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【中文期刊】 张后娟 《医学理论与实践》 2025年38卷4期 550-554页
【摘要】 目的:利用加权基因共表达网络和机器学习方法,筛选和鉴定对卵巢癌患者生存率产生影响的关键基因,为卵巢癌的治疗提供新的思路和靶点.方法:从公共数据库下载GSE14407、GSE15578 和GSE38666 三个包含卵巢癌样本的表达矩阵,将前两...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘超 曹卿卿 等 《医学信息》 2025年38卷10期 7-13页
【摘要】 目的 基于加权基因共表达网络和机器学习算法筛选和识别影响卵巢癌患者生存率的关键基因.方法 下载基因表达综合数据库中编号为GSE38666和GSE26712卵巢癌相关的基因表达矩阵,对以上表达矩阵进行合并和标准化、均一化处理,处理后的表达矩阵...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 范诗语 马克涛 等 《石河子大学学报（自然科学版）》 2025年43卷5期 569-579页
【摘要】 目的 本研究旨在通过加权基因共表达网络分析(weighteal gene co-expression network analysis,WGCNA)以及机器学习算法鉴定心力衰竭(heart failure,HF)发展过程中的关键基因.方法 ...
【关键词】 心力衰竭；心脏纤维化；加权基因共表达网络分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李倩 宋洁云 等 《锦州医科大学学报》 2025年46卷4期 96-101页CA
【摘要】 目的 通过整合流行病学与转录组数据,研究铁超载与代谢功能障碍相关脂肪性肝病(metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease,MASLD)之间的关系,探索铁超载与MASLD发生...
【关键词】 铁超载；代谢功能障碍相关脂肪性肝病；加权基因共表达网络分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈曼娜 温悦 《海峡药学》 2025年37卷7期 17-27页
【摘要】 目的 通过生物信息学的方法挖掘免疫球蛋白A肾病(IgA Nephropathy,IgAN)的关键基因,为IgAN提供新的诊断标志物及免疫细胞浸润特征,并预测IgAN治疗的有效药物.方法 从GEO数据库下载合并GSE73953和GSE9379...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 徐学功 刘燕 等 《中药新药与临床药理》 2024年35卷12期 1816-1826页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于转录组学与加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨降脂轻身胶囊介导NF-κB/NLRP3/Caspase-1信号轴改善高脂血症的作用机制.方法 将40只C57BL/6小鼠随机分为对照组、模型组、瑞舒伐他汀组(1.3 mg·kg-1...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 袁超 练庆海 等 《器官移植》 2024年15卷1期 90-101页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 筛选酒精性肝炎(AH)的自噬关键基因,探讨AH潜在的生物标志物和治疗靶点.方法 采用基因表达综合数据库(GEO)中的2个AH基因芯片和从MSigDB、GeneCards数据库中获得的自噬相关数据集,通过加权基因共表达网络分析(WGCN...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 姚瑞倩 喻东 等 《海军军医大学学报》 2024年45卷12期 1529-1539页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过生物信息学分析和机器学习模型挖掘公共数据库中的有效信息,识别子痫前期相关的候选基因,以提高子痫前期早期诊断的准确性并为发病机制和诊疗研究提供靶点.方法 从基因表达综合数据库中检索子痫前期患者和正常孕妇胎盘组织样本的RNA-seq数...
