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            【中文期刊】 方丽  牛广旭  等 《广东医学》 2023年44卷9期 1114-1120页ISTICCA

            【摘要】 目的 研究肝细胞癌(HCC)组织中细胞周期素依赖激酶2相关性Culin结构域1(CAC1)、细胞周期蛋白B2(CCNB2)、细胞周期蛋白Y(Cyclin Y)及细胞周期蛋白E1(Cyclin E1)的表达,探讨四者的临床意义.方法 应用R语...

            【关键词】 肝细胞癌细胞周期素依赖激酶2相关性Culin结构域1细胞周期蛋白B2

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            【中文期刊】 贾腾飞  周成明  《中国现代普通外科进展》 2023年26卷3期 229-233页ISTICCA

            【摘要】 探讨T复合体1(TCP1)在肝细胞癌(HCC)中的表达水平及临床意义.选取癌症基因组图谱(TCGA)数据库来源的HCC组织作为在线数据库研究对象,选取2018年5月—2019年5月新疆医科大学第一附属医院收治的53例HCC患者为临床研究对象...

            【关键词】 癌,肝细胞TCP1基因预后分析

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            【中文期刊】 管波  单卫民  等 《现代泌尿生殖肿瘤杂志》 2023年15卷4期 203-207页ISTIC

            【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)及药物基因组学(CMap)数据库筛选膀胱尿路上皮癌(BLCA)潜在的治疗药物,为BLCA的药物治疗提供新的思路.方法 提取TCGA数据库中BLCA患者和BLCA转录组的临床数据,通过 WGCNA分析,选择...

            【关键词】 膀胱尿路上皮癌TCGA数据库CMap数据库

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            【中文期刊】 张晶  孔丽丽  《中国实验诊断学》 2023年27卷7期 861-866页ISTIC

            【摘要】 目的 探讨转录因子 E2F3 在上皮性卵巢癌(EOC)中的表达及临床意义.方法 在癌症基因组图谱(TC-GA)数据库及基因表达数据库(GEO)中分析 E2F家族成员在 EOC组织与正常组织中的表达差异及临床意义,同时借助生物信息数据库预测 ...

            【关键词】 转录因子上皮性卵巢癌TCGA

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            【中文期刊】 王雪芹  刘亚锋  等 《安徽医科大学学报》 2022年57卷4期 528-533页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 基于TCGA数据库,结合人类自噬数据库构建预测肺腺癌患者预后的风险模型,探讨自噬相关基因预后风险模型对肺腺癌患者预后的预测性能及与免疫微环境的相关性.方法 从癌症基因组图谱数据库下载肺腺癌患者临床信息和转录组数据,结合人类自噬数据库筛...

            【关键词】 肺腺癌自噬免疫细胞

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            【中文期刊】 庄小捷  余双  等 《中国免疫学杂志》 2022年38卷20期 2433-2437,2442页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库和GSEA富集分析,探讨甲硫氨酸亚砜还原酶B3(MSRB3)在宫颈癌中的作用及相关机制.方法:从TCGA数据库中下载宫颈癌基因数据及临床特征数据.采用单变量和多变量Cox生存分析筛查预后差异表达基因...

            【关键词】 MSRB3宫颈癌预后分析

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            【中文期刊】 李坤  韩娜  等 《医学信息》 2023年36卷7期 1-8页

            【摘要】 目的 探讨Discs大同源物关联蛋白5(DLGAP5)表达在肾透明细胞癌(KIRC)中的作用.方法 基于癌症基因组图谱(TCGA)分析KIRC中DLGAP5的表达情况与临床参数之间的相关性.应用比例风险(Cox)回归模型和Kaplan-Me...

            【关键词】 DLGAP5CD8+T细胞KIRC

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            【中文期刊】 陈彩萍  钱燕芳  《全科医学临床与教育》 2023年21卷4期 336-339,封3页

            【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱数据库(TCGA)筛选乳腺癌预后相关的关键基因作为生物标志物,并构建预后预测模型.方法 从TCGA数据库收集乳腺癌和正常样本的基因表达图谱,利用limma算法筛选乳腺癌样本组和正常组之间的差异表达基因(DGEs),采...

