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            【中文期刊】 张婷  万雨欣  等 《生物技术通报》 2025年41卷1期 263-275页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]有益植物根际微生物通过加强土壤与农作物间互作以促进农作物生长.菌株LN01是一株玉米根际促生菌,探究菌株LN01对玉米植株生长的促进机制.[方法]采用16S rRNA和全基因组学测序,明确菌株LN01分类学地位;其次,通过盆栽实验验...

            【关键词】 Leclercia adecarboxylata LN01根际促生菌全基因组测序

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            【中文期刊】 王娜娜  贾媛  等 《中国热带医学》 2025年25卷3期 333-338页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 探索内蒙古鄂尔多斯市布鲁菌的全基因组结构,进行生物信息学分析,探讨多种布鲁菌种型鉴定方法,为鄂尔多斯市布鲁菌的研究提供理论基础.方法 采用illumina Miseq基因测序仪进行全基因组测序,运用Microobench病原微生物基因...

            【关键词】 布鲁菌全基因组测序种型鉴定

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            【中文期刊】 马晋哲  梁玉凤  等 《中国热带医学》 2025年25卷1期 110-116页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 分析2023年广州市登革病毒2型(dengue serotype 2 virus,DENV-2)分离株的全基因组序列特征,为本地登革热防控提供新的基础数据.方法 使用C6/36细胞分离登革热患者血清中的登革病毒,使用纳米孔测序技术(N...

            【关键词】 登革热登革病毒2型全基因组测序

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            【中文期刊】 龚文平  陈文  《中国热带医学》 2024年24卷1期 12-17页ISTICPKUCA

            【摘要】 结核病是全球死亡人数最多的传染病之一.传统的诊断方法存在局限性,而分子生物学技术的应用为结核诊断和治疗提供了新的途径.本文重点介绍和讨论4种分子生物学方法的应用情况,包括环介导等温扩增(loop-mediated isothermal am...

            【关键词】 结核病分子生物学介导等温扩增

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            【中文期刊】 曹冉冉  刘晨霞  等 《疾病监测》 2024年39卷8期 989-994页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 分析四川省首例猴痘病例感染病毒全基因组特征,为猴痘防控工作提供基础资料.方法 采集病例咽拭子和疱疹液拭子提取核酸,用实时荧光聚合酶链式反应(PCR)进行初筛,确认阳性后用纳米孔测序进行全基因组测序.测序数据用Minimap2 v2.1...

            【关键词】 猴痘猴痘病毒全基因组测序

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            【中文期刊】 文金洲  李柏生  等 《中国热带医学》 2024年24卷6期 714-720页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 分析2022年潮州市非伤寒沙门菌血清型、耐药性及分子流行病学特征,为有效防控食源性疾病的发生提供病原学支持.方法 2022年通过广东省潮州市哨点监测和食品风险监测,分离人源非伤寒沙门菌和食品来源非伤寒沙门菌,并对菌株开展血清学分型、药...

            【关键词】 非伤寒沙门菌血清分型药敏试验

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            【中文期刊】 胡敏玲  张晓晴  等 《中国热带医学》 2024年24卷10期 1166-1172,1216页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 基于全球统一DENV-1基因分型协同监测策略构建纳米孔测序溯源技术体系,并初步应用于患者血清样本测试.方法 基于全球DENV整合序列资源数据库GISDD v1.2.1中DENV-1全基因组序列集,利用MEGA 7.0、primer-B...

            【关键词】 登革病毒纳米孔测序全基因组

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            【中文期刊】 孙亚楠  王春雪  等 《生物技术通报》 2024年40卷5期 248-260页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]从黄河三角洲盐碱地中筛选到具有抗盐促生作用的一株根际菌,制成菌剂用于缓解玉米植株的高盐胁迫.[方法]通过功能培养基、16S rDNA序列和全基因组分析,确定菌株种属以及对玉米植株的抗盐促生效果.[结果]从黄河三角洲盐碱地中筛选到一株...

            【关键词】 玉米植物根际促生细菌萎缩芽孢杆菌

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            【中文期刊】 赵竟男  江友桥  等 《疾病监测》 2024年39卷2期 161-165页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 从病原学角度分析江西省某高校一起学校结核病疫情的传播情况,探讨两种基因分型方法在学校结核病疫情处置中的作用.方法 对2022年江西省某高校一起结核病疫情处置可疑者筛查对象进行涂片、分离培养、Xpert MTB/RIF检测,对获得16株...

            【关键词】 高校疫情结核病

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            【中文期刊】 钟业腾  王洁莹  等 《中国热带医学》 2024年24卷4期 443-449,494页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 探讨耐多药结核病(multidrug-resistant tuberculosis,MDR-TB)的近期传播相关影响因素,以期为海南省MDR-TB防控及临床提供流行病学依据.方法 收集2019年7月-2021年6月在海南医学院第二附属...

