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【中文期刊】 张子龙 何鲖鲖  等 《病毒学报》 2017年33卷3期 455-456页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 针对西非安哥拉回国的不明原因发热病人,筛查其可能携带的传染病病原体.采用荧光PCR的方法对口岸重点关注的黄热病毒、寨卡病毒、登革病毒等病原体进行筛查;采用深度测序的方法,搜索病毒库、细菌库、寄生虫库,进行序列比对筛查各类病原体,采用全基因组...

【关键词】 库波热病毒； 安哥拉； 深度测序；

【中文期刊】 周春莲 徐伟文  《中国新药杂志》 2017年26卷20期 2401-2405页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 循环肿瘤DNA为血液中与肿瘤相关的游离核酸,可作为肿瘤诊治的标志物.基于深度测序的循环肿瘤DNA检测在肿瘤诊治中具有高通量、高灵敏度、微创、一定程度上能克服肿瘤异质性等优势,在评估肿瘤动态和肿瘤负荷、检测微小残留病灶和复发风险预测、个体化用...

【关键词】 深度测序； 循环肿瘤DNA； 肿瘤标志物；

【中文期刊】 于碧鲲 崔鹂  等 《现代预防医学》 2016年43卷1期 124-127,135页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的 通过噪声性听力损失(NIHL)耳蜗差异性miRNA构建的基因调控网络,分析NIHL耳蜗的重要基因及功能,探讨NIHL的损伤机制.方法 6只SPF及SD大鼠通过110 dB SPL(6h/d、24 d)的高斯白噪声暴露建立NIHL模型,...

【关键词】 噪声性听力损失； 下一代sRNA测序； MicroRNA调控网络；

【中文期刊】 刘鹏娟 乔小改  等 《微生物学通报》 2016年43卷9期 2010-2018页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 [目的]分析猪伪狂犬病毒Fa株(PRV-Fa)侵染对猪肾传代细胞PK-15 microRNAs(miRNAs)表达谱的影响.[方法]利用Illumina高通量测序技术,鉴定感染和非感染PRV-Fa的PK-15细胞的miRNAs;筛选并利用实...

【关键词】 猪伪狂犬病毒； microRNAs； 高通量测序；

【中文期刊】 李洋 王昊  等 《病毒学报》 2015年31卷4期 457-462页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 sRNA深度测序技术是2009年起新兴的可用于病毒研究的组学技术,它突破了传统病毒鉴定技术的局限,直接以宿主中sRNA (small RNA)为研究对象,可以快速地鉴定侵染宿主的病毒组成.是一种发现新病毒,监控病毒变异的有效方法.人们用这种...

【关键词】 小RNA； 病毒鉴定； 高通量测序；

【中文期刊】 田思聪 薛婧  等 《中国药学（英文版）》 2020年29卷3期 161-175页 ISTICCSCDCA

【摘要】 为了探讨中草药对肠道菌群的调节作用,我们选择王氏保赤丸和三七总皂甙两种具有悠久应用历史的中药开展本研究.研究模型为雄性Wistar大鼠,分为高中低三个剂量组,连续给药28天.给药结束后,收集大鼠的新鲜粪便进行16S rRNA测序,以确定肠道...

【关键词】 肠道菌群； 中药； 16S rRNA测序；

【中文期刊】 贺健梅 邹潇白  等 《中华流行病学杂志》 2014年10期 1142-1145页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的：利用超深度焦磷酸测序技术（UDS）研究湖南省HIV感染者中原发性耐药流行趋势。方法90份未接受抗病毒治疗的HIV感染者同时采用UDS测序和Sanger测序进行HIV基因型耐药检测，测序结果采用斯坦福大学HIV耐药突变数据库进行分析比对...

【关键词】 HIV-1； 原发性耐药； 超深度焦磷酸测序；

【中文期刊】 安凤霞 卢宝伟  等 《植物生理学报》 2014年4期 483-487页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 microRNA是一类长度为16~29 nt的非蛋白质编码的内源小分子RNA (sRNA)，在植物生长发育以及逆境胁迫响应等过程中发挥着重要作用。本文利用基于HiSeq原理的sRNA深度测序技术，结合生物信息学方法对萱草根系中已知miRNA...

【关键词】 萱草； miRNA； 生物信息学；

【中文期刊】 王铭杰 龚玲  等 《中华肝脏病杂志》 2014年22卷5期 389-392页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 准种(quasispecies)这一概念最早由Eigen[1]在研究RNA分子复制机制时提出.目前,病毒学家公认的准种概念是指:受到遗传变异、竞争和选择等一系列过程影响的高度相关的但不完全相同的变异株和重组基因组组成的动态种群[2].199...