【关键词】 子痫前期；生物标志物；加权基因共表达网络分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张丽娜 姜晓琳 等 《中华中医药学刊》 2024年42卷6期 179-182,后插28-后插31页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法识别肥胖型多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)的关键基因,...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘毅 崔鑫 等 《中药药理与临床》 2024年40卷5期 68-75页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:整合多种生物信息学方法对黄葵胶囊治疗慢性肾脏病(Chronic kidney disease,CKD)的机制进行综合分析.方法:本研究从文献中收集黄葵胶囊的化学成分,从Genecards、OMIM和TTD数据库中收集CKD疾病靶点,利...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王志强 杜慧莹 等 《植物遗传资源学报》 2024年25卷8期 1385-1395页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 以条纹自交系西瓜(TD)和网条突变体西瓜(WT)为材料,通过分离群体的条纹性状比例探索西瓜的条性状遗传基础;以转录组测序及表达差异分析为基础,探索网条突变体西瓜在不同发育阶段的表达谱变化,筛选出条纹自交系与网条突变体西瓜之间表达差异显著的基...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 靳琪鹏 王肖龙 《中成药》 2024年46卷10期 3483-3491页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究葛兰心宁胶囊治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(CAD)可能调控的关键靶点基因.方法 HPLC法对入血成分进行鉴定,同时借助GSE20680数据集,基于P<0.05标准,筛选出15549个差异表达基因.利用加权基因共表达网络分析,鉴定与...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李文茜 田亮玉 等 《中药新药与临床药理》 2024年35卷9期 1306-1318页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨骨坏死康复丸治疗激素性股骨头坏死(Steroid-induced osteonecrosis of the femoral head,SONFH)的主要药理学基础和作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditi...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李轶辉 彭浩 等 《中国比较医学杂志》 2024年34卷1期 69-79页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 结肠癌(colon adenocarcinoma,COAD)患者预后较差.因此筛选结肠癌预后相关基因,建立结肠癌新的预后风险评估模型.方法 基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和基因表达综合(...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈超 陈天翔 等 《中国全科医学》 2024年27卷32期 4050-4059页ISTICPKUCA
【摘要】 背景 肝细胞癌(HCC)是全球常见的癌症相关死亡的第三大原因,约占所有原发性肝癌病例的90%,其复发率和死亡率较高,目前发生的分子机制仍不清楚.目的 探索HCC潜在的分子机制,发掘新的生物标志物.方法 从TCGA数据库下载RNA-seq表达...
【关键词】 癌,肝细胞；加权基因共表达网络分析；Hub基因；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黄一铭 王爱民 等 《中南大学学报（医学版）》 2024年49卷2期 207-219页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:在帕金森病的发病过程中,免疫系统的异常激活和炎症反应起着重要作用.然而,目前对于免疫相关关键基因在帕金森病发生和发展中的具体作用和作用机制的了解仍然有限.本研究旨在通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expr...
【关键词】 加权基因共表达网络分析；机器学习；帕金森病；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 庞雪 《安徽医科大学学报》 2024年59卷11期 1958-1966页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)、机器学习算法、免疫浸润分析和动物实验筛选肛瘘(AF)潜在的生物标志物.方法 下载基因表达数据库中包含AF和瘘管旁组织(PF)的转录组数据进行差异分析,对差异表达基因(DEGs)进行基因本体(G...
【关键词】 肛瘘；加权基因共表达网络分析；机器学习；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王玉涛 孙岩 《山东大学学报（医学版）》 2024年62卷11期 40-53页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 利用单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA)数据分析、加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)、机器学习...
【关键词】 腹主动脉瘤；加权基因共表达网络分析；机器学习；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘景文 马秋玲 等 《世界中医药》 2024年19卷17期 2562-2571页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:探究中医药治疗急性淋巴细胞白血病(ALL)的作用机制,并用实验验证.方法:收集中医药治疗ALL文献的药物组成;利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、通用蛋白质(UniProt)数据库收集高频中药的成分及靶点,基因表达综合系...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 方柔柔 杨启帆 等 《实用心脑肺血管病杂志》 2024年32卷3期 62-69,76页ISTIC
【摘要】 目的 基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选动脉粥样硬化(AS)中铁死亡核心基因,并分析其与免疫浸润细胞的关系.方法 从基因表达综合(GEO)数据库下载AS转录组数据集GSE100927[筛选出颈动脉样本41个,包含12个健康对照者的...
【关键词】 动脉粥样硬化；加权基因共表达网络分析；铁死亡；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吴胜男 蒋环宇 等 《实用临床医药杂志》 2024年28卷1期 48-55页ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学分析溃疡性结肠炎(UC)中具有诊断和治疗潜力的差异表达基因以及潜在的微小RNA(miRNA).方法 采用加权基因共表达网络分析法对GEO数据库中的芯片原始数据进行筛选.获取UC相关差异表达基因进行富集分析.根据关键基因,...