            【关键词】 乳腺癌预后WGCNA

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            【中文期刊】 胡文杰  王钰婷  等 《中国现代医生》 2023年61卷16期 80-85页

            【摘要】 目的 探讨黄芪治疗胃癌的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台检索黄芪的化学成分及作用靶点.癌症基因组图谱数据库下载胃癌基因表达谱及临床特征数据,采用加权基因共表达网络分析(weighted correlation networ...

            【关键词】 黄芪加权基因共表达网络分析胃癌

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            【中文期刊】 韩珺  曲佳慧  等 《继续医学教育》 2023年37卷8期 185-188页

            【摘要】 目的 探讨精确评估肿瘤人群生存预后新方式的应用效果.方法 从人类癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载甲状腺乳头癌相关数据,采用多元线性回归分析评估差异甲基化位点与基因表达间关系、定量DNA甲基...

            【关键词】 甲状腺乳头状癌精准预测生存预后

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            【中文期刊】 马雪萍  柳小平  等 《甘肃医药》 2023年42卷7期 577-584页

            【摘要】 目的:分析肺鳞癌中差异表达的免疫相关基因,从而构建预后模型来预测肺鳞状细胞癌患者的预后及初步探讨免疫细胞浸润现象.方法:从癌症基因组图谱数据库中下载肺鳞癌转录组的基因表达谱.通过生物信息学的方法筛选出预后相关的免疫基因.采用Cox回归分析构...

            【关键词】 癌症基因组图谱肺鳞状细胞癌生物信息学分析

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            【中文期刊】 黄恒彬  《医学理论与实践》 2023年36卷13期 2166-2170页

            【摘要】 目的:采用生物信息学数据库癌症基因组图谱(TCGA)分析miRNA-151a-3p在食管癌(ESCA)中的表达情况及临床意义,研究miRNA-151a-3p在ESCA中与免疫细胞浸润的相关性.方法:样本下载:从TCGA数据库下载 182 例...

            【关键词】 miRNA-151a-3p食管癌癌症基因组图谱

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            【中文期刊】 黄向东  张兴伟  《医学信息》 2023年36卷5期 1-7页

            【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,探索食管癌预后相关lncRNA,构建患者预后预测特征,为食管癌患者的潜在治疗靶点提供新的证据支持.方法 获取TCGA数据库中食管癌患者表达谱及临床信息.使用R语言鉴定癌组织与正常组织之间差异表达的...

            【关键词】 TCGA数据库食管癌lncRNA

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            【中文期刊】 周而乐  佟美辰  等 《齐齐哈尔医学院学报》 2023年44卷1期 1-8页

            【摘要】 目的 TICRR的异常激活与多种癌症的发生发展密切相关,本研究利用生物信息学技术分析TICRR在肺腺癌中的表达情况及作用机制.方法 从癌症基因组图谱-肺腺癌(TCGA-LUAD)数据集获得RNA转录本数据及临床数据,比较不同分组组间TICR...

            【关键词】 TICRR细胞周期G2/M检查点

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            【中文期刊】 郎亚昆  范钰  等 《中国现代医药杂志》 2023年25卷5期 31-36页

            【摘要】 目的 探索肝癌患者LINC02802 的表达及与预后和免疫浸润水平的关系.方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库获得肝癌患者数据及临床资料,以LINC02802 表达量的中位数为界,将癌症患者分为高表达组和低表达组.采用Mann-Whi...

            【关键词】 肝癌TCGA长链非编码RNA

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            【中文期刊】 朱翠雯  柳家翠  等 《分子诊断与治疗杂志》 2022年14卷7期 1212-1216页ISTIC

            【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,分析线粒体天冬氨酰-tRNA合成酶2(DARS2)基因在膀胱癌患者和正常组织中的表达差异,研究其与患者临床特征、预后相关性及参与膀胱癌的调节信号通路.方法 从TCGA数据库下载膀胱癌相关的表达资料...