【关键词】 肝炎病毒,乙型； 准种； 超深度测序；

【中文期刊】 王春花 黄威  等 《中华实验和临床病毒学杂志》 2017年31卷1期 53-56页 MEDLINEISTICCSCDCA

【摘要】 目的 了解手足口病样本中除肠道病毒外的其他病毒病原,并分析其分子特征与基因类型.方法 采用宏基因组学结合生物信息学的方法对1例手足口病患儿样本进行深度测序分析.结果 该病例为肠道病毒71型与札如病毒混合感染.反转录聚合酶链反应(RT-PCR...

【关键词】 札如病毒； 深度测序； 全基因组序列；

【中文期刊】 闫韵秋 张进平  《现代免疫学》 2017年37卷6期 441-448页 ISTIC

【摘要】 本研究探讨miRNA在Cbl-b抑制CD4+T细胞活化中的作用机制.采用miRNA深度测序的方法检测WT CD4+T细胞、Cbl-b-/-CD4+T细胞、抗CD3抗体活化的WT CD4+T细胞和抗CD3抗体活化的Cbl-b-/-CD4+T细...

【关键词】 Cbl-b； CD4+T细胞； miRNA；

【中文期刊】 钟晓明 申晴  等 《生命科学》 2017年29卷3期 230-236页 ISTICCSCD

【摘要】 恒河猴作为人类近缘的模式生物,在基础与转化医学研究中具有独特优势,但其应用受到功能基因组学数据匮乏、基因结构混乱、研究平台缺乏等限制.近年来,深度测序技术的发展为突破这些技术瓶颈提供了机遇.现综述在深度测序技术支撑下,以恒河猴为背景开展的基...

【关键词】 恒河猴； 深度测序； 人类演化；

【中文期刊】 Li Gang Yang Yuchen  等 《生物组学研究杂志（英文）》 2019年02卷4期 169-177页

【摘要】 Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) allows researchers to examine the transcriptome at the single-cell level and has ...

【关键词】 batch effect； deep learning； dropout；

【中文期刊】 徐敏 毛伟  等 《中国输血杂志》 2016年29卷9期 895-898页 ISTICCA

【摘要】 目的 了解重庆地区健康无偿献血人群的微生物组,并调查可能存在的新发/再发病原体的流行情况,本研究利用深度测序的方法对重庆地区5 000人份健康无偿献血者标本进行了宏基因组学分析,以鉴定其中的新发/再发病原体.方法 提取5 000人份血浆核酸...

【关键词】 新发病原体； 献血人群； 宏基因组学；

【中文期刊】 许茹 黄杰庭  等 《中国输血杂志》 2015年28卷10期 1214-1218页 ISTICCA

【摘要】 目的 将深度测序法用于HCV感染者中不同基因型/亚型混合感染的检测.方法 2例HCV RNA阳性血浆标本(标记为1和2号标本),以NS5B.和E1编码区为目的基因,经RT-PCR扩增后做sanger核苷酸序列测定,对其做基因分型发现2个编码...

【关键词】 丙型肝炎病毒； HCV混合型感染； 深度测序；

【中文期刊】 周德建 叶克穷  《生命科学》 2014年26卷3期 207-213页 ISTICCSCD

【摘要】 紫外交联免疫共沉淀(CLIP)技术能揭示RNA结合蛋白质在体内的RNA结合位点.将讨论该技术的基本原理和一些新的发展,这些新发展显著地提高了技术的特异性、灵敏度和应用范围.

【关键词】 紫外交联； 蛋白质RNA相互作用； 深度测序；

【中文期刊】 吕柏楠 赵伟  等 《河北医药》 2015年21期 3228-3231页 ISTICCA

【摘要】 目的：探讨GP6基因rs1654419位点多态性与石家庄市区及周边地区汉族人群下肢深静脉血栓形成的关系。方法应用DNA直接测序技术检测了石家庄市区及周边地区汉族人群中243例下肢深静脉血栓形成（ DVT）患者和445例健康体检者的GP6基因...

【关键词】 深静脉血栓形成； GP6基因； 基因多态性；

【中文期刊】 陈旭东 田路  等 《中华血液学杂志》 2010年31卷9期 607-609页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 通过病例对照研究,了解内皮细胞蛋白C受体(EPCR)基因6936A/G多态性和深静脉血栓形成(DVT)的相关性,进一步了解EPCR在DVT形成中的重要性.方法 用ELISA法检测65例DVT患者和71名健康体检者的外周血血浆可溶性EP...