【关键词】 溃疡性结肠炎；加权基因共表达网络；miRNA-基因调控网络；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张昊军 李泓毅 等 《胃肠病学和肝病学杂志》 2024年33卷1期 40-47页ISTICCA
【摘要】 目的 筛选肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)预后相关生物标志物,从分子水平探讨 HCC 可能的发病机制,并预测对 HCC具有潜在治疗作用的候选药物.方法 下载 TCGA数据库和 GEO 数据库中 HCC 的...
【关键词】 肝细胞癌；加权基因共表达网络分析；分子机制；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 施露 张莲卿 等 《海军医学杂志》 2024年45卷12期 1270-1276页ISTIC
【摘要】 目的 利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法联合网络药理学方法及分子对接技术探讨艾迪注射液治疗肝细胞癌的分子机制.方法 应用癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载肝细胞癌组织样本和正常肝组织样本的蛋白表达数据,将蛋白质组数据整理成表达矩...
【关键词】 艾迪注射液；加权基因共表达网络分析；肝癌；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 唐昕燃 陈顺德 等 《中医药导报》 2024年30卷6期 133-140,166页ISTIC
【摘要】 目的:利用机器学习分析铁死亡基因与多囊卵巢综合征(PCOS)的相关性,构建诊断及预后风险模型,探讨PCOS的潜在铁死亡机制,并预测相关中药.方法:多芯片标准化合并GEO数据库的卵巢组织芯片,采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)算法筛选与...
【关键词】 多囊卵巢综合征；铁死亡；加权基因共表达网络分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 安沛兴 马晓红 等 《疑难病杂志》 2024年23卷10期 1239-1245页ISTICCA
【摘要】 目的 通过构建临床预测模型探究在绝经后子宫内膜癌(EC)患者中发挥关键作用的基因并进行验证,评价其在预测EC患者生存预后中的应用价值.方法 选取2022年1月—2023年10月在西北妇女儿童医院妇产科就诊的EC患者45例,通过手术获得EC患...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张冠 杨登科 《联勤军事医学》 2024年38卷11期 966-970页ISTIC
【摘要】 目的 研究肾结石的关键差异基因、信号通路及蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,从而寻找潜在的诊疗靶点,为难治性、复发性、遗传高风险性结石提供新的诊疗思路.方法 基于生物信息学方法和R...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 柯益忠 石磊 《现代肿瘤医学》 2024年15期 2776-2782页ISTICCA
【摘要】 目的:基于加权基因共表达网络筛选PD-L1阴性非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者的潜在免疫治疗靶点并筛选相应小分子药物提高免疫应答效率.方法:分别从TGCA数据库筛选出1 037例NSCLC...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张桢淳 李永唯 等 《中国动脉硬化杂志》 2024年32卷4期 310-318页ISTICCA
【摘要】 [目的]从空间与基因共表达网络的角度揭示跨种属的缺血性心力衰竭机制.[方法]从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库(NCBI-GEO)中检索获得GSE210374和GSE57338高通量测序数据,利用R语言软件程序包分析筛选在心肌梗死大鼠...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 侯洁欣 戴吉 等 《中国血液流变学杂志》 2024年34卷2期 202-207页ISTICCA
【摘要】 目的 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定与病毒性脓毒症儿童患者相关的关键基因.方法 使用GSE119217数据集进行差异表达基因(DEGs)分析,筛选病毒性脓毒症儿童患者相关的DEGs.采用WGCNA筛选与脓毒症临床特征相关性最高...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 汪茜 龚睿 等 《医学研究杂志》 2024年53卷1期 24-30页ISTIC
【摘要】 目的 基于生物信息学分析影响脓毒症预后的潜在核心基因.方法 利用基因表达数据库(Gene Expression Om-nibus,GEO)筛选到脓毒症患者的基因表达数据集GSE54514和GSE65682,通过加权基因共表达网络分析(wei...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 方斌 莫柔 等 《广西医科大学学报》 2024年41卷8期 1111-1119页ISTICCA
