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          【中文期刊】 张文  骈聪  等 《生物物理学报》 2015年31卷2期 143-153页MEDLINEISTICCA

          【摘要】 启动子是调节基因表达的重要元件,对其的研究对于阐明基因转录调控机制具有重要意义.作者依据RNA聚合酶Ⅱ启动子序列特性选取高效的特征提取方法,构建了基于粒子群优化的支持向量机(particle swarm optimization-suppo...

          【关键词】 位置关联权重矩阵粒子群优化支持向量机

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          【中文期刊】 李琴  张瑾  等 《生物物理学报》 2014年30卷5期 391-400页MEDLINEISTICCA

          【摘要】 前体mRNA的剪接是真核基因表达的关键阶段,识别剪接位点对基因表达也起着至关重要的作用.作者用紧邻与非紧邻的位置关联权重矩阵及组成分的多样性增量得到的五维特征向量来表示序列,应用支持向量机对供体位点和受体位点进行识别.采用5-fold交叉检...

          【关键词】 位置关联权重矩阵多样性增量支持向量机

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          【学位论文】 作者:田陆芳 导师:刘文远   燕山大学   计算机科学与技术 计算机应用技术(硕士) 2011年

          【摘要】 基因表达调控是理解生物体遗传机制,破解生物体奥秘的关键所在.转录是基因表达至关重要的一步,对转录因子结合位点进行识别与注释,无疑将是研究转录调控规律进而构建表达调控网络的关键步骤.随着生物技术和计算机技术的飞速发展,利用计算方法识别转录因子...

          【关键词】 转录因子结合位点Gibbs采样算法

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          【会议论文】杨科利 第十次中国生物物理学术大会 2006年

          【摘要】 通过对五种实验验证的酵母转录因子结合位点序列的单碱基保守性的统计分析,以单碱基位点保守性为参数(图1),提出了预测转录因子结合位点的位置权重矩阵打分函数算法.为了尽可能的减少预测出来的假阳性(FP)结合位点序列,将已知的转录因子结合位点序列...

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