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【中文期刊】 窦媛媛 李秋影 等 《国际老年医学杂志》 2022年43卷1期 11-15页ISTIC
【摘要】 目的 探讨与肌少症相关的潜在关键基因,为肌少症新的分子标记物及靶点提供依据.方法 从GEO数据库下载肌少症和健康对照组的转录组数据(GSE111017),用LIMMA软件包鉴定差异表达基因(DEGS).基于String数据库对蛋白质-蛋白质...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 侯芳霞 刘琳 等 《现代检验医学杂志》 2022年37卷6期 19-23,69页ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学方法对稳定性心绞痛患者外周血基因表达谱芯片进行分析,获取其外周血表达谱特征并筛选关键差异表达基因作为潜在的分子标记物并构建Nomogram诊断模型.方法 从NCBI中的基因表达综合(Gene Expression Omn...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 尤红俊 赵倩倩 等 《山西医科大学学报》 2022年53卷5期 556-565页ISTICCA
【摘要】 目的 对扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy,DCM)进行生物信息学分析,探讨其发病机制并筛选出与病因学相关的核心基因.方法 使用R语言对来自基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 苗文清 王宇 等 《昆明医科大学学报》 2022年43卷6期 25-34页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨冠心病急性心肌梗死患者外周循环血单核细胞中差异基因表达及功能.方法 收集2020年9月至2021年9月在昆明市第一人民医院接受冠脉造影的患者,提取外周血单核细胞总RNA,使用DNBSEQ平台进行第2代高通量测序.检测并筛选差异表达...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 尤红俊 赵倩倩 等 《中西医结合心脑血管病杂志》 2022年20卷22期 4102-4109页ISTIC
【摘要】 目的 对小鼠射血分数保留心力衰竭(HFpEF)转录组高通量测序数据进行生物信息学分析,探讨其发病机制.方法 使用R语言对基因表达综合数据库(GEO)来源的HFpEF转录谱数据进行差异表达分析,STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI...
【关键词】 射血分数保留心力衰竭；基因表达综合数据库；差异表达基因；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吴宝杰 锡书毅 《医学综述》 2022年28卷7期 1446-1452,1457页ISTICCA
【摘要】 目的 基于基因表达谱芯片数据,综合采用生物信息学研究方法,挖掘与严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染相关的差异表达基因(DEGs)和信号通路,构建分子相互作用网络并分析关键基因的功能.方法 在NCBI-GEO数据库中...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 江银辉 杨碧 等 《贵州医科大学学报》 2022年47卷12期 1377-1384页ISTIC
【摘要】 目的 基于转录组测序(RNA-Seq)技术探讨真菌病毒黄曲霉(A.flavus)partitivirus1(AfPV1)感染对寄主A.flavus基因表达的影响.方法 分别提取无病毒感染的A.flavus菌株LD-F1和真菌病毒AfPV1感...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘娜 赵倩倩 等 《临床与病理杂志》 2022年42卷9期 2063-2073页ISTICCA
【摘要】 目的:对小儿扩张型心肌病(pediatric dilated cardiomyopathy,PDCM)血清蛋白及microRNA(miRNA)表达谱进行生物信息学分析,探讨其发病机制.方法:对PDCM血清蛋白芯片数据进行差异分析及基因本体论...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王治 洪莉 等 《吉林大学学报（医学版）》 2020年46卷4期 804-809页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:通过生物信息学方法分析与子宫内膜癌(EC)发生发展相关的关键基因和候选通路,探讨EC的发病机制和治疗靶点.方法:自公共基因芯片数据库(GEO)下载EC芯片数据集GSE17025和GSE63678,使用GE02R在线分析工具和R软件筛选...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张迎春 何诚成 等 《中国老年学杂志》 2020年40卷11期 2331-2339页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探讨多发性硬化症(MS)患者外周血T细胞中发生差异变化的致病相关基因及关键通路.方法 首先,从GEO数据库下载了GEO数据系列GSE43591,GSE13732,GSE32988,包含了42例T细胞实验样本和35例健康对照样本的基因芯...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李倩 高境泽 等 《上海交通大学学报（医学版）》 2020年40卷2期 194-199页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的·探究食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)的发生机制及其潜在靶向药物,为诊断和治疗ESCC提供理论依据.方法·选取2个GEO集(GSE38129、GSE20347),用R语言筛...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 欧阳慧敏 朱虎全 等 《佛山科学技术学院学报（自然科学版）》 2022年40卷1期 10-18页
【摘要】 目的 通过高通量平台筛选差异表达基因间的相互联系和其相互作用的途径.方法 从高通量基因表达数据库(GEO)下载原始数据,比较非小细胞肺癌患者与健康样本的基因表达谱,确定差异表达基因(Differential Gene Expression,...
