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【中文期刊】 唐鹤云 杨啸林  等 《中国生物医学工程学报》 2011年5期 685-689页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 研究氨基酸结构对蛋白质结构预测具有重要意义.目前主要采用二面角来描述氨基酸的几何结构,但是角度的方法比较抽象,并且难量化地评估结构差异的程度.提出一种描述氨基酸结构差异的新方法——C'散点图.这种方法用散点图的形式在三维坐标图上显示羧基碳原...

【关键词】 氨基酸几何结构； C'散点图； 二面角；

【中文期刊】 陆伟刚 张翠仙  等 《天然产物研究与开发》 2006年18卷6期 893-895页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 本文对Δ5-3β,7β-二羟基甾醇(1～3)和Δ5-3β,7α-二羟基甾醇(4～6)的一些核磁共振波谱特征进行了比较.活性测试表明化合物1～6对乙酰胆碱酯酶(AChE)无明显的抑制活性,对丁酰胆碱酯酶(BuChE)则有较强的抑制活性,其中2...

【关键词】 Δ5-3β,7β-二羟基甾醇； Δ5-3β,7α-二羟基甾醇； 胆碱酯酶；

【中文期刊】 梁力丹 李俊杰  《甘肃水利水电技术》 2013年9期 31-34页

【摘要】 文章以安县芭蕉坪滑坡为研究对象，首先采用赤平投影法分析确定边坡岩体中结构面的不利空间组合，再利用三维离散元软件3DEC模拟岩质边坡在不同结构面组合情况下的位移变形特征，以此分析该岩质边坡不同结构面组合之间的二面角效应，发现当岩层层面产状与坡...

【关键词】 结构面； 三维离散元； 稳定性；

【中文期刊】 张红亮 李立  《中国生物化学与分子生物学报》 2009年25卷8期 770-775页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 提出一种在给定构象下计算蛋白质多肽链中所有二面角的新方法.通过总体最小二乘法将每个肽单位中的6个原子拟合为1个肽平面,将连续平面之间包含的角定义为二面角,并以数值实验证明了该方法的有效性.精确的二面角值对很多蛋白质分析方法意义重大,特别是将...

【关键词】 肽链； 二面角； 总体最小二乘法；

【中文期刊】 郝瑞林 单树花  等 《山西农业科学》 2023年51卷9期 1050-1059页

【摘要】 利用制备型高效液相色谱仪从桦褐孔菌中分离并鉴定出12种酚类化合物,通过钼酸铵显色法分析酚类化合物对过氧化氢酶的影响.结果表明,原儿茶醛、Phelligridin E 和Phelligridin I显示出增强过氧化氢酶活性的能力,特别是Phe...

【关键词】 桦褐孔菌； 酚类化合物； 过氧化氢酶；

【中文期刊】 李亭 刘俊  等 《小型微型计算机系统》 2022年43卷1期 203-209页

【摘要】 预测蛋白质三维结构对了解其生物功能、疾病发病机理研究、药物研发等具有重大意义.为了提高蛋白质结构预测的精度,提出了一种基于距离约束和二面角优化的蛋白质结构预测方法(Distance Constraint and Dihedral Angle...

【关键词】 蛋白质结构预测； 距离约束； 二面角优化；

【中文期刊】 相艳 朱爽  等 《辽宁化工》 2022年51卷10期 1362-1364页

【摘要】 采用多组分反应方法,以对氯苯甲醛、丙二腈和取代3-氰乙酰基吲哚三组分为原料,在微波条件下简便快速合成2-氨基-3,5-二氰基-4-(对氯苯基)-6-(取代吲哚基)吡喃化合物.产物结构通过熔点、红外、核磁共振谱和高分辨质谱等方法进行了表征,并...

【关键词】 杂环； 吲哚-吡喃； 多组分反应；

【中文期刊】 蔡棣 田浤  等 《中国药科大学学报》 2017年48卷2期 227-232页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 建立含有L-对硝基苯丙氨酸(p-nitro-L-phenylalanine,pNO2Phe)蛋白的分子动力学模拟方法,分析了含有pNO2Phe的蛋白具有免疫原性的构效关系,为其他含有非天然氨基酸蛋白的动力学模拟研究提供参考.使用CGenFF...