            【关键词】 DARS2膀胱癌TCGA数据库

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            【中文期刊】 陶润  薛胜  等 《现代肿瘤医学》 2022年30卷21期 3947-3951页ISTICCA

            【摘要】 目的:研究触珠蛋白HP在肾透明细胞癌中的表达及临床意义,为肾透明细胞癌的医治提供新的生物治疗靶点和理论依据.方法:从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载肾透明细胞癌的相关基因数据,进行筛选后获得目的基因HP.利用免疫组化研究该基因在肾透明细...

            【关键词】 TCGA肾透明细胞癌免疫组化

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            【中文期刊】 刘翼  吴强  等 《癌症进展》 2022年20卷15期 1538-1541页ISTIC

            【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,研究GTP酶免疫相关蛋白8(GIMAP8)在肺腺癌中的表达及与预后的关系.方法 从TCGA数据库中下载肺腺癌组织的RNASeq数据以及临床数据,分析GIMAP8在肺腺癌组织和正常肺组织中的表达差异...

            【关键词】 肺腺癌TCGA数据库GTP酶免疫相关蛋白8

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            【中文期刊】 布凡  柴剑波  等 《实用肝脏病杂志》 2022年25卷4期 558-562页ISTICCA

            【摘要】 目的 探讨构建基于铁死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)的预后风险模型预测肝细胞癌(HCC)患者预后的价值.方法 自癌症基因组图谱TCGA数据库下载HCC患者RNA测序数据.基于HCC差异水平的铁死亡相关ln-cRNAs构建预后风险模型...

            【关键词】 肝细胞癌铁死亡长链非编码RNA

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            【中文期刊】 石青春  潘立民  等 《实用肝脏病杂志》 2022年25卷6期 869-872页ISTICCA

            【摘要】 目的 研究细胞坏死相关基因对肝细胞癌(HCC)患者预后的影响.方法 自癌症基因组图谱TCGA数据库下载HCC患者mRNA水平数据及其对应的临床资料.应用LASSO Cox回归在TCGA文件中构建多坏死相关基因预后模型.结果 在单因素Cox回...

            【关键词】 肝细胞癌细胞坏死TCGA数据库

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            【中文期刊】 张展瑞  赵文浩  等 《中国肺癌杂志》 2025年28卷1期 22-32页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 背景与目的 铁死亡相关基因在调控细胞内铁稳态和脂质过氧化中发挥关键作用,并且参与调控肿瘤的生长与耐药.铁死亡相关基因在肿瘤组织中的表达可用来预测患者未来的生存时间,帮助医生和患者预测疾病未来的进展.基于癌症基因组图谱(The Cancer ...

            【关键词】 肺肿瘤铁死亡预后模型

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            【中文期刊】 王琛禹  吴治州  等 《陆军军医大学学报》 2025年47卷6期 539-550页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 探究丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(serine/threonine-protein kinase 1,AKT1)介导的肝癌细胞自噬对 125I粒籽辐照敏感性的影响.方法 ①利用iProX数据库和STRING12.0网站对 125I粒籽辐照...

            【关键词】 肝癌细胞125I放射性粒籽AKT1

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            【中文期刊】 朱嘉宁  王天天  等 《口腔疾病防治》 2025年33卷5期 345-358页ISTIC

            【摘要】 目的 基于缺氧相关基因(hypoxia-related genes,HRGs)表达谱构建头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)分类系统,并探讨缺氧基因斯钙素2(stanni...

            【关键词】 头颈部鳞状细胞癌口腔鳞状细胞癌缺氧相关基因

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            【中文期刊】 夏天  胡致远  等 《实用癌症杂志》 2025年40卷1期 23-28,42页ISTIC

            【摘要】 目的 探讨CACNA1A在脑胶质瘤中的表达及其临床意义.方法 从中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库和癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库下载不同级别的胶质瘤的数据,分析CACNA1A的表达情况及IDH状态的CACNA1A表达情况.收集4...

