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【中文期刊】 卢頔 郑若函 等 《现代畜牧兽医》 2024年12期 1-7页
【摘要】 试验旨在分析并比较弓形虫(Toxoplasma gondii)与部分顶复门原虫、模式生物的硫氧还蛋白(thioredoxin,Trx)密码子的使用偏好性.试验获取弓形虫、疟原虫、新孢子虫、球虫、小鼠、大鼠、斑马鱼、果蝇、人等的Trx碱基序列...
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【中文期刊】 许育铭 齐婷 等 《东南大学学报（英文版）》 2021年37卷2期 177-183页
【摘要】 为探索同义密码子对RNA G-四联体(rG4)形成的适应效应,利用G4 Hunter算法搜寻5类真核生物mRNA蛋白编码区的rG4结构.通过对比天然序列和随机序列,评估rG4结构对同义密码子的选择偏好,分析影响rG4形成的因素,检验基因特定...
- 概要：
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【中文期刊】 唐晓芬 陈莉 等 《基因组学与应用生物学》 2013年5期 660-666页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 在基因组学水平上研究密码子使用偏性模式、成因并分析进化过程中的选择压力在基因组学研究中有重要意义。文章概述了目前提出的密码子使用偏性的量化方法及实现原理。目前研究发现：有些量化密码子偏性的方法受高表达基因参考数据集未完全注释的限制，不同密码...
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【外文期刊】 Urbina D ; Tang B ; 等 《Journal of Molecular Evolution》 2006年62卷3期 340-361页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 mitochondrial genomes;directional mutation pressure;genetic code;
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【外文期刊】 Fages-Lartaud, Maxime ; Hundvin, Kristoffer ; 等 《The Plant Journal》 2022年112卷4期 919-945页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 chloroplast;genetic code;codons;
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【外文期刊】 Rispe C ; Legeai F ; 等 《Journal of Molecular Evolution》 2007年65卷4期 413-424页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 codon bias;translational selection;ribosomal proteins;
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【外文期刊】 Pedersen, Steen ; Terkelsen, Thilde Bagger ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2019年431卷6期 1088-1097页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 translation velocity;synonymous codons;mRNA half-life;
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【外文期刊】 Webster, Gina R. ; Teh, Audrey Y. -H. ; 等 《Biotechnology and Bioengineering》 2017年114卷3期 492-502页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 synonymous codons;heterologous protein expression;genetic code;
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【外文期刊】 Lithwick G ; Margalit H ; 《Nucleic Acids Research》 2005年33卷3期 1051-1057页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 PATHOGEN XYLELLA-FASTIDIOSA;SYNONYMOUS CODON CHOICE;TRANSFER-RNA GENES;
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【外文期刊】 McVean GAT. ; Vieira J. ; 《Journal of Molecular Evolution》 1999年49卷1期 63-75页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Morton BR. ; 《Journal of Molecular Evolution》 2003年56卷5期 616-629页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Transition;Transversion;Mutation bias;
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【外文期刊】 de Miranda AB. ; Jabbari K. ; 等 《Journal of Molecular Evolution》 2000年50卷1期 45-55页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Codon usage;Translational selection;Synonymous substitution;
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【外文期刊】 Youhua Chen ; You-Fang Chen ; 《VirusDisease》 2014年25卷3期 285-293页
【关键词】 Synonymous substitution;Multivariate statistics;Optimal codons;
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【外文期刊】 Pluhar W ; 《Journal of Theoretical Biology》 2006年243卷3期 308-321页SCISCIEMEDLINE
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【外文期刊】 Takeuchi F. ; Futamura Y. ; 等 《Journal of Theoretical Biology》 2003年222卷2期 139-149页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Statistics of trinucleotides;Coding sequence;Codon space;
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【外文期刊】 Kliman RM. ; Irving N. ; 等 《Journal of Molecular Evolution》 2003年57卷1期 98-109页SCISCIEMEDLINE
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【外文期刊】 Sueoka N ; 《Journal of Molecular Evolution》 2001年53卷4/5期 469-476页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Pr2 biases fingerprints;Dna g plus c contents;Phylogenetic analyses;
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【外文期刊】 Musto H ; Cruveiller W ; 等 《Molecular biology and evolution》 2001年18卷9期 1703-1707页SCISCIEMEDLINE
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【外文期刊】 Mondal, Sunil Kanti ; Shit, Subhadeep ; 等 《Indian Journal of Biotechnology》 2013年12卷1期 58-66页
【关键词】 Codon adaptation index (CAI);Expected effective number of codons (ENc);Ribulose-1;
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【外文期刊】 Smith NGC ; Eyre-Walker A ; 《Molecular biology and evolution》 2001年18卷6期 982-986页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Human;Synonymous codons;Mutation bias;
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【外文期刊】 Vasquez, Kevin A. ; Hatridge, Taylor A. ; 等 《ACS Synthetic Biology》 2016年5卷2期 133-145页
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【外文期刊】 Charlotte M. Deane ; Rhodri Saunders ; 《Biotechnology Journal: Healthcare,Nutrition,Technology》 2011年6卷6期 641-649页MEDLINE
【关键词】 Codon usage;In vivo protein folding;Synonymous codons;
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【外文期刊】 Ohta T. ; 《BioEssays: news and reviews in molecular, cellular and developmental biology》 1996年18卷8期 673-677页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Dna-sequence variation;Drosophila-melanogaster;Nonsynonymous substitutions;
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【外文期刊】 Daewoo Pak ; Yunsoo Kim ; 等 《Transcription》 2018年9卷1/5期 205-224页
【关键词】 The last universal common cellular ancestor;cloverleaf tRNA;standard genetic code;
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【外文期刊】 Helfenbein KG ; Brown WM ; 等 《Molecular biology and evolution》 2001年18卷9期 1734-1744页SCISCIEMEDLINE
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【外文期刊】 Kattoor, Jobin Jose ; Malik, Yashpal Singh ; 等 《Infection, Genetics and Evolution: Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases》 2015年34卷 17-25页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Avian rotavirus;VP6 gene;Relative synonymous codon usage;
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【外文期刊】 Yang, Qian ; Lyu, Xueliang ; 等 《Nucleic Acids Research》 2021年49卷2期 SCISCIEMEDLINE
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【外文期刊】 Chen R ; Yan H ; 等 《DNA Sequence: The Journal of DNA Sequencing and Mapping》 2007年18卷4期 269-278页SCIMEDLINE
【关键词】 GC nucleotide composition;mechanosensitive channel genes;principal component analysis;
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【外文期刊】 Deng, Youjin ; Huang, Xiaoxing ; 等 《World Journal of Microbiology & Biotechnology》 2015年31卷11期 1691-1698页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Genome sequencing;cDNA library;Relative synonymous codon usage;
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