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            1. Pangenome Analysis of a Salmonella Enteritidis Population Links a Major Outbreak to a Gifsy-1-Like Prophage Containing Anti-Inflammatory Gene gogB

            【外文期刊】 Svahn, Adam J. J. ; Suster, Carl J. E. ; 等 《Microbiology Spectrum》 2023年11卷2期

            【关键词】 Salmonella Enteritidis; foodborne pathogen; pangenome;

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            2. First Complete Providencia rettgeri Genome Sequence, the NDM-1-Producing Clinical Strain RB151. oa

            【外文期刊】 R Alejandro,Marquez-Ortiz ; Leanne,Haggerty ; 等 《Genome announcements》 2017年5卷3期 MEDLINE

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            3. Co-infection with SARS-CoV-2 Omicron and Delta variants revealed by genomic surveillance. oa

            【外文期刊】 Rebecca J,Rockett ; Jenny,Draper ; 等 《Nature communications》 2022年13卷1期 2745页 SCIMEDLINECA

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            4. The evolution and international spread of extensively drug resistant Shigella sonnei. oa

            【外文期刊】 Lewis C E,Mason ; David R,Greig ; 等 《Nature communications》 2023年14卷1期 1983页 SCIMEDLINECA

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            5. Author Correction: The evolution and international spread of extensively drug resistant Shigella sonnei. oa

            【外文期刊】 Lewis C E,Mason ; David R,Greig ; 等 《Nature communications》 2023年14卷1期 2302页 SCIMEDLINECA

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            6. Resistance Mutations in SARS-CoV-2 Delta Variant after Sotrovimab Use. oa

            【外文期刊】 Rebecca,Rockett ; Kerri,Basile ; 等 《The New England journal of medicine》 2022年386卷15期 1477-1479页 SCIMEDLINECABP

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            7. Visualization of Phage Genomic Data: Comparative Genomics and Publication-Quality Diagrams.

            【外文期刊】 Dann,Turner ; J Mark,Sutton ; 等 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2018年1681卷 239-260页

            【关键词】 Comparative genomics; Genomes; Phage;

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            8. Pangenome Analysis of a Salmonella Enteritidis Population Links a Major Outbreak to a Gifsy-1-Like Prophage Containing Anti-Inflammatory Gene gogB.

            【外文期刊】 Adam J,Svahn ; Carl J E,Suster ; 等 《Microbiology spectrum》 e0279122页

            【关键词】 Salmonella Enteritidis; accessory genome; foodborne pathogen;

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            9. Added Value of Genomic Surveillance of Virulence Factors in Shiga Toxin-Producing Escherichia coli in New South Wales, Australia.

            【外文期刊】 Eby M,Sim ; Ryan,Kim ; 等 《Frontiers in microbiology》 2021年12卷 713724页

            【关键词】 STEC; Top-7 serotypes; cgMLST;

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            10. Genomic Epidemiology of NDM-1-Encoding Plasmids in Latin American Clinical Isolates Reveals Insights into the Evolution of Multidrug Resistance. oa

            【外文期刊】 Ricaurte Alejandro,Marquez-Ortiz ; Leanne,Haggerty ; 等 《Genome biology and evolution》 2017年9卷6期 1725-1741页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Providencia rettgeri; antibiotic resistance; bacterial evolution;

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            11. Implementing a national programme of pathogen genomics for public health: the Australian Pathogen Genomics Program (AusPathoGen).

            【外文期刊】 Jessica R,Webb ; Patiyan,Andersson ; 等 《The Lancet. Microbe》 100969页

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            12. Phylogenetically related Argentinean and Australian Escherichia coli O157 isolates are distinguished by virulence clades and alternative Shiga toxin 1 and 2 prophages. oa

            【外文期刊】 Glen E,Mellor ; Eby M,Sim ; 等 《Applied and environmental microbiology》 2012年78卷13期 4724-31页 SCIMEDLINECABP

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            13. Case report: a genomics-guided reclassification of a blood culture isolate misassigned by MALDI-TOF as Yersinia pestis.

            【外文期刊】 Eby M,Sim ; Bryant,Koh ; 等 《Access microbiology》 2022年4卷10期 acmi000422页

            【关键词】 Yersinia; genome sequencing; laboratory biosafety;

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            14. Advancing pathogen genomics in resource-limited settings.

            【外文期刊】 Paul Michael,Pronyk ; Ruklanthi,de Alwis ; 等 《Cell genomics》 2023年3卷12期 100443页

            【关键词】 emerging infectious diseases; genomics; pathogen genomics;

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            15. Persistent Salmonella enterica serovar Typhi sub-populations within host interrogated by whole genome sequencing and metagenomics. oa

            【外文期刊】 Eby M,Sim ; Qinning,Wang ; 等 《PloS one》 2023年18卷8期 e0289070页 SCIMEDLINECABP

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            16. Genomes of Vibrio cholerae O1 Serotype Ogawa Associated with Current Cholera Activity in Pakistan.

            【外文期刊】 Eby M,Sim ; Elena,Martinez ; 等 《Microbiology resource announcements》 2023年12卷1期 e0088722页

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