            【关键词】 脑胶质瘤CACNA1AIDH

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            【中文期刊】 苏赓  王启俊  等 《医学研究杂志》 2025年54卷2期 182-187页ISTIC

            【摘要】 目的 探讨T细胞免疫球蛋白黏蛋白分子(Tim-3)及半乳糖凝集素-9(Galectin-9)的表达与肿瘤T细胞免疫在鼻咽癌中的临床意义.方法 在癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中查找Tim...

            【关键词】 Tim-3Galectin-9肿瘤免疫

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            【中文期刊】 吕敏  周婷婷  等 《温州医科大学学报》 2025年55卷2期 128-133页ISTICCA

            【摘要】 目的:研究Lin28基因在肝母细胞瘤(HB)中的表达情况,并探讨Lin28的表达对HB细胞生物学功能的影响.方法:综合分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库和3个不同来源的基因表达数据库(GEO)数据集中Lin28基因的表达差异情况;通过转染...

            【关键词】 Lin28肝母细胞瘤细胞增殖

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            【中文期刊】 单侠  孙志延  等 《中国微侵袭神经外科杂志》 2025年29卷1期 38-44页ISTICCA

            【摘要】 目的 探究囊泡胺转运蛋白1(vesicle amine transport protein 1,VAT1)促进脑胶质瘤恶性表型的潜在机制.方法 纳入中国脑胶质瘤图谱(Chinese Glioma Genome Atlas,CGGA)数据库及...

            【关键词】 神经胶质瘤囊泡胺转运蛋白1治疗抵抗

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            【中文期刊】 李勇  施丹飞  等 《现代肿瘤医学》 2025年33卷3期 409-416页ISTICCA

            【摘要】 目的:基于生物信息学确定肺腺癌(lung adenocarcinoma,LU AD)中与铁死亡和氧化应激相关的差异表达关键基因,并探讨其在免疫浸润及生存预后中的潜在作用.方法:通过分析基因表达综合(Gene Expres-sion Omni...

            【关键词】 肺腺癌(LUAD)铁死亡氧化应激

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            【中文期刊】 张晓洋  朱翠雯  等 《分子诊断与治疗杂志》 2025年17卷4期 610-613页ISTIC

            【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析CD5在乳腺癌中的表达,研究其与临床特征、生存预后、肿瘤微环境和免疫浸润之间的关系.方法 从TCGA数据库下载相关数据,对1 177个样本(1 065 个肿瘤样本和 112 个正常样本)的转录组...

            【关键词】 CD5乳腺癌肿瘤微环境

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            【中文期刊】 肖宇航  李芳  《同济大学学报(医学版)》 2025年46卷2期 193-199页ISTIC

            【摘要】 目的 通过癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库,分析RYR2基因突变与宫颈癌患者的肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)和肿瘤免疫调节之间的关系及预后价值.方法 利用T...

            【关键词】 宫颈癌基因突变RYR2

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            【中文期刊】 胡国帆  谭若柳  等 《浙江医学》 2025年47卷7期 700-705,733,后插4-后插5页ISTICCA

            【摘要】 目的 基于生物信息学和孟德尔随机化方法探索肾透明细胞癌(KIRC)发生和进展的相关关键基因,研究其潜在的作用机制及预后价值.方法 通过R语言分析来自基因表达综合(GEO)数据库的数据集GSE66272、GSE40435,获取与KIRC相关的...

            【关键词】 孟德尔随机化肾透明细胞癌免疫浸润

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            【中文期刊】 蒋曼妃  王宝锋  等 《海南医学》 2025年36卷7期 913-918页ISTICCA

            【摘要】 目的 探讨hsa-miR-17-3p在膀胱癌(BLCA)中的表达及其与预后、免疫浸润及免疫治疗效果的关系.方法 从TCGA数据库(截至2024年)下载418例BLCA组织样本和19例正常组织样本的miRNA表达数据以及相应的临床数据.首先,...