【关键词】 内皮细胞蛋白C受体； 深静脉血栓形成； 基因,EPCR；

【外文期刊】 Yefei,Liu ; Jiayang,Li ; 等 《International endodontic journal》 SCIMEDLINE

【关键词】 16S rRNA gene sequencing; deep dentinal caries microbiota; pulpitis;

【外文期刊】 Thuy,Doan ; Michael R,Wilson ; 等 《Genome medicine》 2016年8卷1期 90页 SCIMEDLINEBP

【关键词】 Metagenomic deep sequencing; Pathogen discovery; Rubella virus;

【外文期刊】 Phillip,Wulfridge ; Qingqing,Yan ; 等 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2022年2528卷 373-380页

【关键词】 DNA:RNA hybrid; Deep sequencing; R-loop;

【外文期刊】 Virginie,Marchand ; Valérie,Bourguignon-Igel ; 等 《Methods in enzymology》 2021年658卷 25-47页 MEDLINE

【关键词】 Deep sequencing; Epitranscriptome; Mapping;

【外文期刊】 Laura,Palomo ; Francisco,Fuster-Tormo ; 等 《Biopreservation and biobanking》 2017年15卷4期 360-365页 SCIMEDLINEBP

【关键词】 DNA banking; myelodysplastic syndromes; next-generation sequencing;

【外文期刊】 Yong,Shi ; Heng,Xia ; 等 《BMC genomics》 2021年22卷1期 141页 SCIMEDLINEBP

【关键词】 Deep sequencing; MicroRNAs; Osmanthus fragrans;

【外文期刊】 Wenlong,Zhao ; Weiyu,Xiao ; 等 《Plants (Basel, Switzerland)》 2022年11卷7期

【关键词】 chilling stress; chilling tolerance locus; miRNA deep sequencing;

【外文期刊】 Dejan,Gagoski ; H Tomas,Rube ; 等 《bioRxiv : the preprint server for biology》

【关键词】 Peptide binding domains; SH2 domains; bacterial peptide display;

【外文期刊】 Can,Cui ; Xiuyun,Tian ; 等 《Cancer science》 2019年110卷1期 61-71页 SCIMEDLINECABP

【关键词】 T cell receptor; immunohistochemistry; intra-tumor spatial heterogeneity;

【外文期刊】 Shiping,Wei ; Hongpeng,Cui ; 等 《Extremophiles : life under extreme conditions》 2019年23卷6期 747-757页 SCIMEDLINEBP

【关键词】 Archaeal communities; Archaeal primers; Deep-sea sediment;

【外文期刊】 Silvia,D'Ambrosi ; Raquel,García-Vílchez ; 等 《RNA biology》 2024年21卷1期 1-18页 SCIMEDLINEBP

【关键词】 7-methylguanosine; RNA modification; cleavage;

【外文期刊】 Pravin,Prakash ; Dolly,Ghosliya ; 等 《Gene》 2015年554卷2期 181-95页 SCIMEDLINECABP

【关键词】 Catharanthus roseus; Deep sequencing; MicroRNA;

【外文期刊】 Guanwen,Yang ; Jiangting,Cheng ; 等 《Journal of translational medicine》 2024年22卷1期 210页 SCIMEDLINE

【关键词】 Clear cell renal cell carcinoma; Deep learning; Metabolic reprogramming;

【外文期刊】 Mamadou Samb,Yade ; Baba,Dièye ; 等 《Malaria journal》 2023年22卷1期 167页 SCIMEDLINE

【关键词】 Artemisinin partial resistance; Malaria; Pfkelch13 genotype;

【外文期刊】 Sambit K,Mishra ; Chase W,Nelson ; 等 《Virus evolution》 2024年10卷1期 veae013页

【关键词】 VCFgenie; deep sequencing; intrahost single nucleotide variant (iSNV);

【外文期刊】 Yanshu,Xie ; Jingsi,Luo ; 等 《Molecular genetics & genomic medicine》 2023年11卷6期 e2161页

【关键词】 Emery-Dreifuss muscular dystrophy; droplet digital dPCR; genetic counseling;

【外文期刊】 Siqi,Bao ; Ke,Li ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2022年23卷1期 SCIMEDLINEBP

【关键词】 bioinformatics; deep learning; single-cell RNA-sequencing;

【外文期刊】 Stefania,Martino ; Pietro,D'Addabbo ; 等 《International journal of molecular sciences》 2024年25卷17期 SCIMEDLINE

【关键词】 ETFDH; MADD; RNA sequencing;

【外文期刊】 Angelika V,Timofeeva ; Ivan S,Fedorov ; 等 《Life (Basel, Switzerland)》 2021年11卷12期

【关键词】 blastocyst; deep sequencing; logistic regression model;

【外文期刊】 Larissa,Buedenbender ; Abhishek,Kumar ; 等 《Marine drugs》 2020年19卷1期 SCIMEDLINEBP

【关键词】 GNPS molecular networking; Rhodotorula; anticancer;

【外文期刊】 Jieyi,Li ; Jinfeng,Liu ; 等 《Aquatic toxicology (Amsterdam, Netherlands)》 2016年178卷 27-38页 SCIMEDLINECABP

【关键词】 High throughput deep sequencing; Zebrafish; in situ hybridization;

【外文期刊】 Michael A,Asensio ; Yoong Wearn,Lim ; 等 《mAbs》 2019年11卷5期 870-883页 SCIMEDLINEBP

【关键词】 CTLA-4; Humanized mouse antibody repertoires; PD-1;