【关键词】 纳米分子动力学(NAMD)； 可视化分子动力学(VMD)； 分子动力学模似；

【中文期刊】 徐为人 刘成卜  等 《中草药》 2004年35卷4期 375-378页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的水飞蓟宾RRRR对映体分子中存在多个可变的二面角,可以产生许多立体构象,旨在从理论上寻找其合理构象.方法采用二面角系统搜索后,结合AM1方法确定主要构象,以B3LYP/6-31G*方法优化构型后,在B3LYP/3-21G水平计算了振动频...

【关键词】 水飞蓟宾； 构象搜索； 密度泛函方法；

【中文期刊】 李章维 肖璐倩  等 《计算机科学》 2020年47卷7期 161-165页

【摘要】 蛋白质能量模型的不精确性导致数学上的最优解并不一定对应其稳定的天然态结构,同时其巨大的构象空间使得现有方法也极易收敛到局部最优解.针对蛋白质结构能量模型不精确和高维构象空间采样可靠性低的问题,在进化算法的基础上,提出了一种基于二面角相似度的...

【关键词】 蛋白质结构预测； 多模态优化； 二面角相似度模型；

【中文期刊】 朱晓彤 张荣丽  等 《徐州医学院学报》 2013年33卷3期 151-154页 ISTICCA

【摘要】 目的 研究1,4-二苯基-6-苯基氨基-1,3,5-三嗪-2(1H)-硫酮(分子式C21H16N4S,相对分子质量356.44)的合成方法和其单晶结构.方法 先将一定量的苄脒、氢氧化钠和N,N-二甲基甲酰胺(DMF)混合放入10 ml反应器...

【关键词】 1,3,5-三嗪衍生物； 合成； 微波辐射；

【中文期刊】 赵宏涛 黎云燕  等 《天津医科大学学报》 2012年18卷3期 320-323页 ISTIC

【摘要】 目的:研究人细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)与抑制剂roscovitine相互作用的机制.方法:利用分子动力学模拟的方法研究roscovitine与CDK2之间的相互作用.结果:和空载CDK2相比,roscovitine的存在会使RMS...

【关键词】 细胞周期蛋白依赖性激酶2； Roscovitine； 分子模拟；

【中文期刊】 梁静 刘梦源  等 《天津医科大学学报》 2011年17卷4期 437-439页 ISTIC

【摘要】 目的:研究激动剂能够使过氧化物酶体增殖物激活受体-γ (PPAR-γ)的α螺旋结构更稳定的原因以及PPAR-γ可能的活化机制.方法:利用分子动力学模拟的方法研究激动剂对PPAR-γ的α螺旋的诱导契合效应.结果:激动剂的存在能够增加PPAR-...

【关键词】 过氧化物酶体增殖物激活受体-γ； 激动剂； 分子动力学模拟；

【中文期刊】 郭城 杨洪乾  等 《药学进展》 2010年34卷4期 159-163页 ISTICCA

【摘要】 蛋白质侧链构象的准确预测很大程度上决定了建模的质量以及利用计算机手段进行未知蛋白质准确预测的可行性.综述蛋白质侧链构象预测的研究进展,介绍蛋白质侧链构象的基本概念、侧链预测的基本过程、旋转异构体库的发展以及侧链预测软件的应用.

【关键词】 蛋白质； 侧链； 预测；

【中文期刊】 赵丹 宫利东  等 《北华大学学报(自然科学版)》 2008年9卷3期 213-216页 ISTICCA

【摘要】 对尿素与二肽的相互作用的研究可为探讨尿素致蛋白质变性的机理提供基础.应用ABEEM/MM方法,对尿素和缬氨酸二肽间的相互作用进行了理论研究.结果 表明,尿素对缬氨酸二肽的几何结构影响很大,使其骨架二面角发生了明显的扭转.此外,用该方法计算的...

【关键词】 ABEEM/MM浮动电荷分子力场； 尿素； 缬氨酸二肽；

【中文期刊】 王素娟 裴月湖  等 《中国药物化学杂志》 2003年13卷2期 80-82页 ISTICCA

【摘要】 目的阐述某些环状二苯基庚烷类化合物在1H-NMR谱中异常位移的原因.方法利用分子力场MM2法计算环状二苯基庚烷类化合物的空间优势构象,分析MM2法与X-射线单晶衍射法的异同,根据分析结果寻找某些环状二苯基庚烷类化合物在1H-NMR谱中异常位...

