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                【学位论文】 作者:乌浩 导师:高峰   天津大学   生物学 生物物理学硕士 2020年

                【摘要】 枯草芽孢杆菌是广泛使用的微生物种类,在研究微生物群落关系、适应各种生态位的适应性进化、生产特定产品的工程细胞工厂以及基因组理性删减方面具有重要意义。泛基因组分析是研究物种之间和内部基因特征和功能的有效方法。许多研究方向和结论通常取决于准确的...

                【关键词】 泛基因组分析枯草芽孢杆菌

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                【学位论文】 作者:关海霞 导师:林岩   天津大学   生物学 生物物理学硕士 2020年

                【摘要】 支原体(Mycoplasma)是一种无细胞壁的原核生物,专性细胞内寄生,呈现多样的生态位。部分支原体有一定的致病性,给不同行业造成巨大损失,对人类健康构成极大威胁。由于支原体拥有极小的基因组结构和简单的代谢途径,科学家将其作为探究生命基本功...

                【关键词】 支原体基因组学

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                【学位论文】 作者:全春兰 导师:高峰   天津大学   生物学 生物物理学硕士 2019年

                【摘要】 高通量测序技术的迅猛发展,产生了大量的基因组数据。如何利用这些数据挖掘出有价值的生物学知识,已成为大数据时代生物信息学研究中新的机会与挑战。细菌作为微生物种群中非常重要的组成,与人类生活息息相关。对细菌基因组的研究,能够使其在医药、环保、生...

                【关键词】 细菌基因组前导链

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                【学位论文】 作者:张歌 导师:高峰   天津大学   生物学 生物物理学硕士 2017年

                【摘要】 由于在前导链和后随链之间存在着不同的复制机制,碱基组成偏差广泛地存在于细菌基因组中。通常认为,在前导链上存在较多的鸟嘌呤(G)和胸腺嘧啶(T),而在后随链上则相应有较多的腺嘌呤(A)和胞嘧啶(C)。但是,并不是所有细菌都遵循以上规律,例如,...

                【关键词】 细菌基因碱基偏差

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                【学位论文】 作者:黄倩 导师:张春霆   天津大学   生物学 生物物理学硕士 2008年

                【摘要】 人类基因组计划是首个被启动的脊椎动物基因组计划。接着又有作为模式生物的斑马鱼和小鼠的基因组被测序。目前已经有鸡、犬、牛、黑猩猩、河豚等越来越多的脊椎动物基因组测序任务完成。开展脊椎动物的基因组计划,并通过比较基因组学的途径进行研究是生物信息...

                【关键词】 脊椎动物基因组

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                【学位论文】 作者:林岩 导师:张春霆   天津大学   生物学 生物物理学硕士 2006年

                【摘要】 目前,随着DNA测序技术的发展,从细菌到高等真核生物,越来越多的全基因组序列数据正不断涌现。理论和计算将发挥日益巨大的作用,生物信息学作为一门崭新的前沿学科应运而生。基因识别是进行基因组分析的第一步,在生物信息学研究中占有重要的地位。本论文...

                【关键词】 细菌古细菌

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                【学位论文】 作者:郑文新 导师:张春霆   天津大学   生物学 生物物理学硕士 2005年

                【摘要】 随着人类基因组、模式生物基因组计划的蓬勃发展,越来越多的生物全基因组已完成了测序。有理由相信数据的海量积累预示着理论的重大突破,然而数据并不等于知识,如何从冗长的数据中提取有用信息成了当前的一个热门课题。Z曲线是直观研究基因组序列的有力工具...

                【关键词】 序列比对组分向量

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                【学位论文】 作者:窦运涛 导师:张春霆   天津大学   生物学 生物物理学硕士 2005年

                【摘要】 本论文的主要内容是原核生物蛋白质编码基因识别以及通过序列比对的方法确定微生物的必需基因。具体内容如下: 第一部分介绍了人类基因组和模式生物基因组计划,引出了生物信息学的发展背景和主要研究内容以及主要的蛋白质编码基因识别算法和基因识...

                【关键词】 原核生物基因基因识别程序

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                【学位论文】 作者:张建辉 导师:张春霆   天津大学   生物学 生物物理学硕士 2005年

                【摘要】 随着人类基因组、模式生物基因组计划的蓬勃发展,越来越多的生物全基因组已完成了测序.有理由相信数据的海量积累预示着理论的重大突破,然而数据并不等于知识,如何从冗长的数据中提取有用信息成了当前的一个热门课题.Z曲线是直观研究基因组序列的有力工具...

                【关键词】 Z曲线理论冠状病毒

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                【学位论文】 作者:高峰 导师:张春霆   天津大学   生物学 生物物理学硕士 2003年

                【摘要】 随着人类基因组及模式生物基因组大规模测序的顺利实施,GenBank,EMBL和DDBJ国际三大核酸序列数据库的序列数量和碱基个数呈指数增长,同时国际上著名的蛋白质数据库如PIR,SWISS-PROT和PDB等中的蛋白质数目与DNA序列同步,...

                【关键词】 Z曲线真核生物基因组

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                【学位论文】 作者:温省云 导师:张春霆   天津大学   生物学 生物物理学硕士 2003年

                【摘要】 哺乳动物(包括人类)基因组的mosaic结构,是在上个世纪七十年代中期分析牛基因组密度梯度平衡离心实验结果得出的结论.Bernardi et al研究发现人类的基因组是由许多isochore构成的,isochore是较长的(平均长度>>30...

                【关键词】 人类基因组Z曲线理论

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                【学位论文】 作者:马彬广 导师:张春霆   天津大学   生物学 生物物理学硕士 2003年

                【摘要】 生物信息学领域内的许多课题可以抽象成字符序列处理问题,例如,基因识别、蛋白质二级结构预测等.字符序列所能提供的信息不外乎来自两个方面:组成和排列.组成方面的信息可以用常规的频率去反映.问题的关键是如何反映字符序列的排列信息.该文在综述了现有...

                【关键词】 字符序列的解析数论模型对偶描述子

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                【学位论文】 作者:郭锋彪 导师:张春霆   天津大学   生物学 生物物理学硕士 2002年

                【摘要】 在原核生物基因识别领域,目前已有几个比较成熟的计算机程序,但是这些程序并没有解决所有的问题.以张春霆教授提出的DNA序列的Z曲线理论为基础,我们发展了自己的原核生物基因识别程序——ZCURVE1.0.ZCURVE1.0程序由种子ORFs的选...

                【关键词】 原核生物基因组Z曲线理论

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                【学位论文】 作者:杨晓光 导师:张春霆   天津大学   生物学 生物物理学硕士 2002年

                【摘要】 由于迄今为止蛋白质二级结构预测精度还远远不能满足正确推测蛋白质三维空间结构的要求,我们希望从蛋白质二级结构含量预测入手来解决问题.该文利用多元线性回归方法进行了有益的尝试.膜蛋白质在细胞中占有重要的地位.国际上已有成功的方法区分膜蛋白质与非...

                【关键词】 二级结构含量多元线性回归

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