            【关键词】 耐多药结核病结核分枝杆菌危险因素

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            【中文期刊】 陈雨顺  张丽玲  等 《中国热带医学》 2024年24卷11期 1328-1334页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 探讨广州市某医院2021-2023年临床分离的耐碳青霉烯大肠埃希菌(carbapenem-resistant Esche-richia coli,CREC)的流行病学特征,为CREC感染的防控提供科学依据.方法 收集2021-2023...

            【关键词】 耐碳青霉烯大肠埃希菌ST410细菌耐药

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            【中文期刊】 田彤彤  葛家振  等 《生物技术通报》 2024年40卷7期 323-334页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]全面了解绵羊肺炎支原体GH3-3 株的基因序列,研究其潜在的致病机制及其复制、转录、翻译过程的调控机制.[方法]采用体外培养,利用细菌基因组DNA提取试剂盒提取绵羊肺炎支原体GH3-3 株基因组DNA,进行全基因组测序.[结果]绵羊...

            【关键词】 绵羊肺炎支原体GH3-3株全基因组测序

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            【中文期刊】 王利  任红宇  等 《疾病监测》 2024年39卷4期 505-510页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 探讨安徽省马鞍山市公共洗浴场所淋浴水中嗜肺军团菌的污染状况及分布,分析分离菌株全基因组信息及毒力基因和耐药基因预测情况,为军团菌病防控提供数据支撑.方法 2020-2021年,从马鞍山市区3个行政区内49家公共洗浴场所采集216份淋浴...

            【关键词】 嗜肺军团菌全基因组测序毒力基因

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            【中文期刊】 赵莹  董昕  等 《中国热带医学》 2024年24卷11期 1376-1382页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 了解江苏省常州市食源性沙门菌的血清型分布情况、耐药特征及其进化关系,为食源性沙门菌的有效防控提供科学依据.方法 对2021-2023年常州市食源性疾病监测哨点医院腹泻患者粪便标本中分离的117株沙门菌进行血清型鉴定、药物敏感性试验及全...

            【关键词】 沙门菌血清型耐药基因

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            【中文期刊】 唐志坚  李崇亥  等 《中国热带医学》 2024年24卷11期 1396-1399页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 对青海省2023年5岁以下腹泻住院病例开展札如病毒监测,初步研究札如病毒阳性率和流行的基因型别,积累我省札如病毒感染的分子流行病学基础资料.方法 2023年在青海省妇女儿童医院设立监测哨点,按《全国病毒性腹泻监测方案》(2021版)要...

            【关键词】 札如病毒病毒性腹泻全基因测序

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            【中文期刊】 黄世旺  刘倩  等 《疾病监测》 2024年39卷6期 799-804页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 了解2023年2月浙江省杭州市某学校发生的一起聚集性腹泻疫情的流行病学及病原学特征.方法 对该起聚集性疫情开展流行病学调查,并采集腹泻患者肛拭子、食品留样及环境样品进行病原体快速筛查和分离鉴定,对分离的病原菌进行药敏试验和全基因组测序...

            【关键词】 艾伯特埃希菌肠致病性大肠埃希菌聚集性疫情

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            【中文期刊】 李颖  周贵兰  等 《疾病监测》 2024年39卷6期 732-737页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 基于腹泻病原学监测进行弓形杆菌分离和病原特征分析,为该病原导致腹泻相关研究提供基础数据.方法 收集2021-2023年北京市某区腹泻患者基础信息和临床症状信息,采集患者粪便标本进行弓形杆菌培养并使用荧光聚合酶链式反应(PCR)方法进行...

            【关键词】 弓形杆菌腹泻全基因组测序

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            【中文期刊】 刘明香  张静  等 《中国热带医学》 2024年24卷11期 1363-1369页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 了解2023年2-11月上海市虹口区冷冻生禽肉中大肠埃希菌的污染状况及其携带多黏菌素mcr-1耐药基因的分布和遗传特征.方法 2023年2-11月在上海市虹口辖区的农贸市场、商店、饭店和网店等4类场所随机采集鸡、鸭、鸽子等3类生禽肉共...

            【关键词】 生禽肉肠聚集性大肠埃希菌多黏菌素耐药基因

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            【中文期刊】 林文桢  刘秀峰  等 《中国热带医学》 2024年24卷6期 727-733页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 对2018-2023年福州市分离的霍乱弧菌进行全基因组测序,预测毒力基因、耐药基因和序列位点信息,分析不同菌株间遗传关系,为防治霍乱提供依据.方法 对60株霍乱弧菌进行全基因组序列测定,运用生物信息学软件对测序数据进行质控、基因组装和...