【关键词】 药物化学； 谱学特征； 分子力场MM2法；

【中文期刊】 刘述斌 荣春英  等 《物理化学学报》 2015年31卷11期 2057-2063页

【摘要】 根据密度泛函理论,分子的电子密度确定了该体系基态下的所有性质,其中包括结构和反应活性.如何运用电子密度泛函有效地预测分子反应活性仍然是一个有待解决的难题.密度泛函活性理论(DFRT)倾力打造这样一个理论和概念架构,使得运用电子密度以及相关变...

【关键词】 Rényi熵； Tsallis熵； Onicescu信息能；

【中文期刊】 陈优生  《广州化学》 2015年40卷4期 55-58页

【摘要】 以2-甲基-3-硝基苯甲醛为原料,通过还原、氯代和氰代单元反应合成出2-甲基-3-硝基苯乙腈,经过制备单晶并用X-射线衍射表征其为2-甲基-3-硝基苯乙腈晶体结构,化合物属单斜晶系,空间群为P21/C,分子式CgH8O2N2,Mr=176....

【关键词】 2-甲基-3-硝基苯乙腈； X-射线衍射； 晶体结构；

【中文期刊】 孙立卿 周长会  等 《衡水学院学报》 2014年4期 38-41页

【摘要】 采用Gussian03软件包，在B3LYP/6-31G(d，p)基组下计算了木犀草素分子的键长、键角、二面角、最高占据轨道能、最低空轨道能及慕林肯电荷等结构参数，利用木犀草素分子的结构参数分析了木犀草素分子的活性部位，这为木犀草素的药理活性...

【关键词】 木犀草素； 分子密度； 密度泛函理论；

【中文期刊】 邓理丹 苏宇  等 《河南科学》 2014年32卷3期 343-346页

【摘要】 采用密度泛函理论,在B3LYP/6-31G (d)水平下,对苯并[1,2-b:4,5-b']二噻吩(BDT)-thieno[3,4-b]thiadiazole (TD)的低聚物和聚合物进行了理论计算.其中,BDT为电子供体,TD为电子受体,...

【关键词】 密度泛函理论； 苯并[1,2-b； 4,5-b']二噻吩；

【中文期刊】 周长会 吴启勋  等 《陕西理工学院学报（自然科学版）》 2013年6期 55-58页

【摘要】 采用密度泛函理论在B3LYP/6-31G（ d）水平上对苯基亚磷酸甲酯分子的几何结构进行优化，计算了该分子的分子轨道能、键长、键角、二面角、慕利肯电荷分布及轨道电子激发态，这些分子量化计算结果可为研究苯基亚磷酸甲酯分子性质提供理论基础。

【关键词】 密度泛函理论( DFT)； 苯基亚磷酸甲酯； 慕利肯电荷；

【中文期刊】 刘鸿雁 李岩  《吉林化工学院学报》 2013年30卷11期 10-12,21页

【摘要】 采用DFT//B3 LYP方法,在6-31G*基组下,对8-羟基喹啉锂(LiQ)及其衍生物基态结构进行优化.在基态几何优化基础上,用含时密度泛函理论(TD-DFT)计算吸收光谱.用CIS/6-31G*方法优化8-羟基喹啉锂单体的S1激发态结...

【关键词】 8-羟基喹啉锂； 密度泛函； 分子轨道；

【中文期刊】 杨丽君 刘茜  等 《计算机与应用化学》 2012年29卷4期 461-464页

【摘要】 采用Gaussian03程序用MP2/6-311g (2d,p)方法计算了三组(9个)五元杂芳环与苯环处于4种构型时相互作用能随二聚体各参数变化的情况,在此基础上用正交实验设计方法探索4种构型下环间相互作用能的主要影响因素及二聚体各参数的...

【关键词】 五元杂环； 苯； 相互作用；

【中文期刊】 蒋启华 张海东  等 《原子与分子物理学报》 2012年29卷4期 603-607页

【摘要】 采用DFT及TD-DFT方法在B3LYP/6-311++G**水平对S-酮洛芬电子结构及手性光学性质进行了理论研究.研究发现,羰基与两个苯环发生共轭；由于C(20)与C(11)上H原子之间存在空间位阻,羰基与环A及环B之间均存在一定的二面角...