- 概要：
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【中文期刊】 杨冰琪 王竞州 等 《石河子大学学报（自然科学版）》 2022年40卷2期 259-264页
【摘要】 目的 利用转录组测序(RNA sequencing,RNA-Seq)技术分析肥胖相关子宫内膜癌(Endometrial Cancer,EC)癌灶及癌旁组织中的差异表达基因,寻找肥胖相关EC发生、发展的相关危险因素.方法 对4例超重/肥胖伴E...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈鹏 赵超 等 《吉林医学》 2022年43卷8期 2024-2031页CA
【摘要】 目的:筛选和鉴定与膝骨关节炎(KOA)滑膜炎性反应有关的关键基因和通路,并探讨潜在的分子机制.方法:从Cene Expression Omnibus(GEO)数据库下载了两个基因表达数据集(GSE55235和GSE55457),使用RPA和...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 王思月 张洪梅 等 《华北理工大学学报（医学版）》 2022年24卷2期 99-106,112页
【摘要】 目的 筛选胃腺癌(Gastric adenocarcinoma,GAC)差异表达的关键基因并进行验证,分析其调控通路.方法 自美国国立生物技术信息中心基因表达数据库(Gene expression omnibus,GEO)下载GAC基因芯片...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 伦永志 孙杰 等 《中国实验血液学杂志》 2019年27卷3期 673-684页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:筛选急性早期前体T淋巴细胞白血病(ETP ALL)核心基因并分析其与上游互作miRNA、lncRNA和参与通路的相互作用,探讨ETP ALL发生发展过程中的调控机制并寻找可用于临床诊疗的分子靶点.方法:利用基因表达公共数据库(Gene...
【关键词】 急性早期前体T淋巴细胞白血病；差异表达基因集；核心基因；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 徐倩 苏湲淇 等 《中国药房》 2019年30卷24期 3423-3427页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:为阿尔茨海默病(AD)发病机制的阐释、早期预防与诊断以及治疗靶点的筛选提供参考.方法:从美国国立生物技术信息中心公共数据平台基因表达数据库中下载基因芯片数据集GSE28146,使用GEO2R在线分析工具筛选出AD相关差异表达基因(DE...
- 概要：
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【中文期刊】 满君 宋龙飞 等 《现代肿瘤医学》 2021年29卷12期 2057-2062页ISTICCA
【摘要】 目的:应用生物信息学方法挖掘小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)的相关基因,探讨其发病机制,为SCLC诊断和治疗提供靶点.方法:从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中下载基因芯片数...
- 概要：
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【中文期刊】 彭金香 吴沣 《中西医结合心脑血管病杂志》 2021年19卷13期 2163-2167页ISTIC
【摘要】 目的 对尼古丁诱导癫痫发作新皮质中发现的差异表达基因(DEGs)进行生物信息学分析.方法 利用DAVID 6.8和STRING 11.0等分析平台对基因芯片公共数据库(GEO)发表的尼古丁诱导癫痫发作的新皮质筛选DEGs,并进行基因本体(G...
- 概要：
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【中文期刊】 胡超 段灵星 等 《山东医药》 2021年61卷12期 10-13页ISTICCA
【摘要】 目的 对腺性膀胱炎(CG)差异表达基因进行生物信息学分析,并筛选关键基因.方法 自公共平台数据库内完成基因芯片数据集GSE11783的下载,借助在线分析软件GEO2R,完成CG相关差异表达基因的筛选;借助生物信息学资源数据库DAVID6.8...
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【中文期刊】 赵文甲 刘维 等 《医学研究生学报》 2018年31卷9期 916-920页ISTICPKU
【摘要】 目的 干燥综合征(SS)被认为是仅次于类风湿关节炎的常见风湿免疫病.文章利用基因表达谱数据,筛选SS相关基因,以进一步探讨SS的发病机制,寻找治疗SS的潜在药物治疗靶点.方法 采用Affymetrix Human Genome U133 P...