            【关键词】 霍乱弧菌全基因组测序多位点序列分型

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            【中文期刊】 徐奥博  杨阳  等 《疾病监测》 2024年39卷9期 1210-1216页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 了解江苏省临床分离的耐碳青霉烯铜绿假单胞菌的耐药、血清型及基因特征.方法 收集2016-2023年江苏省各哨点医院临床分离的耐碳青霉烯铜绿假单胞菌,采用肉汤稀释法对分离株进行10类19种抗生素的敏感性测定,将分离株全基因组测序并多位点...

            【关键词】 铜绿假单胞菌碳青霉烯耐药耐药性

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            【中文期刊】 王梓  石金川  等 《生物技术通报》 2024年40卷12期 282-290页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]对乌拉盖管理区分离的牛源巴氏杆菌进行荚膜血清分型,对不同血清型菌株进行全基因组测序及基因组进化分析.[方法]对肉牛肺脏进行病原菌分离纯化、16SrRNA鉴定、荚膜血清型分型、药敏试验和小鼠致病性实验;对不同血清型巴氏杆菌进行全基因组...

            【关键词】 多杀性巴氏杆菌荚膜血清型

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            【中文期刊】 周文浩  《临床儿科杂志》 2024年42卷5期 379-383页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 随着科技的进步,新生儿遗传疾病的筛查与诊断技术已经取得了巨大的飞跃,特别是下一代测序(NGS)技术的应用,极大地提高了临床应用的效率和准确性.然而,面对快速诊断的同时,如何提供有效的治疗手段,改善患儿的总体预后,成为了新的挑战.本文将从中国...

            【关键词】 新生儿遗传疾病基因筛查全基因组测序

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            【中文期刊】 周江鸿  夏菲  等 《生物技术通报》 2024年40卷7期 235-246页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]从黄栌枝干内部分离到的细菌CCBC3-3-1 菌株对黄栌枯萎病菌(Verticillium dahliae)表现出较强的拮抗作用,从基因组层面深入研究其拮抗机理,为进一步研发生防菌剂提供理论依据.[方法]利用PacBio RS测序平...

            【关键词】 黄栌大丽轮枝菌泛菌

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            【中文期刊】 王筱  许统圣  等 《中国热带医学》 2024年24卷11期 1390-1395页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 基于全基因组测序技术解析2株同时产NDM-1、OXA-23、OXA-51碳青霉烯酶的鲍曼不动杆菌(Aci-netobacter baumannii)的分子遗传特征,探究其耐药机制、进化路径及传播潜力,为制定临床感染控制策略提供数据支持...

            【关键词】 鲍曼不动杆菌碳青霉烯酶质粒

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            【中文期刊】 张芸  王爽  等 《中国热带医学》 2024年24卷11期 1357-1362页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 探究山东省潍坊市诸城农村健康人群、动物及环境来源奇异变形杆菌(Proteus mirabilis,PM)的分子流行病学特征.方法 2023年11月从山东省潍坊市诸城健康人群、动物粪便及污水样本中分离的奇异变形杆菌进行药物敏感性试验.通...

            【关键词】 奇异变形杆菌耐药基因新德里金属β-内酰胺酶

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            【中文期刊】 张秀芝  赵爱兰  等 《中国热带医学》 2024年24卷8期 1011-1015页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 利用可变数目串联重复序列(variable number tandem repeats,VNTR)和全基因组测序(whole ge-nome sequencing,WGS)分析一起学校结核病疫情的传播情况,探讨2种基因分型方法在处理学...

            【关键词】 学校结核病全基因组测序

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            【中文期刊】 陈翔  高晓东  等 《华西医学》 2024年39卷3期 412-417页ISTICCA

            【摘要】 目的 基于全基因组测序分析外科重症监护室患者定植与感染碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)的耐药基因、毒力基因及同源性.方法 对2021年3月复旦大学附...

            【关键词】 主动筛查碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌全基因组测序分析

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            【中文期刊】 吴焰清  李星龙  等 《生物物理学》 2024年12卷3期 39-50页

            【关键词】 Serratia sp. CM01全基因组测序生物信息学

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            【中文期刊】 张爽  王丽丽  等 《疾病监测》 2023年38卷7期 872-877页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 分析北京市某区2013-2021年腹泻监测中,首次自腹泻病例分离的2株非O157产志贺毒素大肠埃希菌(STEC)病原学及分子生物学特征.方法 应用实时荧光定量PCR方法筛查腹泻病例标本中的肠道致病菌和病毒,对志贺毒素基因(stx)阳性...

            【关键词】 志贺毒素大肠埃希菌肠道病原菌

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            【中文期刊】 方澜  黎妍妍  等 《生物技术通报》 2023年39卷8期 272-282页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 真菌内生细菌是一类特殊细菌,在寄主真菌体内及生态系统中发挥重要作用.为发掘盘龙参内生真菌内具有促生功能的内生细菌资源,并探索其生物学功能,采用荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)检测...

            【关键词】 盘龙参内生真菌高粱附球菌

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