【关键词】 S-酮洛芬； 电子结构； 手性光谱；

【中文期刊】 江峰 凌云  等 《化学研究与应用》 2011年23卷9期 1235-1239页

【摘要】 采用Sonagashira偶联反应和N-烷基化反应合成了含有咔唑和偶氮苯的乙炔衍生物:3-乙炔基-9-(4-[4-(硝基)苯基偶氮苯]氧)亚丁基咔唑3.其结构通过IR,1H NMR,13C NMR,元素分析和X-射线单晶衍射法测定.标题化合...

【关键词】 乙炔衍生物； 咔唑； 偶氮苯；

【中文期刊】 李志锋 李会学  等 《原子与分子物理学报》 2010年27卷2期 226-232页

【摘要】 采用密度泛函B3LYP/6-31+G·方法对多巴胺DA的构象异构及其稳定性进行了研究. 结果表明,势能面上存在6种稳定构象和8种构象转换过渡态, 构象之间主要通过C1-O7 [二面角T1: H15O7C1C6], C2-O8 [二面角T2:...

【关键词】 多巴胺； 构象； 密度泛函理论；

【中文期刊】 兰子平 覃松  等 《内江师范学院学报》 2010年25卷10期 42-45页

【摘要】 采用密度泛函理论在B3LYP/6-311+G*水平上对该化合物可能的两种异构体进行分子几何结构优化和频率计算.结果 表明,最稳定异构体分子的酰胺基团与噻唑环共平面,苯环与噻二唑环共平面,分子由两个共轭平面组成,其二面角为30°左右.并对其进...

【关键词】 N-(1,3-噻唑-2-基)-1,2,3-苯并噻二唑-7-甲酰胺； 光谱； 热力学性质；

【中文期刊】 黄银生 杨京霞  等 《阜阳师范学院学报（自然科学版）》 2010年27卷1期 27-30页

【摘要】 应用密度泛函理论为基础的量子化学计算方法研究了周边氢键和Mg2+的轴向配位体对叶绿素分子结构的影响.结果表明:Mg2+的配位体(水和甲硫氨酸)使叶绿素a(Chla)分子的结构发生了很大的变化;由于水分子中的氧原子对Mg2+的吸引致使叶绿素a...

【关键词】 配位体； 密度泛函理论； 叶绿素a；

【中文期刊】 韩莹 屠树滋  等 《计算机与应用化学》 2004年21卷5期 786-788页

【摘要】 目的:研究新型香豆素磺酰脲化合物降血糖作用与化学结构之间的关系,为进一步设计合成该类化合物提供理论依据.方法:选择10个降血糖活性较强的化合物,利用MM2分子力学和CNDO/2量子化学方法计算有关结构参数并进行定量构效关系研究.结果:香豆素...

【关键词】 香豆素磺酰脲； 降血糖作用； 定量构效关系；

【中文期刊】 林鸿 冯云龙  《应用基础与工程科学学报》 2003年11卷3期 236-240页

【摘要】 合成了2-环己酮-1,3-二肟,并测定了该分子的晶体结构.晶体属单斜晶系,空间群为P 21/c,晶胞参数:a=1.0255(2),b=0.5687(1),c=1.2953(3)nm,β=107.01(3)°,V=0.7223(2)nm3,Z...

【关键词】 2-环己酮-1,3-二肟； 合成； 晶体结构；

【中文期刊】 龙建君 张铭钦  等 《贵州科学》 2003年21卷4期 43-48,71页

【摘要】 用HyperChem 7的PM3方法计算了田菁胶(SGn=1-5)的电子结构,讨论了稳定构象、侧链内旋转势能面及羟基氧和羟基氧负离子的反应活性.结果表明,甘露糖和半乳糖糖基在SG骨架中基本能保持其单体椅式稳定构象,主链二面角ψ1旋转对增大主...

【关键词】 田菁胶； 构象分析； 反应活性；

【中文期刊】 蒋毅民 谭黎峰  等 《无机化学学报》 2002年18卷8期 802-806页

【摘要】 <篇首> 铜是重要的生命元素,它与铁一样能起到输送氧气和电子载体的作用.把铜的配合物作为生物体内金属离子/酶/底物间相互作用的模拟研究一直十分活跃[1～4].我们选取Cu(Ⅱ)与2,6-双(1-苯基亚氨基甲基)吡啶和KPF6合成了配合物Cu[C...