- 概要：
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【中文期刊】 王生贵 《中国医科大学学报》 2018年47卷11期 1003-1007页ISTICPKUCABP
【摘要】 目的 研究女性绝经1年后接受力量训练1年骨骼肌mRNA表达谱的改变情况,并探讨其潜在的功能.方法 从人类基因表达汇编(GEO)数据库下栽GSE16907.在对照观察组和1年期锻炼组分别进行差异表达基因分析,找出入组时和1年后骨骼肌的差别表达...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 何浪 魏娜 等 《中国免疫学杂志》 2016年32卷10期 1424-1427,1436页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的：：利用基因表达谱数据，探讨良恶性乳腺肿瘤患者外周血基因表达变化。方法：从GEO数据库中获取良性和恶性乳腺肿瘤患者外周血单个核细胞(PBMCs)表达谱。 GEO2R在线工具筛选差异表达基因， DAVID工具富集基因功能和通路。 STRI...
- 概要：
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【中文期刊】 毛雁 何思思 等 《遵义医科大学学报》 2021年44卷4期 484-491页
【摘要】 目的 通过识别在食管鳞癌发生发展中具有预后意义的关键基因,探索相关信号通路.方法 从GEO数据库获得2个基因芯片数据集GSE45670和GSE161533,筛选差异表达基因.利用Cytoscape软件可视化STRING数据库构建的PPI网络...
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【中文期刊】 隋英丽 卢坤 等 《青岛大学学报（自然科学版）》 2021年34卷2期 101-109页
【摘要】 肝细胞癌是一种高死亡率的原发性肝癌,其有限治疗和较低的化疗敏感性,使得迫切需要寻找潜在的临床治疗靶点和预后判断的生物标志物.为此,采用生物信息学方法对肝细胞癌发生发展的关键基因进行挖掘.从基因表达数据库(GEO)中下载数据集,并筛选差异表达...
【关键词】 生物信息学；差异表达基因；蛋白质-蛋白质相互作用网络；
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【中文期刊】 陈文标 戴勇 等 《西安交通大学学报（医学版）》 2015年2期 225-231页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的：构建系统性红斑狼疮(SLE)患者与健康对照者(NC)新小核糖核酸(novel microRNA)的差异性表达谱；对显著性差异表达的 novel microRNA 进行靶基因预测,对靶基因的 GO(gene ontology)及 KEG...
- 概要：
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【中文期刊】 王萍 刘可智 等 《山东医药》 2020年60卷8期 29-33页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨改良电抽搐疗法(MECT)治疗精神分裂症的生物学机制.方法 接受MECT治疗的精神分裂症患者16例,采用PANSS评估临床疗效,减分率≥60％为治疗应答组(8例),<60％为治疗无应答组(8例),另选择一般资料相匹配的健康志愿者8...
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【中文期刊】 陈源 黄正如 《国际眼科杂志》 2020年20卷2期 300-306页ISTICCA
【摘要】 目的:通过生物信息学方法分析上皮细胞型和混合型葡萄膜黑色素瘤之间的差异表达基因及关键基因.方法:自GEO数据库中下载基因芯片数据集GSE22138,从中筛选出上皮细胞型和混合型葡萄膜黑色素瘤之间的差异基因,通过DAVID数据库对差异基因行功...
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【中文期刊】 彭倩 韩刚 等 《现代肿瘤医学》 2020年28卷23期 4073-4078页ISTICCA
【摘要】 目的:应用生物信息学方法挖掘胶质母细胞瘤(GBM)的相关基因,进而探讨发病机制,为GBM临床诊断和靶向治疗提供理论依据.方法:从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载基因芯片数据集GSE4290和GSE15824...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 胡黎丹 魏晓云 等 《贵州医药》 2020年44卷5期 685-688页ISTICCA
【摘要】 目的 比较早发性精神分裂症与健康人群之间基因表达差异,探究精神分裂症发病机制.方法 GEO数据库获取基因芯片数据,通过R工具进行差异表达基因分析,使用DAVID工具进行GO富集和通路分析,利用STRING数据库构建蛋白相互作用网络.结果 鉴...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 刘一鸣 袁方超 等 《检验医学与临床》 2020年17卷7期 921-925,929页ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学方法分析参与肝脏再生(LR)终止阶段调控的相关基因,以探讨该阶段精确调控肝脏大小所涉及的相关分子机制.方法 从美国国立生物技术信息中心(NCBI)的高通量基因表达数据库(GEO)下载大鼠部分肝脏切除(PH)术后肝组织基因...