【摘要】 目的:基于非靶向代谢组学和生物信息学方法研究香蜂草苷抗非酒精性脂肪肝病(NAFLD)的作用机制.方法:将18只雄性SD大鼠随机分为正常对照组、模型组和香蜂草苷组(3 mg/kg),每组6只.使用高脂饲料喂养8周诱导建立NAFLD大鼠模型.香...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 玛伊拜·木沙江 钱勇江 等 《中国动脉硬化杂志》 2024年32卷8期 669-676页ISTICCA
【摘要】 [目的]基于血液转录组学探讨动脉粥样硬化患者血液转录组中的关键基因.[方法]从GEO数据库中选取三个数据集GSE12288、GSE27034和GSE90074,进行合并和归一化处理,分析动脉粥样硬化患者和对照者外周血样本之间的差异基因,对差...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 薛丹 张裕惠 等 《浙江临床医学》 2024年26卷5期 652-656,664页ISTIC
【摘要】 目的 应用WGCNA联合免疫浸润方法,分析斑秃发病的核心差异基因及免疫浸润情况并预测斑秃治疗的有效中药.方法 下载基因芯片数据集GSE68801,通过表达差异和模块分析筛选差异基因,在CTD和STRING平台对差异基因进行富集分析及PPI网...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 樊宁丹 王敏 等 《临床精神医学杂志》 2024年34卷6期 425-429页ISTICCA
【摘要】 目的:基于转录组水平探索抑郁症的病因学机制.方法:检测157例抑郁症患者及135名健康对照者的外周血转录组学数据.使用加权基因共表达网络分析,寻找与抑郁症相关的基因共表达模块,利用基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基...
【关键词】 抑郁症；转录组学；加权基因共表达网络分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 舒佳玉 王欢 等 《现代肿瘤医学》 2024年32卷19期 3636-3642页ISTICCA
【摘要】 目的:筛选口腔鳞状细胞癌(OSCC)中铁死亡相关新型生物标志物,并分析免疫细胞浸润情况.方法:从GEO数据库中下载OSCC数据集.利用R软件筛选差异表达基因(DEGs)并进行功能和通路富集分析,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)探究基...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黄美玲 陈辉 等 《南昌大学学报（医学版）》 2024年64卷6期 16-26页ISTIC
【摘要】 目的 利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)与机器学习算法筛选脓毒症预后焦亡相关基因,并验证其在脓毒症模型中的表达.方法 从基因表达综合数据库(GEO)下载GSE95233基因数据集作为训练集,GSE65624基因数据集、GSE16736...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 徐思洁 秦浩 等 《实用肝脏病杂志》 2024年27卷4期 599-602页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨肝细胞癌(HCC)发生进展过程中功能富集通路和关键基因表达.方法 从基因表达数据库(GEO)下载HBV感染不同阶段和正常对照肝脏转录组数据,构建基因网络并使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)将基因分类为不同的模块,对相关模块中...
【关键词】 肝细胞癌；加权基因共表达网络分析；基因集富集分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 曹家兴 张旺 等 《医学研究杂志》 2024年53卷1期 113-120页ISTIC
【摘要】 目的 整合生物信息学挖掘并分析与基底型乳腺癌(basal-like breast cancer,BLBC)的预后相关的核心基因.方法 首先,从GEO数据库中遴选与乳腺癌分子分型相关的数据集,数据处理后利用WGCNA筛选与BLBC相关的模块....
【关键词】 基底型乳腺癌；加权基因共表达网络分析；免疫浸润；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王曼曼 宁文华 等 《实用心脑肺血管病杂志》 2024年32卷5期 72-77,82页ISTIC
【摘要】 目的 基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和机器学习算法探究葡萄糖代谢参与缺血性脑卒中(IS)的机制及其关键基因.方法 本实验时间为2022年11月—2023年6月.从GEO数据库GPL6883平台下载IS芯片数据集GSE16561,其...
【关键词】 缺血性卒中；葡萄糖代谢；加权基因共表达网络分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 付贺青 刘晶 等 《中西医结合心脑血管病杂志》 2024年22卷23期 4285-4292页ISTIC
【摘要】 目的:通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)对小鼠心脏转录组测序数据进行分析,筛选与心肌肥厚发生有关的基因和细胞信号通路.方法:通过主动脉弓缩窄法(TAC)构建心肌肥厚小鼠模型,在体外水平、解剖水平和病理水平对模型进行评价.对小鼠心肌组织...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
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