【关键词】 铜配合物； Schiff碱； 晶体结构；

【中文期刊】 罗飞  《数学教学通讯》 2001年6期 38页

【摘要】 <篇首> 立体几何题的解答或证明往往涉及到某个三面角的面角或二面角,而解这类题用通常的方法常常需要添加辅助图形,构思曲折,计算繁杂.本文将通过三面角的余弦定理,介绍某类立体几何题的解题方法.

【学位论文】 作者： 殷文杰 导师：胡俊  浙江工业大学  其他 电子信息（硕士） 2023年

【摘要】 蛋白质作为生命体的主要组成成分，具有多种生命活动特性，如血红蛋白提供氧气运输功能、球蛋白极大增强人体免疫力等。蛋白质结构的确定具有非常深远的研究意义，其可以帮助理解蛋白质功能，深入改造蛋白质结构，辅助设计新的药物分子。传统测定蛋白质结构的方...

【关键词】 蛋白质； 二级结构；

【学位论文】 作者： 杨一洲 导师：林子敬  中国科学技术大学  物理学 凝聚态物理（硕士） 2022年

【摘要】 脯氨酸(P)是组成蛋白质的20种天然氨基酸(AAs)之一，由于其特殊的吡咯环结构，往往会在成为蛋白质二级结构的末端。脯氨酸的特殊结构引起了学者的广泛兴趣，已有前人使用系统法完成了对脯氨酸结构的DFT计算。但对含脯氨酸小肽、含脯氨酸的多肽体系...

【关键词】 脯氨酸； 小肽体系；

【中文期刊】 张毓敏 章鲁  《上海交通大学学报（医学版）》 2007年27卷1期 88-91页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 设计一个预测蛋白质结构的评分函数.方法 根据蛋白质两两残基中Cα-Cα、N-N、C′-C′的空间距离分布及主链二面角(φ, ψ)的分布构建该评分函数.结果 通过国际共享的评估数据证明,该评分函数的各个组成部分是协同一致的.结论 所设计...

【关键词】 评分函数； 蛋白质结构预测； 蛋白质诱饵；

【中文期刊】 张文玺 刘杰  等 《中华解剖与临床杂志》 2018年23卷4期 298-305页 ISTIC

【摘要】 目的 探讨三维(3D)打印的股骨近端骨折复原模型在术前规划与术中的应用,研究3D数据校正方案临床应用的可行性.方法 纳入2015年10月—2017年9月江苏省溧阳市人民医院骨科47例股骨近端骨折患者,按照左右两侧股骨自身配对方案,采用三层面...

【关键词】 股骨骨折； 骨折固定术,内； 3D打印技术；

【会议论文】王凯 中国化学会第29届学术年会 2014年

【摘要】 本文主要研究在于次毫秒级时间尺度上,对溶菌酶自然折叠状态下进行分子动力学模拟,用以研究整个溶菌酶在自然折叠状态下的构象空间,来分析溶菌酶在自然折叠状态下结构与功能的热力学与动力学关系.我们采用主链二面角分组方法,同时区分不同转换时间尺度的二...

【关键词】 分子动力学模拟； 主链二面角分组； 熵；

【学位论文】 作者： 魏艳宇 导师：贾亚  华中师范大学  物理学 理论物理（硕士） 2012年

【摘要】 能量函数在蛋白质结构预测中至关重要，包括构象搜索、结构选取、结构优化等过程都要有相应的能量函数作为指导。依据是否由已知的实验结构信息导出，可将常见的能量函数划分成基于物理和基于知识两大类，本文所要讨论的基于蛋白质三维结构的二面角的统计势即是...

【关键词】 蛋白质三维结构； 能量函数；

【学位论文】 作者： 袁俊丽 导师：吕帆 侯方  温州医科大学  其他 医学技术（硕士） 2023年

【摘要】 目的
　　弱视是一种视觉系统发育障碍疾病，由发育关键期内异常的视觉经验导致。弱视主要临床表现为最佳矫正视力低下、立体视功能损伤及其他空间和时间上的视觉功能缺陷，但眼部结构无病理性变化，因此可作为天然的视觉系统发育异常模型。人们普遍认为...

【关键词】 弱视； 深度感知；