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【中文期刊】 李康梅 陈泯锜 等 《癌症进展》 2020年18卷20期 2072-2076页ISTIC
【摘要】 目的 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别卵巢癌发生及发展过程中的枢纽基因.方法 从基因表达综合数据库的GSE18520数据集中筛选出卵巢癌的差异表达基因(DEG).采用综合生物信息学分析选择枢纽基因,并研究其相关的预后特征.使用基...
【关键词】 加权基因共表达网络分析；卵巢癌；枢纽基因；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 满君 张晓梅 等 《现代肿瘤医学》 2020年28卷12期 2031-2038页ISTICCA
【摘要】 目的:应用生物信息学方法挖掘食管鳞状细胞癌(ESCC)的相关基因,探讨其发病机制,为ESCC诊断和靶向治疗提供依据.方法:从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载基因芯片数据集GSE100942和GSE1735 ...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 欧丹艳 袁媛 等 《医学研究生学报》 2014年4期 382-386页ISTICPKU
【摘要】 目的：噬血细胞性淋巴组织细胞增生症（ hemophagocytic lymphohistiocytosis ， HLH）是一种致命的过度炎症性疾病，好发于儿童，死亡率高达40％。为进一步了解儿童HLH的发病机制，研究利用生物信息学方法筛选儿...
【关键词】 噬血细胞性淋巴组织细胞增生症；儿童；差异表达基因；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 何熠 熊海风 等 《广西医学》 2019年41卷18期 2321-2325页ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学分析筛选骨关节炎相关的差异表达基因(DEGs),并分析其生物学功能.方法 从GEO数据库下载微阵列数据集GSE1919,其包括5个骨关节炎样品和5个匹配的对照样品.利用R语言的Limma工具包进行数据分析,筛选DEGs....
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 胡瑞玮 陈淑芹 等 《江苏大学学报（医学版）》 2019年29卷2期 103-107页ISTICCA
【摘要】 目的:通过生物信息学方法分析Wfs1基因敲除小鼠肝脏的基因表达谱芯片,探讨WFS1基因突变的潜在致病机制.方法:从美国国立生物技术信息中心GEO数据库下载基因表达谱芯片数据(GSE55143),利用分析工具GEO2R进行差异表达基因筛选,通...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 王子明 李新阳 等 《食管疾病》 2020年2卷1期 55-62页
【摘要】 目的 本研究利用食管鳞状细胞癌(ESCC)相关微表达矩阵芯片数据,筛选出与ESCC发生、发展显著相关的关键通路及关键基因,并对关键基因所在的功能模块进行GO和KEGG富集分析、蛋白-蛋白相互作用分析以及关键基因在ESCC患者中的生存分析.方...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 李熹阳 谷明宇 等 《医学信息》 2020年33卷2期 80-85页
【摘要】 目的 基于TCGA数据库筛选影响前列腺癌(PCa)风险水平的关键基因,并建立PCa患者生存风险预测模型.方法 从TCGA数据库下载PCa患者基因表达数据及相关临床数据,通过前期研究初步筛选基因,并将患者分为高、低风险两类;对基因进行差异表达...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘蜀东 魏晓云 等 《精神医学杂志》 2018年31卷3期 173-176页ISTIC
【摘要】 目的 比较精神分裂症患者与正常人尸检脑组织基因水平上的表达差异,分析差异表达基因调控的功能通路.方法 GEO数据库下载精神分裂症患者与正常人的尸检脑组织转录组测序数据,通过整合生物信息方法分析显著差异表达基因,利用GO和KEGG pathw...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 白超博 佡剑非 《神经损伤与功能重建》 2018年13卷2期 69-72页ISTIC
【摘要】 目的:对Hoehn-Yahr分级为1期的帕金森病(PD)患者外周血进行基因芯片研究,分析PD患者外周血基因表达的变化.方法:从GEO数据库中获得Hoehn-Yahr分级为1期的PD患者外周血基因数据集GSE54536.运用GEO2R筛选差异...
【关键词】 帕金森病；Hoehn-Yahr分级；差异表达基因；
- 概要：
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