文期刊】 Huang, Zekun ; Huang, Wanlong ; 等 2022年22卷1期 15-27页

【关键词】 evolution; genome organization; Nautilus pompilius;

【外文期刊】 Gross SS ; Brent MR ; 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2006年13卷2期 379-393页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 gene prediction; genome annotation; comparative genomics;

【外文期刊】 Du, Yuhui ; Zou, Jinrong ; 等 《Microbiology Spectrum》 2023年11卷2期

【关键词】 Agrobacterium fabrum; pan-chromosome; genetic diversity;

【外文期刊】 Umlai, Umm-Kulthum Ismail ; Bangarusamy, Dhinoth Kumar ; 等 2022年23卷1期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 rare diseases; whole genome sequencing; variant interpretation;

【外文期刊】 Horsch M ; Schadler S ; 等 《Proteomics》 2008年8卷6期 1248-1256页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 gene expression profiling; mutant mouse strains; synexpression groups;

【外文期刊】 Belova, I. V. ; Tochilina, A. G. ; 等 《Microbiology》 2019年88卷3期 309-315页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Escherichia coli M-17; full genome sequencing; genome annotation;

【外文期刊】 Ng KP ; Yew SM ; 等 《Eukaryotic cell》 2012年11卷5期 705-706页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Base Composition; Base Sequence; Cladosporium;

【外文期刊】 Ganbat, Dariimaa ; Oh, DoKyung ; 等 《Antonie van Leeuwenhoek: Journal of Microbiology and serology》 2023年116卷8期 791-799页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Brachybacterium; Brachybacterium sillae; Hot spring;

【外文期刊】 Sarac OS ; Gursoy-Yuzugullu O ; 等 《Computational biology and chemistry》 2008年32卷2期 122-130页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 protein function prediction; subsequence distribution; function classification;

【外文期刊】 《Virology》 2012年434卷2期 175-180页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Biological sequence databases; Genome annotation; Viral genomics;