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【中文期刊】 Xue Sun Wei Zhang 等 《遗传学报》 2025年52卷1期 93-104页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Recent advances in spatially resolved transcriptomics(SRT)have provided new opportunities for charac-terizing spatial st...
【关键词】 Spatial domain identification；Spatially resolved transcriptomics；Multi-head graph attention networks；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Mengnan Cheng Yujia Jiang 等 《遗传学报》 2023年50卷9期 625-640页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The ability to explore life kingdoms is largely driven by innovations and breakthroughs in technology,from the invention...
【关键词】 Spatially resolved transcriptomics；Bioinformatic tools；Spatial single-cell；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Yanhe Zhou Xinyi Jiang 等 《药物分析学报（英文版）》 2023年13卷8期 851-861页SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Tumors are spatially heterogeneous tissues that comprise numerous cell types with intricate structures.By interacting wi...
【关键词】 Tumor；Spatially resolved transcriptomics；Spatially resolved metabolomics；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 冯爱静 王文淼 等 《生物医学工程研究》 2024年43卷6期 468-474页ISTIC
【摘要】 为缓解空间转录组学数据因高离散性、稀疏性和分辨率受限导致空间域识别精度低的问题,基于多尺度邻域特征融合策略,本研究提出了一种空间域识别方法stMSAA.本研究在人类背外侧前额叶皮层数据集和人类乳腺癌数据集上进行实验,调整兰德系数、归一化互信...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Yijia Fangma Mengting Liu 等 《药物分析学报（英文版）》 2023年13卷7期 694-710页SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Recent studies have highlighted spatially resolved multi-omics technologies,including spatial genomics,transcriptomics,p...
【关键词】 Central nervous system disorders；Multi-omics；Spatial transcriptomics；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Yuying Huo Jiakang Wang 等 《遗传学报》 2024年51卷12期 1505-1508页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Human cancer is one of the leading causes of death worldwide.Tumor heterogeneity and complex microenvironment are major ...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Guang-Hui Tan Shi-Jie Liu 等 《动物学研究》 2024年45卷3期 586-600页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 The placenta plays a crucial role in successful mammalian reproduction.Ruminant animals possess a semi-invasive placenta...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Lidong Guo Yao Li 等 《遗传学报》 2023年50卷9期 713-719页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Data visualization empowers researchers to communicate their results that support scientific reasoning in an intuitive w...
【关键词】 Spatially resolved transcriptomics；Stereo-seq；Spatial transcriptomics；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Duan Honglin Cheng Tao 等 《血液科学（英文）》 2023年05卷1期 1-14页
【摘要】 Spatial transcriptomics, which is capable of both measuring all gene activity in a tissue sample and mapping where this ...
【关键词】 In situ hybridization；In situ sequencing；Spatially resolved multi-omics；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Asp, Michaela ; Bergenstrahle, Joseph ; 等 《BioEssays :》 2020年42卷10期 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 gene expression;RNA;RNA-sequencing;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Strell, Carina ; Hilscher, Markus M. ; 等 《The FEBS journal》 2019年286卷8期 1468-1481页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 cell profiling;gene expression maps;in situ sequencing;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Safieddine, Adham ; Coleno, Emeline ; 等 《Nature protocols erecipes for researchers》 2023年18卷1期 157-187页
【关键词】 SPATIALLY-RESOLVED TRANSCRIPTOMICS;IN-SITU;LOCALIZATION;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Zhang Chuanchao ; Li Xinxing ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷4期 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 spatially resolved transcriptomics;spatial domain identification;spatial information;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Zeng, Hongkui ; 《Cell》 2022年185卷15期 2739-2755页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 SPATIALLY-RESOLVED TRANSCRIPTOMICS;NERVOUS-SYSTEM;GABAERGIC INTERNEURONS;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Shi Xuejing ; Zhu Juntong ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷5期 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 spatially resolved transcriptomics;spatial domain identification;different similarity measures;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Dai, Min ; Pei, Xiaobing ; 等 2022年23卷2期 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 cell marker gene;cosine similarity;single-cell RNA-seq;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Carina,Strell ; Markus M,Hilscher ; 等 《The FEBS journal》 2019年286卷8期 1468-1481页SCIMEDLINECABP
【关键词】 cell profiling;gene expression maps;in?situ sequencing;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Dan,Liu ; Lu,Xiao ; 等 《Small methods》 2025年9卷11期 e00770页
【关键词】 cancer immunotherapy;spatially resolved transcriptomics;tumor microenvironment;
- 概要：
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- 结论：
【外文期刊】 Lidong,Guo ; Yao,Li ; 等 《Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao》 2023年50卷9期 713-719页
【关键词】 3D visualization;Data sharing;MERFISH;
- 概要：
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- 结论：
【外文期刊】 Sergio,Marco Salas ; Daniel,Gyllborg ; 等 《BMC bioinformatics》 2021年22卷1期 391页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Analysis toolbox;In situ sequencing;Probabilistic cell typing;
- 概要：
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- 结论：
【外文期刊】 Eliah G,Overbey ; Saswati,Das ; 等 《Cell reports methods》 2022年2卷11期 100325页
【关键词】 RNA-sequencing;single-cell;spaceflight;
- 概要：
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- 结论：
【外文期刊】 Jie,Liao ; Xiaoyan,Lu ; 等 《Trends in biotechnology》 2021年39卷1期 43-58页SCIMEDLINECABP
【关键词】 fluorescence in situ hybridization;in situ sequencing;single-cell RNA-seq;
- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 Elin,Lundin ; Chenglin,Wu ; 等 《BMC biology》 2020年18卷1期 6页SCIMEDLINEBP
- 概要：
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【外文期刊】 Boyi,Guo ; Wodan,Ling ; 等 《ArXiv》
【关键词】 Spatially-resolved transcriptomics;integrative analysis;multi-sample;
- 概要：
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- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 Xiaosheng,Bai ; Xinyu,Bao ; 等 《Small methods》 2025年9卷7期 e2402111页
【关键词】 dynamic graph convolution;graph convolutional network;spatial domain identification;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Lequn,Wang ; Yaofeng,Hu ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2024年25卷4期 SCIMEDLINEBP
【关键词】 spatial distribution alignment;spatial domain identification;spatially resolved transcriptomics;
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【外文期刊】 Sebastian,Tiesmeyer ; Shashwat,Sahay ; 等 《Frontiers in genetics》 2022年13卷 785877页
- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 Oscar,Ospina ; Alex,Soupir ; 等 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2023年2629卷 115-140页
- 概要：
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【外文期刊】 Eirini,Kalliara ; Emma,Belfrage ; 等 《Cancers》 2023年15卷8期 SCIMEDLINEBP
【关键词】 biomarker discovery;cutaneous T-cell lymphoma;mycosis fungoides;
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