            【关键词】 hsa-miR-17-3p膀胱癌癌症基因组图谱

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            【中文期刊】 王倩  杨文会  等 《微循环学杂志》 2025年35卷2期 42-50页ISTIC

            【摘要】 目的:分析热休克蛋白70(HSP70)水平对非小细胞肺癌患者预后生存、疗效及肿瘤免疫微环境的影响.方法:收集癌症基因组图谱(TCGA)数据库1 114例非小细胞肺癌患者资料,依据其HSP70基因评分分为高表达(HSP70high)组(n=6...

            【关键词】 热休克蛋白70非小细胞肺癌肿瘤免疫微环境

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            【中文期刊】 张春雷  王东星  等 《现代泌尿生殖肿瘤杂志》 2025年17卷2期 96-100页ISTIC

            【摘要】 目的 筛选与膀胱癌免疫检查点抑制剂(ICIs)治疗效果相关的关键基因.方法 利用生物信息学方法,获取IMvigor 210数据集中同时与ICIs治疗效果及总生存率(OS)相关的基因,利用这些基因将癌症基因组图谱(TCGA)数据库中膀胱癌患者...

            【关键词】 膀胱癌免疫检查点抑制剂关键基因

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            【中文期刊】 李瑞华  田国祥  等 《中国循证心血管医学杂志》 2019年11卷3期 280-283,291页ISTIC

            【摘要】 TCGA(The Cancer Genome Atlas)即肿瘤基因组图谱计划是一项由美国NCI(National Cancer Institute)和NHGRI(National Human Genome Research Institu...

            【关键词】 TCGA数据库肿瘤数据提取

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            【中文期刊】 林琳  倪楠  等 《中国医学装备》 2018年15卷6期 93-96页ISTIC

            【摘要】 目的:应用癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析乳腺癌中E-钙黏蛋白(CDH1)基因突变情况.方法:从TCGA数据库收集乳腺癌数据集1098例,按照CDH1是否发生突变分为未突变组(986例)和突变组(112例),统计患者临床信息,应用cBi...

            【关键词】 乳腺癌E-钙黏蛋白基因突变

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            【中文期刊】 林琳  倪楠  等 《中国医学装备》 2018年15卷3期 86-89页ISTIC

            【摘要】 目的:应用癌症基因组图谱(TCGA)数据集,在皮肤黑色素瘤中进行神经母细胞瘤大鼠肉瘤(NRAS)基因突变分析.方法:从TCGA数据库收集471例皮肤黑色素瘤病例数据集,统计患者临床信息、应用cBioPortal网站、SPSS统计学软件对数据...

            【关键词】 黑色素瘤神经母细胞瘤大鼠肉瘤(NRAS)基因突变

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            【中文期刊】 张程  李程  等 《医学信息》 2025年38卷1期 37-43页

            【摘要】 目的 构建与双硫死亡相关长链非编码RNA(DRL)风险评分.方法 从癌症基因组图谱TCGA数据库中下载乳腺癌的转录组数据,使用Perl脚本提取患者的lincRNA数据,通过Sperman相关性分析识别与双硫死亡相关的lincRNA,通过单因...

            【关键词】 乳腺癌双硫死亡长链非编码RNA

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            【中文期刊】 谢龙祥  闫中义  等 《河南大学学报(医学版)》 2018年37卷3期 223-228页CA

            【摘要】 由美国政府发起的癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)计划是一个公共资助的项目,其采用高通量基因组测序、基因芯片技术,运用多维数据整合分析方法,将人类几乎所有癌症(包括亚型在内的50多种肿瘤)的基因组变异...

            【关键词】 癌症基因组图谱(TCGA)癌症基因组测序

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            【中文期刊】 储云鹏  叶长青  《中国医学前沿杂志(电子版)》 2024年16卷3期 40-49页ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的 筛选吸烟相关肺癌基因并探讨其在肺癌中的意义.方法 基于基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中吸烟相关数据集(GSE18385、GSE76324 和 GSE11906)和肺癌相关数据集(GSE27...

            【关键词】 吸烟肺癌基因

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